白菜型油菜IPT 基因家族鉴定及表达分析
2024-05-12刘博王旺田马骊武军艳蒲媛媛刘丽君方彦孙万仓张岩刘睿敏曾秀存
刘博 王旺田 马骊 武军艳 蒲媛媛 刘丽君 方彦 孙万仓 张岩 刘睿敏 曾秀存
摘要:异戊烯基转移酶(isopentenyltransferase,IPT)是细胞分裂素生物合成的第一限速酶,为分析IPT 基因家族在白菜型油菜生长中的功能,利用生物信息学方法从其基因组中鉴定出13个BrIPT 基因,它们不均匀地分布在7条染色体上。BrIPTs 可分为4个亚族,各家族成员均含有8~10个保守基序和1~2个UTR区。BrIPT 基因的启动子区域包含众多响应元件。BrIPT 基因家族成员受环境因子、生物激素及防御与应激调控。qRTPCR结果显示,tRNA-IPT基因BrIPT4、BrIPT6、BrIPT9 在白菜型油菜体内各个部位均有表达。相比于苗期,成熟期白菜型油菜IPT 基因的表達量更高,为后续深入研究IPT 基因家族成员的生理生化功能提供了理论依据。
关键词:白菜型油菜;IPT 基因家族;细胞分裂素;生物信息学分析
doi:10.13304/j.nykjdb.2022.0373
中图分类号:S565.4 文献标志码:A 文章编号:10080864(2024)02005611
油菜是我国主要油料作物之一,每年提供大量优质食用油,而且油菜籽还可以生产高蛋白饲用饼粕,是我国第二大饲用蛋白源[1]。油菜主要分为3个亚种,即甘蓝型油菜(Brassica napus L.)、白菜型油菜(Brassica rapa L.)和芥菜型油菜(Brassica juncea L.)。白菜型油菜适宜种植区域的北边界为39°46′N,是我国北方寒旱区唯一能够越冬的油料作物,也是冬季和春季地表有效覆盖作物之一[2]。但北方地区冬季寒冷干燥、春季少雨干旱,白菜型油菜的产量受到严重影响[3]。因此,选育优质、高产、抗逆性强的白菜型冬油菜品种受到广大科研工作者的高度重视。