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结核分枝杆菌检测试剂盒优化方案对结核分枝杆菌的诊断价值

2020-05-07胡佳娜范大鹏陈园园鲍志坚蔡龙

浙江实用医学 2020年5期
关键词:磁珠离心管恒温

胡佳娜,范大鹏,陈园园,鲍志坚,蔡龙

(浙江中医药大学附属中西医结合医院,浙江 杭州 310003)

肺结核仍是全世界最严重的慢性传染病之一,我国也是肺结核较严重的国家之一。2018年WTO相关报告显示,我国结核病患者每年增加约88.9万[1]。PCR-荧光探针法、结核RNA恒温扩增技术目前已是结核分子诊断中较普遍的检测技术[2],PCR-荧光探针法用于检测结核分枝杆菌的DNA,具有难以区分死菌和活菌的缺点[3];结核分枝杆菌的mRNA半衰期非常短,在常温中容易降解[4],在常规操作中可能会导致一定的RNA流失,降低所测标本的阳性率,造成活动性肺结核的漏诊;MGIT 960液体快速培养周期长,通常需要1-2个月的时间,无法达到“快速确诊”的目的。本研究通过结核分枝杆菌检测试剂盒(TB-SAT)优化方案与已有的常规检测法作对比,以临床诊断为金标准,探讨优化方案的诊断价值。

1 资料与方法

1.1 一般资料 收集2019年12月在本院收治的105例疑似肺结核患者的肺泡灌洗液标本,其中男66 例,女 39 例,年龄 17-83 岁,平均(45.7±19.1)岁。所有患者经临床表现,痰找抗酸杆菌检测及胸部CT检查等方式,结合 《肺结核诊断标准(WS 288-2017)》[5-6]确诊105例中肺结核75例,非肺结核30例。

1.2 方法

1.2.1 结核分枝杆菌检测试剂盒(TB-SAT)优化方案 核酸提纯步骤如下:(1)处理样本:灌洗液样本依照1:1或1:2比例添加保存液,混匀后放在温度为95℃水浴,10分钟,然后超声15分钟,使灌洗液标本充分液化和达到菌体破碎的效果;(2)将处理过的样本转移至1.5mL离心管中,加入200μL矿物油吸磁弃上清;(3)在上述离心管里中加入300μLDEPC水,震荡混匀,60℃水浴 5分钟,吸磁后取上清到新的1.5mL离心管中;(4)分别在上述离心管里加入200μL病毒核酸提纯液,对其混匀,在60℃环境下孵育10分钟,后在室温中静置10分钟;(5)将上述离心管放入离心机中短暂离心后,置于磁珠分离仪器上,待清晰发现磁珠到达管壁后使用移液器将管中以及盖上的液体吸出,并将气泡排除去,留下磁珠;(6)将吸干后的样本管移离磁力架,加入 1mL洗涤剂重悬磁珠,重复步骤(5);(7)重复步骤(6),此步骤尽量去除可见的残余液体,以免影响后续反应,然后室温干燥2分钟;(8)将样本管移离磁力架,之后往各管中加入30μLTB-SAT核酸扩增检测液,重悬磁珠,将磁珠悬液全部转到新的八连管,并盖上盖子。核酸提纯后进行SAT操作:60℃加热10分钟后,立即在42℃保持5分钟,加酶后上PCR仪器,程序设定与原RNA恒温扩增检查试剂一样。结果判读:与RNA恒温扩增检测的结果判读方法一样,有标准的S曲线并且Ct值<40判定为阳性,>40判定为阴性。

1.2.2 对比试验 (1)RNA恒温扩增检测。使用结核分枝杆菌RNA恒温扩增试剂盒检测,完全按照说明书进行操作,并根据说明书进行结果判读。(试剂购自上海仁度生物科技有限公司,批号:20191101)。(2)PCR-荧光探针法。使用晶芯结核/非结核分枝杆菌核酸检测试剂盒,完全按照说明书操作并进行结果判读。(试剂购自成都博奥晶芯生物技术有限公司,批号:20190701)。(3)MGIT 960液体快速培养。采用美国BD公司试剂,操作步骤及结果判读参照《结核病实验室检验规程》[7]。

1.3 统计学处理 使用SPSS 26.0对以上几种检测结果的诊断效能进行比较,计数资料用百分率表示,采用 χ2检验。

2 结果

TB-SAT优化方案较RNA恒温扩增检测、PCR-荧光探针法及MGIT 960液体快速培养阳性率升高。以临床诊断为金标准,TB-SAT优化方案的灵敏度为73.33%。TB-SAT优化方案,RNA恒温扩增检测及PCR-荧光探针法特异度均为100.00%,MGIT 960液体快速培养的特异度为93.33%。详见表1。

表1 不同检测方法诊断结果

3 讨论

结核分枝杆菌检测试剂盒优化方案的本质是RNA的核酸提纯方法的优化,此方法能减少RNA在实验操作过程中的降解,提高了RNA的检出率,对原分子检测的方法是一种互补。优化方案试剂中的保存液的功能主要为液化标本,延长RNA的降解时间,降低RNA的降解率,对RNA起到一定的保护作用,此为TB-SAT优化方案中的核心试剂,在此方案中起着关键的作用,大大提高阳性率。

TB-SAT优化方案与MGIT液体快速培养比较可看出TB-SAT优化方案阳性率高出培养结果,因此只用培养结果作为肺结核病原学阳性统计标准可能存在漏诊,应联合分子生物学来提高临床诊断中的病原学阳性率[8]。非肺结核患者中存在2例MGIT 960培养阳性结果,分析原因,其中1例为非结核分枝杆菌,而TB-SAT优化方案只能检测出结核分歧杆菌,相比MGIT 960快速培养提高了检测的特异度;另1例,培养结果为结核分枝杆菌,其阳性原因可能与标本保存不当,未处理标本前RNA已经降解有关。TB-SAT优化方案作为一种分子生物学手段,具有快速、简便等优点,相比细菌学培养结果在阳性率方面低于分子生物学手段,但结核菌培养具有不可替代的价值,结核药敏和非结核MIC药敏法等都需要用培养出的菌株才能进行检测[9]。此外细菌学的表型药敏结果与生物学的基因型药敏结果结合考虑,有利于个体化的抗结核治疗方案综合全面的制定,已达到更高的治疗效果[10]。本研究对TB-SAT优化方案、RNA恒温扩增检测技术、PCR-荧光探针法和MGIT 960液体快速培养进行了分析比较,探讨结核分枝杆菌TB-SAT优化方案的检测价值,研究结果显示TB-SAT优化方案的诊断灵敏度73.33%,特异度100%,诊断效能较高,可能与优化方案中的保存液有关。在保存液的作用下RNA的降解率降低,检出率得到了提高。从以上结果分析可得TB-SAT优化方案可及时发现活动性肺结核,诊断灵敏度及特异性高,可帮助降低肺结核的漏诊率,具有一定的临床推广价值。

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