基于网络药理学探讨女贞子治疗糖尿病肾病作用机制 *
2024-02-26魏文一景彩芳张学兰李钦青
杨 杰 魏文一 景彩芳 张学兰 李钦青※
(1.山西中医药大学/国家级分子中医药学国际联合研究中心/中医脑病学山西省重点实验室,山西 太原 030024;2.山东中医药大学药学院,山东 济南 250355)
随着现代人生活条件的改善和环境的变化,糖尿病作为一种慢性代谢性疾病,其发病率逐年增高。据统计[1,2],2035 年全球糖尿病患者将达6 亿,其中30%~40%会进一步发展为糖尿病肾病(Diabetic nephropathy,DN),DN 已成为导致终末期肾脏疾病(End-stage renal disease,ESRD)的重要原因。DN 的发病机制复杂,现代研究[3-7]认为DN 的发生发展与多因素相关,包括遗传、糖代谢异常、血流动力学异常、炎症反应、氧化应激等。
中药女贞子(Ligustri Lucidi Fructus)是木犀科女贞属植物女贞(Ligustrum lucidumAit)的干燥成熟果实,《本草经疏》中记载其可入肾经,《本草纲目》认为该药可以养阴益肾。女贞子中含有萜类、黄酮类、苯乙醇苷类,以及一些挥发油、脂肪酸、多糖、氨基酸、微量元素等成分[8],具有降血糖、降血脂、抗氧化应激[9]等功效。因此,本研究基于网络药理学,对女贞子治疗DN的机制作初步探讨。
1 靶点的筛选
1.1 女贞子成分及作用靶点的筛选 通过网络药理学TCMSP(https://tcmspw.com)平台检索女贞子的成分,得到可能的活性成分13个;检索各成分的作用靶点,经合并、去重、标准化,得到女贞子靶点252个。见图1。
图1 女贞子成分-靶点网络图
1.2 DN 作用靶点的筛选 使用Drugbank、GeneCards、OMIM 数据库检索DN 的作用靶点,通过合并、去重、标准化得到其作用靶点1084个,其中与女贞子交集的靶点116个。见图2。
图2 女贞子与DN交集靶点文氏图
2 蛋白互作分析(PPI)筛选关键靶点
将女贞子与DN 的交集靶点导入STRING 数据库中(https://cn.string-db.org/)进行分析,得到PPI图。以连接度值≥2倍中位数为筛选条件,得到关键靶点18个,分别 是STAT3、 JUN、 IL-6、 MAPK1、 RELA、 TNF、TP53、AKT1、IL-10、FOS、EGFR、CAV1、ESR1、IL-1β、CREB1、IL-4、MAPK8、STAT1。见图3。
图3 女贞子与DN的交集靶点蛋白互作图
3 基因本体论(GO)富集分析
将女贞子与DN 的交集基因导入Metascape 数据库中(https://metascape.org/),分别进行生物过程分析(BP)、细胞成分分析(CC)和分子功能分析(MF),根据P 值从小到大排列,每组选择前10 条。见图4。生物过程主要涉及对外界刺激的反应,细胞的运动、代谢等;细胞成分主要是细胞膜区、细胞外基质、囊泡腔等;分子功能主要涉及细胞因子、受体配体结合和调节、转录因子、核受体等。
图4 女贞子-DN交集基因GO富集分析图
4 京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析
使用Metascape 数据库对交集基因进行KEGG 富集分析,按照P 值从小到大排序,选择前20 条可能与女贞子治疗DN 有关的通路。见图5。得到的通路与晚期糖基化终末产物、粥样硬化、白介素-17(IL-17)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、低氧诱导因子-1(HIF-1)等相关。
图5 女贞子作用DN通路图
5 小结
中药女贞子具有治疗肝肾阴虚、内热消渴等证的作用,研究[10]证实其对DN也具有一定的效果。本研究基于网络药理学对女贞子治疗DN 机制作初步探讨,PPI 分析得到女贞子治疗DN的关键靶点18个,其中IL-6、IL-10、IL-4、IL-1β、TNF等因子均能直接参与炎症反应过程,信号传导及转录激活蛋白(STAT)为介导炎症的重要靶点[11],丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、蛋白激酶B(AKT)也被证实与炎症密切相关[12]。GO 富集分析结果显示,生物过程主要体现为对外界刺激的反应、细胞运动等;细胞成分主要与细胞膜和细胞外基质相联系;分子功能体现为各类细胞因子、转录因子等。KEGG 富集分析发现,其中多数与炎症相关,如IL-17 信号通路、TNF 信号通路、Toll 样受体信号通路、NF-κB 信号通路、NOD 样受体信号通路等,均直接、间接引起或促进炎症反应的发生。尤其是NF-κB 信号通路,它参与多种炎症因子和相关蛋白翻译、表达、转录等[13],而与肾脏损伤相关的生长因子、Toll 样受体、NOD 样受体等[14]均可激活NF-κB。研究[15-17]证实,女贞子水提液可以抑制NF-κB 的活化,降低小鼠腹腔巨噬细胞的炎性反应;其所含熊果酸能够降低促炎细胞因子及蛋白激酶α(IKKα)水平,提高NF-κB 抑制蛋白α(IκBα)水平,抑制NF-κB 磷酸化;所含黄酮类物质槲皮素可以抑制NF-κB的翻译和表达,减轻DN大鼠的炎症反应。
综上所述,炎症反应与DN 的发生、发展密切相关,而NF-κB 通路是炎症反应中的关键通路。实验结果提示女贞子可能是通过影响NF-κB通路发挥治疗DN 的功效,为后续的功效和机制研究提供了理论基础。