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乳腺癌患者血清长链非编码RNA ATB表达水平检测及临床诊断价值

2020-12-08袁建芬喻海忠

现代检验医学杂志 2020年2期
关键词:灵敏度引物标志物

洪 宏,袁建芬,喻海忠

(南通市中医院检验科,江苏南通 226001)

近年来,乳腺癌的发病率及死亡率逐年增高,严重威胁女性的身心健康[1]。目前,临床上常用的肿瘤标志物CA153特异度和灵敏度均不高,容易出现误诊及漏诊,且单项肿瘤标志物的检测在辅助诊断中有一定的局限性[2]。长链非编码RNA-ATB (long non-coding RNA-ATB,lncRNA-ATB) 在多种恶性肿瘤组织或血清中异常表达,但在乳腺癌外周血表达水平的研究较少,且表达情况较传统标记物CA153对乳腺癌的诊断价值也未见报道。本研究旨在对研究对象血清中lncRNA-ATB表达水平进行检测,并探讨联合检测CA153模式在乳腺癌诊断中的价值,现详细报道如下。

1 材料与方法

1.1 研究对象 选取2017年6月~2019年9月期间收治的乳腺癌患者37例,同期乳腺良性疾病患者30例及健康体检者26例作为研究对象。乳腺癌组纳入标准:病理检查确诊为乳腺癌,排除曾进行化疗或放疗、肝肾功能异常、过敏者等,年龄38~79岁,平均年龄51.2岁。乳腺良性疾病组为同期收治患者,年龄46~72岁,平均年龄53.2岁。另健康组为女性体检者,均无肝肾、心血管及乳腺等疾病,年龄43~76岁,平均年龄52.4岁。各组在年龄、性别上差异无统计学意义(P>0.05),具有可比性。

1.2 试剂和仪器 Trizol(Invitrogen 美国),TakaRa PrimeScript RT reagent kit,SYBR Premi ExTaq kit(大连宝生物工程有限公司),lncRNAATB及内参引物(上海生工生物工程有限公司)。Cobas z 480实时荧光定量PCR仪(Roche 瑞士),Cobas e 411电化学发光仪(Roche 瑞士),CA153试剂及质控品均为原装配套试剂。

1.3 方法 术前空腹抽取静脉血3 ml,1 h内于4 ℃条件下,以12 000 g离心力离心10 min分离血清,用Trizol法提取血清中的总RNA。分光光度仪A260nm/280nm检测吸光度,1.8~2.2 合格,进行下一步逆转录反应,按照TakaRa PrimeScript RT reagent kit试剂盒说明书操作,生成的cDNA置于-70 ℃保存。采用实时荧光定量PCR(qPCR)法检测血清lncRNA-ATB及内参基因GAPDH表达水平。lncRNA-ATB上游引物:5’-TACAACCACTGCACTACCTG-3’,下游引物:5’-TGGAATGCTTGAAGGCTGCT-3’;GAPDH上游引物:5’-GGGAGCCAAAAGGGTCAT-3’,下游引物:5’-GAGTCCTTCCACGATACCAA-3’ 反应体系为:cDNA 2 µl,上下游引物各1 µl,SYBR 10 µl,H2O 6 µl,共20 µl;反应条件为:95 ℃预变性2 min,95 ℃ 5 s,60 ℃ 25 s,40个循环,溶解曲线1个循环。用2-△△Ct表示lncRNA-ATB的相对表达含量。用罗氏Cobas e 411型电化学发光仪检测CA153。

1.4 统计学分析 采用SPSS13.0统计软件进行数据分析,首先用Kolmogorov-SmirnovZ检验进行正态性检验,呈非正态分布,用M(P25,P75)表示。多组间比较采用Kruskal-WallisH检验,两组间比较采用非参数Mann-WhineyU检验。联合诊断采用二元Logistic回归分析,受试者工作特征曲线(ROC曲线)下面积(AUC),灵敏度和特异度评价指标的诊断价值。以P<0.05为差异有统计学意义。

2 结果

2.1 各组lncRNA-ATB相对表达水平比较 1ncRNAATB在乳腺癌组[1.82(1.19,3.74)]、乳腺良性疾病组[1.13(0.92,1.31)]和健康对照组[0.98(0.83,1.14)]血清中的表达水平差异有统计学意义(H=29.45,P<0.01)。乳腺癌组血清lncRNA-ATB表达水平明显高于乳腺良性病组(U=233,P<0.01)和健康对照组(U=131,P<0.01),差异有统计学意义。

2.2 血清CA153含量和lncRNA-ATB相对表达量单独与联合检测对乳腺癌的诊断价值 见图1。结果显示,lncRNA-ATB灵敏度为89.2%,特异度为67.9%,AUC为0.824(95%CI:0.735~0.914,P<0.01),其临床诊断临界值(cutoff value≤1.104),而CA153灵敏度仅为67.6%,特异度为91.1%,AUC为0.809(95%CI:0.712~0.906,P<0.01)。再以lncRNA-ATB,CA153为自变量,建立Logistic回归模型,通过模型中的概率值来拟合联合检测的ROC曲线,CA153和lncRNA-ATB联合检测的灵敏度提高至83.8%,特异度为80.4%,AUC为0.876(95%CI:0.800~0.953,P<0.01)。

3 讨论

lncRNA是一类长度超过200个核苷酸的RNA分子,能通过表观遗传、转录及转录后的调控等方面影响相关基因的表达,参与染色体修饰、基因沉默、转录激活等,与肿瘤的发生、发展相关,其表达异常影响着肿瘤细胞的生物学行为[3-4]。由于不具有编码蛋白质的潜能,曾被认为是无用RNA或转录噪声[5]。lncRNA-ATB全称lncRNA actived by TGF-β,长度约为2.4kb,位于人类第14号染色体上,是首个被发现的能被转化生长因子激活的长链非编码RNA[6]。lncRNA-ATB在多种肿瘤中异常表达,是肿瘤发生、发展过程中的关键调控分子[7-9]。lncRNAATB在曲妥珠单抗耐药的乳腺癌患者组织中及SKBR-3细胞系中呈高表达,其机制为lncRNA-ATB通过ceRNA结合miR-200c上调ZEB1和ZNF127的表达,高表达的ZEB1/ZNF127促进肿瘤细胞发生EMT和对曲妥珠单抗的耐药,下调lncRNA-ATB可以显著抑制SKBR-3细胞的生长,同时可促进曲妥珠单抗耐药的SKBR-3细胞凋亡[10]。

本研究显示,乳腺癌患者血清中lncRNA-ATB表达水平显著高于乳腺良性疾病者和体检健康者,提示lncRNA-ATB可能扮演着癌基因的角色,检测乳腺癌患者血液中的循环核酸,lncRNA-ATB可能为乳腺癌辅助诊断的一个潜在的分子标志物。ROC曲线显示,以lncRNA-ATB相对表达的临床诊断临界值(cutoff value≤1.104)用于诊断乳腺癌的灵敏度为89.2%,特异度为67.9%,AUC为0.824,与传统标志物CA153的灵敏度仅为67.6%,特异度为91.1%,AUC为0.809相比,灵敏度有提高,特异度略低,但诊断价值较高。进一步通过建立Logistic回归模型,模型中的概率值来拟合联合检测的ROC曲线显示,联合检测的灵敏度提高至83.8%,特异度为80.4%,AUC为0.876。联合检测诊断乳腺癌的效能优于单独检测,联合诊断可提高诊断的准确性,但要注意假阳性问题。

综上所述,lncRNA-ATB在乳腺癌患者血清中呈现高表达,在乳腺癌诊断中敏感度高,与传统标志物CA153联合检测弥补了单一指标检测的不足,可考虑为乳腺癌辅助诊断的一种潜在生物学标志物用于临床,以减少漏诊。不足之处在于本研究纳入的病例数有限,诊断价值仍需大样本进一步验证,缺少对乳腺癌术前、术后的比较、与临床病理特征的相关性及治疗疗效的观察等方面的研究,在后续工作中将通过随访、功能研究等进一步验证lncRNA-ATB的临床应用价值。

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