基于网络药理学和文献聚类分析研究阳和汤治疗非小细胞肺癌作用机制
2022-10-11艾青华江久程卫国张妍
艾青华 江久 程卫国 张妍
肺癌位居我国恶性肿瘤发病首位,研究报告显示,2015年我国新发肺癌病例约为78.7万例,发病率为57.26/10万,中标率为35.96/10万[1],已成为对国民健康造成严重威胁的疾病之一。手术、放化疗、免疫疗法及中医药治疗是目前非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)的主要治疗手段,尽管近年来微创手术、精准放疗、靶向治疗、射频消融治疗等取得了长足的发展,但其总体5年生存率仍不高,约10%~20%。肿瘤微环境是肿瘤细胞赖以生存和发展的场所,调控肿瘤微环境成为了肿瘤治疗的重要新策略。阳和汤出自《外科证治全生集》,具有温阳散寒、活血化痰和通络散结的功效,临床常用于治疗骨结核、肿瘤、类风湿性关节炎、无菌性肌肉深部脓肿、慢性妇女乳腺小叶增生、痛经等证属阳虚寒凝者。近年来广泛应用于肿瘤的临床治疗,临床研究表明阳和汤联合放化疗治疗肿瘤效果优于单纯使用放化疗方案,阳和汤观察组可显著提高患者生存、生命质量,减轻患者痛苦[2]。然而,其化学物质基础和抗NSCLC的作用机理尚不明确。为进一步探明阳和汤(本研究结合临床实际应用,在原方基础上加淫羊藿、枸杞,减鹿角胶)的化学物质基础和抗NSCLC的作用机理,通过网络药理学和实验文献聚类分析探讨阳和汤在体内“多成分—多靶点—多通路”的整体药理作用机制,从分子水平来解析中药复方及配伍的科学基础,为中医治疗肺癌提供新思路和用药参考。
1 材料和方法
1.1 网络药理学研究
1.1.1 阳和汤成分靶点和NSCLC靶点筛选 通过TCMSP数据库[3](https://tcmspw.com/tcmsp.php)检索白芥子、甘草、干姜、枸杞、麻黄、肉桂、熟地黄以及淫羊藿的化合物成分,本研究中,口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥30%和类药性(class of drugs,DL)≥0.12的化合物被选择用于后续研究,将纳入的化合物成分通过TCMSP数据库进行成分的靶点获取,经汇总删重后,白芥子获得6个化合物成分,74个靶点;甘草获得98个化合物成分,230个靶点;干姜获得11个化合物成分,102个靶点;枸杞获得55个化合物成分,200个靶点;麻黄获得39个化合物成分,255个靶点;肉桂获得4个化合物成分,63个靶点;熟地黄获得9个化合物成分,36个靶点;淫羊藿获得25个化合物成分,218个靶点。以“non-small cell lung cancer”为关键词,在GeneCards[4]数据库(https://www.genecards.org/)、 NCBI基因数据库[5](https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)进行人类基因检索,其中GeneCards的数据将Relevance score进行中位值的筛选以获得更相关的靶点。经检索,在GeneCards数据库检索到2453条相关基因,NCBI数据库获得1939个基因。将这2个数据库的基因合并删重之后,得到3132个NSCLC相关基因,随后将筛选出的阳和汤成分靶点和NSCLC靶点输入韦恩图制作软件Venny 2.1,得到190个交集靶点,作为阳和汤作用于NSCLC的预测靶点,进行后续的蛋白—蛋白互作网络(protein-protein interaction,PPI)构建、基因本体论(Gene ontology,GO)分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and Genomes,KEGG)通路富集分析。
1.1.2 阳和汤治疗NSCLC靶点网络构建和关键成分筛选 为了更好地理解阳和汤治疗NSCLC 作用机制中相应靶点之间的复杂关系,本研究将纳入的成分、NSCLC以及作用靶点为基础,构建了成分—疾病—靶点网络图,导入Cytoscape 3.8.0[6]中进行网络图的绘制并进行拓扑分析,将成分进行degree的排序,将大于2倍平均度值的成分筛选出来作为关键成分。
1.1.3 交集靶点PPI网络构建和拓扑分析 为阐明靶点蛋白在生物网络系统水平的作用,将获取的交集靶点输入String数据库[7](https://string-db.org/cgi/input.pl)进行PPI网络的构建,将生物种类设定为“人类(Homo sapiens)”,可信度设置为>0.9,构建PPI 网络。本研究将获取的PPI网络导入Cystoscape 3.8.0中,通过Network Analyzer工具进行拓扑分析,以自由度(degree)、介数(betweenness centrality)、 平均最短路径长度(average shortest path length) 和接近中心性(closeness centrality)这四个参数为参考标准,通过degree排序,选取分值大于平均分的基因作为关键靶点,并筛选出前20个关键靶点。
1.1.4 MCODE聚类分析 通过MCODE分析[8]进行关键基因的筛选,将已经构建好的PPI网络导入Cytoscape 3.8.0中,打开MCODE模块进行基因簇的分析以及核心靶点的筛选。
1.1.5 GO富集分析和KEGG通路富集 为进一步说明药物与疾病交集靶点在基因功能和信号通路中的作用,本研究将药物疾病交集靶点进行GO 的生物过程(biological process,BP)、分子功能(molecular function,MF)、细胞组分(cell component,CC)富集,引用String 数据库,将校正P值≤0.05的项目进行筛选,使用R 3.6.3 软件,安装并引用clusterProfiler、enrichplot、ggplot2包,进行柱状图和气泡图绘制。
1.1.6 阳和汤治疗NSCLC的通路和靶点网络构建 将阳和汤—成分—NSCLC—通路—靶点网络文件导入Cytoscape 3.8.0进行通路网络图的绘制,更直观地展示阳和汤活性成分在治疗NSCLC过程中可能的作用通路和靶点。
1.2 实验文献聚类分析
基于对阳和汤及关键成分槲皮素、木犀草素、山奈酚作用于NSCLC的实验文献进行数据挖掘,进一步佐证网络药理学的预测结果。
1.2.1 文献来源及检索方式 2021年6月计算机检索PubMed、EMBASE、Science Direct、中国知网(CNKI)、万方知识服务平台、维普网(VIP)和中国生物医学文献数据库(CBM)等数据库,检索均从建库截至2021年6月。中文检索词:阳和汤、槲皮素、木犀草素、山奈酚、大鼠、小鼠、细胞、通路、实验;非小细胞肺癌、肺癌、肺肿瘤、NSCLC;英文检索词:Yanghe decoction、Quercetin、luteolin、Kaempherol、cell、non-small cell lung cancer、lung cancer、lung carcinoma、NSCLC。
1.2.2 文献纳入与排除标准 纳入标准:(1)阳和汤及关键成分槲皮素、木犀草素、山奈酚对NSCLC作用机制的实验研究;(2)阳和汤为中药复方制剂,实验用直接煎煮或成分萃取均可,槲皮素、木犀草素、山奈酚实验成分包括天然萃取与化学合成;(3)研究类型包括体内实验(in vivo)和体外实验(in vitro);(4)文献报道数据必须有但不限于作用靶点;(5)语言包括中文或英文。排除标准:(1)作者与内容、数据重复文献,包括期刊论文与学位论文内容/数据相同文献,中、英文研究者与研究内容、数据相同文献,均只选用最新发表文献1篇,其余视为重复文献排除;(2)综述类文献;(3)药理研究、实验、方药机制类文献无作用靶点数据或者实验结果不确定的文献;(4)关于槲皮素、木犀草素、山奈酚经修饰后的衍生物实验研究的文献。
1.2.3 统计学处理 使用Noteexpress进行文献管理和初筛,然后逐篇阅读文献全文,将符合纳入标准的文献收入,利用Microsoft Excel 2016建立数据库,录入文献的外部特征,如:题目、作者、文献发表时间、发表形式等;文献内部信息,如:实验类型、实验药物、实验动物/细胞、检测靶点、靶点信号的上调/下调、可能的信号通路等。对于检测靶点、靶点信号的上调/下调数据信息进行标准化,以文献中检测出的靶点频次为数据的度值,然后形成矩阵数据,导入Heatmap illustrator软件进行聚类分析,结果以矩阵热图表示,对于其他类信息采用描述性统计方法。
2 结果
2.1 基于网络药理学分析阳和汤治疗NSCLC的作用机制
2.1.1 药物疾病交集靶点的PPI网络分析和拓扑分析 通过前期数据挖掘和靶点筛选,课题组将190个交集靶点导入Cytoscape软件绘制PPI网络图,如图1所示,该网络中有190个节点,832条边,平均度值为8.76。图中的节点颜色和大小根据度值调整,度值越大颜色越深,度值越大线越粗,从粗到细表示边介数从大到小。拓扑分析通过degree排序,总共筛选出个68关键靶点,将前20个靶点使用R 3.6.3进行图片绘制,横坐标为每个靶点的度值,见图2。其中度值最高的为MAPK1,其他依次为MAPK3、STAT3、Akt1、JUN等,所有的关键基因都在NSCLC中的发生发展过程中扮演重要角色。
图1 关键靶点网络互作图
图2 拓扑分析结果(前20个关键靶点)
2.1.2 核心基因与关键成分 通过MCODE分析进行关键基因的筛选,总共得到7个基因簇和6个核心基因,核心基因为CYP3A4、INSR、RXRB、PLG、PGR、SCD。将成分—疾病—靶点网络图,导入Cytoscape 3.8.0 中进行拓扑分析。将成分进行degree的排序,将大于2倍平均度值的成分筛选出来作为关键成分,总共有11个关键成分(度中心性值越高成分越重要),详见表1。
表1 阳和汤关键成分信息表
根据关键成分的排序赋值成分在关联药物中的分值,槲皮素为11,其他10种成分依次为10至1,然后统计关联药物的分值,关联药物及分值详见图3。除熟地黄之外,阳和汤其余药物均与关键成分关联,其中麻黄、甘草、淫羊藿分值居前三,并显著高于其他的关联药物。
图3 阳和汤关键成分与关联药物分值图
2.1.3 药物疾病交集靶点的GO富集与KEGG通路富集 通过GO富集分析到2405条生物过程,165项分子功能相关,68项细胞组分相关。将药物疾病交集靶点进行KEGG通路富集分析,总共富集到168条信号通路,并筛选出最显著的前20条通路绘制气泡图,详见图4。
图4 KEGG通路富集气泡图
2.1.4 阳和汤治疗NSCLC的多成分、多靶点、多通路网络图 运用Cytoscape 3.8.0进行中药—成分—疾病—通路—靶点网络图的绘制,见图5。如图所示,紫色为中药,蓝色为化合物,黄色为中药作用于疾病的靶点,绿色为最显著的前20条通路,红色为NSCLC,直观地展示了阳和汤活性成分在治疗NSCLC过程中的多成分—多通路—多靶点的作用特点。
图5 阳和汤治疗NSCLC的中药—成分—疾病—通路—靶点网络图
2.2 基于实验研究文献聚类分析阳和汤治疗NSCLC的作用机制
2.2.1 纳入文献及实验情况 本次纳入研究的文献共44篇,其中中文35篇、英文9篇,发表年份与篇数分别为(2005/3,2007/3,2009/1,2010/1,2012/6,2013/1,2014/3,2015/3,2016/2,2017/5,2018/5,2019/4,2020/5,2021/2)。44篇文献中纳入实验50个,其中体内实验14个,体外实验36个,实验动物包括大鼠(2)和小鼠(12),实验用细胞系/株与实验次数分别为(A549/26,H460/5,H1975/3,H1299/1,HCC827/1,BEAS-2B/1)。
2.2.2 阳和汤及关键成分作用于NSCLC的靶点聚类分析 研究将标准化处理后的检测靶点、靶点信号的上调/下调数据导入Heatmap illustrator软件进行聚类分析,结果以矩阵热图表示,其中图6左侧为体内实验检测槲皮素(Que)、木犀草素(Lut)、阳和汤(YHD)治疗NSCLC的作用靶点与靶点信号的表达,图6右侧为体外实验检测槲皮素(Que)、木犀草素(Lut)、山奈酚(Kae)治疗NSCLC的作用靶点与靶点信号的表达,红色显示上调,蓝色显示下调,颜色的深浅显示度值。
图6 阳和汤治疗NSCLC的靶点信号热图
图6显示促肿瘤细胞凋亡信号的上调,如Bax/Bcl-2、p53、PTEN等,促进肿瘤细胞生长/抑制肿瘤细胞凋亡信号的下调,如VEGF、EGFR、Akt、Vimentin、Src等,其可能的通路几乎覆盖了NSCLC的主要的通路,如Src/Fn14/NF-κB、PTEN-PI3K-Akt/mTOR、EGFR/ALK、RAS-MAPK、JAK-STAT、HER3,阳和汤的关键成分作用点有相同也有不同,具有靶点信号调节的互补和叠加效应,充分地显示了中药复方多成分—多靶点—多通路治疗肿瘤的作用机制。
3 讨论
《素问·阴阳应象大论篇》云:“阳化气,阴成形。”中医将肺癌称为“肺积”,阳虚阴结、气血亏虚、痰瘀互结是肺癌的主要病机。阳和汤温阳补血,散寒通滞,可起“益火之源,以消阴翳”之功,以温消积,多联合放化疗或者靶向治疗脾肾阳虚型中晚期NSCLC。本研究发现阳和汤含有多个具有一定的抗肿瘤作用的关键成分,如槲皮素、木犀草素、山奈酚、β-谷甾醇、异甘草素等,显著关联药物为麻黄、甘草、淫羊藿,提示开通腠理逐寒凝、温通气血养肺金是阳和汤治疗阳虚型肺癌的主要机制。近期研究认为槲皮素和木犀草素均能调控NF-κB信号通路,均可联合吉非替尼起到协同抗NSCLC作用,其中槲皮素下调p-Akt蛋白的表达水平,促进肿瘤细胞凋亡[9],通过抑制Src/Fn14/NF-κB信号通路,抑制NSCLC细胞的增殖和转移,槲皮素的低细胞毒性和高丰度代表了其在NSCLC临床治疗中的应用前景[10]。有研究认为,槲皮素通过调控SIRT1/AMPK[11]、AMPK/mTOR[12]信号通路可诱导自噬促进肺癌细胞凋亡。木犀草素可降低TBK1的表达,部分恢复对吉非替尼的敏感性[13]。另有研究认为,下调AIM2可能是木犀草素对NSCLC的抗肿瘤作用关键途径[14],木犀草素可有效抑制H460细胞的增殖和迁移,这可能与其对E-cadherin和N-cadherin等上皮间质转化相关标志蛋白的调控有关[15]。山奈酚能通过调控miRNA21/PTEN/Akt信号通路抑制NSCLC A549细胞增殖[16],通过抑制ERRα降低NSCLC A549细胞侵袭和迁移能力,并抑制其上皮间质转化[17]。另外,成分—靶点网络中的关键靶点主要有MAPK、STAT3、Akt1、IL-6、EGFR等,这些蛋白参与细胞增殖、分化、癌变、转移、凋亡等,调控靶点蛋白的表达是抑制NSCLC的过程中起到重要作用。结合GO及KEGG通路富集分析,阳和汤可能通过调控MAPK/NF-κB/STAT/Akt1/TNF等多级交叉的信号通路抑制肿瘤血管生成,抑制肿瘤细胞增殖与迁移,诱导肿瘤细胞凋亡。
网络药理学分析充分体现了阳和汤治疗NSCLC多通路、多靶点的网络模式,中药复方的多成分可以通过多种途径作用于疾病的多个方面,并且产生相互协同效应。研究的第二部分通过对实验研究文献的聚类分析,进一步清晰地展示了阳和汤及其关键成分作用于NSCLC的生物靶点分布及靶点信号的调节,不仅佐证了网络药理学的分析结果,并且更加丰富和具体,明确到成分对应靶点信号的调节方式,成分之间靶点互补以及共同靶点的作用关系。在过去的20年中,NSCLC治疗已经从以细胞毒性治疗为中心发展到以肺腺癌和肺鳞癌中特定分子亚型为靶点的有效且耐受性更好的治疗方案[18],近年有多项临床研究认为靶向药联合中药复方治疗NSCLC更能获益,中药复方可起到增敏增效、提高免疫力、提高患者生活质量、减少不良反应的作用[19]。本研究纳入分析的文献也为此提供了实验研究依据,体内实验研究显示阳和汤有较好的免疫调节作用,例如增加NK细胞活性[20],提高CD3+、CD4+/CD8+比率,提高荷瘤小鼠体质量、脾指数和胸腺指数及血清Th1、细胞因子IL-2 含量,从而使荷瘤机体内Th1/Th2平衡漂移向Th1 占主导的地位转换,起到抑制肿瘤的效果[21],为阳和汤在临床应用中减轻放化疗不良反应,改善临床症状提供了体内实验依据。体外实验研究中部分实验采用TKI靶向药耐药株H1975[22]、PC9/GR10来检测阳和汤关键成分的抗耐药效果,结果显示对于重启肿瘤细胞凋亡信号通路具有积极作用,从而验证了阳和汤在临床应用中对TKI靶向药的增敏效果。目前一线靶向治疗NSCLC药物吉非替尼、奥希替尼、厄洛替尼等治疗的靶点为EGFR,有研究结果显示肺癌患者中肺阴亏虚型、气虚亏虚型、痰湿蕴肺型、肾阳虚衰型、肺脾气虚型EGFR表达依次增高[23],提示扶阳类中药改善肺癌患者的阳虚体质可增强EGFR-TKI药效。阳和汤筛选出的关键靶点中也有EGFR,文献聚类分析显示EGFR下调频次最高,为阳和汤联合靶向药治疗阳虚型肺癌提供了理论依据和用药参考。
本研究通过网络药理学和实验文献聚类分析以阐明阳和汤及关键成分的作用靶点及网络作用机制,对于临床治疗NSCLC不同亚型化药耐药、TKI抑制剂靶向药耐药的患者,在联合用药的药方配伍上具有一定的指导意义,为研制更为有效的抗肿瘤药物提供了一定的理论依据。本研究首次尝试采用实验文献数据挖掘、热图聚类分析来佐证网络药理学研究结果,实验文献由于是全网检索,实时采集,数据更新更全,可弥补网络药理学数据库更新滞后的不足,增加了研究深度与广度,热图分析更能清晰地呈现研究结果,适合在网络药理学研究中推广。网络药理学在药物发现的过程中发挥了越来越重要的作用,但在这个领域仍存在一定的局限性,目前采用网络药理学针对疾病筛选出的活性成分并非是中药材现行标准中的主要质控成分或药材中含量较高的成分,筛选出某些活性成分相似度较高,如槲皮素、山柰酚和谷甾醇等具有广泛的活性,在不同药物或处方的筛选中,筛选出来的结果有较大程度的相似性,显然这一现象有待进一步探讨[24]。桂皮醛作为肉桂标准活性成分,能有效抑制细胞凋亡,通过抑制Wnt/β-catenin信号通路,逆转NSCLC细胞上皮间质转化[25],但在本研究未筛选出来,提示数据库尚有待完善,筛选成分的标准尚有待优化。另中药复方君臣佐使的配伍不仅针对疾病,也以证型为主,例如,中药治疗NSCLC有多个方剂,不同的方剂治疗不同证型,中药标准活性成分并不一定具有抗肿瘤作用,更侧重于改善主要症状,从整体上改善内环境,激发人体自愈机制,症状的改善对患者产生积极心理作用,心理作用并非药理机制,这种复杂的、间接的抗肿瘤机制无法在网络药理学中体现出来。本研究阳和汤中的熟地黄,用量最大,检索2020版《中华人民共和国药典(一部)》[26],熟地黄标准活性成分为地黄苷D,并不具有抗肿瘤作用,地黄中的抗肿瘤作用成分为地黄多糖,地黄多糖在炮制过程发生了水解反应,其含量明显降低,抗肿瘤作用也随之减弱,仅从药物成分来看,生地黄抗肿瘤作用更佳[27],但针对阳虚型肿瘤患者,生地黄药性偏寒,不可多用,重用药性甘温的熟地黄则能生精益髓,补阳祛邪,其药理作用主要为抗氧化、调节免疫、促进造血、抗疲劳[28],起到整体调节和体质改善作用,利于其他药物中的抗肿瘤活性成分药理机制的发挥。中药网络药理学还需要经过不断地完善和改进,不仅将其与药理学、药动学、毒理学和药效学等学科有效结合,更要坚持以中医药整体观念和辨证论治思维进行课题研究的科学设计,使筛选得到的活性成分和作用机制更有说服力。
注:本文出现的英文简写之中文全称对应如下:
槲皮素(quercetin,Que)
木犀草素(luteolin,Lut)
山奈酚(kaempferol,Kae)
腺嘌呤核糖核苷酸活化蛋白激酶(adenosine monophosphate activated protein kinase,AMPK)
黑素瘤缺乏因子2(absent in melanoma 2,AIM2)
丝/苏氨酸激酶(serine/threonine kinase,AKT)
间变性淋巴瘤激酶(anaplastic lymphoma kinase, ALK)
激活蛋白-1(activator protein-1,AP-1)
淀粉样β前体蛋白(amyloid beta precursor protein,APP)
自噬相关5、7、12同源物(autophagy related 5、7、12 homolog,Atg5、7、12)
B淋巴细胞瘤-2基因中X蛋白比值(BCL2-associated X/B-cell lymphoma-2,bax/bcl-2)
过氧化氢酶(catalase,CAT)
周期蛋白D1(cyclin D1,CCND1)
细胞分裂周期2(cell division cycle 2,CDC2)
髓细胞组织增生病毒癌基因同源物(myelocytomatosis viral oncogene homolog,c-Myc)
细胞色素c氧化酶亚基2,(cytochrome c oxidase subunit 2,COX-2)
趋化因子(C-X-C基元)配体8[chemokine (C-X-C motif) ligand 8,CXCL8]
细胞色素P4503A4酶(cytochrome enzyme code P4503A4,CYP3A4)
肝癌缺失1(deleted in liver cancer 1,DLC-1)
双特异性磷酸酶6(dual specificity phosphatase 6,DUSP6)
表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)
上皮间质转化(epithelial-mesenchymal transitions, EMT)
雌激素受体相关受体α(recombinant estrogen related receptor alpha,ERRα)
雌激素受体1(estrogen receptor 1)
局部粘着斑激酶(focal adhesion kinase,FAK)
成纤维细胞生长因子诱导分子-14(fibroblast growth factor-inducible 14,Fn14)
v-fos FBJ鼠科骨肉瘤病毒癌基因同源物(v-fos FBJ murine osteosarcoma viral oncogene homolog,FOS)
谷胱甘肽(glutathiore, GSH)
人类表皮生长因子受体-2,3(human epidermal growth factor receptor 2,3, HER2,3)
缺氧可诱导因子1(hypoxia inducible factor,HIF-1)
白细胞介素(interleukin,IL)
导型一氧化氮合酶(inducible nitric oxide synthase,iNOS)
胰岛素受体(insulin receptor,INSR)
两面神激酶(janus kinase,JAK)
v-jun肉瘤病毒17(v-jun sarcoma virus 17,JUN)
亮氨酸氨肽酶3(leucine aminopeptidase 3,LAP3)
微管相关蛋白1轻链3(microtubule-associated protein 1 light chain3,LC3)
丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)
鼠类转化3T3细胞双分2,4(murine double minute 2,Mdm2,4)
微小核糖核酸34a-5p(micro RNA-34a-5p,miR-34a-5p)
丝裂素活化蛋白激酶磷酸酶-1(mitogen activated protein kinase phosphatase 1,MKP-1)
基质金属蛋白酶(matrix metalloproteinases, MMPs)
哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mechanistic target of rapamycin,mTOR)
衔接因子蛋白1(adaptor protein 1,NCK1)
核因子-κB(nuclear factor-κB,NF-κB)
自然杀伤细胞(nature killer cell,NK-C)
烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸氧化酶(nadph oxidase,NOX)
核受体亚家族3组C成员1(nuclear receptor subfamily 3 group C member 1,NR3C1)
肿瘤蛋白21,53,62(tumor protein 21,53,62,p21,53,62)
聚腺苷二磷酸核糖聚合酶(poly ADP-ribose polymerase,PARP)
增殖细胞核抗原(proliferating cell nuclear antigen,PCNA)
丙酮酸脱氢酶激酶同工酶1(pyruvate dehydrogenase kinase isozyme 1,PDK1)
孕酮受体(progesterone receptor,PGR)
磷酸化组蛋白H3(phosphorylated histone H3,PHH3)
磷脂酰肌醇 -3- 激酶(phosphatidylinositol-3-kinase,PI3K)
血纤维蛋白溶酶原(plasminogen,PLG)
脯氨酸丰富蛋白BstNI亚家族( proline-rich protein BstNI subfamily,PRB)
蛋白S6激酶(protein S6 kinase,p-S6K)
第10染色体缺失与张力蛋白同源的磷酸酶基因(gene of phosphate and tension homology deleted on chromosome ten,PTEN)
鼠科白血病病毒癌基因同源物(rat eukemia viral oncogene homolog,RAF)
鼠肉瘤病毒相关基因(rat sarcoma virus related genes,RAS)
成视网膜细胞瘤1(retinoblastoma 1,RB1)
网状内皮细胞过多症病毒癌基因同源物A(reticuloendotheliosis virus oncogene homolog a,RELA)
类视黄醇X 受体(β retinoid X receptor,RXRB)
硬脂酰基辅酶A脱氢酶(stearoyl-CoA desaturase,SCD)
沉默信息调节因子1(sirtuin 1,SIRT1)
锰超氧化物歧化酶2(manganese superoxide dismutase superoxide dismutase 2,SOD2)
信号传导和转录激活因子3(signal transducer and activator of transcription3,STAT3)
转化生长因子β引导(transforming growth factor beta-induced,TGFBI)
胰激肽释放酶抑制剂(trypsin kallikrein inhibitor,TKI)
肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)
血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)
血管内皮生长因子A(vascular endothelial growth factor A,VEGFA)
无翅基因β-连环蛋白(wingless/β-catenin,Wnt/β-catenin)