新型冠状病毒抗原检测胶体金法与核酸检测实时荧光RT-PCR方法比较
2022-05-24许玉玲王海霞李金月夏向群黄学勇
许玉玲 王海霞 李金月 夏向群 黄学勇
河南省疾病预防控制中心,传染病预防控制所,河南省传染病病原生物重点实验室(郑州 450016)
新型冠状病毒肺炎(COVID-19)(简称新冠肺炎)是近两年全球大流行的一种呼吸道传染病,患者多出现肺部感染症状[1],给全球经济造成巨大损失。《新型冠状病毒防控方案》(第八版)提出“外防输入、内防反弹”的防控策略,落实“早预防、早发现、早报告、早隔离、早治疗”的措施,严格落实“动态清零”政策。当前新型冠状病毒实验室确诊方法主要为核酸检测实时荧光RT-PCR 法,需要专业实验室、人员和仪器,样本采集后经前处理、提取核酸,PCR 体系配制、PCR 扩增至获得结果,最短需6 h。抗原检测胶体金法检测的是样本中新型冠状病毒的一种蛋白,方便快捷,不受实验条件和仪器限制,采样后10 min 内出结果。本研究选择河南省疾病预防控制中心生物资源库保存的新冠样本,用实时荧光和胶体金两种方法检测,对比结果,分析胶体金法能否作为早期快速诊断新冠感染的一种方法。
1 资料与方法
1.1 标本来源 所有标本来自河南省新冠肺炎监测系统,各省辖市疾控冷链运输至河南省疾病预防控制中心生物资源库,-80 ℃集中保藏。选择2021年7-8月份新冠阳性鼻咽拭子60份,口咽拭子30 份;同期,中高风险区新冠阴性鼻咽拭子60 份,口咽拭子30 份。
1.2 梯度稀释和RNA 提取 所有原始样本按照《新型冠状病毒防控方案》(第八版)》附件10《新冠病毒样本采集和检测技术指南》进行前处理后,在1.5 mL EP管中取原样本50 μL,加450 μL的病毒保存液进行10 倍稀释,混匀后取50 μL,加入450 μL的病毒保存液进行100 倍稀释。原样本、10 倍和100 倍稀释后的样本,使用QIAGEN 核酸提取试剂盒提取核酸。
1.3 RT-PCR 核酸检测 使用武汉明德新型冠状病毒2019-nCoV 核酸检测试剂盒(荧光PCR 法)检测ORF1ab∕N 基因,试剂批号:210804,有效期至2022年6月3日。配制反应体系:反应液20 μL,RNA 5 μL,设阴性、阳性对照,使用ABI 7500 实时荧光定量PCR 仪,反应条件:50 ℃15 min,1 个循环;95 ℃30 s,1 个循环;95 ℃3 s,60 ℃40 s,40 个循环收集荧光信号。阴性、阳性对照结果正常,Ct值≤38,结果判阳性。
1.4 胶体金法抗原检测 使用南京诺唯赞公司的新型冠状病毒(2019-nCoV)抗原检测试剂盒检测,试剂批号V20210506570,有效期至2023年2月17日。将样本80 μL 加入保存液,混匀后加4 滴入检测孔,15 min 内观察质控线和检测线,质控线测出实验成立,观察记录结果。
1.5 统计学方法 使用Excel 和SPSS 25.0 进行统计,计量资料采用()表示,计数资料采用例数表示。以核酸检测结果为金标准,计算180 个样本胶体金法抗原检测的阳性和阴性符合率,计算13 个阳性样本10 倍和100 倍稀释后,胶体金法抗原检测的阳性符合率。分别对核酸检测目标基因Ct 值<25 和25 <Ct 值<30 的样本进行分层统计,按照公式分别计算阳性符合率:A∕(A+C)×100%,阴性符合率:D∕(B+D)×100%以及总符合率:(A+D)∕(A+B+C+D)×100%。对胶体金法与核酸检测结果进行Kappa 分析。P<0.05 为差异具有统计学意义。
2 结果
2.1 RT-PCR 法核酸检测结果 从大疫情网获得所有样本均采自发病7 d 内,新冠阳性样本90 份,核酸检测目标基因Ct 值均小于35,新冠阴性样本检测结果均阴性。阳性样本核酸检测Ct 值结果见表1。
表1 新冠样本Ct 值结果分布Tab.1 Distribution of Ct values of SARS-CoV-2 samples±s
表1 新冠样本Ct 值结果分布Tab.1 Distribution of Ct values of SARS-CoV-2 samples±s
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2.2 胶体金法抗原检测结果 核酸检测的阳性样本90 个,胶体金法抗原检测只有1 例为阴性,核酸检测阴性样本90 个,金标法抗原检测结果均阴性,见表2。
表2 胶体金标法检测结果Tab.2 Results of colloidal gold method 例
2.3 胶体金法抗原检测与RT-PCR 法核酸检测结果符合率 以核酸检测结果为金标准,胶体金法抗原检测的阳性符合率为98.89%,95%CI:93.97%~99.80%,阴性符合率为100.00%,95%CI:95.91%~100%,总符合率99.44%,95%CI:96.92%~99.90%。对核酸检测目标基因Ct 值<25,25<Ct 值<30 的样本进行分层统计,胶体金法抗原检测的阳性一致率分别为98.44%,95%CI:91.67%~99.72%;98.81%,95%CI:93.56%~99.79%。
2.4 Kappa 分析 Kappa=0.989,胶体金法抗原检测结果与RT-PCR 法核酸检测结果几乎完全一致,一致性好。结果见表3。
表3 抗原检测胶体金法与RT-PCR 法核酸检测结果的Kappa 分析Tab.3 Kappa analysis of colloidal gold method for SARS-CoV-2 and RT-PCR
2.5 梯度稀释后实验结果 13个原样本及其10倍和100 倍稀释后核酸检测ORF1ab 和N 基因分别为:(22.99 ± 3.83)、(22.49 ± 3.96);(25.74 ± 4.32)、(25.94±4.88);(28.66±4.16)、(28.85±4.32)。10倍稀释后金标法检测结果均阳性,100 稀释后金标法有2 个阴性,Ct 值均大于33。10 倍和100 倍稀释后金标法阳性符合率分别为100%、84.61%。
3 讨论
《新型冠状病毒肺炎防控方案(第八版)》,新型冠状病毒肺炎确诊病例需满足新冠疑似病例与核酸检测阳性,或者病毒基因测序与已知新冠病毒高度同源,或未接种过新冠疫苗但新冠特异性IgM 抗体和IgG 抗体阳性等[2]。核酸检测的是新冠病毒的遗传物质RNA,如果检测结果为阳性,可直接确诊为感染病例,检测灵敏度和特异性都高于其他方法。实时荧光RT-PCR 是核酸检测最常用的方法,是确诊新冠肺炎的“金标准”[3]。但PCR 方法也有一些缺点,从前期样本处理到出报告通常需要至少4 ~6 h,且存在一定的假阴性;采样不当、标本保存不当、采用不同类型的标本、采样遇不排毒时期以及使用不同厂家试剂都可能造成核酸检测结果“假阴性”而出现漏诊。
病毒基因测序要求专业仪器、专业人员、测序专用试剂盒,新型冠状病毒基因组全长近30 000 bp,二代测序至少需要48 h 出结果,结果分析更需要专业人员操作。但病毒测序有一锤定音的作用,配合流行病学调查常作为聚集性疫情病毒溯源的终结手段,适用于科研及专业机构。
抗体检测的是患者体内免疫系统应对新冠病毒感染而产生的抗体,新冠患者血清特异性IgM和IgG 抗体在发病1 周内都非常低,随着病程发展,IgM 逐渐升高,在第3 周达到峰值,然后逐渐下降;IgG 抗体在发病后3~6 周上升幅度较大,发病后第9 周达到峰值,并维持一定时间[4]。健康人群全程接种新冠疫苗后,体内特异性IgG 抗体也能维持较长时间。开展全员核酸检测是为发现更多潜在的早期病例,在早期大规模筛查方法中,血清学试验并不适用,在临床上血清学检测结合流行病学史、临床表现和基础疾病等情况动态观察新冠患者的病程[4],综合判断。
抗原检测胶体金法是检测样本的新型冠状病毒的一种蛋白,采用双抗体夹心法,以固相免疫层析形式进行测定,待检样本的抗原与标记物垫上的抗体结合为胶体金标记抗体-抗原的复合物,继续扩散至T 线(检测线)和C 线(质控线),指示反应完成。如果检测阳性,很可能为新冠感染病例。张赛等[6]研究显示该方法检测新冠病毒抗原灵敏度和特异度都高于96.5%,且与其他呼吸道病原没有交叉反应,可作为现有核酸检测法的补充手段,用作早期筛查。泰国的研究者CHAIMAYO 等[7]对454 份(60 个阳性,394 个阴性)新冠样本进行金标法抗原检测与PCR 检测对比,金标法的灵敏度和特异度为98.33%、98.73%,他们认为这种快速简单的抗原检测金标法可以用作筛查试验。EJAZI 等[8-9]对当前各种新冠诊断方法进行综述,认为核酸检测试剂价格高、检测时间长限制了它在大规模测试中的应用,免疫方法简单且适合大规模检测。国外多个研究团队对比新冠抗原快速检测方法和RT-PCR 检测结果,认为快速检测抗原的方法可以作为RT-PCR 核酸检测的辅助方法[10-12]。本研究180 个样本,核酸检测新冠阳性90 个、新冠阴性90 个。用胶体金法检测抗原,与核酸检测结果比较,胶体金法阳性符合率98.89%,阴性符合率100%。胶体金法抗原检测与RT-PCR法核酸检测方法的一致性统计指标Kappa 值为0.989,一致性非常好。本次研究的新冠阳性样本核酸检测ORF1ab 和N 基因Ct 值为23.00 ± 4.38、21.14 ± 4.20,标本中病毒载量较高,抗原易检出。在金标法未检出的一例鼻咽拭子,分析未检出原因可能与样本曾进行56 ℃30 min 灭活,导致蛋白变性所致。挑选13 个样本进行10 倍和100 倍的稀释,每稀释10 倍,核酸检测靶基因的Ct 数值增加3.24 左右,当Ct 值大于33 时,金标法检测的灵敏度下降,100 倍稀释后金标法灵敏度下降,为84.61%。新冠患者早期感染,咽部排毒量较多,PCR 检测Ct 值较小,胶体金法也更容易检出,患者感染后期和复阳阶段[13],咽部排毒量逐渐减少,PCR 检测Ct值逐渐增加,Ct 值大于33 后,胶体金法检测容易出现漏检。
抗原检测胶体金法具有较高的敏感度和特异度,该方法快速、简单,准确并且不受场地、仪器、人员限制,可以作为聚集性疫情需要大规模排查时的初筛方法,更早发现新冠感染者,使“早发现”关口前移,提供更多的时间进行摸排、流调及后续一系列防控措施的制定,具有较高的应用价值,可以作为早期辅助诊断新型冠状病毒感染的快速方法。