基因间长链非编码RNA00963 通过靶向miRNA-511-3p 调控胰腺癌细胞增殖、迁移和侵袭的分子机制研究
2021-09-15邹永妮杨健武君华
邹永妮,杨健,武君华
1西安天博医学检验实验室实验中心,西安 710018
2空军军医大学唐都医院血液内科,西安 710038
3西安市中心血站白细胞研究室,西安 710000
近年来胰腺癌的发病率和病死率不断升高,在过去的几十年中,胰腺癌患者的5 年生存率几乎没有变化,且胰腺癌的诊断和治疗仍然是一个巨大的挑战,生物标志物的应用有助于确定治疗方法,也为改善预后提供了机会。因此,探索胰腺癌的发展机制和新的治疗靶点具有重要意义。微小RNA(microRNA,miRNA)和长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)等非编码RNA均在肿瘤细胞的增殖、凋亡、侵袭和远处转移方面发挥重要的调节作用,其可用于胰腺癌的诊断和治疗,在临床中具有广阔的应用前景。研究报道,基因间长链非编码RNA00963(long intergenic non-protein coding RNA 963,LINC00963)在食管癌组织中的表达显著增加,且与食管癌的淋巴结转移、TNM 分期及不良预后有关;敲低LINC00963 的表达可抑制食管癌细胞增殖、体外侵袭及体内肿瘤生长。LINC00963表达升高与患者的预后不良有关,其可通过抑制miRNA-204-3p/纤连蛋白1(fibronectin 1,FN1)通路促进骨肉瘤的增殖和侵袭。LINC00963 通过使肿瘤抑制因子miRNA-542-3p 海绵化促进核仁蛋白2(nucleolar protein 2,NOP2)表达,从而促进前列腺癌的转移。然而LINC00963 对胰腺癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响及调控机制尚不清楚。在前列腺癌细胞系和人前列腺癌中,miRNA-511-3p 表达显著下调,慢病毒诱导的miRNA-511-3p 表达上调可抑制肿瘤细胞的增殖和迁移。研究表明,LINC02163 可通过抑制miRNA-511-3p 的表达促进结直肠癌的进展。然而LINC00963是否通过调控miRNA-511-3p 影响胰腺癌进展目前尚不清楚。因此,本研究旨在探讨LINC00963 对胰腺癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响及其调控机制是否与miRNA-511-3p有关,现报道如下。
1 材料与方法
1.1 材料
正常胰腺上皮细胞hTERT-HPNE 和胰腺癌细胞系Capan-1、SW1990 均购自深圳市豪地华拓生物科技有限公司,胰腺癌细胞系PaTu8988 购自上海雅吉生物科技有限公司。RPMI-1640 培养基购自上海高创化学科技有限公司,荧光定量试剂盒购自北京达科为生物技术有限公司,RIPA 蛋白裂解液购自北京百奥莱博科技有限公司,二喹啉甲酸(bicinchoninic acid,BCA)试剂盒购自北京凯瑞基生物科技有限公司,细胞计数试剂盒8(cell counting kit-8,CCK-8)购自上海易汇生物科技有限公司,Transwell 小室和Matrigel 均购自上海子起生物科技有限公司,双荧光素酶报告基因检测试剂盒购自南京诺唯赞生物科技有限公司。
1.2 细胞处理与分组
应用RPMI-1640 培养基常规培养正常胰腺上皮细胞hTERT-HPNE 和胰腺癌细胞系Capan-1、SW1990、PaTu8988,分别将si-NC、si-LINC00963、pcDNA-NC、pcDNA-LINC00963、miRNA-NC、miRNA-511-3p、anti-miRNA-NC、anti-miRNA-511-3p 转染至Capan-1 细胞中,记为si-NC 组、si-LINC00963组、pcDNA-NC 组、pcDNA-LINC00963 组、miRNANC 组、miRNA-511-3p 组、anti-miRNA-NC 组、antimiRNA-511-3p 组;分 别 将si-LINC00963 与antimiRNA-NC、anti-miRNA-511-3p 共转染至Capan-1细胞中,记为si-LINC00963+anti-miRNA-NC 组、si-LINC00963+anti-miRNA-511-3p 组;正常培养的细胞作为NC 组。
1.3 实时荧光定量聚合酶链反应检测LINC00963和miRNA-511-3p 的表达水平
提取细胞总RNA,反转录成cDNA,按照试剂盒说明书进行聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR),反应条件:95 ℃2 min;95 ℃15 s,60 ℃30 s,72 ℃30 s,共40 个循环。LINC00963 和miRNA-511-3p 分别以甘油醛-3-磷酸脱氢酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)和U6
基因为内参。LINC00963 上游引物序列为5'-GGTAAATCGAGGCCCAGAGAT-3',下游引物序列为5'-ACGTGGATGACAGCGTGTGA-3';GAPDH
上游引物序列为5'- CATGAGAAGTATGACAACAGCCT-3',下游引物序列为5'-AGTCCTTCCACGATACCAAAGT-3';miRNA-511-3p 上游引物序列为5'-AGACAGAAAACGATGTGTAA-3',下游引物序列为5'-CAGTGCGTGTCGTGGAGT-3';U6
上游引物序列为5'-CGCTTCGGCAGCACATATACTA-3',下游引物序列为5'-CGCTTCACGAATTTGCGTGTCA-3';引物均由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。采用2法计算LINC00963 和miRNA-511-3p 相对表达量。1.4 蛋白质印迹(Western blot)法检测细胞周期蛋白D1(cyclin D1)、基质金属蛋白酶(matrix metalloproteinase,MMP)2、MMP9 的表达水平
提取总蛋白,采用BCA 试剂盒定量,将蛋白样品进行聚丙烯酰胺凝胶电泳,然后转膜、脱脂奶粉封闭,再分别加入一抗和二抗孵育,采用电化学发光液显影,成像后应用Quantity One 软件测定蛋白条带灰度值,以β-肌动蛋白(β-actin)为内参计算cyclin D1、MMP2、MMP9 相对表达量。
1.5 CCK-8 检测细胞增殖
将1.2 中的各组Capan-1 细胞培养24 h 后,添加10 μl CCK-8 溶液,孵育2 h,应用SpectraMax M5酶标仪检测450 nm 处的光密度(A)值,以A 值代表细胞活性。
1.6 Transwell 实验检测细胞迁移和侵袭
取1.2 中各组对数生长期细胞,采用无血清培养液重悬细胞。细胞迁移实验:将200 μl Capan-1细胞悬液和600 μl RPMI-1640 完全培养液分别加入至Transwell 小室的上室和下室,培养24 h 后应用多聚甲醛固定,并采用结晶紫染色,显微镜下观察并拍照,计算迁移细胞数目。细胞侵袭实验:采用Matrigel 包被Transwell 小室的上室,之后的操作与细胞迁移实验相同。
1.7 双荧光素酶报告实验检测LINC00963 和miRNA-511-3p 的靶向调控关系
构建含有miRNA- 511- 3p 结合位点的LINC00963 野生型及突变型报告基因载体,在Capan- 1 细 胞 中 转 染miRNA- 511- 3p mimics 和LINC00963 野生型及突变型报告基因载体,按照说明书检测荧光素酶活性。
1.8 统计学分析
2 结果
2.1 正常胰腺上皮细胞和胰腺癌细胞系中LINC00963 和miRNA-511-3p 相对表达量的比较
胰腺癌细胞系Capan-1、SW1990、PaTu8988 中LINC00963 相对表达量均高于正常胰腺上皮细胞hTERT-HPNE,miRNA-511-3p 相对表达量均低于正常胰腺上皮细胞hTERT-HPNE,差异均有统计学意义(P
﹤0.05)。(表1)表1 不同细胞系中LINC00963 和miRNA-511-3p 相对表达量的比较(±s)
2.2 LINC00963 低表达对Capan-1 细胞增殖、迁移和侵袭的影响
NC 组、si-NC 组、si-LINC00963 组Capan-1 细胞中LINC00963、cyclin D1、MMP2、MMP9 相对表达量及A 值、细胞迁移数目、细胞侵袭数目比较,差异均有统计学意义(P
﹤0.01)。si-LINC00963 组Capan-1 细 胞 中LINC00963、cyclin D1、MMP2、MMP9 相对表达量均低于si-NC 组,细胞活性(A值)低于si-NC 组,细胞迁移和侵袭数目均少于si-NC 组,差异均有统计学意义(P
﹤0.05)。(图1、图2、表2)图1 Western blot检测NC组、si-NC组、si-LINC00963组Capan-1细胞中cyclin D1、MMP2、MMP9蛋白表达情况
图2 Transwell实验检测NC组、si-NC组、si-LINC00963组Capan-1细胞的迁移和侵袭能力(结晶紫染色,×200)
表2 NC 组、si-NC 组、si-LINC00963 组Capan-1 细胞中LINC00963、cyclin D1、MMP2、MMP9 相对表达量及细胞增殖、迁移和侵袭情况的比较(±s)
2.3 miRNA-511-3p 高表达对Capan-1 细胞增殖、迁移和侵袭的影响
miRNA-511-3p 组中miRNA-511-3p 相对表达量 明 显 高 于miRNA-NC 组,cyclin D1、MMP2、MMP9 相对表达量均明显低于miRNA-NC 组,A 值明显低于miRNA-NC 组,细胞迁移和侵袭数目均明显少于miRNA-NC 组,差异均有统计学意义(P
﹤0.01)。(表3、图3、图4)图3 Western blot检测miRNA-NC组、miRNA-511-3p组Capan-1细胞中cyclin D1、MMP2、MMP9蛋白表达情况
图4 Transwell实验检测miRNA-NC组、miRNA-511-3p组Capan-1细胞的迁移和侵袭能力(结晶紫染色,×200)
表3 miRNA-NC 组和miRNA-511-3p 组Capan-1 细胞中miRNA-511-3p、cyclin D1、MMP2、MMP9 相对表达量及细胞增殖、迁移和侵袭情况的比较(±s)
2.4 LINC00963 靶向调控miRNA-511-3p 的表达
Starbase 预测显示LINC00963 和miRNA-511-3P 具 有 结 合 位 点(图5)。miRNA-511-3p 与LINC00963 野生型报告质粒共转染后Capan-1 细胞的荧光素酶活性明显低于miRNA- NC 与LINC00963 野生型报告质粒共转染后的Capan-1 细胞,差异有统计学意义(P
﹤0.01),而miRNA-511-3p或miRNA-NC 与LINC00963 突变型报告质粒共转染后的细胞荧光素酶活性比较,差异无统计学意义(P
﹥0.05)(表4)。si-LINC00963 组中miRNA-511- 3p 相对表达量高于si- NC 组,pcDNALINC00963组中miRNA-511-3p相对表达量低于pcDNA-NC组,差异均有统计学意义(P
﹤0.05)(表5)。图5 Starbase对LINC00963和miRNA-511-3p结合位点进行预测的示意图
表4 miRNA-NC 或miRNA-511-3p 与LINC00963 野生型及突变型报告质粒共转染Capan-1 细胞后双荧光素酶活性的比较(±s)
表5 不同组别Capan-1 细胞中miRNA-511-3p 相对表达量的比较(±s)
2.5 miRNA-511-3p 低表达可以逆转LINC00963低表达对Capan-1 细胞增殖、迁移和侵袭的影响
anti-miRNA-511-3p 组中miRNA-511-3p 相对表达量低于anti-miRNA-NC 组,cyclin D1、MMP2、MMP9 相对表达量均高于anti-miRNA-NC 组,A 值高于anti-miRNA-NC 组,细胞迁移和侵袭数目均多于anti-miRNA-NC 组,差异均有统计学意义(P
﹤0.05);si-LINC00963+anti-miRNA-511-3p 组中miRNA-511-3p 相对表达量低于si-LINC00963+antimiRNA-NC 组,cyclin D1、MMP2、MMP9 相对表达量均高于si-LINC00963+anti-miRNA-NC 组,A 值高于si-LINC00963+anti-miRNA-NC组,细胞迁移和侵袭数目均多于si-LINC00963+anti-miRNA-NC组,差异均有统计学意义(P
﹤0.05)。(图6、图7、表6)表6 anti-miRNA-NC组、anti-miRNA-511-3p组、si-LINC00963+anti-miRNA-NC组、si-LINC00963+anti-miRNA-511-3p组Capan-1细胞中miRNA-511-3p、cyclin D1、MMP2、MMP9 相对表达量及细胞增殖、迁移和侵袭情况的比较(±s)
图6 Western blot检测anti-miRNA-NC组、anti-miRNA-511-3p组、si-LINC00963+anti-miRNA-NC、si-LINC00963+anti-miRNA-511-3p组Capan-1细胞中cyclin D1、MMP2、MMP9蛋白表达情况
图7 Transwell实验检测anti-miRNA-NC组、anti-miRNA-511-3p组、si-LINC00963+anti-miRNA-NC组、si-LINC00963+antimiRNA-511-3p组Capan-1细胞的迁移和侵袭能力(结晶紫染色,×200)
3 讨论
胰腺癌是恶性程度最高的消化道肿瘤,具有发病症状不明显、早期诊断困难、进展迅速以及预后差等特点,且发病率呈逐年上升趋势,近年来分子靶向治疗在胰腺癌的治疗领域取得了一定进展,靶向治疗已成为治疗胰腺癌的新方法。研究表明,lncRNA 可参与胰腺癌的发生、发展和转移等生物学过程。研究报道,LINC00963 在乳腺癌组织中过表达,且与淋巴结转移、TNM 分期和分化程度有关;沉默LINC00963 的表达可通过调控miRNA-625-高迁移率族蛋白A1(high mobility group protein A1,HMGA1)抑制乳腺癌细胞的增殖、迁移和侵袭,并促进体外细胞凋亡。LINC00963 通过激活磷脂酰肌醇3 激酶(phosphatidylinositol 3-hydroxy kinase,PI3K)/蛋白激酶B(protein kinase B,PKB,又称AKT)途径促进肝癌细胞的增殖。LINC00963 通过miRNA-124-3p/卷曲蛋白受体4(frizzled class receptor 4,FZD4)途径促进结直肠癌的增殖和迁移。LINC00963 还能够通过miRNA-608/伏隔核蛋白1(nucleus accumbens associated 1,NACC1)途径促进黑色素瘤的进展,并且能够预测不良预后。以上研究表明,LINC00963 在多种恶性肿瘤中发挥促癌作用。本研究结果显示,与正常胰腺上皮细胞hTERT-HPNE 比较,胰腺癌细胞系Capan-1、SW1990、PaTu8988 中LINC00963 表达水平升高,表明LINC00963 在胰腺癌中也可能发挥促癌作用。本研究结果还显示,降低LINC00963 的表达水平后,cyclin D1、MMP2、MMP9 表达水平均降低,细胞活性降低,细胞迁移和侵袭数目均减少,表明LINC00963 低表达可以抑制胰腺癌细胞增殖、迁移和侵袭。
研究表明,lncRNA 可通过调控miRNA 海绵化影响恶性肿瘤进展,如ZFPM2 反义RNA 1(ZFPM2 antisense RNA 1,ZFPM2-AS1)可通过调控miRNA-511-3p 参与肺腺癌细胞的增殖和迁移过程。ZFPM2-AS1 还能够通过调控miRNA-511-3p 影响宫颈癌的恶性程度。另有研究表明,LINC02163 能够通过调节miRNA-511-3p 的表达加速乳腺癌的恶性肿瘤行为。本研究结果显示,胰腺癌细胞系中miRNA-511-3p 低表达,提高miRNA-511-3p 的表达水平可抑制胰腺癌细胞增殖、迁移和侵袭。此外,LINC00963 能够靶向调控miRNA-511-3p,miRNA-511-3p 低表达可以逆转LINC00963 低表达对Capan-1 细胞增殖、迁移和侵袭的影响。
综上所述,低表达LINC00963通过靶向上调miRNA-511-3p的表达抑制胰腺癌细胞增殖、迁移和侵袭。