唐山市苯丙酮尿症患儿筛查及PAH基因突变情况分析
2020-10-23鲁程绯郭志义鲁弼嘉李小倩刘佳玮
鲁程绯,郭志义△,鲁弼嘉,李小倩,刘佳玮
苯丙酮尿症(phenylketonuria,PKU)是一种常见的新生儿氨基酸代谢障碍性疾病,属于常染色体隐性遗传疾病[1]。其发病机制主要是苯丙氨酸(phenylalanine,PA)代谢途中的苯丙氨酸羟化酶(phenylalanine hydroxylase,PAH)基因突变导致肝脏PAH缺乏或活性降低,使PA不能正常转化为酪氨酸而引发的代谢性疾病[2-3]。其主要临床表现为发育迟缓、精神亢进、智力低下等,极大地影响了患者的生理健康[4]。PKU可根据其血中PA浓度分为经典型和非经典型两种,其中经典型占PKU患者总数的90%[5]。由于PAH在不同种族和地区发生的基因突变存在差异,各个国家和地区均有其突变特点。据统计,我国PKU发病率约为1/11 000,且绝大部分患者由PAH基因突变引发[6-7]。PAH是一种具有催化活性的四聚体,可催化人体肝脏中的PA转化成酪氨酸,其编码基因由13个外显子(Exon)和12个内含子构成[8-9]。PKU前期症状不明显,容易被忽略。因此,在出生后需通过前期筛查预防性治疗才能避免病情恶化。本研究通过分析唐山市近4年来PKU患儿筛查结果,探讨新生儿PAH基因突变的情况。
1 对象与方法
1.1研究对象 收集2015年1月—2018年12月唐山市妇幼保健院新生儿筛查中心接收的303 777例新生儿PKU筛查结果,所有样本分别来自唐山市各市、县、镇级医院。其中男163 243例,女140 534例。
1.2筛查方法 在新生儿出生后3 d内,针刺采集足跟血于筛查滤纸上,晾干后通过茚三酮免疫荧光法检测足跟血中PA含量,试剂盒购于芬兰雷勃公司,相关操作严格按照说明书进行。若PA初筛浓度≥120 μmol/L,提示为可疑阳性,筛查人员通过电话或短信的形式通知可疑阳性患儿家长带回复查。若复查PA浓度仍≥120 μmol/L,则可确诊为PKU。
1.3聚合酶链反应(PCR)检测PAH基因 采用酚-氯仿提取外周血DNA,提取后置于-20℃保存。参照文献[10]进行PCR 扩增,引物序列:Exon2上游 5′-AGAGTTCATGCTTGCTTTG-3′,下游 5′-TGGAAGTTTGCTACGACAT-3′;Exon3上 游 5′-GTTAGGTTTTCCTGTTCTGGT-3′,下 游 5′-TGTGGAGTTACTTATGTTGCA-3′;Exon6上 游 5′-CCCCGACTC CCTCTGCTAA-3′,下游 5′-CCTCTGCCTCAATCCTCCC-3′;Exon7上 游 5′-GTCTCCTAGTGCCTCTGACT-3′,下 游 5′-GCAATGAACCCAAACCTC-3′;PCR扩增条件:95℃预变性5 min;95℃变性30 s,60℃复性30 s,73℃延伸50 s,共循环32次,72℃10 min。PCR产物经2%琼脂糖检测并纯化后委托生工生物工程(上海)股份有限公司进行双向测序。
2 结果
2.1 唐山市新生儿PKU筛查情况分析 303 777例PKU筛查的新生儿中,初步筛查结果有609例可疑阳性,共召回411例(67.49%)进行复查,确诊42例(13.8/10万)。见表1。
Tab.1 PKU screening of newborns in Tangshan from 2015 to 2018表1 2015—2018年唐山市新生儿PKU筛查情况
2.2 唐山市新生儿PAH基因突变情况分析 42例PKU患者的PAH基因测序显示,在84条染色体上共检测到62个(73.81%)突变位点。所有患者均检测出突变基因,其中20例患者检测出2个突变位点,22例患者检测出1个突变位点。所有患者共检测出12种突变,其中错义突变8种,无义突变2种,缺失突变1种,剪接突变1种。患者基因突变分布在第2、3、6、7、9外显子上,其中第7外显子最多,共35个(56.45%);其次为第3外显子14个(22.58%)。唐山市常见突变基因分别为Exon7-R243Q(18个,29.03%)、Exon3-R111X(10个,16.13%)和 Exon7-R261Q(10个,16.13%)。见表2。
Tab.2 PAH gene mutation in Tangshan City表2 唐山市PAH基因突变情况
2.3 典型案例分析 1例女性患儿,在PAH基因外显子区域同时发现2处杂合突变:c.208-210delTCT(缺失突变),导致氨基酸改变p.S70del(缺失突变),根据美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)指南,该突变变异类型可评级为Pathogenic(致病突变);c.964G>A(鸟嘌呤>腺嘌呤),导致氨基酸改变p.A322T(丙氨酸>苏氨酸),根据ACMG指南,该突变变异类型可评级为Likely pathogenic(疑似致病突变)。见图1。
Fig.1 Sanger sequence of two gene mutations in a typical PKU child and his parents图1 1例典型PKU患儿及其父母的两个基因突变受检位点Sanger测序图
3 讨论
PKU是由遗传因素导致基因缺陷引发的遗传代谢性疾病,尤其是近亲结婚会增加下一代的发病风险。目前,基因诊断是产前诊断PKU的唯一方法,基因诊断能够有效避免PKU患儿的出生,及时发现并对已生育的PKU患儿加以治疗,从而缓解其病情[11-12]。现已知的PAH基因突变类型多种多样,其中以错义突变居多,约占60.08%,其次为缺失突变(13.35%)和剪切突变(11.03%)[13-14]。PAH基因突变类型、位点在不同种族和地区之间均有差异。目前发现PAH突变在每个外显子上均能发生,但主要集中在3、6、7和11外显子上,且随着地区的不同其发生频率也不同[15]。
本研究结果显示,唐山市在2015—2018年间共确诊PKU 42例,发病率为13.8/10万,略高于全国PKU发病率1/11 000。分析其原因之一为不同国家和地区的PAH突变类型、位点等诸多因素不同[16]。本研究中42例PKU患儿84条染色体上共检测到62个(73.81)突变。患儿PAH基因中共检测到12种突变 ,以 Exon7-R243Q(29.03%)、Exon3-R111X(16.13%)和 Exon7-R261Q(16.13%)为主。其中R243Q在本市患儿中出现频率最高,与国内大部分研究[17]相一致,但出现频率相对高于报道的河南地区人群(18.14%)[18]和新疆地区人群(21.8%)[19],提示R243Q是我市PKU患儿的突变热点基因。本研究结果显示,患儿PAH基因突变多出现于第7外显子上,共35次(56.45%),与其他国内外研究[20]结果相一致,说明第7外显子也是我市患儿PAH基因高频突变位点。
本研究结果发现1例典型病例,该患儿在PAH基因外显子区域出现2处杂合突变:c.208-210delTCT(缺失突变),导致氨基酸改变p.S70del(缺失突变),根据ACMG指南,该突变变异类型可评级为Pathogenic(致病突变);c.964G>A(鸟嘌呤>腺嘌呤),导致氨基酸改变p.A322T(丙氨酸>苏氨酸),根据ACMG指南,该突变变异类型可评级为Likely pathogenic(疑似致病突变)。查阅相关文献,暂未发现与本案例相一致的报道。
综上,唐山市2015—2018年PKU发病率为13.8/10万,略高于全国发病率,PAH基因变异以错义突变为主,且第7外显子是唐山市患儿PAH基因高频突变位点,R243Q出现频率最高且高于国内其他地区。