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基因工程学习过程中的几个常见误区

2018-10-20周毓

中学生物学 2018年2期
关键词:解旋酶

周毓

摘 要 对学生在基因工程学习过程中存在的几个概念误区进行分析讨论,并对有关知识进行补充,以帮助学生更好地理解和掌握相关概念。

关键词 限制酶 DNA聚合酶 筛选基因 解旋酶

中图分类号 Q-49 文献标志码 E

人教版高中生物选修3包括:基因工程、细胞工程、胚胎工程、生态工程四个专题,基因工程是其他三个专题的基础,同时也是近年高考选考部分必会出现的内容,考查学生对实际问题的解决能力。由于基因工程是从分子的角度来考虑问题,概念比较抽象,学生对一些知识点的理解感觉很困难,做题时屡屡出现问题。笔者通过查阅资料,对教师教学以及学生学习过程中存在的几个误区进行分析。

1 限制酶只能切割一种核苷酸序列

人教版高中生物选修3第一节“DNA重组技术的基本工具”对限制酶的专一性是这样描述的,“它们能够识别双链DNA的某种特定核苷酸序列,并且使每一条链中特定部位的两个核苷酸之间的磷酸二酯键断开”。很多学生认为限制酶只能识别一种核苷酸序列。

表1展示了在历年考试中出现的部分限制酶及其识别序列。大部分限制酶仅识别一种核苷酸序列,比如BamH I只识别G↓GATCC。但是还有少数限制酶识别的序列不止一种,比如Hind II识别的序列一共有四种:GTT↓AAC、GTT↓GAC、GTC↓AAC、GTC↓ GAC。這四种序列并不是四种核苷酸的随机组合,而有一定的规律可循,即符合GT(T/C)↓(A/G)AC这样一种模式。所以,对于书中“限制酶能够识别双链DNA的某种特定核苷酸序列”,笔者认为还需要教科书编写者用更精确的语言来描述。

2 DNA复制时,DNA聚合酶不需要引物

人教版高中生物必修3第三章第三节“DNA的复制”的教材,图3-13展示了DNA分子的复制过程。这个图可以帮助学生理解DNA复制的基本过程,但同时也给部分学生一种误导:DNA聚合酶结合到模板DNA后,可以将游离的脱氧核苷酸连接起来,形成与模板DNA互补的DNA单链。由于这种理解上的偏差,导致学生在理解PCR技术时很困惑:如果DNA聚合酶可以将单个脱氧核苷酸连接成DNA单链,为什么还要在PCR反应体系中再添加引物呢?

事实上,无论在体外还是体内,DNA复制都只能沿着已存在的核苷酸链延伸,不能从头合成DNA链。在体内进行DNA复制时,RNA聚合酶先与DNA模板结合,合成一小段RNA链,作为引物;接着DNA聚合酶再以RNA引物3′端作为起始端,合成新的DNA链;当DNA复制完成后,RNA引物会被DNA聚合酶I或者核糖核酸酶切掉。在体外进行DNA复制时,直接以人工合成的一段DNA片段作为引物,在复制结束时,不需要再将引物切掉。

3 运载体上的标记基因都是抗性基因

重组DNA构建后,紧接着就是导入到受体细胞。在实际操作中,并不能保证所有的重组DNA都能进入到受体细胞,也不能保证导入到受体细胞中的质粒都是重组DNA,也可能含有空载体。所以在技术上要求重组DNA上必须有标记基因来鉴定生物是否成功转化。在平时教学时,笔者习惯于以抗性基因用作标记基因,比如青霉素抗性基因、氯霉素抗性基因等。这就给学生造成一种误解,认为只有抗性基因才能作为标记基因。

事实上,在实验过程中,能够使用的标记基因的种类有很多,除了抗性基因,还有颜色反应基因、代谢缺陷型互补基因等。比如,蓝白斑筛选法(图1),其原理是载体中含有LacZ基因,外源DNA克隆位点位于在LacZ基因内部。若无外源DNA分子插入,LacZ基因在IPTG(异丙基硫代-β-D-半乳糖苷)诱导下,表达的β-半乳糖苷酶能将X-gal(5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-半乳糖苷)切割成半乳糖和深蓝色的物质5-溴-4-靛蓝。5-溴-4-靛蓝可使整个菌落显蓝色。若外源DNA分子插入运载体中,LacZ基因失活,因而不能表达出β-半乳糖苷酶,在X-gal的培养基上菌落显白色。根据菌落蓝白颜色的不同,筛选出需要的转化子。在教学的时候,教师应该补充其他的质粒的一些标记基因,开拓学生的视野。学生在碰到类似的信息题时,就不会感觉手足无措。

4 转录过程需要解旋酶

人教版高中生物必修3第三章第三节“DNA的复制”教材的,图3-13展示了DNA分子的复制过程。DNA复制开始时,在解旋酶的作用下,DNA双螺旋结构被打开,DNA聚合酶以一条链为模板合成DNA单链。自然地,学生会形成一种定势,即只要是DNA双链解旋的过程,就必定需要解旋酶。因此学生会理所当然地认为,在DNA转录形成mRNA的时候,也需要解旋酶。事实上,并非如此。

原核细胞内只有一种RNA聚合酶,它负责所有mRNA、rRNA、tRNA的合成。此RNA聚合酶由α、β、β′、ω、σ亚基聚而成的全酶。其中α亚基具有解开前方DNA双螺旋以及恢复后面DNA双螺旋的作用。因此,原核细胞中的RNA聚合酶具有解旋酶的活性,能够打开DNA双链。而真核细胞的RNA聚合酶有三种,三种RNA聚合酶都无解旋作用。只有RNA聚合酶II可以转录形成mRNA。RNA聚合酶II要实现转录形成mRNA,需要至少7种辅助因子参与(表2)。真核细胞转录时,辅助因子与模板DNA上的TATA框结合,形成转录起始复合物。该复合物具有依赖于ATP供能的DNA解旋酶活性,在转录链延伸中发挥作用。总之,原核细胞中RNA聚合酶起解旋作用,真核细胞中RNA聚合酶无解旋作用,它依靠某些辅助因子将DNA双链打开。

参考文献:

[1] 王镜岩等.生物化学教程[M].北京:高等教育出版社,2008:524.

[2] 李兴玉.简明分子生物学[M].北京:高等教育出版社,2009:91.

[3] 朱玉贤.分子生物学[M].北京:高等教育出版社,2007:75.

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