APP下载

94例乳腺癌患者BRCA1/2基因突变研究

2022-03-12

山东医学高等专科学校学报 2022年1期
关键词:致病性基因突变位点

(临沂国众医学检验有限公司,山东 临沂 276000)

乳腺癌易感基因(Breast cancer susceptibility gene,BRCA)是重要的抑癌基因,包括BRCA1和BRCA2。BRCA在DNA修复的同源性重组机制中扮演重要角色,BRCA基因突变会导致基因组不稳定性显著增加。胚系BRCA1/2突变(gBRCAm)将显著提高乳腺癌、卵巢癌、胰腺癌、前列腺癌以及其他癌症的发病风险,且发病呈年轻化趋势。相关研究表明,约5%-10%的乳腺癌和15%-22%的卵巢癌是由BRCA1/2基因突变导致的[1]。BRCA基因致病性突变使女性发生乳腺癌风险提高5倍,发生卵巢癌风险提高10-30倍[2]。因此,通过BRCA基因检测,了解其状态,有助于采取预防性手术及评估家属遗传风险。

1 材料与方法

1.1研究对象 选取2019年8月—2020年6月在本公司实验室进行BRCA基因检测的乳腺癌患者94例,其中男1例,女93例;年龄26-68岁,平均(41.16±8.93)岁;其中10例有乳腺癌家族遗传史。

1.2方法 核酸抽提及纯度测定:抽取患者静脉血5 mL,采用北京天根血液基因组DNA提取试剂盒提取基因组DNA,提取后采用超微量核酸蛋白测定仪进行DNA浓度及纯度测定。文库制备及NGS测序由杭州联川基因诊断技术有限公司完成。所有核酸序列位置编码参考美国国家生物技术信息中心网站的GenBank上的野生型cDNA序列;采用Blast程序确定检测的位点是否引起氨基酸编码改变,把检测到的位点在乳腺癌信息中心网站上进行对照,确定是否为新的突变位点。BRCA基因变异风险程度参考《BRCA数据解读中国专家共识》。

2 结果

94例乳腺癌患者中,共检测到10例致病性突变,突变率为10.64%,其中2例有乳腺癌家族遗传史,8例为散发,二者比较无统计学意义(χ2=1.03,P=0.31)。其中6例存在BRCA1基因突变,突变率为6.38%(6/94);4例存在BRCA2基因突变,突变率为4.26%(4/94);二者比较无统计学意义(χ2=0.42,P=0.516)。所有突变位点均经一代测序验证,结果一致。突变情况见表1,致病性突变位点测序见图1。

表1 乳腺癌基因突变位点

图1 致病性突变的测序图谱

BRCA1基因中发现5个突变位点,其中1个为新发现位点突变c.5511-5524delGGTGTTGGACAGTG(p.Trp1837fs),且经一代测序验证,结果一致,该突变为移码突变,推测导致蛋白翻译提前终止;其余4个为已报道的致病点突变(c.212G>A;c.5539T>C)和致病剪切位点突变(c.212+1G>T;c.135-2A>G),可引起 BRCA1基因转录后剪切异常,进而影响其蛋白功能。

BRCA2基因中发现3个突变位点,2个为新发现位点:c.5895delT和c.1498-1499insT,均为移码突变。c.5895delT(p.His1966fs)推测导致蛋白翻译提前终止;c.1498-1499insT (p.Gly500fs)属于功能缺失性变异,该变异是非重复区域内单个核苷酸的插入,可能影响蛋白质功能。另外1个为已报道的致病性突变c.8504C>A,导致蛋白发生截短变异。

3 讨论

近年来研究表明,BRCA1/2突变在乳腺癌的发病过程中起着非常重要的作用。BRCA1基因定位于人类染色体17q21,长度约81 kb,BRCA1蛋白和多种相关蛋白共同作用维持基因组的稳定,同时在DNA损伤修复、细胞周期、基因转录调节、细胞凋亡等机制中发挥着重要的生物学功能。BRCA2是一种抑癌基因,位于第13号染色体13q12.3位置,全长84193 bp,编码3418个氨基酸残基组成的蛋白质,该蛋白质通过同源重组及部分调节RAD51的活性参与DNA损伤的修复,进而阻止癌细胞的生长发育[3]。

BRCA基因突变率在不同人群存在较大差异[4-5]。本研究结果显示,BRCA1的突变率(6.38%)高于BRCA2(4.26%),但二者尚无统计学意义。这可能与人群的选择及检测方法不同有关。本次研究中,有家族遗传史的乳腺癌患者中有一对母女(9号和10号)发生了相同的基因突变,提示我们有家族遗传史的高风险人群,应及早进行基因筛查,提前做好健康管理及干预,具有非常重要的意义。

总之,本次对94例乳腺癌患者进行的BRCA1/2检测,共发现3个新的突变位点,这3个位点突变类型均为移码突变,涵盖BRCA1和BRCA2基因区域。这一实验结果进一步丰富了乳腺癌患者BRCA基因突变谱,也为中国人群BRCA基因相关研究提供一定的基础资料,并为未来的临床基因检测提供了筛查模式。

猜你喜欢

致病性基因突变位点
高致病性FAdV-4分离株fiber2结构蛋白表达和细胞内定位的分析
Pd改性多活性位点催化剂NH3-SCR脱硝反应机理研究
基于网络公开测序数据的K326烟草线粒体基因组RNA编辑位点的鉴定与分析
基因型和表现型的快速判断法
一种改进的多聚腺苷酸化位点提取方法
基因突变的“新物种”
“基因突变和基因重组”复习导航
鸡大肠杆菌的血清抗性与致病性检验
台湾地区及多国发生禽流感,以色列发生新城疫