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基于还原石墨烯和硫堇-金纳米粒子复合物的电化学DNA生物传感器的制备

2022-06-17时安琪

关键词:信使探针杂交

董 笑,时安琪,耿 明

(1淮北师范大学 信息学院,安徽 淮北 235000;2安徽师范大学 化学与材料科学学院,安徽 芜湖 241000)

0 引言

随着人类基因组计划研究的蓬勃发展,DNA 生物传感器在基因测序、分子诊断和癌症疾病早期诊断中发挥的作用也越来越大[1-3].电化学DNA 生物传感器的构建一般是通过共价键合或者化学吸附作用,将敏感元件探针DNA 固定到电极表面,通过检测杂交过程产生的电化学信号来实现定量检测目标DNA,具有制备简单、操作方便、灵敏度高且稳定性好的优点.

石墨烯特殊结构使它具有优良电学、光学、力学和热学性质,已经作为一种良好的电化学传感材料,广泛用于传感器的制备中.目前很多课题组已经报道以石墨烯作为修饰电极的DNA生物传感器[4-9].

本实验结合纳米金和石墨烯优点,制备一种以金纳米-石墨烯为传感界面的电化学三明治型DNA生物传感器.最佳实验条件下,该传感器拥有良好的分析性能及宽的线性响应范围(1.00×10-16mol·L-1~1.00×10-9mol·L-1).该传感器有望用于实际样品的分析.

1 实验部分

1.1 试剂与仪器

硫堇(上海国药化学试剂有限公司)、还原石墨烯(rGO)(中科炭纳米科技有限公司)、氯金酸(HauCl4·4H2O)(上海化学试剂有限公司)、二烷基磺酸钠(SDS)(中国天津阿法埃莎化学有限公司)、牛血清白蛋白(BSA,96%-99%)(郑州博赛生物技术股份有限公司)、不同序列的DNA(上海生工生物工程技术服务有限公司中).

CHI60C电化学工作站(上海辰华仪器公司).

扫描电子显微镜(SEM)(日本日立公司,JEOLJSM-4800F).

探针DNA序列:5′-SH-(CH2)6-AAA ACC CTC CTC AAC CCC CT-3′.

信使DNA序列:5′-CCT CTA TAC CAA TTT CCA AAA-(CH2)3-3′.

目标DNA序列:5′-TGG AAA TTG GTA TAG AGG AGG GGG TTG AGG AGG GT-3′.

单碱基错配序列:5′-TGG AAA TTG GTA TAG AGG AGG GGN TTG AGG AGG GT-3′(“N”代表碱基A,C或者T).

完全不互补序列:5′-CAT GGC GGA AGC CGC TAC GTC CCC GGT CTA CAT TC-3′.

用pH7.4的0.01 mol·L-1磷酸缓冲溶液(PBS)配制不同序列的DNA,存于冰箱中待用.实验中DNA杂交时所用溶液为含有0.1 mol·L-1NaCl 的0.01 mol·L-1PBS(pH7.4),电化学检测液为0.10 mol·L-1PBS(pH7.4),实验用水均为重蒸水.

三电极系统:工作电极为玻碳电极或修饰电极(Φ=3 mm),参比电极为饱和甘汞电极(SCE),对电极为铂丝电极;

1.2 金纳米粒子的合成

金纳米粒子(Au NPs)的制备采用柠檬酸三钠还原氯金酸法,具体过程如下:将置于圆底烧瓶中的1 mL氯金酸原液(质量浓度为1 g·100 mL-1)与99 mL去离子水混合液体加热至沸腾,迅速将4 mL新配制的柠檬酸三钠(质量分数为1%)溶液加入至烧瓶中,全程保持搅拌,直至溶液颜色逐渐由紫色变为酒红色.约15 min后停止加热,将溶液冷却至室温,移至棕色广口瓶中存放,置于冰箱中待用.

1.3 信使DNA-硫堇-金纳米粒子复合物的制备

信使DNA-硫堇-金纳米粒子复合物(rDNA-Thi-Au NPs)是根据文献报道的内容稍加修改制备而成[10].将300 μL的信使DNA(1.00×10-5mol·L-1)加入到1.7 mL浓缩后的Au NPs溶液中,保持摩尔比(信使DNA:Au NPs)为150.在冰箱里混合放置24 h后,通过金-硫键的作用信使DNA连接在Au NPs上.然后加入含有0.1 mol·L-1NaCl(pH 7.4)的0.01 mol·L-1PBS缓冲溶液使其“老化”12 h.接着,将200 μL硫堇(0.1 mmol·L-1)加入到上述溶液中,室温下低速搅拌24 h.最后,加入1.0 mL质量分数为1%的BSA溶液用以封闭活性位点.将制备好的复合物在16 000 r/min条件下离心10 min,将上层清液移除,用去离子水反复洗涤3次,最后分散在pH值为7.4的0.01 mol·L-1PBS缓冲溶液中(含0.1 mol·L-1NaCl).

1.4 DNA生物传感器的组装

在制备修饰电极之前,需对玻碳电极进行预处理[11].分别用不同粒度的α-Al2O3对裸玻碳电极抛光处理,然后分别在无水乙醇、丙酮和去离子水中超声5 min,最后在氮气气氛中吹干.

将0.5 mg·mL-1的还原石墨烯在乙醇溶液中进行超声,超声均匀后,滴涂5.0 μL到预处理后的电极表面,室温下晾干,在电极表面形成石墨烯薄膜(rGO).将该电极置于1.0 mg·mL-1HAuCl4/0.10 moL·L-1NaNO3溶液中,-0.20 V条件下恒电位沉积20 s[12],取出后用重蒸水冲洗3次,室温晾干,获得Au NPs-rGO修饰电极.

将5.0 μL浓度为1.00×10-5mol·L-1的探针DNA滴涂到构建的修饰电极表面,4 ℃条件下放置2 h.然后将其浸泡到质量分数为0.1% SDS 溶液中5 min,接着用重蒸水冲洗电极3次,完成探针DNA/金纳米-石墨烯修饰电极(sDNA/Au NPs-rGO/GCE)的制备.

1.5 电化学检测

首先,将不同浓度的目标DNA 先与200 μL 负载到Au NPs 上的信使DNA 在37 ℃杂交液中杂交45 min[13],然后将探针DNA/金纳米-石墨烯修饰电极浸泡到含有目标DNA 与信使DNA 的杂交液中,在37 ℃条件下杂交2 h.之后用质量分数为0.1% SDS 溶液和蒸馏水冲洗电极3 次,除去没有杂交的目标DNA与信使DNA.

采用差示脉冲伏安法(DPV)作为检测手段,检测液为0.10 mol·L-1PBS缓冲液(pH 7.4).通过检测杂交后硫堇产生的电流信号,发现与目标DNA杂交后硫堇的还原峰电流与目标DNA浓度的对数呈现良好的线性关系,进而可实现对目标DNA的定量分析.

2 结果与讨论

2.1 传感器的制备原理

传感器的构建过程如图1所示,还原石墨烯的存在增大电极的比表面积,加快电子的传递能力.纳米金具有优良的光电效应,而且生物相容性好,可以通过金-硫键来固定一端修饰有巯基的探针DNA.同时制备一种信使DNA-硫堇-金纳米粒子复合物,当加入目标DNA时,探针DNA与信使DNA可以和目标DNA分段互补进行杂交反应,形成一种“夹心型”的结构.杂交后,连接在复合物上的硫堇也被修饰到电极表面,硫堇是一种电活性物质,可以产生很强的电信号,并且目标DNA的浓度越大,杂交的信使DNA的数量越多,接上的硫堇的量也越多,通过产生的电信号响应值从而实现对目标DNA的定量检测.

图1 DNA生物传感器的构建原理图

2.2 金纳米粒子-石墨烯/玻碳电极修饰电极的表征

本实验中,扫描电镜(SEM)用来表征修饰电极材料,结果如图2所示.图2A清楚地显示还原石墨烯光滑的褶皱片层结构.当在其表面电沉积金纳米粒子以后,可以看到金纳米粒子大量地分布在电极表面(如图2B所示).

图2 不同修饰电极的扫描电镜图

2.3 实验条件优化

实验中对信使DNA-硫堇-金纳米粒子复合物中加入硫堇量以及杂交时间进行优化,结果如图3 所示.当加入的硫堇(0.01 mmol·L-1)体积从50 μL 增加到200 μL 时,硫堇的电信号响应值是逐渐增大的(保持目标DNA的浓度为一常量),当硫堇体积超过200 μL时电流基本不再变化(如图3A所示),表明硫堇与金纳米粒子的结合量达到饱和.还对DNA 的杂交时间进行考察,从图3B 中可以看出杂交时间从0.5 h变化到2.0 h时,随着杂交时间的增加,硫堇的信号值逐渐增大,2 h后峰电流值基本不再变化,所以选择的最佳杂交时间为2 h.按照文献[14-15],选择的金纳米粒子最佳电沉积时间为20 s.检测液pH 值为7.4,其原因是硫堇的信号强度与pH有关,它的电极反应是一个2电子及2质子的过程.同时,由于DNA在过高及过低的酸度条件下容易变性,因此选择在生理pH条件下进行测试,其pH值选择7.4.

图3 实验条件优化

2.4 分析性能

通过差示脉冲伏安法(DPV)检测传感器的分析性能.如图4A所示,在最佳实验条件下,传感器与不同浓度的目标DNA进行杂交,结果表明检测信号随着DNA浓度的增大而增强,并且在目标DNA浓度为1.00×10-16mol·L-1~1.00×10-9mol·L-1范围内,硫堇的电化学信号与DNA浓度的对数与呈现良好的线性关系(图4B所示),线性回归方程为I(μA)=202.9+11.97 log C(DNA浓度单位是mol·L-1),线性相关系数达到0.998 9,检测限达到3.5×10-17mol·L-1(信噪比为3).说明该生物传感器具有良好的灵敏性.

图4 传感器的分析性能

2.5 选择性

本实验中,还对传感器的选择性进行考察.实验中选择3种单碱基错配DNA、完全错配DNA以及完全互补DNA 序列分别与探针以及信使DNA 进行杂交.杂交后归一化的结果如图5 所示,与单碱基错配DNA 杂交后电流值约是完全互补DNA 序列信号的40%,而完全错配DNA 杂交后信号响应值最小,只有完全互补DNA 信号的6%.表明该生物传感器选择性好,可以很好地区分单碱基错配DNA 与完全互补DNA.

图5 传感器与不同DNA序列杂交后的电流值的归一化图

3 结论

本文构建一种基于金纳米粒子-石墨烯的修饰电极,该修饰电极具有高的比表面以及很好地导电性.同时,制备一种信使DNA-硫堇-金纳米粒子-复合物,通过检测硫堇的电信号值实现对目标DNA的定量分析.该生物传感器制备过程简单,灵敏度较高,选择性好,为其他高灵敏生物传感器的制备提供思路.

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