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石蜡切片中卵巢癌基因1第2外显子PCR-SSCP检测法建立

2018-07-18苗小艳赵文娇孔繁斗赵春艳

中国老年学杂志 2018年13期
关键词:石蜡外显子条带

苗小艳 石 敏 李 岩 赵文娇 孔繁斗 赵春艳

(大连医科大学检验医学院,辽宁 大连 116044)

卵巢癌基因(OVCA)1是与卵巢癌、乳腺癌等有关的肿瘤抑制基因〔1~5〕,定位于人染色体17p13.3〔1〕,该区域在卵巢癌中发生杂合性缺失(LOH)的频率高达50%~86%〔2,6~9〕,研究显示该基因缺失可能在卵巢癌早期阶段即存在〔8〕。但关于OVCA1的生物学功能及其在肿瘤发生发展中的作用和机制目前尚不清楚。研究发现乳腺癌中OVCA1基因多个外显子存在碱基突变〔3〕,本研究拟建立石蜡包埋切片标本OVCA1第2外显子的聚合酶链反应(PCR)单链构象多态性(SSCP)检测方法。

1 材料与方法

1.1材料 石蜡包埋组织标本来自大连医科大学附属第一医院2009年经病理确诊的卵巢浆液性乳头状囊腺癌标本3例、卵巢浆液性乳头状囊腺瘤4例和正常卵巢组织3例。石蜡包埋组织基因组DNA提取试剂盒(TaKaRa DEXPATTM)、DNA marker和PyrobestTMDNA聚合酶试剂盒购自宝生物工程(大连)有限公司,其余试剂为国产分析纯。

1.2基因组DNA的提取 按试剂盒说明进行操作:将2枚10 μm石蜡包埋组织切片放入1.5 ml Ep管中,加入DEXPAT试剂0.5 ml。100 ℃加热10 min,12 000 r/min 4 ℃离心10 min。将含有DNA水层移入另一新Ep管中作为PCR反应模板。PCR扩增 引物序列:上游5′-TTCCATCTCAATCTGGCTTC-3′,下游5′-CATCTGGGCCAGGCAAC-3′。扩增条件:95℃ 5 min;95℃ 30 s,59℃ 30 s,72℃ 30 s,30个循环;72℃延伸2 min。3%琼脂糖凝胶电泳检测扩增片段。

1.3SSCP检测 5 μl DNA样品加入等量SSCP上样缓冲液〔10 ml上样缓冲液中含有去离子甲酰胺9.4 ml,0.5 mol/L乙二胺四乙酸(EDTA)0.4 ml,5% 溴酚蓝0.2 ml〕,混匀,98℃变性10 min,立即置于-20℃冰浴10 min。配制8%非变性聚丙烯酰胺凝胶,将上述样品上样、200 V、4℃电泳。电泳结束后,取出凝胶,置于固定液(含40%乙醇、10%醋酸)中固定30 min,去离子水漂洗5 min,重复3次。加入银染溶液(0.012 mol/L硝酸银)染色20 min,去离子水洗涤5 s,重复3次。加入显色剂(1.5%NaOH、0.02%甲醛)轻轻晃动,显色30 s后,显色液变黄或出现棕色颗粒。更换显色液,轻轻摇动,5 min后将凝胶移入终止液(10%醋酸)终止显色反应。取出凝胶,吸水纸吸干表面水分,拍照记录结果。

2 结 果

2.1OVCA1基因第2外显子的PCR扩增结果 以提取自卵巢组织石蜡切片的基因组DNA为模板进行PCR扩增,3%琼脂糖凝胶电泳检测扩增片段(271 bp),可见PCR扩增产物成单一条带,条带位置正确。见图1。

2.2OVCA1第2外显子的SSCP检测结果 凝胶上可见3条清晰条带。10例卵巢组织标本中,DNA条带数目及位置相同。见图2。

1~3为卵巢浆液性乳头状囊腺癌,4~7为卵巢浆液性乳头状囊腺瘤,8~10为正常卵巢组织,M为DL500 DNA marker;下图同图1 OVCA1第2号外显子的PCR扩增片段

图2 OVCA1基因第2号外显子的SSCP检测

3 讨 论

卵巢癌是妇科恶性肿瘤中死亡率最高的疾病,具有发病隐匿、早期诊断困难、预后差等临床特点,绝大部分卵巢癌患者就诊时已属晚期,5年存活率仅为30%〔10〕,而早期卵巢癌的5年存活率可高达90%以上〔10,11〕。

抑癌基因缺失或突变导致功能丧失是肿瘤发生的重要机制。OVCA1是一个由12个外显子组成、编码443个氨基酸的抑癌基因〔2,6~9〕。有研究表明过表达OVCA1基因可抑制细胞增殖并阻滞于G1期〔3〕。敲除小鼠OVCA1基因后,肿瘤发生率明显增加〔4〕。过表达OVCA1可通过p16途径抑制卵巢癌细胞增殖〔12〕,并具有抑制卵巢癌细胞迁移和侵袭的作用〔13〕。研究还发现在卵巢癌、乳腺癌等肿瘤中存在OVCA1基因多个外显子突变〔3〕,但这种突变与卵巢癌发生发展的关系尚不清楚。

PCR-SSOP技术为点突变的检测手段〔14〕,具有简便、快速、灵敏度高、无需特殊仪器设备、价格低廉、无需已知突变位点及序列等优点,被广泛用于点突变的初步筛选〔14,15〕。本研究结果表明该PCR扩增条件适合OVCA1第2外显子扩增;本文所建立的SSCP电泳及染色条件适合用于OVCA1基因第2外显子单链构象的检测。本研究显示,所测3例卵巢癌和4例卵巢良性肿瘤中未检出点突变。

4 参考文献

1Yu YR,You LR,Yan YT,etal.Role of OVCA1/DPH1 in craniofacial abnormalities of Miller-Dieker syndrome〔J〕.Hum Mol Genet,2014;23(21):5579-96.

2Liang M,Ayanga B,Du S,etal.Ovca1,a candidate gene of the genetic modifier of Tp53,Mop2,affects mouse embryonic lethality〔J〕.Genes Chromosomes Cancer,2008;47(4):315-25.

3Bruening W,Prowse AH,Schultz DC,etal.Expression of OVCA1,a candidate tumor suppressor,is reduced in tumors and inhibits growth of ovarian cancer cells〔J〕.Cancer Res,1999;59(19):4973-83.

4Chen CM,Behringer RR.Ovca1 regulates cell proliferation,embryonic development,and tumorigenesis〔J〕.Genes Dev,2004;18(3):320-32.

5Jensen MR,Helin K.OVCA1:emerging as a bona fide tumor suppressor〔J〕.Genes Dev,2004;18(3):245-8.

6Chisholm KM,Goff BA,Garcia R,etal.Genomic structure of chromosome 17 deletions in BRCA1-associated ovarian cancers〔J〕.Cancer Genet Cytogenet,2008;183(1):41-8.

7Loucks CM,Parboosingh JS,Shaheen R,etal.Matching two independent cohorts validates DPH1 as a gene responsible for autosomal recessive intellectual disability with short stature,craniofacial,and ectodermal anomalies〔J〕.Hum Mutat,2015;36(10):1015-9.

8Wiper DW,Zanotti KM,Kennedy AW,etal.Analysis of allelic imbalance on chromosome 17p13 in stage Ⅰ and stage Ⅱ epithelial ovarian cancers〔J〕.Gynecol Oncol,1998;71(1):77-82.

9Huang J,Hu N,Goldstein AM,etal.High frequency allelic loss on chromosome 17p13.3-p11.1 in esophageal squamous cell carcinomas from a high incidence area in northern China〔J〕.Carcinogenesis,2000;21(11):2019-26.

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11Barnett R.Ovarian cancer〔J〕.Lancet,2016;387(10025):1265.

12Kong F,Tong R,Jia L,etal.OVCA1 inhibits the proliferation of epithelial ovarian cancer cells by decreasing cyclin D1 and increasing p16〔J〕.Mol Cell Biochem,2011;354(1-2):199-205.

13孔繁斗,刘 丽,魏 巍,等.抑癌基因OVCA1体外对卵巢癌细胞 A2780迁移和侵袭的抑制作用〔J〕.中国肿瘤生物治疗杂志,2008;15(4):351-7.

14Itonaga M,Matsuzaki I,Warigaya K,etal.Novel methodology for rapid detection of kras mutation using PNA-LNA mediated loop-mediated isothermal amplification〔J〕.PLoS One,2016;11(3):e0151654.

15Csikos A,Hodzic A,Pasic-Juhas E,etal.Applicability and sensitivity of PCR-SSCP method for milk species identification in cheese〔J〕.Acta Alimentaria,2016;45(1):69-76.

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