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沉默lnc-SLC2A12-10∶1抑制人胃癌细胞系AGS增殖、迁移和侵袭

2022-07-11李世宝张好良

基础医学与临床 2022年7期
关键词:小室孔板亲本

刘 磊,李世宝,张好良*

(1.徐州医科大学 生理学教研室,江苏 徐州 221004; 2.徐州医科大学附属医院 检验科,江苏 徐州 221002)

胃癌(gastric cancer)在中国恶性肿瘤中的发病率和病死率均居前列[1],早期胃癌治疗后5年生存率可超过90%,甚至治愈[2],但中国早期胃癌的诊治率低于10%。传统的肿瘤标志物CEA、CA19-9、CA72-4敏感性和特异性均不高,因此,寻找其他非侵入性的生物标志物筛选胃癌是非常必要的。外泌体中包含大量的蛋白质和不同的RNA,它们可以调节受体细胞的行为,并作为疾病的循环生物标志物[3]。既往研究表明肿瘤源性外泌体中长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)含量较高[4],不同lncRNA在肿瘤的进展中可发挥促癌或抑癌的作用[5-8]。

Lnc-SLC2A12-10∶1在基因芯片、胃癌细胞和胃癌患者血清中外泌体中均高表达,提示lnc-SLC2A12-10∶1在胃癌进展中发挥促癌基因的作用[9]。为进一步研究lnc-SLC2A12-10∶1在胃癌中的调控机制,本实验采取lnc-SLC2A12-10∶1基因干扰技术构建lnc-SLC2A12-10∶1沉默的胃癌AGS细胞,探讨lnc-SLC2A12-10∶1对胃癌细胞增殖、迁移和侵袭的作用。

1 材料与方法

1.1 材料

人胃癌细胞系AGS和人胚胎肾上皮细胞系HEK-293T(中国科学院细胞库);DMEM培养基(Gibco公司);胎牛血清(杭州四季青公司);CCK-8试剂盒和Polybrene(徐州维科曼得生物工程有限公司);Transwell小室和Matrigel基质胶(Corning公司);pLVX-shRNA2-Puro vector(湖南科爱医疗器械有限公司);miRNA 引物第一链 cDNA 合成试剂盒和引物(上海生工生物工程技术有限公司)。

1.2 方法

1.2.1 短发夹RNA(short hairpin RNA,shRNA)的设计及制备:针对lnc-SLC2A12-10∶1的靶点,构建shRNA片段序列(表1,shRNA由上海生工生物工程技术有限公司合成)。Oligo片段两两配对,混匀后置于PCR仪中95 ℃, 5 min,室温静置20 min,形成双链Oligo片段,经酶切后连接于载体上构建pLVX-shRNA-Puro。

1.2.2 慢病毒包装:将HEK-293T细胞按2.5×106个/mL的浓度接种于10 cm培养皿中,过夜培养。细胞汇合度在70%~80%开始按操作手册包装病毒。6 h后,更换新鲜DMEM完全培养基。24 h后在荧光显微镜下观察报告基因(ZsGreen1)表达情况,判断感染效率。在48、72和96 h连续3次收集病毒原液。将收集的原液 2 000×g离心5 min,去除细胞碎片,上清经过0.45 μm滤膜过滤。

1.2.3 稳定转染多克隆AGS细胞的筛选:将胃癌AGS细胞按照1×105个/孔接种在6孔板中,第2天细胞汇合度在50%~70%可进行慢病毒感染。每孔加入50 μL慢病毒和1 μL Polybrene混匀,8 h后换成完全培养基。24 h后在倒置荧光显微镜下观察ZsGreen1的表达情况,判断感染效率。感染48 h后换成含0.5 μg/mL嘌呤霉素筛选培养基,继续培养,每日观察,根据细胞状态传代,待细胞感染率达 80% 时结束筛选。按照文献[9]进行RT-qPCR并观察干扰效率。

1.2.4 CCK-8法检测胃癌细胞增殖:96孔板每孔加100 μL细胞悬液,调整细胞浓度至3×104个/mL,置于培养箱培养,每组细胞设置5个复孔。分别在22、46 h更换培养基为CCK-8悬液(100 μL完全培养基+10 μL CCK-8液/孔),置于培养箱作用2 h后,在酶标仪450 nm处检测各孔吸光度(A)值。

1.2.5 划痕实验检测胃癌细胞迁移:将细胞按1×106个/mL铺于6孔板中,待细胞贴壁并增殖满后,弃去培养基,用10 μL枪头进行划痕, PBS清洗3次, 去除划下的细胞,加入1% FBS血清浓度的DMEM培养基,继续培养。 0、24 和48 h分别于相同位置拍照并分析。

表1 Lnc-SLC2A12-10∶1 shRNA片段序列Table 1 Sequences of lnc-SLC2A12-10∶1 shRNA fragment

1.2.6 Transwell小室法检测胃癌细胞迁移:在24孔板中加入完全培养基,放入Transwell小室,小室内加入200 μL细胞悬液,调整细胞为2×105个/mL,培养48 h。取出Transwell小室,弃去孔中培养基,PBS清洗3次,4%多聚甲醛固定20 min,PBS清洗3次,将小室翻转晾干;0.1%结晶紫染液染色20 min,用PBS清洗3次,用棉签轻轻擦掉上室残留细胞。倒置显微镜观察拍照,200倍镜下取孔的上、下、左、右、中5个视野计数细胞,并计算平均值。

1.2.7 Transwell小室法检测胃癌细胞侵袭:提前将Matrigel基质胶放在4 ℃过夜融化。将Transwell放入24孔板,将Matrigel基质胶与预冷的DMEM培养基按1∶5体积稀释,取100 μL稀释胶加入Transwell上室,然后于培养箱中静置3 h,使Matrigel胶凝固。向Transwell上室加入细胞悬液100 μL,下室加入800 μL完全培养基培养48 h。取出Transwell小室,弃去孔中培养基,PBS清洗3次,4%多聚甲醛固定20 min,PBS清洗3次,将小室翻转晾干;0.1%结晶紫染液染色20 min,用PBS清洗3次,用棉签轻轻擦掉上室残留细胞。倒置显微镜观察拍照,200倍镜下取孔的上、下、左、右、中5个视野计数细胞,并计算平均值。

1.2.8 Lnc-SLC2A12-10∶1靶向微小RNA(micro RNA,miRNA)软件预测和荧光定量 PCR 验证:根据lnc-SLC2A12-10∶1序列,用生物信息预测软件(上海伯豪生物科技公司)预测可能的靶向miRNA。使用miRNA 第一链 cDNA 合成试剂盒,按试剂说明书操作,获得miRNA cDNA。再用表2引物序列进行RT-qPCR 验证,以U6为内参,铁蛋白重链1(ferritin heavy chain 1,FTH1)为lnc-SLC2A12-10∶1亲本基因,结果基于2-△△Ct法计算,所有实验重复3次。

1.3 统计学分析

2 结果

2.1 Lnc-SLC2A12-10∶1干扰的胃癌AGS细胞株的建立和鉴定

转染48 h后观察绿色荧光ZsGreen1的表达情况,各组转染效率均在80%以上(图1)。shRNA1、shRNA2、shRNA3(short hairpin RNA)均能有效干扰lnc-SLC2A12-10∶1的表达,shRNA2敲减效果最为明显,因此选择shRNA2组进行下一步实验。

表2 预测miRNA和lnc-SLC2A12-10∶1亲本基因引物

2.2 敲低lnc-SLC2A12-10∶1对AGS细胞增殖的影响

48 和72 h时lnc-SLC2A12-10∶1 shRNA2组较AGS NC组A值明显降低(图2)(P<0.05)。

2.3 沉默lnc-SLC2A12-10∶1对AGS细胞迁移的影响

与对照组细胞比较,沉默lnc-SLC2A12-10∶1后,细胞划痕愈合减慢(图3)(P<0.05),迁移到Transwell下室的细胞量明显减少(图4)(P<0.05)。

2.4 沉默lnc-SLC2A12-10∶1对AGS细胞侵袭的影响

与对照组相比,沉默lnc-SLC2A12-10∶1后AGS细胞的侵袭能力明显减低(图5)(P<0.05)。

2.5 Lnc-SLC2A12-10∶1靶向miRNA荧光定量 PCR 验证

根据软件预测,lnc-SLC2A12-10∶1可能的靶向miRNA是hsa-miR-105-5p、hsa-miR-150-3p、hsa-miR-449b-3p、hsa-miR-588、hsa-miR-1275和hsa-miR-4701-5p。沉默lnc-SLC2A12-10∶1后,lnc-SLC2A12-10∶1的亲本基因FTH1表达增加(P<0.05),同时hsa-miR-105-5p和hsa-miR-150-3p的表达也明显增多(P<0.05)(图6)。

*P<0.05 compared with NC group, scale bar=100 μm图1 不同lnc-SLC2A12-10∶1 shRNA转染AGS细胞后的荧光效果及干扰效率

*P<0.05 compared with NC group图2 CCK-8法检测沉默lnc-SLC2A12-10∶1对AGS细胞增殖的影响Fig 2 Effect of lnc-SLC2A12-10∶1 silencing on proliferation of AGS cells detected by CCK-8

3 讨论

胃癌的形成涉及到原癌基因的激活、抑癌基因的失活以及表观遗传学调控等。近年来,大量研究证实lncRNA在胃癌的发生发展以及介导治疗耐药性等方面中起到重要的作用。Lnc-CTSLP4可抑制胃癌细胞的迁移、侵袭和上皮间质化[10];沉默lncRNA TRPM2-AS可抑制胃癌细胞的增殖、 转移和放射抵抗[11]等。因此,寻找诊断lncRNA标志物及研究其调控机制,为胃癌诊断和治疗提供新的靶点,将具有巨大的临床应用前景和社会效益。

*P<0.05 compared with NC group, scale bar=200 μm图3 划痕实验检测沉默lnc-SLC2A12-10∶1对AGS细胞迁移的影响Fig 3 Effect of lnc-SLC2A12-10∶1 silencing on AGS cell migration detected by wound healing

*P<0.05 compared with NC group, scale bar=200 μm图4 Transwell小室法检测沉默lnc-SLC2A12-10∶1对AGS细胞迁移的影响Fig 4 Effect of lnc-SLC2A12-10∶1 silencing on AGS cell migration detected by Transwell assay n=3)

*P<0.05 compared with NC group, scale bar=200 μm图5 Transwe小室法检测沉默lnc-SLC2A12-10∶1对AGS细胞侵袭的影响Fig 5 Effect of lnc-SLC2A12-10∶1 silencing on AGS cell invasion detected by Transwell assay n=3)

*P<0.05 compared with NC group图6 沉默lnc-SLC2A12-10∶1对预测miRNA和亲本基因的影响Fig 6 Effect of lnc-SLC2A12-10∶1 silencing on predicted miRNA and parental gene

Lnc-SLC2A12-10∶1是新发现的lncRNA,位于6号染色体,含有1个外显子,是lncRNA,全长701 bp。前期研究发现lnc-SLC2A12-10∶1高表达与肿瘤大小、TNM分期、淋巴结转移、分化程度有关[9],但lnc-SLC2A12-10∶1在胃癌中的功能未见报道。本课题组通过设计lnc-SLC2A12-10∶1干扰序列构建沉默细胞株,进行细胞功能实验,结果显示,敲减lnc-SLC2A12-10∶1之后,AGS细胞增殖、侵袭和迁移能力都受到抑制,表明lnc-SLC2A12-10∶1在胃癌细胞中发挥促癌的作用。

LncRNA发挥功能,通常是通过序列特异性和构象结合与DNA、RNA和蛋白质相互作用,发挥支架、诱饵(分子壑或miR吸附)和RNA增强作用[12-13]。检索ensembl数据库发现,lnc-SLC2A12-10∶1属于假基因(pseudogene)铁蛋白重链1假基因26(ferritin heavy chain 1 pseudogene 26,FTH1P26)。假基因转录本最近被证明可以发挥竞争内源性RNA(competitive endogenous RNA,ceRNA)作用吸附miRNA,从而调控亲本基因的表达[14]。通过生物信息预测软件预测,发现lnc-SLC2A12-10∶1可能的靶向miRNA是hsa-miR-105-5p、hsa-miR-150-3p、hsa-miR-449b-3p、hsa-miR-588、hsa-miR-1275和hsa-miR-4701-5p。沉默lnc-SLC2A12- 10∶1后,lnc-SLC2A12-10∶1的亲本基因FTH1表达恢复,同时hsa-miR-105-5p和hsa-miR-150-3p表达也明显增加,提示hsa-miR-105-5p和hsa-miR-150-3p可能是lnc-SLC2A12-10∶1的靶向miRNA,并参与lnc-SLC2A12-10∶1对亲本基因FTH1的调控。

综上,本研究成功构建了lnc-SLC2A12-10∶1沉默的胃癌细胞株。实验初步证实lnc-SLC2A12-10∶1在胃癌细胞中发挥促癌作用,若在肿瘤微环境中进行靶向敲除,理论上将会提高胃癌治疗效果。鉴于lnc-SLC2A12-10∶1在胃癌细胞恶性生物学行为中的重要作用,其具体作用和机制仍需进一步研究。

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