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鸭圆环病毒检测方法研究进展

2018-01-22于新友李天芝

中国动物检疫 2018年6期
关键词:圆环核酸敏感性

于新友,张 颖,李天芝

(1.山东绿都生物科技有限公司,山东滨州 256600;2.山东省滨州畜牧兽医研究院,山东滨州 256600)

鸭圆环病毒病(Duck circovirus disease,DuCVD)是由鸭圆环病毒(Duck circovirus,DuCV)感染引起的一种免疫抑制性疾病[1]。各品种和日龄鸭均可感染发病,临床表现为羽毛发育不良、脱落、生长缓慢、饲料转化率降低、消瘦和贫血等[2]。单纯感染DuCV时,一般仅造成鸭零星死亡,但该病毒感染后可造成鸭免疫抑制,容易混合感染或继发其他疾病,致鸭死亡率升高,给养鸭业造成了经济损失。2003年Hattermann等[3]首先报道该病,随后世界各地均有相关报道,2006年Chen等[4]在我国台湾地区检测到DuCV感染,2006年姜世金等在我国大陆地区鸭群中检测到DuCV感染。近年来,DuCV在我国鸭群中的感染及混合感染病例呈上升趋势[5],引起兽医界的高度关注。

DuCV属圆环病毒科圆环病毒属,病毒粒子呈圆形或二十面体对称,无囊膜,直径约为15~16 nm,是目前已知最小的鸭病毒。该病毒对外界环境抵抗力强,一旦感染鸭群很难被清除,且目前尚不能在体外培养。DuCV是单链环状DNA病毒,基因组长约2.0 kb,有2个主要的阅读框ORFV1和ORFC1,分别编码与病毒复制有关的Rep蛋白和核衣壳蛋白Cap蛋白,病毒可分为DuCV-1和DuCV-2基因型。本文对DuCV诊断方法研究进展进行了综述,以期为该病的快速诊断和防控提供参考。

1 血清学检测方法

1.1 间接免疫荧光试验(IFA)

IFA的基本原理是先用一抗处理待检细胞,形成抗原抗体复合物,再加入荧光标记抗体,在相应条件下孵育,采用荧光显微镜进行检测,如果发出荧光则表明有病毒粒子存在。张兴晓[6]根据已发表的DuCV LY0701株Cap基因序列,设计1对引物,成功扩增出目的片段,连接表达载体pGEX-6P-1,转化感受态BL21,成功表达出重组蛋白,将蛋白纯化后免疫BALB/c小鼠,制备抗血清Ab-Cap,建立了DuCV IFA检测方法,应用于临床病料检测。结果显示,法氏囊、肝脏和胸腺病料样品中的病毒含量依次减少。

1.2 酶联免疫吸附试验(Enzyme linked immunosorbent assay,ELISA)

ELISA是指将抗原或抗体包被到特定反应板上,利用抗原抗体结合原理,加入相应抗体或抗原进行反应,从而实现对抗原或抗体的定量或定性检测,适合大批量样本同时检测,主要应用于抗体检测。苏小东等[7]对鸭群进行DuCV血清流行病学调查,用原核表达了全长DuCV Cap蛋白,表达的重组蛋白免疫原性良好,重蛋白纯化后作包被抗原,应用30份DuCV抗体阴性血清和16份DuCV抗体阳性血清,建立了检测DuCV抗体的间接ELISA方法,用建立的方法检测从江苏省部分鸭场收集的阳性血清,发现DuCV抗体阳性率约为26.7%(38/142)。

2 分子生物学检测方法

2.1 核酸探针技术

核酸探针技术是常用的分子生物学诊断技术,具有操作简单、不受抗原抗体反应的限制和结果易于判定等优点,适合在基层推广使用。Zhang等[8]利用PCR方法扩增出DuCV基因片段约228 bp,然后用地高辛标记,建立斑点杂交方法,最小可检测13.2 pg DuCV目的基因片段。邹金峰等[9]用地高辛标记DuCV全基因组克隆制成核酸探针。特异性检测结果显示,探针仅能与DuCV的核酸发生阳性杂交反应,与其他常见鸭病毒病核酸均无杂交反应;敏感性结果表明,该探针对DuCV的最低检出量约为5 pg DuCV的DNA。

2.2 常规PCR方法

常规PCR方法是根据网上公开的病原基因序列,比对分析后查找保守区域部分,设计相应引物,通过DNA聚合酶的作用,采用PCR仪,在体外大量扩增目的基因,通过琼脂糖凝胶电泳检测扩增产物,从而判定检测结果,是一种快速、简便、特异的诊断方法。李志国等[10]根据DuCV-1和DuCV-2 Cap基因保守序列,分别设计2对不同的特异性引物,优化反应扩增条件后,建立了能同时检测这2种不同基因型的双重PCR检测方法。该方法检测的敏感性为1拷贝的DuCV DNA。对山东省6个不同鸭场收集的病料样品进行检测,发现鸭场中DuCV-1和DuCV-2的混合感染率为50.0%(3/6),DuCV-2单一感染率约为33.33%(2/6)。

2.3 限制性片段长度多态性聚合酶链反应

限制性片段长度多态性聚合酶链反应即PCRRFLP技术,其基本操作是先用PCR扩增目的基因,再将其用特定的限制性内切酶切成大小不等的片段,通过电泳检测基因大小,从而实现病毒的分类或分型检测。万春和等[11]根据DuCV-1和DuCV-2复制相关蛋白基因编码区核苷酸序列特征,建立一种鉴别DuCV-1和DuCV-2的聚合酶联反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法。结果表明,特异性的PCR引物可同时对DuCV-1和Du CV-2进行扩增,获得约616 nt大小的目的片段。将获得的PCR产物经KpnⅠ酶切后,发现KpnⅠ酶切DuCV-1扩产物后条带无任何变化,而DuCV-2 PCR扩增产物被切成约360 nt和256 nt 2种不同大小的基因片段。

2.4 套式PCR方法

套式PCR是根据1种病原的基因保守序列,设计2对不同的引物,即外引物和内引物,先以病原核酸为模板,用外引物进行扩增,再将扩增产物作为模板,用内引物进行第2次扩增,从而大大提高了检测敏感性。由于是以第1次扩增产物为模板,因此如果第2次能成功扩增目的基因,则表明方法具有良好的特异性。柴顺秀等[12]根据GenBank发布的DuCV保守区基因组序列,设计合成内、外2对引物,通过PCR反应条件的优化,建立了套氏PCR检测DuCV的方法。该法对4种其他鸭病原的扩增结果均为阴性,第1轮和第2轮检测的名感性分别为10 pg和0.1 pg,是常规PCR方法敏感性的100倍。蔡锐等[13]根据GenBank发布的DuCV序列,采用生物软件,设计2对引物,即外引物对和内引物对,建立了DuCV套氏PCR检测方法。应用建立的方法对从安徽不同鸭场采集的胸腺、肝脏、法氏囊等不同组织器官进行检测,发现套氏PCR扩增的目的基因大小为340 bp,该方法特异性好,对正常鸭胚、健康鸭肝脏和8种常见鸭病原扩增结果均为阴性,外引物第1次扩增检测的敏感性为1 ng DuCV DNA,内引物第2次扩增检测的敏感性为1 fg DuCV DNA,检测敏感性是单纯用外引物的106倍。

2.5 多重PCR方法

多重PCR是在PCR反应体系中加入多种引物,同时检测2种或以上疾病,可实现多种疾病的快速检测筛查,特异性好,效率高,成本低,在临床诊断中应用广泛。许宗丽等[14]等根据DuCV、鸭瘟病毒和鸭源新城疫病毒基因保守序列,分别设计3对特异性引物,通过优化PCR反应条件,建立了检测这3种疾病的多重PCR检测方法,对DuCV、鸭瘟病毒和鸭源新城疫病毒3种病毒核酸扩增的目的基因大小分别为338、576和823 bp,检测的敏感性分别为 4.67×102、1.12×103和2.59×103拷贝/µL。张艳芳等[15]针对Gen Bank中坦布苏病毒E基因和DuCV REP基因的保守序列,设计合成了2对引物,通过优化反应体系条件及特异性和敏感性评价,建立了双重PCR检测DuCV和鸭坦布苏病毒的方法。敏感性检测结果显示,该法对2种病毒基因组检测敏感性均为100 fg;特异性检测结果显示,该方法特异性良好,对鸭常见的其他病毒,如H9亚型禽流感病毒、番鸭细小病毒、新城疫病毒、鸭肝炎病毒、鸭瘟病毒、番鸭呼肠孤病毒和减蛋综合征病毒等,其核酸扩增结果均为阴性。曹慧慧等[16]为建立能同时检测并区分DuCV和鹅圆环病毒(Goose circovirus,GoCV)的方法,根据DuCV和GoCV基因组的保守区域设计2对特异性引物,预期特异性扩增DuCV和GoCV片段大小分别为192 和556 bp。优化了扩增反应条件后,建立了DuCV和GoCV双重PCR检测方法。特异性检验表明该方法无法扩增其他水禽病原,DuCV和GoCV的最低检出限分别为104拷贝/µL和105拷贝 /µL。

2.6 荧光定量PCR方法

在PCR技术基础上发展的荧光定量PCR是一种高度灵敏的核酸定量技术,融汇了传统PCR技术和光谱技术的特点,具有可实现定量检测、灵敏度高和特异性强等多种优点。荧光定量PCR方法可分为染料法和探针法2种。染料法成本低,最常用的染料是SYBR Green Ⅰ,主要原理是与DNA双螺旋结构小沟部分结核发出荧光,对引物的特异性要求非常高,否则容易产生假阳性,探针法成本较高,各实验室可根据自身条件进行选择。赵光远等[17]根据DuCV保守基因,设计了1对引物,建立了DuCV SYBR Green Ⅰ荧光PCR检测方法。结果显示,该法检测的敏感性达到1×102拷贝标准品DNA,特异性好,与鸭瘟、H9亚型禽流感、小鹅瘟和鸭肝炎病毒等不发生交叉反应,具有良好的重复性。许宗丽等[18]根据鸭副黏病毒(DPMV)和DuCV保守基因,设计了 2对引物和2条TaqMan探针,建立了DuCV和DPMV的双重荧光定量PCR检测方法。该方法敏感性好,对DuCV和DPMV的检测敏感性分别达到140和160个拷贝数,该方法特异性强,对H9型禽流感病毒、番鸭细小病毒、鸭瘟病毒和鸭肝炎病毒等的检测结果均为阴性。刘玲凤等[19]为实现对DuCV的快速检测,分析比对Gen Bank发布的DuCV全基因组序列,选择保守区域,设计了1对引物,建立了荧光PCR检测DuCV的检方法。重复性和灵敏性检测结果表明,该方法重复性良好,检测下限为67.2拷贝/µL。将建立的DuCV实时荧光定量PCR检测方法分别对鸭肝炎病毒(DHV)、大肠杆菌、新城疫病毒(NDV)、H9亚型禽流感病毒、小鹅瘟病毒(GPV)核酸或cDNA进行特异性检测,结果表明特异性良好。

2.7 环介导等温扩增(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)技术

LAMP技术是一种在恒温条件下进行核酸扩增的技术,只需要普通水浴锅,不需要价格昂贵的PCR仪,操作简便,反应时间短,敏感性高,特异性好,适合基层应用。赵光远等[20]根据GenBank发布的DuCV基因保守序列,应用软件设计了6条引物,并优化扩增反应体系和程序,建立了DuCV的LAMP检测方法。该方法对H9亚型禽流感、小鹅瘟、鸭瘟、鸭肝炎和鸭副黏病毒核酸的扩增反应结果均为阴性,对DuCV核酸模版的检测敏感性为10 fg,是常规PCR方法的1 000倍,整个反应过程可在1 h内完成,大大提高了检测效率。

3 小结

DuCV是一种新发病毒,其相关研究还不深入,目前尚不能进行体外培养。实验室诊断方法主要有电镜观察、分子生物学诊断和间接ELISA方法。电镜法对仪器要求高,一般实验室很难达到,不能广泛应用。间接ELISA方法虽然能处理大量样品,但还没有商品化的试剂盒,且鸭群感染后抗体能持续很长时间,因此,检测抗体抗性并不能说明鸭处于发病期。分子生物学检测针对病原检测。因发病期鸭组织器官中含大量病毒,且能排毒,在临床检测中具有重要意义,所以检测时一定要选取正确的靶器官,常选取发病初期鸭法氏囊、脾脏和肝脏等组织,需尽快将样品送至实验室检测,全程保持低温,避免样品腐败变质。分子生物检测法种类繁多,各有利弊。探针法虽能检测大量样品,但操作繁琐,常规PCR大多数实验室都能开展,但检测敏感度低,不能定量;荧光PCR操作简便,对仪器和人员要求高;LAMP方法检测速度快,适合基层用,但前期研发困难,检测容易出现假阳性。不同实验室可根据自身条件选择适合的方法。随着分子生物学的发展,新型便携式仪器可能很快被研发出来,从而出现敏感性高、特异性好、价廉、可操作性强、适合广泛推广应用的新技术,为DuCVD防控工作奠定基础。

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