利用AlphaMissense准确预测蛋白质组的错义突变
2023-12-30赵林
广东药科大学学报 2023年5期
在人类基因组中观察到的绝大多数错义突变具有未知的临床意义。研究人员开发了AlphaMissense,这是一种基于AlphaFold的新AI模型,它在人类和灵长类物种变异群体频率数据库上进行了微调,用于预测错义突变的致病性。通过结合结构背景和进化保守性,AlphaMissense在广泛的遗传和实验性基准测试中实现了最先进的预测,而且完全没有明确地在此类数据上进行过训练。基因的平均致病性分数也可以预测其细胞的重要性,能够识别现有统计方法不足以检测的短的必需基因。作为一种研究社区的资源,科研人员提供了一个囊括所有可能的人类单个氨基酸替换预测的数据库,并将89%的错义变异分为可能良性或可能致病两类。