金黄色葡萄球菌的表型药物敏感性与耐药基因携带性的相关分析
2021-02-02于美美王佳齐顾增辉吴湘艳沈兰东庄龙其李倩
于美美,王佳齐,顾增辉,吴湘艳,沈兰东,庄龙其,李倩
金黄色葡萄球菌(staphylococcus aureus,SA)存在于皮肤和软组织感染、败血症等感染性疾病。目前SA耐药情况严重,耐甲氧西林葡萄球菌(methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)治疗非常困难[1]。细菌携带的耐药基因与耐药性有一定相关性,对耐药菌株的检测有一定辅助作用。为了解SA耐药与基因携带性的关系,指导临床合理用药,本研究对分离的SA菌株86株进行表型药物敏感性和耐药基因携带性的相关分析。现报道如下。
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 菌株:选取2015年8月-2016年5月潍坊医学院附属医院检验科分离出的非重复SA菌株86株。
1.1.2 主要试剂及仪器 EasyTaq® DNA Polymerase和EasyPure® Bacteria Genomic DNA Kit购自北京全式金公司,全自动微生物鉴定药敏试验分析仪VITEK 2-Compact和鉴定卡VITEK® 2 AST-GP67购自法国生物梅里埃公司,PCR扩增仪Applied BiosystemsTMVeritiTM96-Well Thermal Cycler购自Thermo Fisher Scientific公司。
1.2 观测指标与方法
1.2.1 菌株鉴定与药敏试验:全自动微生物分析仪用于菌株鉴定及药敏试验,药敏试验结果参考CLSI 2014标准[2]。质控菌株为SA ATCC 29213。MRSA指对苯唑西林耐药[最低抑菌浓度(minimum inhibitory concentration,MIC)≥4 μg/ml]或头孢西丁耐药(抑菌圈直径≤21 mm或MIC≥8 μg/ml)的SA[2]。
1.2.2 耐药基因检测:取过夜培养的菌液1 ml离心去上清,加入EasyPure® Bacteria Genomic DNA Kit试剂盒中的RB11 200 μl和溶葡萄球菌素(10 mg/ml)10 μl重悬,37 ℃温育1 h,再用试剂盒提取基因组。在华大基因进行耐药基因片段的引物合成(表1),使用相应引物对每株SA的基因组分别进行PCR扩增,扩增条件:94 ℃ 5 min;94 ℃ 30 s,45 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s,循环30次;72 ℃ 10 min。PCR阳性片段在北京睿博兴科生物技术有限公司测序,使用Blast(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)进行DNA序列比对,测序片段序列与数据库中该基因序列符合者纳入统计范围。耐药基因PCR扩增相应引物见表1。
表1 耐药基因PCR扩增相应引物
1.3 统计学方法 应用SPSS 21.0统计软件进行统计学分析。应用WHONET 5.6对药敏试验结果进行统计。耐药率比较采用χ2检验或Fisher精确概率法,P<0.05为差异有统计学意义。
2 结 果
2.1 标本及科室分布
2.1.1 患者临床资料分布构成比:患者中男性患病率略高于女性,18~60岁患者最多,标本主要来源于分泌物、脓液和痰。见表2。
表2 患者临床资料分布构成比
2.1.2 科室分布:SA菌株多分布在儿科、关节外科、ICU和皮肤病科等。见表3。
表3 86株SA的科室分布
2.2 菌株耐药情况
图1 86株SA药敏试验结果
表4 MRSA与MSSA耐药情况比较
2.3 相关耐药基因检测情况
表5 SA耐药基因检测结果
注:M为DNA marker;a:泳道1为blaZ,2为tetM,3为msrA,4为qacA;b:泳道1为mecA,2为dfrG,3为tet38;c:泳道1为msrB,2为tetK,3为aac(6′)aph(2″),4为ermB,5为qacC;d:泳道1为ermA;e:泳道1为ermC
2.3.2 MRSA和MSSA耐药基因检测结果:MRSA中mecA、tetK和tetM基因检出率大于MSSA(P<0.05),MRSA中最常见的四种耐药基因携带谱blaZ+msrA+msrB+tet38占73.91%。见表6。
3 讨 论
表6 MRSA和MSSA耐药基因检测结果
环境对基因表达的影响使得SA对某些抗生素的表型耐药性和耐药基因携带性之间的相关性不高,因此分子生物学方法只能作为辅助诊断工具。本研究中检出的MRSA除对苯唑西林、青霉素完全耐药外,对红霉素、克林霉素、四环素的耐药率均>60%,说明MRSA除对β-内酰胺类抗生素耐药之外,对大环内酯类、林克酰胺类、四环素类抗生素也具有一定耐药性。MRSA对3种及3种以上抗生素耐药的菌株占95.65%,表现出多重耐药的特征,可能与MRSA携带多种耐药基因有很大关系。MRSA最常见的耐药基因谱为blaZ+msrA+msrB+tet38,且23株MRSA均含有不等数目的耐药基因,有1株MRSA携带12种耐药基因,这要求今后临床用药更加谨慎[7]。
综上所述,本地区SA表现出多重耐药的特征,且与部分耐药基因密切相关,治疗时应根据药敏试验结果合理选用抗生素进行治疗。