长链非编码RNA TPT1-AS1在非小细胞肺癌中的表达及临床意义
2021-07-28贺伯伟王鹏国
贺伯伟,王鹏国
肺癌是最常见的癌症,其中85%的病人为非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC),据统计,经手术治疗后约40%NSCLC 病人,会因癌细胞转移复发或死亡,严重危害人们身体健康。因此,找寻与NSCLC 疾病进展密切相关的生物标志物,是寻找新型靶向药物的基础。近来研究发现转录生成的RNA,只有2%左右序列进行编码蛋白质,其它的称均不编码蛋白称为非编码RNA。非编码RNA分为长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)和小非编码RNA(small non-coding RNA,sncRNA),lncRNA 与肿瘤细胞的增殖、凋亡密切相关。研究发现,lncRNA 异常表达与乳腺癌、胃癌、肾细胞癌等多种肿瘤发生发展密切相关。已有研究发现,lncRNA TPT1-AS1在脑胶质瘤、肝癌中有重要的作用,但在非小细胞肺癌少有报道,本研究通过观察TPT1-AS1 在非小细胞肺癌中的表达,分析其与临床病理特征的关系。
1 资料与方法
1.1 一般资料
选取 2014 年 7 月至 2016 年 9 月陕西省核工业二一五医院非小细胞肺癌病人,手术切除非小细胞癌组织100 例、癌旁肺组织100 例。病人男性 65 例,女性 35 例,年龄(54.70±6.21)岁。纳入标准:(1)经诊断确诊为非小细胞肺癌病人;(2)所选病人术前未进行过化疗和放疗;(3)病人生存期不小于3 个月,排除标准:(1)无明确的病灶;(2)患有严重心脑血管疾病的病人;(3)患有精神障碍疾病的病人。样本在-80 ℃冰箱保存。所有病人均签订知情同意书。术后对所有病人进行随访,统计病人生存情况,以病人死亡为终点事件,随访截止时间2019 年2 月。本研究符合《世界医学协会赫尔辛基宣言》相关要求。1.2 试剂及仪器
PrimeScript RT reagent Kit(货号RR047A)购 自 日 本 TAKARA 公 司 ;AceQ qPCR SYBR Green Master Mix(货号Q111-02)购自南京诺唯赞生物科技有限公司;BCA 蛋白浓度检测试剂盒(货号P0010S)购自上海碧云天公司;TRizol试剂(货号TR118-100)购自上海素尔生物科技有限公司;酶标仪(型号Multiskan GO)、超低温冰箱(型号MDFU32V)购自美国 Thermo 公司;Real time-PCR 所需引物由生工生物工程上海股份有限公司合成。1.3 方法
定量聚合酶链反应(qPCR):(1)提取组织RNA:取100 mg肺癌组织及癌旁组织于试管内然后加1 mL Trizol,用研磨器在冰上研磨45 s 制备组织匀浆液,加入氯仿和异丙醇提取RNA,加20~50 μL RNase-free 水溶解完全后,测浓度。按照Prime-Script RT reagent Kit 说明书进行逆转录操作,体系为10 μL,在冰盒上进行操作。实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)体系按照试剂盒说明书进行配制,总体积20 μL,每个样本设置3 个重复,GAPDH 为内参,PCR 反应条件:预变性:95 ℃,30 s,40 个循环,95 ℃,10 s,60 ℃,20 s,延伸:70 ℃,10 s,反应结束后,TPT1-AS1 相对表达量用 2计算,引物序列见表1。表1 qRT-PCR引物序列
2 结果
2.1 lncRNA TPT1
-AS1 在非小细胞肺癌中的相对表达
经qRT-PCR 检测后,与癌旁肺组织相比,非小细胞肺癌组织中TPT1-AS1 表达水平显著升高[(2.18±0.16)比(0.91±0.12),t=
63.500,P
<0.05]。2.2 lncRNA TPT1
-AS1 的表达与非小细胞肺癌临床病理特征的关系
100 例非小细胞肺癌病人按照lncRNA TPT1-AS1 平均表达水平将非小细胞肺癌组分为lncRNA TPT1-AS1 高表达组59 例和低表达组41 例,分析lncRNA TPT1-AS1 在非小细胞肺癌病人中的表达与临床病理特征的关系结果表明,lncRNA TPT1-AS1 在非小细胞肺癌病人组织中的表达与淋巴转移、TNM 分期有关(P
<0.05),与病人的性别、年龄、肿瘤大小、病理类型、分化程度无关(P
>0.05)。见表2。表2 TPT1-AS1的表达与非小细胞肺癌临床病理特征的关系
2.3 lncRNATPT1
-AS1 表达对病人生存关系的影响
lncRNATPT1-AS1 高表达组 NSCLC 病人 3 年存活率为10.17%,lncRNATPT1-AS1 低表达组NSCLC病人3 年存活率为41.46%,log-rank 检验显示,与lncRNA TPT1-AS1 低表达组相比,高表达者生存率显著降低(χ
=13.376,P
<0.001)。2.4 预后影响因素分析
单因素分析显示,lncRNATPT1-AS1表达、TNM 分期、淋巴转移是非小细胞肺癌病人预后的危险因素。多因素分析显示,lncRNATPT1-AS1 表达和TNM 分期是影响非小细胞肺癌病人预后的独立危险因素(HR=1.954,95%CI
为1.545~2.473,P
<0.05;HR=2.013,95%CI
为1.591~2.547,P
<0.05)。见表3。表3 影响非小细胞肺癌病人预后的危险因素分析结果
3 讨论
肺癌主要分为非小细胞肺癌(NSCLC)和小细胞肺癌(SCLC),其中NSCLC 是肺癌中发病率最高,根据其病理学形态和临床特征可以分为:腺癌、鳞癌、大细胞癌等。近年来,常规化学疗法和放射疗法已取得较好发展,是肺癌病人治疗的重要手段,NSCLC 发生受多种基因的调控,目前其发病机制尚不明了。因此,加强分子水平研究NSCLC 发生发展相关因子,寻找新的治疗靶点有利于NSCLC 的诊治及预后。
长链非编码RNA(lncRNA)是长度超过200 个核苷酸的非编码RNA,缺少完整功能性的开放阅读框,水平表达低,无蛋白编码能力,但可以通过与RNA 结合蛋白互作,调控其靶基因启动子,还可在转录或转录后调控基因表达。Schmitz 等研究报道lncRNA 在基因控制发育和分化以及人类疾病中发挥多中功能,Zhang 等研究发现,lncRNATUG1 通常在非小细胞肺癌(NSCLC)组织中被下调,TUG1 敲低促进体外和体内的肿瘤细胞增殖。Chen等研究发现,lncRNA HULC 在多种肿瘤中的预后效果密切相关。Liu 等研究发现,lncRNA XLOC的异位表达促进胃癌细胞活力,迁移和侵袭,导致转移加速,而lncRNA XLOC 表达降低则阻碍细胞迁移和侵袭。Jiang 等发现,通过调控 LncRNA EGFR 表达,可以促进Treg 细胞分化。综上所述,异常的lncRNA 在各种生物学过程中发挥关键作用,包括细胞分化,增殖,凋亡,迁移,侵袭等。目前,大量研究结果表明,多种lncRNA 在肺癌中起着抑制或促进的调控作用。本研究发现,lncRNA TPT1-AS1在NSCLC 的癌组织中的表达显著高于癌旁组织,提示lncRNA TPT1-AS1可能在NSCLC中是促癌因子。
Lu 等研究表明,LncRNA AFAP1-AS1 在肝细胞癌和肝内胆管癌中表达均上调,与癌症的恶化程度及预后密切相关。本研究结果与此类似:lncRNA TPT1-AS1 表达与NSCLC 病人临床病理学特征的相关性,结果显示,lncRNA TPT1-AS1 在 NSCLC 癌组织相对表达量与淋巴转移、TNM 分期显著相关,提示lncRNA TPT1-AS1 的表达可能与NSCLC 的发生发展过程相关。通过对研究组生存相关分析,发现lncRNA TPT1-AS1 高表达组病人生存率显著降低于lncRNATPT1-AS1 低表达组NSCLC 病人,进一步多因素分析结果显示,lncRNA TPT1-AS1 表达和TNM分期是影响NSCLC 病人预后的独立危险因素,提示lncRNA TPT1-AS1 表 达 和 TNM 分 期 与 NSCLC 病 人预后密切相关,可能通过检测lncRNA TPT1-AS1 表达监测NSCLC病人病情发展,评估病人预后。
综上所述,研究 lncRNA TPT1-AS1 在 NSCLC 病人癌组织中高表达,与NSCLC 的发生发展相关,对NSCLC 病人预后评估有一定的指导意义。由于本研究临床样本的数量和地域有局限性,需要扩大样本,并且需要进一步研究lncRNA TPT1-AS1 的分子作用机制,为NSCLC 的早期筛查和预后判断提高更多的理论依据。