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基于表面等离子体共振技术筛选与转录因子AP-2γ具有高亲和力的小分子化合物

2021-09-03赖丹宁张逸菲王培鑫林少玲胡嘉淼

食品与药品 2021年4期
关键词:响应值样点亲和力

赖丹宁,张逸菲,王培鑫,林少玲,胡嘉淼*

(1. 闽台特色海洋食品加工及营养健康教育部工程研究中心,福建 福州 350002;2. 福建农林大学 食品科学学院,福建 福州 350002)

表面等离子体共振(surface plasmon resonance,SPR)是一种无标记的生物分析技术,常用于检测金属/介电界面上的生物分子相互作用[1-2]。它可用于鉴定并量化分子相互作用,如蛋白质-核酸、蛋白质-蛋白质、蛋白质-小分子化合物等相互作用的结合亲和力[3-6]。AP-2γ转录因子属激活蛋白2转录因子家族。该家族由4个不同的成员组成,分别为AP-2α,AP-2β,AP-2γ及后来发现的AP-2δ[7]。目前研究表明,该家族所有成员都有一个独特的介导蛋白质二聚化的螺旋-环-螺旋(helix-span-helix)结构;而N端富含脯氨酸和谷氨酰胺的区域介导转录激活[8]。许多研究表明,恶性肿瘤与AP-2γ蛋白的过量表达及活性异常有关[9-12]。因此,寻找可有效抑制AP-2γ活性的小分子化合物被认为是潜在的肿瘤药物开发策略。

本文采用SPR技术筛选美国食品药品监督管理局(Food and Drug Administration,FDA)批准的药物分子库中,同AP-2γ蛋白存在高亲和力的小分子化合物,并测定样品间相互作用的动力学常数,以期为新型抗肿瘤药物的开发提供依据。

1 仪器与材料

1.1 仪器

PlexArray®HT生物分子相互作用分析仪(美国Plexera公司)。

1.2 材料

AP-2γ蛋白(DetaiBio公司,纯度>90 %);DA1018药物芯片(美国Plexera公司),芯片上打印有FDA批准的1018种小分子化合物及阴性对照二甲亚砜(DMSO)、阳性对照雷帕霉素(rapamycin);DMSO(北京索莱宝);丙三醇(国药集团);甘氨酸(北京索莱宝);1×PBS(pH 7.4,北京索莱宝)。

2 方法

2.1 流通相及固定相的制备

选择FDA 分子库的 1018 种小分子作为固定相,由厂家预先通过3D光交联方式打印于SPR芯片表面;流通相选择AP-2γ蛋白溶液,使用前将AP-2γ蛋白原液用1×PBS(pH 7.4)及10 %丙三醇缓冲液稀释成3 个浓度梯度(5 0 0,2 5 0,1 2 5 nmol/L)。

2.2 SPR实时动力学分析

用生物分子相互作用分析仪加载打印有目标分子的芯片,随后加载不同浓度梯度(500,250,125 nmol/L)的AP-2γ蛋白样品各 650 μl,流速为2 μl/s,结合时间为300 s,解离时间为300 s。用盐酸甘氨酸(pH 2.0)溶液作为重生液。所得的3次数据通过Plexera SPRi 系统计算并获得平均值。

3 结果

3.1 系统基线建立及芯片质量验证

首先以100 nmol/L 的FK506结合蛋白12(FK506-binding protein of 12 kD)作为流通相检验芯片质量,结果见图1。由图1可知,FK506结合蛋白12与阴性对照DMSO基本无相互作用,信号基本同系统背景的基线信号相仿;而FK506结合蛋白12与已知的配体雷帕霉素(阳性对照)迅速结合产生信号,响应值迅速升高,并在约300 s后达到饱和,响应值趋于稳定。提示该芯片质量检测合格、SPR系统工作正常。

图1 阴阳性样点信号对照

3.2 FDA批准的1018种药物与AP-2γ蛋白的相互作用

通过高通量SPR技术成功地从FDA批准的1018种药物中筛选出了80种能与目标AP-2γ蛋白特异性结合的药物分子(见表2)。流通相AP-2γ蛋白溶液流过芯片过程中,与芯片上80个结合样点发生结合所生成的响应值见图2。

根据图2,截取600~700 s时间段内的响应值,分别求平均值,可得AP-2γ蛋白(500 nmol/L)与芯片上结合样点的解离稳定阶段的最大响应值(RUmax)。如图3所示,AP-2γ蛋白与S4190(辛可芬,cinchophen)相互作用的解离稳定阶段的RUmax最大,其次是S3105(那氟沙星,nadifloxacin)、S1761(舒洛芬,suprofen)和S4166 (氯磺丙脲,chlorpropamide)。

图2 500 nmol/L AP-2γ与芯片上结合样点的结合情况

图3 AP-2γ 蛋白(500 nmol/L)与芯片上的结合样点的平均最大信号

3.3 样品与AP-2γ蛋白结合情况的验证

将不同浓度的AP-2γ蛋白(500,250,125 nmol/L)流过芯片,分别测定其响应值变化曲线,见图4。由图4可见,相互作用所呈现的响应值曲线均符合结合-解离循环的特征,即SPR测定结果表明测定信号响应值均呈稳定、上升、稳定、小幅下降、稳定趋势。这是由于前100 s时,仪器管道中只有缓冲液,故信号保持稳定、平坦;100 s后仪器开始进样蛋白流通相,溶液中蛋白浓度突然上升,样点上开始逐渐结合蛋白,此时实时检测信号开始上升;流通相流通一定时间后,AP-2γ蛋白与芯片上结合样点结合至饱和状态,故实时检测信号到达峰值,曲线大致维持平稳;约300 s开始,缓冲液流通进芯片,将未结合的蛋白洗脱下来,实时检测信号变弱,检测信号开始不断下降,此为解离阶段;解离完成后,信号曲线趋于平稳[13]。此外,随着流通相浓度的增加,特异性结合信号逐渐增强。

图4 AP-2γ与样品S4190(a),S3105(b), S1761(c)和S4166(d)的浓度梯度结合曲线

3.4 动力学数据分析

FDA批准的药物分子库中,能与AP-2γ蛋白特异性结合的小分子共有80种。通过对这80种小分子与AP-2γ蛋白的亲和力常数(KD)进行计算,可发现KD集中在10-9~10-7mol/L左右,证实测得特异性结合能力强,见表1。

表1 目标药物与AP-2γ蛋白结合的动力学、亲和力

表1(续)

进一步以10为底,对FDA批准的药物分子库样品与AP-2γ蛋白的结合常数平均结合速率常数(Avg Kon),平均解离速率常数(Avg Koff)取对数进行分析,可得结合能力动力学分布图(见图5),可见这80种小分子与AP-2γ蛋白的特异性结合绝大部分都在类型一、三区域内,结合都是稳定的。

图5 80种小分子化合物与AP-2γ蛋白的结合能力动力学分布图

4 讨论

SPR技术灵敏度高,特异性强,能实现高通量检测,并可实时监测化学生物反应过程,为抗肿瘤药物开发提供了有力的研究工具。本研究中,我们采用了SPR技术对抗肿瘤的潜在药物进行筛选。在FDA批准的1018种药物中,我们确定了80种与AP-2γ蛋白具有较高的亲和力、有可能应用于肿瘤治疗的潜在药物。其中,氯磺丙脲(chlorpropamide)对AP-2γ蛋白的亲和力最强,其次是甲溴辛托品(anisotropine methylbromide)、维生素D3 (Vitamin D3)、扎托布洛芬(zaltoprofen)、羟萘酸苄酚宁(bephenium hydroxynaphthoate)、吡硫翁锌(pyrithione zinc,PYZ)、阿西美辛(acemetacin、雷米普利(ramipril)、阿昔洛韦(acyclovir)、那氟沙星(nadifloxacin)等。

其中值得关注的如维生素D3在癌症的发病机制和过程中的重要性已通过体外研究、动物研究及流行病学研究得到证实。Amir等[14]报道乳腺癌骨转移患者每天服用10 000 IU维生素D3和1000 mg钙补剂能显著减少疼痛部位的数量。Fife等[15]发现维生素D3能显著抑制雌激素受体阴性、孕激素受体阴性的人乳腺癌细胞系MDA-MB-435、人前列腺癌细胞系LNCaP和人骨肉瘤细胞系U2OS的体外增殖。Swami等[16]研究发现,与对照组(饲料含1000 IU/kg维生素D3)相比,在4周维生素D3补充饮食(饲料含5000 IU/kg维生素D3)后,携带MCF-7乳腺癌异种移植瘤的免疫功能受损小鼠的肿瘤显著缩小(>50 %)。Marshall等[17]研究发现每天补充4000 IU维生素D3可降低低风险前列腺癌患者重复活检阳性率。此外,在一些研究中,维生素D代谢物(25-羟基维生素D)水平较低被证实与乳腺癌预后不良有关[14]。

吡硫翁锌(pyrithione zinc,PYZ)是一种锌的配位复合物,被FDA批准为非处方局部抗菌药物,用于治疗银屑病和B波段紫外线(ultraviolet radiation B,UVB)诱导的表皮增生[18]。近年多项研究表明,PYZ在癌症干预方面具有应用潜力。Srivastava等[18]研究发现PYZ可有效降低口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)细胞的集落形成、迁移和侵袭的能力;其机制主要涉及PYZ引起OSCC细胞中PI3K/AKT/mTOR和WNT/b-catenin等信号通路的改变,降低了14-3-3z、14-3-3s、cyclin D1、c-Myc、丙酮酸激酶M2(pyruvate kinase M2)等蛋白的表达。此外,PYZ治疗还被证实可显著减少免疫受损NOD/SCID/Crl小鼠的移植成瘤体积,而不会对正常组织造成明显的毒性。项航[19]研究发现PYZ可在胃癌细胞中通过改变溶酶体膜通透性抑制自我保护性自噬,还可抑制异种皮下移植瘤的生长。Tailler等[20]在FDA批准的1040种药物中发现PYZ和哇巴因(ouabain,OUA)是潜在的抗白血病药物,PYZ和OUA均能有效诱导急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)细胞凋亡,诱导凋亡染色质凝聚和抑制核因子-κB存活信号(nuclear factor-κB survival signaling),导致抗凋亡蛋白表达减少。

氯磺丙脲、甲溴辛托品、扎托布洛芬等药物目前虽然还没有应用于癌症治疗的相关报导,但相比其他药物,它们具有与AP-2γ蛋白亲和力高、结合稳定等优势,仍具有很大的发展成为抗癌药物的潜力。本文从现有的已被FDA批准的1018种药物中寻找能AP-2γ蛋白特异性结合,并具有较高亲和力的药物,可有效减少研究周期,便于药物更快地服务于临床。

5 结论

综上,本文利用高通量SPR技术,从FDA批准的药物库筛选出能与AP-2γ蛋白产生特异性结合的80种小分子药物,并得到了相应的动力学常数。在后续的研究中,需对AP-2γ蛋白与目标样品的结合情况进行挑选验证,可结合解离稳定阶段的平均最大信号值RUmax及各结合样点的亲和力来挑选结合信号强、亲和力大的药物进行相关验证试验。

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