羌活-独活治疗膝骨关节炎的作用机制
2022-03-08吴鹏时孝晴廖太阳王培民张农山黄正泉丁亮邢润麟茆军
吴鹏 时孝晴 廖太阳 王培民 张农山 黄正泉 丁亮 邢润麟 茆军
南京中医药大学附属医院,江苏 南京210029
膝骨关节炎(knee osteoarthritis, KOA)是一种以膝关节疼痛、活动受限、僵硬甚至畸形为主要症状的慢性退行性骨关节疾病[1]。患者年轻化、发病率逐渐上升,使KOA已成为全球范围内的公共卫生问题[2]。目前,无论是药物还是手术治疗均具有一定局限性,中医药在KOA的治疗上历史悠久、副作用较少、疗效确切[3]。羌活-独活二者经常被用于风寒湿引起的关节疼痛、风湿骨病[4]。羌活辛、苦,性温,辛温解表、散寒止痛、通利关节,为治疗风寒湿痹之要药,独活辛、苦、微温,祛风除湿、疏经通络、通痹止痛,能散在里之伏风,二者一上一下,一表一里,相须为用。二者作为药对出现最早记载于《外台秘要》:羌活行上焦而理上……独活行下焦而理下……二者配伍,直通上下,横行肢臂、腰膝、治各类风寒湿痹皆可[5]。但中药成分复杂,具体作用机制还需进一步研究,借助现代网络药理学,探讨羌活-独活药对治疗膝骨关节炎的作用机制,为其治疗KOA提供有力的理论支撑,有助于中医药的现代化。
网络药理学通过分析药物、基因和蛋白的相互作用,发现其相互作用网络,这与中医药的“整体观、系统观”十分契合[6-8],目前,网络药理学已被广泛运用于中药药理机制研究、药物重新定位、毒副作用等相关研究[9-11]。本研究拟通过网络药理学,探讨羌活-独活治疗KOA的潜在作用靶标和信号通路,为羌活-独活治疗KOA提供科学依据。
1 材料与方法
1.1 筛选羌活-独活活性成分
通过中药系统药理学数据库和分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCMSP)以“羌活,独活”为关键词检索所有化合物活性成分信息,筛选条件:药物口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥ 30%,药物相似性(drug-likeness,DL)≥ 0.18,筛选出羌活-独活活性成分[12-14]。
1.2 筛选羌活-独活和KOA相关靶点
通过GeneCard、OMIM、PharmGkb、Therapeutic Targets和DrugBank 数据库,以“Knee osteoarthritis”为关键词,检索与KOA相关的基因,通过Uniprot数据库(https://www.uniprot.org/uniprot/)将上述获得的羌活-独活作用靶标转化为对应的基因名称,再将羌活-独活活性成分的靶点预测结果与检索出的KOA相关靶标进行匹配,筛选交集靶点,确定羌活-独活治疗KOA的核心靶点,通过Venny2.1.0(https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html)绘制韦恩图。
1.3 构建羌活-独活活性成分与KOA作用靶点网络
将筛选出的12个羌活-独活活性成分和16个KOA的相关靶点导入Cytoscape 3.8.0软件构建羌活-独活活性成分与KOA靶点网络[15]。
1.4 构建蛋白互作网络(PPI)及筛选核心基因
将上述羌活-独活的蛋白靶点导入String数据库(https://string-db.org/),设置物种:Homo sapiens,置信度:0.4,绘制PPI网络,通过拓扑分析筛选关键靶点,使用R project软件制作显示基因名和与其相连节点数的条形图。
1.5 GO和KEGG富集分析
使用RGUI和org.Hs.eg.db将所得到的羌活-独活治疗KOA潜在靶点转化为entrezID后再使用RGUI、DOSE和ClusterProfiler对相关靶点进行GO和KEGG富集分析。选择富集程度最高的前20条通路。
1.6 分子对接
使用Discovery Studio 2016 3.0对羌活-独活活性成分与3个KOA核心靶点通过分子对接进行间接验证。羌活-独活类药成分与KOA作用靶点分别通过Chemical Book数据库和PCSB PDB数据库获取。将上述获得的靶蛋白进行去水、加氢等处理,保存为对接受体。使用LibDock模块进行分子对接,保存各图像。通过LibDock score结果评价活性成分和关键靶点之间的对接效应,LibDock score 分数越高表明配体与受体蛋白结合性越好。
2 结果
2.1 羌活-独活活性成分
在TCMSP数据库中根据OB≥ 30%,DL≥ 0.18的原则下筛选出羌活-独活15种活性成分,最终纳入12个有效活性成分,详见表1。
2.2 羌活-独活活性成分与KOA作用靶点的构建
通过TCMSP平台筛选出羌活-独活中分成35个有效活性成分作用靶标,在GeneCard、OMIM、PharmGkb、Therapeutic Targets和DrugBank 数据库中检索到1 952个与KOA相关靶点,映射后得到16个共同靶基因,韦恩图见图1,羌活-独活活性成分靶标见表2。
表1 TCMSP中筛选羌活-独活的活性成分
图1 羌活-独活成分与KOA靶点韦恩图Fig.1 Venn map of ingredient of ligustrilucidi-Notopterygium incisum-Angelica pubescens-KOA
表2 羌活独活治疗KOA潜在靶点信息
图3 羌活-独活治疗KOA潜在核心靶点Fig.3 Potential core targets for Notopterygium incisum-Angelica pubescenstreating KOA
2.3 羌活-独活活性成分与KOA靶点网络的构建
将12种活性成分与16个KOA相关作用靶点进行映射后导入Cytoscape 3.8.0构建羌活-独活成分-KOA靶点网络,见图2。
图2 羌活-独活成分-KOA靶点网络Fig.2 Ingredient of Notopterygium incisum-Angelica pubescens-target network of KOA注:蓝色长方形:中药名称;红色菱形:疾病名称;黄色椭圆形:药物有效成分;绿色椭圆形:疾病作用靶标。
2.4 核心靶点筛选
将16个关键靶标导入STRING数据库,PPI网络显示其中16个节点,43条边,将TSV数据导入Cytoscape,基于度中心性(degree centrality,DC)、介数中心度(betweenness centrality,BC)、接近中心性(closeness centrality,CC)使用CytoNCA对上述数据进行分析,删除2个孤立点,对剩下的14个节点进行第1次筛选,DC≥ 6.000,BC≥ 0.619,CC≥ 2.767,网络显示共有5个节点,10条边,再对这5个节点进行第2次筛选,DC≥ 9.000,BC≥ 0.765,CC≥ 21.867,网络显示共有3个节点,3条边,最终得到的JUN、PTGS2、CASP3为核心靶点,见图3。
2.5 GO和KEGG通路富集分析
GO分析显示羌活-独活能够参与核受体的活动、配体激活的转录因子活性等相关过程,见图4。KEGG富集分析显示主要与细胞凋亡、雌激素、P53、IL-17、AGE-RAGE等信号通路密切相关,见图5。
图4 羌活-独活活性成分潜在治疗KOA靶点的GO功能分析Fig.4 GO biological process enrichment analysis of Notopterygium incisum-Angelica pubescens against KOA
图5 羌活-独活活性成分潜在治疗KOA靶点的KEGG富集分析Fig.5 KEGG signaling pathway of Notopterygium incisum-Angelica pubescens against KOA
2.6 分子对接分析
分子对接结果显示,羌活-独活活性成分与筛选出的JUN、PTGS2、CASP3均能较好对接,与网络药理学筛选结果相吻合,间接验证了羌活-独活能够调节KOA的核心靶点。配对结果见表3,部分对接过程见图6。
3 讨论
KOA作为一种慢性、高致残性疾病,给患者及社会带了沉重的经济负担,现已成为医学领域亟待解决的公共健康问题。疼痛是KOA最常见的症状,超过65 %的KOA患者以疼痛为最主要表现。多数就诊的KOA患者表示疼痛是影响其生活质量的重要原因,控制疼痛是其最主要的就诊目的[16]。对症状性的KOA患者,口服或局部使用非甾体类抗炎药或曲马多是常见的诊疗手段[17]。但不可否认的是,尽管西药的运用获得了一定的成效,但远期临床疗效仍难尽人意。与此同时,非甾体类抗炎药在治疗
表3 配体受体蛋白分子对接情况Table 3 Molecular docking of Ligand receptor protein
图6 羌活-独活活性成分和KOA靶点beta-sitosterol对接过程Fig.6 The docking process of active ingredient of Notopterygium incisum-Angelica pubescens with beta-sitosterol of KOA targets注:a~c依次为CASP3、JUN、PTGS2与beta-sitosterol对接过程。
KOA的同时,还会引起胃肠道及心血管等方面的副作用[18-19]。
在祖国医学中,KOA属于“痹症”范畴,《素问·痹症》记载到:风寒湿三气杂至,合而为痹也”,大多数KOA患者为老年人,年老体弱,肝肾不足,气虚亏虚,不足以濡养经脉,再加上风、寒、湿三邪入侵,寒湿凝滞,气血淤阻,不通则痛[20]。中医药具有多通路、多靶点、多途径的作用特点,对复杂性疾病往往能更好的发挥治疗作用。网络药理学作为一种药物研究策略,在中医药的研究中已得到广泛应用,有利于我们更好的了解药物及其化合物的作用[21]。此外,分子对接有助于揭示药物与靶点之间的关系。
羌活-独活对KOA的治疗疗效显著,然而分子层面的相关研究相对缺乏。因此,在本研究中,结合拓扑分析和分子对接策略,通过构建和分析目标网络,对目标进行富集分析,揭示潜在机制。本研究筛选出了羌活-独活的12个活性成分和16个防治KOA的作用靶点。有研究[22]显示,羌活-独活联用较单味药能更减缓佐剂关节炎大鼠的足趾肿胀,提高机械刺激疼痛阈值,抑制炎症因子的分泌。其中欧前胡素抗炎镇痛作用已得到广泛研究[23-25]。异欧前胡素能够抑制脂多糖刺激的RAW264.74小鼠巨噬细胞NO的释放[26]。佛手柑内酯对大鼠成骨细胞的增殖和分化具有促进作用[27]。香叶木素可以改善KOA软骨细胞变形,增加软骨细胞数量,能够缓解软骨细胞凋亡和免疫反应[28]。由此可见羌活-独活能够多通路、多靶点治疗KOA。
富集分析显示,羌活-独活能够参与半胱氨酸型内啡肽酶活性参与凋亡过程,核受体的活动、配体激活的转录因子活性、类固醇激素受体活性等相关通路,与细胞的增殖、凋亡和调控细胞代谢密切相关。KEGG富集分析显示相关通路主要包括细胞凋亡、雌激素、P53、IL-17、AGE-RAGE等信号通路。CASP3、CASP8、CASP9和PTGS2都是与凋亡密切相关的蛋白酶,CASP3不仅能够激活CASP6、CASP7和CASP9,还能调控细胞的迁移、侵袭,在KOA中与软骨的退变和软骨细胞凋亡关系密切[29-31]。BAX主要位于细胞质,能够释放下游凋亡因子,当BAX过表达会抑制BCL-2的活性,促进细胞凋亡[32-33]。JUN是激活蛋白1的亚单位之一,JNK受刺激后能促进JUN磷酸化,扩大炎症反应[34]。AR是一种配体依赖性反转录调节蛋白,雄激素能够通过AR干预细胞免疫和细胞因子起到抗炎作用[35-36]。ESR1是一种配体依赖的转录因子,常表达于软骨细胞、破骨细胞、成骨细胞以及骨髓基质细胞等,雌二醇靶向ESR1能够抑制ERK信号通路,激活自噬,抑制凋亡,调控软骨细胞增殖[37]。正常软骨中没有NOS2表达,当NOS2受到相关刺激则能升高NO,增加对软骨的破坏[38]。
综上,本研究运用网络药理学的方法,对“羌活-独活”治疗KOA的作用机制进行了探究,同时通过分子对接将核心靶点与关键成分进行对接验证,间接证实了本研究的准确性和可靠性。通过分析,筛选出羌活-独活12种活性成分和16个潜在作用靶点,初步推测羌活-独活可能通过欧前胡素、异欧前胡素、佛手柑内酯、香叶木素、谷甾醇等有效活性成分调控CASP3、JUN、CASP8、AR等靶点调节细胞凋亡、雌激素、P53、IL-17、AGE-RAGE等信号通路,抑制炎症,干预细胞凋亡过程,从而起到治疗KOA的作用。本研究初步阐释了羌活-独活治疗KOA的合理性,为羌活-独活治疗KOA提供了理论依据和新的方向。