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SYBR Green实时荧光定量PCR法检测人乳腺球蛋白在乳腺癌诊断中的应用*

2015-12-06孙昌瑞江咏梅

成都医学院学报 2015年5期
关键词:灵敏度特异性阳性率

孙昌瑞,邓 君,冯 林,洪 华,江咏梅

1.四川大学华西第二医院 检验科(成都 610071);2.四川省医学科学院·四川省人民医院 检验科(成都 610072);3.四川省妇幼保健医院 检验科(成都 610000)

乳腺癌发病率较高,且呈不断上升趋势,早期即可发生微转移,因此,乳腺癌相关基因的检测对于早期诊断、防治复发和预后判断等有重要意义。人乳腺球蛋白(human mammaglobin,HMAM)特异性表达于乳腺组织,对乳腺癌具较高诊断价值。目前常用免疫组织化学染色和RT-PCR等对HMAM mRNA进行检测,上述方法存在标本来源困难,灵敏度较低,特异性较差,操作复杂,或需采用强诱变剂等缺点,而SYBR Green实时荧光定量PCR(real time fluorescence quantitative PCR,FQ-PCR)具有高灵敏性、高特异性、高精确性、无污染和可定量等优点。本研究采用SYBR Green FQ-PCR检测HMAM mRNA在外周血循环肿瘤细胞中的表达并分析其病理意义,同时与RT-PCR进行比较,以期为乳腺癌分子标志物的选择及靶向治疗提供依据。

1 资料与方法

1.1 临床资料

病例组选取2011年1月至2014年6月四川省人民医院门诊和住院部的相关女性患者共371例:良性乳腺疾病91例,年龄28~77岁,其中纤维瘤53例,脂肪瘤38例,并排除患其他肿瘤可能性;乳腺癌193例,年龄31~78岁;其他肿瘤患者87例,年龄32~81岁,其中结肠癌31例、肺癌26例、卵巢癌30例。所有研究对象的确诊均根据病理学诊断结果。乳腺癌患者纳入标准[1]:1)年龄≥18岁;2)可测量、可评价;3)预测寿命≥2个月;4)美国东部肿瘤协作组(eastern cooperative oncology group,ECOG)得分为0~2分;5)无严重衰竭性疾病;6)无第2个部位恶性肿瘤;7)接受了前期的辅助治疗、放射治疗;8)无任何转移性疾病。

对照组随机选择同期健康女性体检者,排除乳腺和卵巢疾病,且无乳腺癌和卵巢癌家族史,共45例,年龄27~75岁。

1.2 仪器和试剂

逆转录、FQ-PCR 体系、β-actin试剂盒和7500 FAST Sequence Detector分析仪(美国ABI公司);RNA提取、cDNA的合成和PCR扩增试剂(上海生工生物公司);IMMELITE WANG化学发光仪(天津得普);全自动生化分析仪(日本奥林巴斯2700)。

1.3 SYBR Green FQ-PCR探针和引物

采用PE公司Primer Express软件设计HMAM探针和引物,序列如下:HMAM引物正向,5′-GAGTTCATAGACGACAATGCC-3′,反向,5′-CCGTAGTTGGTTTCTCACCAT,β-actin-3′引物:正向,5′-CTCTTCCAGCCTTCCTT CCT-3′,反向,5′-AGCACTGTGTTGGCGTACA G-3′,由上海生工生物公司合成。

1.4 SYBR Green FQ-PCR反应

1)取静脉血5mL,1mg/mL EDTA抗凝,弃去上方的1mL,防上皮细胞污染,采用一步法提取细胞总RNA。2)cDNA的合成:逆转录体系20μL:细胞总RNA 1μg,RNasin 20U,引物200ng,5×反应缓冲液4μL,M-MLV反转录酶20U,42℃反应55min。3)PCR:逆 转 录 产 物 5μL,探 针150nmol/L,引物各为400nmol/L,dATP、dCTP和dGTP各200μmol/L,dUTP 400μmol/L,10×缓冲液5μL,Taq DNA 聚合酶1.25U,MgCl25mmol/L,尿嘧啶 N-糖基化酶(UNG)0.5U。在7500FAST Sequence Detector分析仪上测定标准品和标本HMAM和β-actin含量。扩增参数为:50℃,2min;96 ℃,10min;再95 ℃30s,65 ℃1min,42个循环。仪器根据标准曲线自动计算HMAM和β-actin的拷贝数,以 HMAM 和β-actin比值作为HMAM的表达水平。

1.5 阳性判断

应用2-ΔΔCt方法计算目的基因的相对表达量(Ct为循环阈值)。ΔCt值=目的基因(HMAM)Ct值-β-actin基因 Ct值,以β-actin为对照;ΔΔCt=乳腺癌组的ΔCt值-健康体检组的ΔCt值,以健康体检组为对照。45例健康人的基因表达相对量为1.003±0.087,2-ΔΔCt值为乳腺癌组基因相对健康体检组基因表达的倍数,测定值以2-ΔΔCt>2为表达阳性。阳性率=阳性表达人数/总人数×100%。

1.6 RT-PCR

RNA提取、cDNA合成和PCR扩增的实验方法均按照操作说明进行,引物与FQ-PCR相同,用琼脂糖电泳法和溴化乙啶染色观测结果。

1.7 CA153、CEA和TSGF的检测

CA153和CEA采用化学发光法进行测定;TSGF采用酶连续监测法进行测定。

1.8 ER、RR和HER2的检测

采用免疫组织化学Envision二步法,具体步骤按试剂盒说明书进行。

1.9 统计学方法

应用SPSS 17.0软件进行数据分析。定性资料以例数和率表示,各组基因标志物表达阳性率的比较采用χ2检验,与临床病理资料及受体表达的相关性分析采用Spearman等级相关分析,不同方法用于乳腺癌诊断的评价采用 McNemar检验。检验水准α设定为0.05。

2 结果

2.1 HMAM的表达

健康体检者、良性乳腺疾病、其他肿瘤患者和乳腺癌患者 HMAM 阳性率分别为20.0%、31.9%、31.0%和42.0%,乳腺癌患者HMAM阳性率明显高于健康体检者、良性乳腺疾病和其他肿瘤患者,差异有统计学意义(χ2=5.153,3.797,4.875;P=0.017,0.029,0.035);良性乳腺疾病和其他肿瘤患者HMAM阳性率高于健康体检者,差异有统计学意义(χ2=4.103,4.031;P=0.024,0.023);良性乳腺疾病和其他肿瘤患者比较,差异无统计学意义(χ2=1.069,P=0.275)。

2.2 HMAM癌基因表达与乳腺癌临床病理因素的关系

193例乳腺癌患者HMAM表达阳性率与患者年龄、肿瘤大小、类型无关(rs=1.203,1.022,1.021;P=0.256,0.302,0.391);与乳腺癌临床分期、组织学分级、腋窝淋巴结转移呈正相关(rs=5.023,6.236,5.389;P=0.015,0.011,0.013)(表1)。

2.3 HMAM表达与激素受体的相关性

193例乳腺癌患者HMAM表达与雌激素受体(ER)、孕激素受体(PR)表达无明显相关性(rs=0.081,0.075;P=0.324,0.395);与 HER2/neu表达呈正相关(rs=0.223,P=0.012)(表2)。

表1 HMAM表达与乳腺癌患者临床病理学特征的相关性[n(%)]

表2 乳腺癌HMAM表达与激素受体的相关性[n(%)]

2.4 SYBR Green FQ-PCR和 RT-PCR法用于乳腺癌微转移诊断的评价

SYBR Green FQ-PCR检测HMAM对乳腺癌诊断的灵敏度(χ2=5.715,P=0.0213)和特异性(χ2=5.116;P=0.0325)均高于 RT-PCR法,其差异有统计学意义(表3)。

表3 FQ-PCR和RT-PCR法灵敏度和特异性的比较

2.5 HMAM、CA153、TSGF和CEA对乳腺癌诊断的灵敏度和特异性

HMAM对乳腺癌诊断的灵敏度高于TSGF和CEA,差异有统计学意义(χ2=4.179,4.251;P=0.037,0.034),也高于 CA153,但差异无统计学意义(χ2=2.801;P=0.098);特异性高于 CA153、TSGF 和 CEA(χ2=4.279,4.901,5.231;P =0.031,0.027,0.024)(表3~表6)。

表4 CA153对乳腺癌诊断的灵敏度和特异性

表5 TSGF对乳腺癌诊断的灵敏度和特异性

表6 CEA对乳腺癌诊断的灵敏度和特异性

3 讨论

HMAM基因定位于人染色体11q13区域,是子宫珠蛋白超家族成员之一,也是上皮组织来源的组织特异性标志[2]。HMAM基因所编码的蛋白质氨基酸序列与子宫珠蛋白超家族同源,几乎只在乳腺上皮细胞中表达并在乳腺癌组织中过表达,在骨髓中阳性表达预示预后较差。研究发现,HMAM可能与亲脂素B蛋白通过二硫键形成异源二聚体而发挥作用,其异常表达与乳腺癌的微转移和疗效密切相关[3]。HMAM mRNA特异性表达于乳腺组织,而在其他肿瘤如肝癌、肺癌、结直肠癌、胃癌等均不表达[4]。

由于HMAM具有较高组织特异性,在乳腺癌微转移中具较高潜在诊断价值,因此它一直是近年国内外研究较多的乳腺癌相关基因,Tjensvoll等[5]研究显示,5例术前骨髓HMAM阳性表达患者,其中4例术后出现复发。进淑娟等[6]发现患者乳腺癌组织、腋窝淋巴结及外周血中HMAM mRNA表达与乳腺癌的临床分期相关,提示HMAM检测可以反映乳腺癌的微转移。鲍慧铮等[7]在2014年报道,FQ-PCR检测44例乳腺癌患者外周血HMAM 表达阳性率为38.6%,CK19和HMAM联合检测的阳性率为56.8%。

虽然国内外已有关于HMAM对乳腺癌辅助诊断的相关报道,但上述报道主要局限在乳腺癌和良性肿瘤患者,缺少与不同检测方法的比较及于其他肿瘤标志物的比较等,且例数较少,本研究旨在较为全面地探讨HMAM在乳腺癌辅助诊断中的意义。

本研究发现,乳腺癌患者HMAM阳性率明显高于健康体检者、良性乳腺疾病和其他肿瘤患者(P<0.05),表明 HMAM 可辅助乳腺癌的诊断。在与病理学特性的比较中,HMAM表达与乳腺癌临床分期、组织学分级、腋窝淋巴结转移和HER2/neu表达相关;级别越高的肿瘤阳性率越高,腋窝淋巴结转移者表达高于无转移者。目前,用于乳腺癌诊断的肿瘤标记物主要有CA153、TSGF和CEA等,CA153是报道较多且对乳腺癌特异性较高的标志物,单独应用时其灵敏度低,阳性率仅为22.5%~40.2%[8];TSGF在恶性肿瘤形成早期,即释放到血液中并达到一定浓度,是恶性肿瘤血管扩增的刺激因子和血管增生的物质基础,而与非肿瘤血管增生无关[9-11],虽然其灵敏度较高,但特异性差;CEA 的阳性率和特异性也较低。本研究发现,HMAM对乳腺癌诊断的灵敏度(42.0%)高于TSGF(33.7%)和CEA(30.6%),特异性(70.9%)高于 CA153(45.3%)、TSGF(39.0%)和 CEA(36.3%)。

SYBR Green FQ-PCR主要是利用Taq酶5′→3′外切酶活性,在常规PCR基础上加入荧光标记探针进行核酸定量分析,与普通的RT-PCR法相比,具有以下优点:1)在PCR扩增对数期对mRNA的表达进行定量,结果更为可靠;2)扩增和检测同时进行,减少了交叉污染;3)高灵敏性、高特异性和高精确性。本研究SYBR Green FQ-PCR对HMAM检测灵敏度为42.0%,RT-PCR为30.1%,SYBR Green FQ-PCR对 HMAM 检测特异性为70.9%,RTPCR为59.6%;4)高度自动化、快速,可缩短检测时间1~2h。

综上所述,SYBR Green FQ-PCR法能快速定量检测外周血中HMAM的基因表达,具有高灵敏度、高特异性、高精确性、高效率和污染小等特点,且标本来源容易,可为乳腺癌的辅助诊断提供客观可靠的依据。

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