以问题解决为导向,构建高效生物课堂
——以“DNA的PCR扩增”教学为例
2021-12-01□高成
□高 成
(杭州第七中学,浙江杭州 310024)
苏霍姆林斯基说:“人的心灵深处有一种根深蒂固的需要,就是希望自己是一个发现者、研究者、探究者。”科学探究要求学生能够发现生活中的科学问题,并进行观察、提问、实验设计、方案实施和结果交流讨论[1]。在科学探究的过程中,学生可以亲历科学事实的发现过程,掌握科学探究的基本方法和技能,主动进行意义建构,完善知识网络,拓展思维深度和广度。因而,科学探究被认为是学习科学的有效途径[2]。
PCR 技术(聚合酶链式反应)是利用DNA聚合酶在体外进行DNA复制的过程。所涉及的反应过程都是微观的化学反应,学生没有直观认识,也难以理解其在疾病诊断、医学鉴定、科学研究等方面发挥的关键作用。在以往的教学过程中,这部分内容往往采用的是理论讲解或者观看动画等方式,学生缺乏真实体验,学习效率不高。随着技术的发展与成熟,PCR 技术早已不是什么高深的实验内容。在杭州的普通高中实验室中,已经配备了PCR 仪等相关的实验器材。因此,如何挖掘科学问题,设置学生可操作、能探究、有意义的PCR 实验情境,是提高仪器利用率,构建高效生物课堂的关键。
在浙科版普通高中教科书《生物学》选择性必修3《生物技术与工程》第四章《基因工程》第一节第二个“活动”——“PCR 扩增DNA片段及凝胶电泳鉴定”的教学活动中,笔者先让学生通过阅读背景资料,逐步发现并提出问题“如何鉴定未知骨骼样本的性别”,以此创设真实的情境。接着以解决真实情境问题为导向,借助合适的学习资料,让学生主动运用科学思维,通过小组汇报等形式,共享学习成果,逐步剖析PCR 扩增过程中模板来源、反应体系、反应条件等内容,发展理性思维,自主构建知识体系。学生借助实验操作手册和产品使用说明书,自主设计实验,以口腔上皮细胞等简单有效的实验材料完成实验,既在学中做,又在做中学,解决问题,并学以致用,加深对PCR 技术的理解,提升应用知识的能力,体会PCR技术在生产生活中的重要应用。
一、创设真实情境,导出科学问题
PCR 技术在古生物研究、基因检测、刑事侦破、疾病诊疗等方面有广泛应用,这为生物课堂创设真实问题情境提供了大量的素材。例如,在课堂导入环节中,可以采用对曹操墓进行考古挖掘的相关新闻报道为例导入新课,提出问题:“考古人员在古墓中发现了一块骨骼残骸,你有什么办法可以确定该遗骸的性别?”学生阅读笔者提供的资料,分析推理得出:可以通过观察样本中是否含有Y染色体的特有基因DYZ1来判断。DYZ1基因,位于人类的Y染色体上,其特异序列长度为154bp,拷贝数为3000~5000。由于其拷贝数多,特异性好,被广泛用于性别鉴定。
从真实案例出发,可快速将学生带入问题情境,引导学生明确探究活动的目的和意义,让学生对本节实验课内容产生期待并激发学习欲望。但从骨骼残骸中提取到的DNA的量非常少,怎样检验其是否含有154bp 的DYZ1基因片段呢?笔者指导学生阅读资料学习DNA 琼脂糖凝胶电泳的基本原理和方法(如图1),然后尝试使用课前准备好的DNA 样本进行琼脂糖凝胶电泳,电泳需要30分钟左右。在这个等待过程中,笔者安排后续学习内容。
图1 DNA琼脂糖凝胶电泳的基本原理及相关问题
笔者给出一个电泳结果图,并提出问题串:1.第一泳道中加入标准DNA 的作用是什么?2.第二泳道的DNA 片段大小是多少?3.观察到的DNA条带是一个DNA分子吗……以此巩固并深化学生对DNA琼脂糖凝胶电泳的掌握。在学生掌握了DNA琼脂糖凝胶电泳的原理后,笔者将探究任务明确为:如何从微量DNA中精确获得大量的DYZ1基因片段?
二、理论实践结合,尝试科学探究
学生在普通高中教科书《生物学》必修2模块中已经学习过DNA 的复制过程,为学习DNA 的体外扩增打下了坚实的基础。学生通过类比分析,结合相关阅读资料,能够根据PCR 技术的基本原理,得出PCR 反应需要模板、原料、DNA聚合酶等成分。
通过小组合作学习PCR 试剂使用说明书,学生可以依葫芦画瓢,设计配置PCR 反应体系的方法。为方便实验操作,笔者推荐学生使用2X PCR mix 试剂,它含有耐高温的taq 酶(DNA聚合酶)、dNTP、PCR 反应所需的缓冲液等,只需加入适量引物和模板,即可进行PCR扩增(见表1)。
表1 实验使用的PCR反应体系
由于PCR 反应非常灵敏,可以扩增目的基因序列超过1000 万倍,在使用时应注意避免微量待扩增DNA 的污染,并尽量考虑设置不加模板的空白对照,以确认是否有待扩增DNA 的污染。笔者设计表格(见表2)引导学生思考如何设置空白对照、阳性对照和阴性对照。
表2 实验分组设计
学生分小组进行实验操作,提取男性和女性的口腔上皮细胞DNA 粗提取物,作为对照组的模板,进行PCR 扩增。口腔上皮细胞DNA粗提取液(模板)的制备方法如下:1.取检材前,用凉开水漱净,去除口腔内的食物残渣;2.用无菌的牙签在口腔两侧颊部轻轻刮动数次,获得口腔上皮细胞;3.将牙签放入300μL裂解液中,反复搅动几次,再将细胞洗下即可。阳性对照和阴性对照的DNA模板获取方法简单易行,可由学生自主探究总结。如此,可以使学生对实验结果产生认同感,有效激发学生的探究兴趣。各小组同时按照设计好的PCR反应体系和实验分组(见表1、2),配制反应液,在实验探究中解决问题。
三、探究结果分享,知识迁移拓展
各小组将配制好的PCR 反应液放入PCR仪中进行反应。传统手动PCR仪有95℃、55℃和72℃三个不同温度池,分别对应变性、退火和延伸三步,学生能较为直观地体验PCR 仪的工作原理,但这类PCR 仪使用费时费力,而且效果不佳。现在实验室配备的PCR 仪一般都是全自动PCR 仪,仅需设置仪器参数,方便高效,缺点是学生难以对变性、退火和延伸三步反应的本质即“温度变化”产生直观体验。对比两类PCR 仪的使用方法,可让学生体会到技术进步能推动科学发展。教师可让学生体验PCR 仪程序设置过程,再结合教学视频讲解PCR扩增的基本步骤,以使学生了解PCR仪的基本工作原理,明确变性、退火、延伸三步的作用,理解PCR 扩增能以指数的形式大量扩增DNA的原理。
最后,笔者引导学生观察课前制备的样本的DNA 琼脂糖凝胶电泳结果,判断未知样本的性别,实现问题的解决,完成科学探究过程(如图2)。笔者适时总结PCR 技术的基本原理和特点,介绍其在科学研究和疾病诊断等方面的重要作用,以及其在非法性别鉴定中的作用,让学生认识到科技是一把双刃剑,并提示学生对任何科学技术都要理性科学地使用。
图2 PCR反应程序和电泳检测结果
在本实验教学过程中,笔者以解决性别鉴定的问题为核心,通过材料阅读和实验设计等环节帮助学生完成实验探究。在具体操作中,又将 PCR 过程分解为 DNA 检测、PCR 反应体系配制、PCR 仪操作等部分,并将PCR 技术基本原理和基本操作过程以问题串的形式呈现出来。学生则通过材料阅读、小组汇报、小组实验等环节,获取信息、理性思考,并在同伴分享中提升对知识的理解。课堂上,笔者利用小组汇报、分享、交流等教学环节,不断将学习推向深入。
以科学探究为主体的教学活动,能够让学生在发现问题、研究问题、解决问题的探索中,发现生活中有意义的问题,并促使学生主动生成相关知识体系。在开展教学活动的过程中,教师应当充分考虑学情,灵活运用多种教学组织方式,改进并拓展教材实验,充分发挥学生的主体地位,给学生提供足够的探究活动,构建高效的生物课堂,以实现“学中做”和“做中学”,帮助学生实现深度学习。