Figshare数据库介绍及实现数据共享

陈冲，田国祥，乔萌萌，赵雪诺，曹家豪，吕军

随着大数据时代的发展和开放存取运动的兴起，对科研数据进行共享逐步成为了国情领域关注的焦点。科学数据是科学研究的重要成果，对经济发展和国家安全有着重要意义[1]。科学数据共享可有效利用科学数据。新型冠状病毒肺炎疫情暴发以来，疫情相关数据大量公开，对科研和政府决策提供了重要帮助。Figshare数据库作为大型稳健科研数据共享平台，是实现数据共享以及数据再利用的典型。为科研及政府决策提供更详细、开放及可用的数据分享，提高数据质量[2-7]。本文将详细介绍如何在Figshare平台上实现数据共享。

1 Figshare简介

Figshare数据共享平台是由英国Macmillian出版公司的分支机构Digital Science支持建设的，是其支持的众多投资组合业务之一。目的是为了使研究中的辅助材料更容易被发现及查找。Figshare平台服务学科多样，以生物学为基础，在Digital Science公司支持下，现已发展为包含生物学在内的将近30多种学科，如医学、地理学、物理学、人文学、天文学等，主要以生物学和医学为主，覆盖整个科学研究领域。平台接受多种格式的科研数据，提供了当前学术出版所不具备的一种文件共享模式。平台给所有对象分配唯一的DOI号，采用Creative Commons许可协议共享数据，大大减少了版权纠纷，可供全球科学家存取、共享信息，并采用基于云的数据管理系统来保证数据存储的安全和可靠性，还为用户提供权限设置的功能，用户自行决定对其科研数据、音频、论文和视频等研究成果是否公开。

FigShare的特点是容易发现，安全且易进入，方便管理；可以共享、快速、便捷地上传数据，该平台可以接受各种研究文件类型；所有以云数据为基础发表的成果可以被引用，且安全储存，任何地点均可存储；功能强大，公共空间不设限，为用户提供1 GB的私人空间，可存储一些目前不想公开的数据；鼓励发表科研数据和图表，体现开放科研的理念，成为科学研究的新工具以及现有科技出版模式的有益补充，可了解研究内容的全部计量统计，易于发现研究亮点[8,9]。

2 注册Figshare账号

用户首先进入Figshare数据库官方网站（https://figshare.com/），用户点击图1中的“Sign up”进入注册页面，图2带“*”号的为必填信息，信息填写完成后，点击下面“Sign up now”即可完成注册，该注册过程完全免费。注册后用户会收到一封邮件，该邮件是为了确定注册者是否为该账户的拥有者。用户点击邮箱链接来激活账户，登录邮箱和密码后即成功注册。无论是下载Figshare数据还是在Figshare平台发布数据，均须先登录账号。

图1 Figshare主页界面

图2 Figshare账号注册页面

3 搜索和下载Figshare数据

Figshare平台中所有数据均可免费使用。在Figshare首页，可以看见“Browse”版块，其中显示的是最近在Figshare平台上发布的数据和被下载次数最多的文章标题及其作者（图3），此页面可按科学研究方向分类，方便用户查询。访问者若遇见自己感兴趣的文章标题，可直接点击标题，即可看到文章的具体信息和数据资料。如果用户有具体的搜索方向，可在首页“Search on figshare”搜索关键字。

图3 Figshare数据库浏览页面

在“Search on figshare”可输入的关键词类型包括作者、标题以及DOI号等。我们以搜索“neural stem cell”为例。在“Search on figshare”中搜索“neural stem cell”，搜索结果如图4所示，结果可以按照Relevance、Posted date、Firsted online date、Acceptance date、Publication date进行排序。图中可以看到搜索结果里包含文章用过的表格、数据、及图片等，根据自己所需点击进入，找到页面里的下载符号，即可下载。当引用该文献和数据时，点击页面中“cite”，下载其引用格式。

图4 neural stem cell搜索页面

Figshare数据库不仅只有文献数据和表格等，用户如果想用代码操作或作图时，也可以在Figshare中搜索，搜索到代码教程、脚本以及相关安装包等。以搜索常用的R语言的一个包“ggplot”为例。同样的，在“Search on figshare”中搜索“ggplot”，结果如图5所示，在图中我们可以看到相关的脚本、教程、软件、数据、图表等。

图5 ggplot搜索界面

点击脚本，可以看到1篇文献所用的脚本，在其下方可看到引用和下载的标识，可以直接引用及下载。下载软件后解压缩后能看到许多需要的代码。点击教程（图6～7），进入页面显示的是绘制条形图和散点图的教程，包括源代码、函数说明以及部分步骤截图，清晰且全面。

图6 条形图和散点图教程、源代码及操作步骤

4 发布数据

如今，大部分期刊要求投稿者将其研究数据公布出来，主要是为了鼓励科研数据再次被科研人员利用起来，其次，也可以推动科学研究的公开化、透明化。研究者在Figshare数据库公布的数据可以被其他科研人员共享，用户在平台搜索数据时，也可以发现使用该数据做出的文章，有助于提高出版商及作者的名誉和影响力。

图7 条形图和散点图的函数说明

Figshare平台主要服务于科研人员、出版商以及科研机构，其中主营对象是科研人员。与其他平台相比，Figshare平台服务有四项独具特色的服务。①平台接受大部分格式的研究结果，如视频、音频、PDF等，是其他平台很难做到的。②只要科研人员上传成果，即可享有DOI，本人可自行决定是否将其数据公开。③平台提供在线合作空间，可以给自己的合作伙伴共享私密的个人数据，以便更好的提升其价值。④Figshare API服务，自动化的研究工作流程。

科研人员在Figshare平台上传数据主要有10个步骤，具体如下：①在Figshare官网首页找到创建新项目按钮，在文件中找到自己的成果，完成后出现图8。②插入标题，争取最大限度地暴露数据的信息。③添加作者，用户可以重新排列作者的出现顺序，如果您是替别人上传，可将自己名字删除，如要添加没有Figshare账户的作者，可选择“add author details”并输入他们的名字、电子邮件地址（可选）和身份识别码ORCID（可选）。④可选择多个类别，如果找不到，可以找到最好的选择，然后在底下的关键字更加具体一点。⑤下拉菜单选择项目类型，该平台可以接受任何文件形式。⑥添加更具体的关键字，可任意添加多个关键字，只需在每个关键字后面按Enter键，平台就会记住之前的关键字，方便其他人找到。⑦写一个描述，包括研究所用的方法、数据收集或法律道德要求的信息。⑧还可加入与数据相关的资助信息以及与研究成果相关的其他材料参考。⑨选择许可证，可决定其他人如何再利用该数据，可根据需求从多个许可中进行选择。⑩勾选“发布”，系统将提示检查已分配的许可证以及使用条款。如所在机构已经开始审阅，则会提示，该项目在公开发送之前以供审阅，确保提交内容是准确的，一旦发布，DOI可共享发布，公共数据也可在社交媒体上共享，生成私有链接，以便共享其私人数据。

图8 上传数据操作页面

本文主要详细介绍了在Figshare平台上传和下载数据，如读者有其它与Figshare平台相关问题，进入（https://help.figshare.com/）网站，图9是该网站页面，用户所遇到的问题基本在此均可得到解答。

图9 help.figshare主页面

5 结语

Figshare数据库是一个覆盖全科领域的数据库。与其它数据库相比，它可接受任何格式的科研成果，上传成果均可享有DOI等各项优势。此外，Figshare平台还与20多家知名出版社合作，更加高效地实现数据共享。平台通过给研究成果分配DOI，使得科研数据的利用率以及研究人员和出版商的学术声誉都得到了提高。科研数据的免费使用、操作页面方便简单等一系列优势使得Figshare数据库受到科研人员的一致赞赏。文章详细介绍了在该平台搜索、下载数据，上传数据。Figshare平台以提高学术研究的传播性、可重用性和可发现性为主要目标，以各种形式呈现的研究成果能够更好地被引用、发现以及分享为服务理念，以研究工作流程的简化为唯一的服务宗旨，此平台将会逐渐发展壮大。