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长链非编码RNA在胃癌中的作用

2021-12-29郭进军

科学咨询 2021年25期
关键词:负相关靶点标志物

赵 永 郭进军 何 松

(1.重庆医科大学第二临床医学院 重庆 400010;2.重庆市急救医疗中心 重庆 400010;3.重庆医科大学附属第二医院 重庆 400010)

胃癌(GC)指源于胃黏膜上皮细胞的恶性肿瘤,是全球第二常见的癌症相关死亡原因,严重威胁人类健康[1]。由于缺乏有效的临床早期诊断肿瘤分子标志物,大多数胃癌患者确诊时已是中晚期,多数伴有广泛浸润和远处转移,虽然手术切除及放、化疗等多种手段广泛应用于GC治疗,但治疗效果不佳,5年生存率仅约为30%[2][3]。近几十年来,lncRNAs的异常表达已被证明与多种人类癌症(包括胃癌)的发生和发展有关。长非编码RNA(Long Non Coding RNAs,lncRNAs)由于其高度的特异性、易于非侵袭性的可及性以及在不同病理生理条件下的异常表达,作为潜在的诊断或预测生物标志物而备受关注。它们也可能成为治疗胃癌的靶点。因此,探索lncRNAs的特殊功能将有助于更好地理解胃癌的发病机制,并开发新的胃癌治疗方法。本文就lncRNAs在胃癌中的表达和功能进行综述,并分析其作为诊断标记物和治疗靶点的潜在应用。

一、lncRNA简介

随着全基因组分析的快速发展,人们发现大多数基因组被转录的RNA中98%不能被翻译成蛋白,这类不能被翻译成蛋白质的RNA统称为非编码RNA(non-codingRNA,ncRNA)[4][5]。根据ncRNA的大小,人们将它分为两类:一类是长度小于200nt的短链ncRNA,如siRNA,microRNA等;一类是长度大于200nt、缺少有效的开放阅读框或包含高密度的终止子的长链非编码RNA,称为lncRNA。根据lncRNA在基因组的位置,lncRNA可以分为5类[6]:反义lncRNA;内含子非编码RNA;基因间的lncRNA;正义lncRNA;双向lncRNA。在过去,人们认为lncRNA被误认为只具有逆转录功能的“噪声”“垃圾”,但是随着国内外研究的不断深入,很多研究表明lncRNA在生物进程中发挥了很大的作用[6][7][8]。lncRNA的异常表达会导致一些癌基因与抑癌基因的异常表达。因此,lncRNA与肿瘤的发生、发展、转移及预后有关。

二、lncRNA与胃癌发生、发展、转移及预后

(一)lncRNA与胃癌发生、发展

lncRNA H19位于染色体11p15.5上,其高表达与乳腺癌、膀胱癌和宫颈癌等多种肿瘤的增殖和侵袭有关[9][10][11][12][13]。H19也被报道在胃癌中起癌基因的作用,其过表达可能与胃癌的发生有关。Li等[14]研究表明lncRNA H19在胃癌组织中的表达高于正常组织,且与淋巴结转移和临床分期呈正相关。在体外,H19的上调可以促进胃癌细胞的增殖、迁移和侵袭,而H19的下调则导致细胞凋亡[15][16][17]。Zhou[18]等使用逆转录实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测发现了在GC患者中血清外泌体lncRNA H19的表达水平明显高于健康志愿者(P<0.01),并且与术前GC患者的相比,术后GC患者的血清外泌体在术后LNCRNA H19水平显着降低。这些结果提示lncRNA H19可能是一种潜在的具有诊断和预后价值的胃癌生物标志物。

关于H19作为癌基因在胃癌中的潜在作用机制,已有多位研究人员提出了H19作为胃癌致癌基因的潜在功能机制。研究表明ISM1是H19的结合蛋白,其表达与H19的表达呈正相关[19]。CALN1是miR-675的靶基因,其表达与miR-675呈负相关。H19在胃癌中的作用是通过直接上调ISM1和海绵吸附miR-675间接抑制CALN1表达来介导恶性进展。另有研究发现lncRNA H19可以作为竞争性内源RNA起作用,通过在GC细胞中螯合let-7c来调节HER2表达,而Let-7c在癌症中被认为是肿瘤抑制因子[20]。其他研究表明,胃癌组织中H19的表达与miR-141的表达呈负相关。H19可促进胃癌的增殖和侵袭,而miR-141则抑制胃癌的增殖和侵袭。H19和miR-141之间的竞争抑制关系在胃癌的发生发展中起着重要作用[21]。

Linc00152属于基因间的lncRNA,位于染色体2p11.2上,长约828nts长的转录本[22]。Pang等人采用实时定量逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)检测71对胃癌患者癌组织及癌旁正常组织中LINC00152的表达,发现LINC00152在胃癌组织中的表达水平显著高于其配对的正常组织(P=0.045)和正常胃黏膜(P=0.004),LINC00152的高表达与肿瘤的侵袭性相关(P=0.042)[23]。此外,LINC00152的高表达与肿瘤大小、浸润深度及预后呈正相关。Zhao等[24]敲除Linc00152基因会导致细胞增殖抑制,增强细胞周期G1期阻滞,触发晚期凋亡,减少上皮向间充质转化(EMT)程序,并抑制细胞的迁移和侵袭。这些结果提示Linc00152可能是一种致癌的lncRNA,参与胃癌的发生和侵袭性进展。Linc00152有可能成为胃癌诊断和治疗的新生物标志物。

功能分析表明[24],敲除Linc00152基因可以抑制细胞增殖和集落形成,将细胞周期阻滞于G1期,诱导晚期凋亡,抑制上皮向间充质转化(EMT)程序,抑制细胞迁移和侵袭。另一项研究表明,通过敲除LINC00152可以显著抑制胃癌细胞的增殖。此外,Linc00152可以直接与致癌驱动因子表皮生长因子受体(EGFR)结合,从而激活PI3K/AKT信号转导通路,从而促进肿瘤生长,有望成为未来治疗的潜在靶点[25]。Huang等人[26]发现LINC00152与miR-193a-3p呈负相关,miR-193a-3p通过靶向MCL1显著抑制胃癌细胞增殖,抑制肿瘤生长。因此,LINC00152通过LINC00152/miR-193a-3p/MCL1通路发挥其在胃癌发生发展中的生物学效应。

(二)lncRNA与胃癌的转移

生长停滞特异性转录本5(growtharrest-specific5,GAS5)GAS5是一种长约650nts的非编码RNA,最初是在生长停滞期间筛选潜在的肿瘤抑制基因时分离出来的[27]。Gas5在胰腺癌、卵巢癌、骨肉瘤、肾细胞癌、结直肠癌等多种肿瘤中被认为是一种肿瘤抑制因子[28][29][30][31][32][33]。Liu等发现[34]Gas5在胃癌中低表达是一种常见事件,并且在远处转移的组织中以及正常胃上皮细胞系Gas5表达水平明显低于无远处转移的组织及胃癌细胞系中,这表明Gas5可能在胃癌转移中起关键作用。这些结果证实了Gas5在胃癌中表达下调,可能参与了胃癌的转移。也有研究显示GAS5与肿瘤的大小(P=0.008)、分期(P<0.001)、浸润深度(P<0.001)和局部淋巴结转移(P<0.001)呈负相关[35]。

Gas5在胃癌中的表达下调已被普遍证实,但其作用机制尚不清楚。越来越多的证据表明,在肿瘤发生过程中,Gas5可能通过与miRNA结合发挥作用。Li等人[36]发现过表达Gas5可以通过负调控miR-222抑制胃癌细胞的增殖,miR-222被证明是一种致癌的miRNA。Liu等[37]发现lncRNA GAS5与Y-box结合蛋白1(YBX1)相互作用,敲除lncRNA GAS5可加速YBX1蛋白的周转,而不影响YBX1的转录。lncRNA GAS5的下调降低了YBX1蛋白的水平,从而降低了YBX1转录的p21表达,逆转了胃癌G1期细胞周期停滞。同时也证明了lncRNA Gas5/YBX1/p21通路可能为发展以lncRNA为基础的胃癌治疗提供有用的靶点[38]。另有研究发现Gas5的作用可能是通过上调P21蛋白的表达和抑制CDK6介导,抑制胃癌细胞的增殖。

转移相关肺腺癌转录本1(metastasis- associated lung adenocarcinoma transcript 1, MALAT1)是长约800nts的非编码RNA,位于染色体11q13.1上。MALAT1是Ji等人于2003年最初在早期非小细胞肺癌发现的原癌基因之一,Bi等人证实了它促进癌症的增殖、迁移和转移[39][40][41][42]。近年来也有研究提示MALAT1可能作为癌基因在胃癌中发挥作用,高水平的MALAT1可作为胃癌远处转移的潜在生物标志物。Xia等人[43]报道胃癌患者远处转移组织和血浆中的MALAT1水平显著高于无远处转移患者和健康对照组(P<0.01)。此外,COX分析表明MALAT1的高表达与胃癌患者的不良预后正相关(风险比,0.242;95%CI,0.154-0.836;P=0.036)。另一项研究通过分析MALAT1在胃癌组织和配对的非癌组织中的表达水平,也表明了MALAT1表达水平的上调与局部侵袭、淋巴结侵袭、腹膜转移和短总生存期之间的正相关[44][45]。

体外研究证实[46],MALAT1与miR-1297呈负相关,并发挥分子海绵作用,拮抗miR-1297抑制HMGB2表达的能力。这表明MALAT1/miR-1297/HMGB2轴在胃癌发生发展过程中发挥重要调控作用,为胃癌治疗提供了新的靶点。另有研究表明,MALAT1通过与EZH2结合抑制抑癌基因PCDH10的表达,导致胃癌细胞迁移和侵袭[47]。MALAT1还可以作为miR-23b-3p的竞争性内源性RNA,降低其对TG12的抑制作用,而TG12是自噬的重要调节因子[48]。这将促进化疗诱导的胃癌细胞自噬和化疗耐药。这些结果表明,MALAT1可以作为胃癌的治疗靶点。

(三)lncRNA与胃癌的预后

位于染色体14q32.3上的母系表达基因3(MEG3)在多种肿瘤组织和细胞中表达下调[49]。现已证实MEG3基因是一种肿瘤抑制基因,与包括胃癌在内的多种癌症有关。Peng等发现MEG3在胃癌组织中表达下降,并且MEG3在胃癌中的表达水平与pM分期(P<0.01)和pT分期(P<0.01)呈负相关,与患者性别、年龄、静脉浸润、肿瘤位置、borrmann分型、T分期和pN分期等临床病理特征无显著差异。此研究还表明,MEG3的表达与肿瘤大小呈负相关,与胃癌患者的总体生存率呈正相关。越来越多的研究表明,MEG3的过表达可以抑制胃癌的增殖和转移,并且与肿瘤的深层侵袭、晚期转移和不良预后密切相关。

研究表明,lncRNA可能通过与miRNAs相互作用,促进信号通路,在胃癌的发生发展中发挥重要作用。MEG3在胃癌患者和细胞系中降低,其表达与转移性胃癌相关,MEG3可通过miR-181a上的竞争内源性RNA(CeRNA)活性上调Bcl-2的表达,从而抑制了细胞增殖、迁移、侵袭,促进了细胞凋亡。miR-770及其宿主基因MEG3可能发挥抑癌作用,近端启动子和增强子区域的高甲基化可能是MEG3和miR-770失活在GC发展中的关键机制之一。MEG3和miR-770可作为预测GCA患者预后的潜在生物标志物。故MEG3可以作为竞争的内源性RNA,吞噬不同的miRNAs,从而调节胃癌的恶性行为。另有研究表明,MEG3过表达促进了胃癌细胞系p53的表达,提示MEG3可能通过p53依赖的转录途径抑制胃癌的增殖和转移。

lncRNA UCA1位于19q11,长约1.4kb。研究人员首次在膀胱癌中发现了尿路上皮癌相关基因1(UCA1)。UCA1随后被证明是一个致癌的长非编码RNA。近年来,UCA1一直被证实在胃癌的发病机制中发挥重要作用。在之前的一项研究结果显示UCA1在胃癌组织中的表达水平明显高于癌旁正常组织,并且与健康对照组相比,GC患者的血浆UCA1表达明显上调(p<0.0001),手术后血浆中的表达水平(AUC=0.883)较术前显着降低(p<0.01),下调UCA1会抑制GC细胞增殖,迁移和凋亡。研究人员进一步的临床病理分析显示,UCA1的表达水平与肿瘤大小、浸润深度、TNM分期和总体生存不良呈正相关。

功能研究表明,UCA1的表达可以促进胃癌细胞的增殖、集落形成和侵袭,而沉默UCA1则抑制肿瘤的生长。Cao等人通过改变人胃癌细胞中UCA1和miR-495的表达来评价细胞的体外活性以及体内的腹膜转移和成瘤能力。UCA1作为miR-495的一个ceRNA,可以通过上调PRL-3来加速胃癌的发展,促进胃癌细胞的增殖、迁移和侵袭,同时抑制细胞凋亡,促进了胃癌细胞的腹膜转移和成瘤。同时,上调miR-495的表达可以逆转UCA1的促进作用。这为胃癌的靶向干预治疗提供了一个有潜力的基础。另一项研究表明,抑制UCA1可降低子宫内膜异位症相关蛋白水平,转化生长因子β-1(TGF-β-1)可部分逆转这种作用。推测在转化生长因子β-1诱导下,Uca-1可能促进胃癌的增殖、侵袭和转移。Gu等人发现UCA1可能通过负调控miR-590-3p的表达和激活其下游靶标CREB1的表达来发挥作用。UCA1/miR590-3p/CREB1可能成为治疗胃癌的潜在靶点。

除了上述已被充分证实的lncRNAs外,许多其他lncRNAs在胃癌中起着重要的病理作用。比如LincRNA00978、HULC、ANRIL、FendrR等lncRNAs,LincRNA00978在胃癌组织和血浆中升高,通过激活转化生长因子β/smad2/MMP9通路诱导内膜转化。在肝癌中HULC高表达的lncRNAs也通过加速胃癌细胞的EMT而促进肿瘤细胞的迁移。ANRIL是位于INK4基因区的反义lncRNA。已有研究表明ANRIL在胃癌中过表达,并与肿瘤大小、TNM分期和生存率下降呈正相关。ANRIL通过mTOR和CDK6/E2F1途径调控miR-99a/miR-449a,从而调控胃癌的发生发展。FendrR是在肿瘤发生中起重要作用的lncRNA之一。研究人员已经证明了Fendrr的下调及其与浸润深度、淋巴结转移和患者预后不良的相关性。这表明,lncRNA在胃癌发生、发展等过程中具有重要作用。

三、问题及展望

因此,筛选和识别潜在的用于预后、监测和评估患者治疗反应的早期生物标志物,有助于改善胃癌患者的预后及生存质量。lncRNA作为重要的基因表达调控因子,通过细胞增殖、细胞周期、细胞凋亡、细胞分化、细胞迁移、侵袭等多种过程,在肿瘤细胞的生物学功能中发挥着明显不同的功能作用。全基因组测序技术已经成为一项重要的技术,并报道了大量新发现的lncRNA,这表明lncRNA在胃癌预后和诊断中的应用前景广阔。然而,我们目前对lncRNA与胃癌的关系的了解仍然有限。因此,需要更多的研究来更好地了解lncRNA及其在胃癌中的作用机制。

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