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人泛素-核糖体蛋白27a原核表达载体构建及表达*

2013-02-06广东医学院医学检验学院广东东莞523808

检验医学与临床 2013年12期
关键词:核糖体凝胶电泳泛素

曾 涛,何 德(广东医学院医学检验学院,广东东莞 523808)

泛素-核糖体蛋白S27a(UBRPS27a)是泛素和核糖体蛋白的融合蛋白,由RPS27A基因编码[1]。核糖体蛋白S27a(RPS27a)为核糖体40S亚基组成蛋白之一,除参与蛋白质合成外,还具有其他重要功能。RPS27A基因在多种活性增殖细胞中高度表达,其过表达是肝癌、胃癌、结肠癌等多种恶性肿瘤的典型特征,很可能是恶性转化细胞或肿瘤组织的标志物,但其在肿瘤细胞中的功能作用及其分子机制尚未清楚[2-5]。本研究以原核系统表达人UBRPS27a,旨在为进一步研究其结构与功能奠定基础。

1 材料与方法

1.1 材料 原核表达载体pGEX4T-1、人急性早幼粒细胞白血病HL-60细胞株、大肠埃希菌JM109及BL21(DE3)由广东医学院生物化学与分子生物学研究所保存。Taq DNA聚合酶、限性内切酶BamHⅠ和SmaⅠ、DNA T4连接酶、DL2000 DNA分子标记物、λHindⅢ标记物、载体PMD18-T购自TaKaRa公司。质粒抽提试剂盒和DNA凝胶回收试剂盒购自TIANGEN公司。TRIzol试剂和反转录(RT)聚合酶链反应(PCR,RT-PCR)试剂盒购自Invitrogen公司。其他试剂均为国产或进口分析纯。

1.2 方法

1.2.1 RPS27A基因cDNA全长克隆 根据人RPS27A基因cDNA序列(GenBank NM_002954)以及pGEX4T-1载体上的多克隆位点设计上游引物P1(5′-CGC GGA TCC ATG CAG ATT TTC GTG AA-3′,下划线部分为BamHⅠ酶切位点)及下游引物P2(5′-TCC CCC GGG TTA CTT GTC TTC TGG TTT G-3′,下划线部分为SmaⅠ酶切位点),由上海生工公司合成。收集对数生长期HL-60细胞,TRIzol试剂抽提总RNA,Oligo dT18引物反转录合成RPS27AcDNA第1链;以P1和P2为引物,RT-PCR扩增RPS27A编码区cDNA片段全长,扩增反应条件为95℃5min,94℃45s、52℃1min、72℃1min循环35次,72℃10min,取扩增产物进行2.0%琼脂糖凝胶电泳,在紫外分析仪上观察扩增结果并拍照;将胶回收法纯化的目的片段与PMD18-T载体进行T/A克隆重组,挑选单克隆菌落,PCR鉴定阳性克隆送上海生工公司测序;用质粒提取试剂盒抽提经测序验证克隆正确的质粒DNA(TRPS27A)。

1.2.2 pGEX4T-1-RPS27A重组质粒构建 以BamHⅠ和SmaⅠ对T-RPS27A质粒和pGEX4T-1载体进行双酶切,酶切产物用琼脂糖凝胶电泳分离;胶回收法纯化的目的基因DNA片段与线性载体DNA片段在T4连接酶作用下连接过夜,转化感受态JM109细菌;挑取单克隆菌落接种于含氨苄西林(Amp+)LB培养基中,37℃振荡培养过夜,提取质粒DNA,PCR与双酶切法鉴定后将阳性候选克隆送上海生工公司测序。

1.2.3 重组质粒诱导表达 以测序验证正确的pGEX4T1-RPS27A重组质粒转化感受态BL21细菌,挑选单克隆菌落,PCR与双酶切法鉴定;将含重组质粒的BL21细菌接种于Amp+LB培养基,振荡培养过夜;将过夜培养菌按体积比1∶30接种于新鲜LB培养基,37℃剧烈振荡培养至A600约为0.5,加1mmol/L异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)培养4h;以冰预冷磷酸盐缓冲液悬浮菌体,超声破碎,离心取上清进行12%十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE),考马斯亮蓝R250染色后观察结果。

2 结 果

2.1 RPS27A基因cDNA全长克隆 RT-PCR扩增产物经琼脂糖凝胶电泳,在200bp与500bp之间发现1条清晰DNA条带,大小与目的基因预期片段480bp相符(见图1)。

图1 RPS27AcDNA扩增产物琼脂糖凝胶电泳

2.2 pGEX4T1-RPS27A重组质粒酶切鉴定 PCR鉴定阳性重组质粒双酶切产物琼脂糖凝胶电泳显示,酶切获得的2个片段分别与pGEX4T-1载体(4 950bp)及RPS27A目的片段(480bp)预期大小相符(见图2)。测序结果显示重组质粒中插入DNA片段序列与RPS27A基因cDNA全长完全一致(见图3)。

图2 pGEX4T-1-RPS27A重组质粒酶切鉴定

2.3 GST-UBRPS27a融合蛋白诱导表达 pGEX4T-1-RPS27A重组质粒诱导表达产物电泳图出现了2个过表达蛋白条带,1条与GST-UBRPS27a融合蛋白相对分子质量(RMM)44×103(GST、UBRPS27a的RMM分别为26×103和18×103)相符,表达效率很高,另出现1条RMM稍小的蛋白条带(见图4)。

图3 pGEX4T1-RPS27A重组质粒中插入DNA片段部分测序图谱

图4 SDS-PAGE分析大肠杆菌GST-UBRPS27a重组蛋白的表达

3 讨 论

人UBRPS27a蛋白N端是泛素,C端是RPS27a,两端结构域在不同物种中均高度保守。RPS27a通过C4型锌指结构域与DNA结合,组成核糖体结构,参与蛋白合成。RPS27a通常与泛素融合,主要存在于细胞质中。泛素在核糖体合成过程中作为分子伴侣,在RPS27a进入核糖体之前对其有保护和稳定作用。本研究扩增了RPS27A基因编码区全长cDNA,成功构建了pGEX4T-1-RPS27A重组质粒,并在大肠埃希菌中诱导表达了GST-UBRPS27a融合蛋白,为进一步利用GST标签进行UBRPS27a蛋白纯化、制备其单克隆抗体及研究其结构奠定了基础。蛋白诱导表达产物电泳图显示除GST-UBRPS27a融合蛋白高效表达外,另有1条RMM相对较小的条带(约30×103左右)过表达。为排除其他混杂克隆的干扰,本研究将pGEX4T-1-RPS27A重组克隆在Amp+LB培养基上进行划线培养,挑取单克隆菌落重新诱导表达后,依然出现该条带。由此可见该蛋白条带是特异的,考虑可能为GST-UBRPS27a融合蛋白部分降解产物,有待后续实验进一步验证。

RPS27A基因的表达在多种肿瘤组织中异常升高,可能在肿瘤发生、发展中具有重要作用。该基因是一种早期生长反应基因,在结肠癌及胃癌组织中的表达明显高于周边正常黏膜组织[4]。而且RPS27A基因在低分化肝癌中的表达较正常水平升高20倍以上,用RNA干扰方法沉默RPS27A基因可导致肿瘤细胞周期停滞及细胞萎缩,说明该基因与肝癌发生有关[6]。RPS27A基因在胰腺癌的癌前病变组织表达水平升高,可用于胰腺癌早期鉴别诊断。深入分析RPS27A基因与肿瘤的关系有利于发现新的肿瘤标志物及临床治疗靶标。但目前对该分子在肿瘤细胞中的具体功能及分子作用机制所知尚少。蛋白激酶CK2与多种肿瘤密切相关,是目前肿瘤治疗研究中的靶点之一[7]。黄功华等[8]采用酵母双杂交技术筛选HL-60细胞cDNA文库时发现,人UBRPS27a是CK2α′亚基的候选结合蛋白。但酵母双杂交系统有可能存在假阳性结果。故本研究诱导表达的GST-UBRPS27a融合蛋白为采用GST pull down试验验证UBRPS27a与CK2α′亚基的相互作用准备了条件,也为后续研究UBRPS27a结构与功能及其在肿瘤发生发展过程的分子调控机制奠定了基础。

[1]Kirschner LS,Stratakis CA.Structure of the human ubiquitin fusion gene Uba80(RPS27a)and one of its pseudogenes[J].Biochem Biophys Res Commun,2000,270(3):1106-1110.

[2]Ganger DR,Hamilton PD,Klos DJ,et al.Differential expression of metallopanstimulin/S27ribosomal protein in hepatic regeneration and neoplasia[J].Cancer Detect Prev,2001,25(3):231-236.

[3]Mafune K,Wong JM,Staniunas RJ,et al.Ubiquitin hybrid protein gene expression during human colon cancer progression[J].Arch Surg,1991,126(4):462-466.

[4]Wong JM,Mafune K,Yow H,et al.Ubiquitin-ribosomal protein S27agene overexpressed in human colorectal carcinoma is an early growth response gene[J].Cancer Res,1993,53(8):1916-1920.

[5]Revenkova E,Masson J,Koncz C,et al.Involvement of Arabidopsis thaliana ribosomal protein S27in mRNA degradation triggered by genotoxic stress[J].EMBO J,1999,18(2):490-499.

[6]Fatima G,Mathan G,Kumar V.The HBx protein of hepatitis B virus regulates the expression,intracellular distribution and functions of ribosomal protein S27a[J].J Gen Virol,2012,93(4):706-715.

[7]Trembley JH,Chen Z,Unger G,et al.Emergence of protein kinase CK2as a key target in cancer therapy[J].Biofactors,2010,36(3):187-195.

[8]黄功华,梁景耀,陈碧,等.用酵母双杂交系统筛选泛素/核糖体蛋白S27a[J].癌症,2005,24(1):40-46.

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