外周血Circ_0070934/miR⁃199a⁃5p/MGAT3 作为生物标志物在过敏性鼻炎⁃哮喘综合征中的诊断价值
2022-09-14胡钰洁黄燕华刘志光施宇佳
胡钰洁,吴 迪,黄燕华,刘志光,施宇佳,张 倩
南京医科大学附属常州第二人民医院呼吸与危重症医学科,江苏 常州 213003
支气管哮喘(哮喘)是一种反复发作的慢性气道疾病,以慢性气道炎症、气道高反应、可逆性气流受限和气道重塑为特征,表现为反复发作的喘息、气促、胸闷、咳嗽等呼吸道症状[1]。过敏性鼻炎和哮喘分别表现为上呼吸道和下呼吸道炎症,两者在病因、免疫学和发生机制等方面均极为相似,因此,根据“同一气道、同一疾病”概念,近年来提出过敏性鼻炎⁃哮喘综合征(combined allergic rhinitis and asth⁃ma syndrome,CARAS)这一新医学诊断名称,指同时发生的临床或亚临床上呼吸道过敏(过敏性鼻炎)和下呼吸道过敏性症状(哮喘)[2]。
非编码RNA(non⁃coding RNA,ncRNA)是指转录组中不翻译为蛋白质的RNA分子,包括长链非编码RNA(long non⁃coding RNA,lncRNA)、微小RNA(microRNA,miRNA)、环形RNA(circular RNA,circ⁃RNA)等[3]。ncRNA在过敏性疾病(包括过敏性鼻炎和哮喘)的发生发展中发挥重要作用,参与了气道炎症应答、气道重塑、气道高反应、上皮分化、黏液生成等重要过程,并有望成为疾病诊断的生物标志物和治疗靶标[4]。研究报道,miR⁃199a⁃5p在中性粒细胞哮喘患者外周血及诱导痰液中的表达升高,并且和肺功能呈负相关[5],但在CARAS患者中的表达水平变化及相关研究未见文献报道。本研究通过circBANK 基因库预测到环形RNA circ_0070934 与miR⁃199a⁃5p 结合,并且通过Targetscan 预测miR⁃199a⁃5p 靶向调控甘露糖甙乙酰氨基葡糖转移酶(mannoside acetylglucosaminyltransferase 3,MGAT3)。本研究旨在通过比较CARAS患者和健康对照外周血中circ_0070934/miR⁃199a⁃5p/MGAT3 的表达差异,探讨其作为CARAS早期诊断生物标志物的价值,评估其与CARAS患者相关临床指标之间的相关性,为进一步研究其在CARAS发生发展中的机制打下基础。
1 对象和方法
1.1 对象
本研究于2020 年7 月—2021 年12 月在南京医科大学附属常州二院呼吸与危重症医学科门诊收集38 例CARAS 患者和43 例性别、年龄匹配的健康对照。过敏性鼻炎诊断标准参照中国过敏性鼻炎诊治指南[6],哮喘诊断根据我国2020版支气管哮喘防治指南[7],CARAS 的诊断须同时符合过敏性鼻炎和哮喘的诊断标准。正常对照组为健康志愿者,无哮喘和过敏性鼻炎病史,无其他过敏性及免疫系统疾病等。CARAS患者为初诊患者,未使用抗哮喘药物。所有受试者均需排除合并感染、肺栓塞、慢性阻塞性肺疾病、肺结核、血液系统疾病及肝脏功能异常等疾病,均进行血常规、肝功能、肾功能、血糖、血脂以及心电图等检查以排除基础疾病。所有受试者均需签署知情同意书,本研究获得南京医科大学附属常州二院伦理委员会批准(批件号:[2020]KY213⁃01)。
1.2 方法
1.2.1 采集血液样本
用EDTA抗凝管收集患者和健康对照的静脉外周血10 mL,其中5 mL 低速离心机3 000 r/min 离心10 min,分离血清,用于ELISA 测量MGAT3 蛋白水平;另留存5 mL 全血用于qRT⁃PCR 测定circ_0070934、miR⁃199a⁃5p及MGAT3的表达水平。所有受试者的血液样本均储存于-80 ℃。
1.2.2 ELISA测定
人MGAT3 ELISA试剂盒(上海科兴生物科技有限公司)对CARAS 患者和对照组血清样本中MGAT3的含量进行检测,严格按照试剂盒说明书进行实验和操作。
1.2.3 qRT⁃PCR检测
使用RNAliquid 超速全血总RNA 提取试剂盒(北京汇天东方科技有限公司)提取总RNA,实验步骤按照说明书进行。使用紫外线分光光度计对提取的RNA 浓度及纯度进行检测。采用FastQuant cDNA 第一链合成试剂盒(北京天根生化科技有限公司)进行反转录,合成mRNA cDNA/circRNA cDNA。采用miRNA 第一链cDNA 合成(加尾法)(上海生工生物工程股份有限公司)进行反转录。使用Super⁃Real PreMix Plus(SYBR Green)(北京天根生化科技有限公司)对mRNA和circRNA进行扩增,使用miR⁃NA 荧光定量PCR 试剂盒(染料法)(上海生工生物工程股份有限公司)对miRNA 进行扩增,用ABI 7300型荧光定量PCR仪,采用2-ΔΔCT法进行数据的相对定量分析。circ0070934 的内参为GAPDH,MGAT3 的内参为GAPDH+ACTB,miRNA 的内参为U6。MGAT3、circ_0070934、ACTB、GAPDH 的上下游引物和miR⁃199a⁃5p的上游引物由北京博迈德公司合成,U6 的上下游引物和miR⁃199a⁃5p 的下游引物为miRNA 荧光定量PCR 试剂盒提供的通用引物。引物序列如下:MGAT3(F:5′⁃TCCTGTTTCCCT⁃CACTGTGC⁃3′;R:3′⁃ACACACGCACAA⁃ACAT⁃GAGC⁃5′);circ_0070934(F:5′⁃GGTGAAAG⁃GACT⁃GATCAACCAT⁃3′;R:5′⁃TGTCTTGAGCTT⁃TCCT⁃GCCT⁃3′);miR⁃199a⁃5p(F:5′⁃CCCAGTGTT⁃CAGACTACCTGTTC⁃3′);ACTB(F:5′⁃TCCGCAAA⁃GACCTGTACGC⁃3′;R:5′⁃CTGGAAGGTGGACAGC⁃GAG⁃3′);GAPDH(F:5′⁃TCGACAGTCAGCCGCAT⁃CTTCTTT⁃3′,R:5′⁃ACCAAATCCGTTGACTCCGAC⁃CTT⁃3′)。
1.3 统计学方法
采用SPSS 21.0 统计软件,计量资料采用Kol⁃mogorov⁃Smirnov 检验进行正态性检验,对符合正态分布的计量资料以均数±标准差()表示,不符合正态分布的计量资料以中位数(四分位数)[M(P25,P75)]表示,分类变量资料以比例表示,两样本比较采用t检验(正态分布的资料)或Mann⁃WhitneyU检验(非正态分布资料),相关关系采用Pearson 相关分析(正态分布的资料)或Spearman 秩相关分析(非正态分布的资料),受试者操作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线判断诊断灵敏度与特异度,通过曲线下面积(area under the curve,AUC)判断诊断效果,AUC=0.5,无诊断价值,AUC 越接近1,提示诊断越准确,P<0.05 为差异有统计学意义(双尾法)。
2 结果
2.1 研究对象的临床特征
本研究纳入38 例CARAS 患者及43 例健康对照,两组年龄、性别、体重指数(body mass index,BMI)匹配。与健康对照组相比,CARAS 组患者肺功能第1 秒用力呼气容积占预计值百分比(percent predicted forced expiratory volume in one⁃ second,FEV1%pred)及第1 秒用力呼气容积占用力肺活量比值(the first second forced expiratory volume ratio of forced vital capacity,FEV1/FVC)显著降低(P<0.05),而嗜酸性粒细胞(eosinophils,EOS)绝对值、EOS 比例及呼出气一氧化氮(FeNO)明显高于对照组(P<0.001,表1)。
表1 研究对象临床特征Table 1 Clinical characteristics of subjects
2.2 CARAS 组与健康对照组血浆MGAT3 的表达水平
ELISA 实验结果显示,CARAS 组患者外周血血浆MGAT3 的表达量(0.20±0.05)较对照组(0.32±0.31)明显下降(P=0.035,图1)。
图1 CARAS组与健康对照组血浆MGAT3的表达水平Figure 1 Expression level of plasma MGAT3 in CARAS group and healthy control group
2.3 CARAS 组与健康对照组circ_0070934、miR⁃199a⁃5p及MGAT3的表达水平
qRT⁃PCR 结果显示,与健康对照组相比,MGAT3 在CARAS 组中表达明显降低(图2A,P<0.001),circ_0070934 在CARAS 组中表达也明显降低(图2B,P=0.001),而miR⁃199a⁃5p 的表达量则明显上调(图2C,P=0.013)。
图2 CARAS组与健康对照组外周血中MGAT3、miR⁃199a⁃5p和circ_0070934表达水平Figure 2 Expression levels of MGAT3,miR⁃199a⁃5p and circ_0070934 in peripheral blood of CARAS group and healthy control group
2.4 circ_0070934/MGAT3/miR⁃199a⁃5p 与CARAS患者临床指标的相关性
CARAS 患者外周血MGAT3 mRNA 水平与EOS绝对值(r=0.412,P=0.011)、EOS 比例呈正相关(r=0.469,P=0.003),circ_0070934 与EOS 绝对值(r=-0.516,P=0.001)、EOS 比例呈负相关(r=-0.348,P=0.035)(表2,图3)。MGAT3、circ_0070934与FeNO、FEV1%pred 及FEV1/FVC 没有相关性。miR⁃199a⁃5p与EOS 绝对值、EOS 比例、FeNO、FEV1%pred 及FEV1/FVC均没有明显相关性(表2)。
图3 circ_0070934/MGAT3与CARAS患者临床指标的相关性Figure 3 Correlation between circ_0070934/MGAT3 and clinical indexes of CARAS patients
表2 circ_0070934/miR⁃199a⁃5p/MGAT3与CARAS患者临床指标的相关性Table 2 Correlation between circ_0070934/miR⁃199a⁃5p/MGAT3 and clinical indexes of CARAS patients
2.5 circ_0070934/miR⁃199a⁃5p/MGAT3 在CARAS中的诊断效果
ROC 曲线分析以评估MGAT3、miR⁃199a⁃5p 和circ0070934 作为CARAS 生物标志物的价值(表3、图4)。当界值(cut⁃off value)为0.208 时,MGAT3 mRNA作为CARAS 生物标志物的灵敏度为73.7%,特 异度 为100.0%,AUC 为0.933(95%CI:0.882~0.984,P<0.001),此指标作为CARAS 生物标志物的诊断价值最佳。多因素联合诊断ROC 曲线分析(表3、图5),当界值为0.539 时,MGAT3、miR⁃199a⁃5p 与circ_0070934 作为联合诊断CARAS 的生物标志物的灵敏度为92.1%,特异度为93.0%,AUC 为0.959(95%CI:0.916~1.000,P<0.001)。
图4 MGAT3、miR⁃199a⁃5p 和circ_0070934 作为CARAS生物标志物的ROC曲线分析Figure 4 ROC curve analysis of MGAT3,miR⁃199a⁃5p and circ_0070934 as CARAS biomarkers
图5 MGAT3、miR⁃199a⁃5p和circ_0070934作为CARAS生物标志物的多因素联合ROC曲线分析Figure 5 Multivariate combined ROC curve analysis of MGAT3,miR⁃199a⁃5p and circ_0070934 as CARAS biomarkers
表3 MGAT3、miR⁃199a⁃5p和circ_0070934作为CARAS生物标志物的价值Table 3 Value of MGAT3,miR⁃199a⁃5p,circ_0070934 as biomarkers of CARAS
3 讨论
过敏性鼻炎和哮喘被认为是同一疾病的两种表现,80%的哮喘患者患有过敏性鼻炎,而60%的过敏性鼻炎会发展为哮喘[2,8]。目前CARAS的诊断主要参照过敏性鼻炎和哮喘的两个诊治指南,尚无CARAS 相关诊断生物标志物的报道。本研究首次在CARAS 患者外周血中检测circ_0070934/miR⁃199a⁃5p/MGAT3 水平,发现circ_0070934 与MGAT3的表达较健康对照下调,而miR⁃199a⁃5p 的表达水平上调。
研究报道,miR⁃199a⁃5p在中性粒细胞哮喘患者外周血及诱导痰液中的表达升高,并且和肺功能呈负相关,但与外周血EOS 无相关性[5]。本研究也未发现miR⁃199a⁃5p与CARAS患者EOS之间存在相关性,提示miR⁃199a⁃5p可能不参与调节EOS。但本研究发现CARAS患者的外周血circ_0070934表达水平与EOS绝对计数和EOS比例都呈负相关,MGAT3的表达水平则与之呈正相关,提示circ_0070934 和MGAT3可能与EOS炎症密切相关,其具体机制有待进一步研究。
本研究用ROC 曲线分析circ_0070934、miR⁃199a⁃5p 和MGAT3 在CARAS 中的诊断价值,发现MGAT3取界值为0.208时,灵敏度和特异度高(分别为73.7%和100.0%),为最佳参数。其次是circ_0070934,取界值为0.620 时,灵敏度为71.1%,特异度为69.8%。而miR⁃199a⁃5p则相对较低,取界值为1.166 时,灵敏度为55.3%,特异度为72.1%。另外,本研究又对这些指标进行了多因素联合的ROC曲线分析,发现当circ_0070934、miR⁃199a⁃5p 和MGAT3 3 个指标联合时,对CARAS 的诊断价值最高,取界值为0.539 时,灵敏度为92.1%,特异度为93.0%。可以看出,在单因素诊断CARAS 时,MGAT3的诊断价值最高,但多因素联合诊断的价值要明显高于单因素,尤其是circ_0070934、miR⁃199a⁃5p 和MGAT3 3个检测指标联合后,对于CARAS 的诊断有着非常重要的意义。因此,外周血circ_0070934、miR⁃199a⁃5p 和MGAT3 都可以作为诊断CARAS 的潜在生物标志物,值得扩大样本进一步验证。
上皮⁃间充质转化(epithelial⁃mesenchymal tran⁃sition,EMT)是上皮细胞呈现迁移性间充质表型的过程,EMT 可分为3种类型,Ⅰ型与胚胎着床、发育和器官形成相关,Ⅱ型与损伤修复、组织再生、纤维化和炎症相关,Ⅲ型参与了癌症的进展和转移。其中,与特应性疾病相关的Ⅱ型EMT,对肺、鼻腔、肠道和皮肤的上皮更新和炎症有很大影响[9]。EMT对正常组织修复和通过多种炎症途径发出信号至关重要。支气管上皮细胞EMT 的增加会导致支气管哮喘屏障功能障碍。支气管哮喘的典型特征即慢性气道炎症、气道重塑、气道高反应和可逆性气流受限,气道重塑过程涉及气道上皮细胞中纤维母细胞的增加,最终导致纤维化,而EMT 可以解释这些纤维母细胞的起源[10]。EMT 在过敏性鼻炎中的研究相对较少,并且大多数研究主要使用患者的慢性鼻窦炎组织,通过活检组织中EMT标志物将其分为发生鼻息肉和未发生鼻息肉的亚型[11]。
MGAT3基因最初在母鸡输卵管中被发现,由它编码的N⁃乙酰氨基葡萄糖转移酶3(N⁃acetylglucos⁃aminyltransferase Ⅲ,Gnt Ⅲ),参与了多种肿瘤的EMT 过程,对肿瘤细胞的迁移有调控作用[12]。在TGF⁃β1诱导处理的人肝癌细胞中,GnT Ⅲ基因表达及其催化产物——平分型N⁃乙酰葡萄糖胺(N⁃acetyl⁃glucosamine,GlcNAc)结构降低,Smad3和Erk1/2的磷酸化上调,最终导致了肝细胞癌的EMT[13]。Pinho等[14]发现,MGAT3和GnT Ⅲ介导的E⁃cadherin的N⁃糖基化丢失是EMT 的机制,在EMT 过程中,MGAT3的表达显著降低。在宫颈癌中,MGAT3的过度表达导致上皮分化标志物E⁃cadherin 的表达增加,间充质标志物N⁃cadherin 和β⁃catenin 的表达降低,从而抑制了宫颈癌细胞转移[15]。乳腺癌细胞中MGAT3的过度表达抑制了细胞迁移、增殖、集落形成、EMT标志物的表达和AKT信号通路[16]。另外,miR⁃199a⁃5p也在如卵巢癌、乳腺癌、喉癌、口腔鳞癌、甲状腺癌、结直肠癌、侵袭性膀胱癌等多种恶性肿瘤中表现出了抑制EMT 的作用[17-23]。但在另外一些如肝细胞癌、胃癌、宫颈癌及前列腺癌等肿瘤中却也可促进肿瘤细胞EMT的过程[24-27]。
虽然目前已有许多研究证实miR⁃199a⁃5p 和MGAT3 这两种生物标志物在肿瘤细胞EMT 过程中发挥了不可或缺的作用,但其是否参与CARAS 的EMT 过程,从而影响患者气道重塑过程尚未明确。而且对于circ_0070934 的研究较少,目前只知它参与了皮肤鳞状细胞癌的侵袭和增殖[28],但具体机制尚不清楚。探索circ_0070934/miR⁃199a⁃5p/MGAT3在CARAS EMT 中的作用和机制将成为下一步研究的目标,这对于发现CARAS新的治疗靶点有着重要意义。
慢性鼻窦炎伴鼻息肉(chronic rhinosinusitis with nasal polyps,CRSwNP)常与支气管哮喘和鼻炎共存[29]。研究表明,哮喘使鼻息肉的风险增加了3.5倍,过敏性鼻炎则使患鼻息肉的风险增加2.5 倍[30]。轻度和中度哮喘患者的鼻息肉患病率分别为4.8%和9.6%,而重症哮喘患者达到44.6%[31]。鼻息肉和哮喘共病(nasal polyps and comorbid asthma,NPCA)的患者有两种不同的炎症表型:嗜酸性和非嗜酸性,并且上下气道的炎症类型一致。与非嗜酸性NPCA 患者相比,嗜酸性NPCA 患者哮喘表型更严重,FeNO和IgE水平更高,血EOS增多,药物治疗后鼻息肉复发率也增加[32]。伴有CRSwNP的重症哮喘通常是一种高EOS 类型,其特征是2 型固有淋巴细胞(innate lymphoid cells,ILC2)激活,释放IL⁃5和IL⁃13,以及相对少量的IL⁃4[33]。这些细胞因子通过趋化EOS,促进气道炎症细胞浸润[34-36]。另一项研究也发现,EOS计数和FeNO水平低的重症哮喘患者鼻息肉的发生率显著低于数值较高者,EOS 计数大于420 个/μL 和FeNO 水平≥39 ppb 是重症哮喘伴随鼻息肉的最佳预测因子[37]。鼻息肉的存在与哮喘患者的肺功能FEV1的加速下降显著相关[38]。因此,鼻息肉的存在对哮喘患者的症状、表型、类型、严重度及预后都有着显著影响,呼吸道过敏性疾病与鼻息肉同时存在无疑会加重炎症过程,使治疗受阻并复杂化,增加复发率。本研究并没有纳入鼻息肉,鉴于鼻息肉的存在与EOS 和FeNO 有正相关性,而本研究发现circ_0070934/miR⁃199a⁃5p/MGAT3 与EOS和FeNO 有相关性,因此合理猜测circ_0070934/miR⁃199a⁃5p/MGAT3与鼻息肉也存在某种联系,其具体作用机制值得进一步研究探讨。
综上所述,本研究发现circ_0070934/miR⁃199a⁃5p/MGAT3 可以作为CARAS 诊断的生物标志物。CARAS的发生发展机制仍有许多未明晰的地方,本研究仅挑选circ_0070934/miR⁃199a⁃5p/MGAT3作为切入点探索这些指标在CARAS 患者外周血中的表达水平及其意义,其具体作用机制需进一步深入研究,为CARAS的早期诊断和治疗提供更多思路和理论支持。