多种类型系统评价的整合式在线软件—JBI SUMARI简介
2017-01-15邢唯杰周英凤
朱 政 胡 雁 邢唯杰 周英凤 顾 莺
·循证医学方法学·
多种类型系统评价的整合式在线软件—JBI SUMARI简介
朱 政1胡 雁1邢唯杰1周英凤1顾 莺2
系统评价(以及由系统评价所产生的推荐意见和临床指南)是基于证据的医疗保健中的支柱,其重要价值在近30年来得到了学术界的广泛认同[1]。在过去的20年中,公开发表的系统评价的数量不断增加,同时,根据研究类型的不同,从传统的量性研究系统评价,发展到质性研究、专家意见和文本类系统评价、经济学评价和混合方法的系统评价[2]。系统评价最好能在确定研究问题、撰写系统评价计划书、选取研究、评估研究对象、提取和合成资料、撰写系统评价全文等关键环节中有相关工具的辅助和支持[3,4]。另外,在构建临床实践指南、促进临床决策过程中,不仅仅是对有效性的系统评价,同样需要对可行性和适宜性进行评价。然而,现有的系统评价软件缺乏对质性资料整合的方法学指导和软件上的支持。澳大利亚JBI循证卫生保健中心为了帮助研究人员和从业人员进行不同类型研究的文献资源的汇总、合成、分析和整合,开发了针对不同类型系统评价的整合式在线软件—JBI SUMARI,以便于简化、支持整个制作系统评价的过程。
1 JBI SUMARI软件的理念
SUMARI系统全称为“文献信息的管理、评估、评价集成系统:System for the Unified Management, Assessment and Review of Information”,是JBI近年来研发的一款开展各类别系统评价的在线工具。
基于多元主义的证据观指导,2001年由Alan Pearson教授担任主席的JBI证据整合方法学组在量性研究系统评价工具JBI MAStARI(JBI Meta Analysis of Statistics Assessment and Review Instrument)基础上构建了质性研究、文本和专家观点、卫生经济学研究的评价工具及整合的方法学指导,在系统评价方法学上有了突破。多元主义的证据观也成为研发JBI SUMARI系统中的重要哲学基础。自1996年JBI成立至今,在系统评价方法学上不断在发展,已形成包括量性研究、质性研究、文本和专家意见、卫生经济学研究等在内的系列系统评价的指导手册。2014年,在对系统评价软件进行4次主要更新后,JBI决定对软件进行重建,应用现代信息技术和网络手段,将不同类型的系统评价工具整合在一个平台上,形成了丰富的整合式证据综合在线工具,以适应证据综合迅速发展的需求,并将该软件命名为JBI SUMARI,于2016年正式上线JBI平台。
新JBI SUMARI系统在既往JBI系统评价软件的基础之上,研发了RESTful API构架,并在此构架上,采用AngularJS开发以web为框架的用户界面[5]。以浏览器为客户端的设置可以支持在笔记本电脑、平板电脑和其他移动设备上的使用。基于网络云端技术整合了4大模块,①QARI模块(JBI Qualitative Assessment and Review Instrument):开展质性研究的文献质量评价、资料提取和整合;②MAStARI模块(JBI Meta Analysis of Statistics Assessment and Review Instrument):开展队列研究、时间序列研究及描述性研究Meta分析;③ACTUARI模块(JBI Analysis of Cost, Technology and Utilisation Assessment and Review Instrument):开展经济学研究的文献质量评价、资料提取和整合;④NOTARI模块(JBI Narrative, Opinion and Text Assessment and Review Instrument):开展专家意见及文本报告的文献质量评价、资料提取和整合。
新版本的JBI SUMARI支持撰写系统评价的全过程,包括:确定研究问题,撰写系统评价计划书,文献的纳入与排除,质量评价,内容提取和内容综合,撰写系统评价全文。新系统支持10种不同类型的系统评价,包括:干预性研究的有效性评价、质性研究系统评价、成本/经济学研究的系统评价、发生率和流行趋势的系统评价 、诊断性试验的系统评价、病因和风险研究的系统评价、文本报告和专家意见的系统评价、混合性系统评价、系统评价再评价以及系统的范畴综述。
2 JBI SUMARI软件的应用简介
以干预性研究的有效性评价和质性研究系统评价为例,介绍JBI SUMARI软件(2017.02.08版本)的主要功能。
2.1 登陆和注册 JBI中心及分中心成员可以通过jbi@adelaide.edu.au进行身份验证进行注册,一般用户可在JBI-OVID数据库中,选择“EBP”菜单下的“JBI SUMARI”软件。登陆网址为:https://www.jbisumari.org/。
2.2 创建不同类型的系统评价 第1次登录JBI SUMARI时,仅可见“创建项目”按钮,点击后系统会自动弹出创建系统评价类型的选择菜单。JBI SUMARI支持上述10种类型的系统评价,选择撰写的系统评价种类,输入项目名称后按创造按钮。系统自动在首页生成新建项目。
2.3 撰写系统评价正文 点击项目名称后,进入撰写和修改界面。该界面分为7个部分,分别为项目概述、计划书撰写、研究纳入与排除、质量评价、内容提取、内容综合和正文浏览。
2.3.1 项目概述 项目概述界面可以浏览文章的标题、作者信息、研究纳入与排除、质量评价、内容提取和综合的进度。由于系统评价强调2人以上进行文献质量评价和资料提取,因此需要在“项目概述-参与者”条目中邀请一同开展系统评价的研究者,输入邮箱地址,进行注册和邮箱验证,方可继续完成其他步骤,同时系统会在另一位研究者账号中生成该项目信息。
2.3.2 计划书撰写 近年来,越来越多的国际专业期刊要求提交系统评价正文之前需要提供已发表的系统评价计划书。计划书的撰写可以为研究者理清思路,有助于减少评价过程中发生严重偏倚的可能性。在JBI SUMARI中根据系统评价的类型,提供了包括标题、作者、背景、研究问题、方法、纳入排除标准、检索方法、文献质量评价方法、资料提取方法、利益冲突申明、致谢、参考文献和附录的撰写系统评价计划书的模板。不同类型的系统评价,其提供的模板标题和内容不同。直接点击每一个分标题可对相应部分和例句进行编辑。
其中所涉及到的参考文献可以通过右侧“引注”条目下使用EndNote导出的题录导入到JBI SUMARI系统中,也可以根据提示手动录入参考文献信息。参考文献的信息保存在“引注”条目下,可以通过按住鼠标左键将文献拖拽至正文指定部位,并且系统会自动在正文“参考文献”部分生成文献信息。
点击“导出”按键,会生成排版后的RTF文件,该文件可以直接满足PRISMA-P对于系统评价计划书的内容和格式要求。
2.3.3 文献纳入与排除 文献纳入与排除界面可以选择“导入XML文件”自动导入EndNote题录,或者选择“创建研究”手动录入文献信息。文献信息栏目中显示了已导入的文献信息,包括作者、标题和发表年份。通过阅读文献的标题和摘要后,选择“纳入”和“排除”。“导出DOCX文件”功能可以生成符合PRISMA要求的“文献纳入排除流程图”。
2.3.4 质量评价 质量评价界面可以在线完成文献质量评价。该界面主要显示了符合纳入标准的文献信息以及2位研究者文献质量评价的进度。点击“开始”进入单篇文献质量评价页面,系统会根据所选择的系统评价的类型,选择相应的JBI 2016年更新版的文献质量评价工具。当选择排除文献时,需要对排除理由进行说明。2位研究者需要在各自账号内分别对相同的文献进行质量评价,当评价结果不一致时,系统会显示不一致的评价条目,提示2位研究者必须进行协商或者需要第三方进行判断。研究者必须对不一致的部分进行统一,否则无法完成整个评价过程。当文献质量的评价进度由“进行中”转变为“完成”时,表示该文献的质量评价已完成。点击“导出”按键,系统自动生成文献质量评价表格。
2.3.5 内容提取 通过文献质量评价后纳入的文献会显示在“内容提取”界面。选择文献,点击“开始”进入内容填写。不同类型的系统评价提取的内容不同,系统会自动生成内容提取的模板。完成所有文献的内容提取后,点击“导出”按键生成内容提取表格。
2.3.6 内容综合 内容综合界面可完成“Meta分析”或“质性整合”两部分。
2.3.6.1 Meta分析 点击“内容综合”下拉菜单中的Meta分析,点击“创建”按钮,并输入比较的名称,例如“中心静脉通路vs外周静脉通路”。选择“打开”下拉菜单,该界面会提示输入结局指标的名称和结局变量的类型(连续变量或二分类变量)。点击 “制图”按钮,进入森林图制图界面。森林图制图界面中分为参数模块、数据模块、图表模块。“参数模块”中,需要对“统计方法”、“模型类型”、“效果测度”和“可信区间”进行选择。“数据模块”中需要添加研究并分别填写文献中2组研究的总例数和阳性例数。当填写完毕后,可在“制图模块”中点击“生成”按钮,系统会自动生成tiff格式的森林图。
2.3.6.2 质性整合 点击“内容综合”下拉菜单中的质性整合。质性整合界面包括“研究”、“分类”、“综合结论”和“Meta整合流程图”4个子界面。
“研究”界面中,添加研究后可以录入每篇质性研究的“主题”、与该主题相关的“原文描述”和该主题的“可信程度”。每个主题的可信程度分为“明确的”、“可信的”和“不支持”3类。
“分类”界面中,可以对所有质性研究原文中的主题进行进一步归纳和提炼。首先需要“创建分类”,再选中主题后,选择“分配选项”将主题移动到相应的分类中。
“综合结论”界面中,可以进一步对分类进行提炼,综合后的结论需要用一段综合性阐述对所包含的分类进行归纳。首先需要“创建结论”,再选中分类后,选择“分配选项”将分类移动到相应的结论中。
完成所有归纳和提炼后,点击“Meta整合流程图”, 系统会自动生成tiff格式的Meta整合流程图。
2.3.7 正文浏览 正文界面可以进一步浏览和修改系统生成的正文。
[1]胡雁. 循证护理学. 北京:人民卫生出版社,2012
[2]Pearson A, Weeks S, Stern C. Translation science and the JBI model of evidence-based healthcare. Philadelphia: PA Lippincott Williams & Wilkins,2011
[3]Munn Z, Tufanaru C, Aromataris E. JBI's systematic reviews: data extraction and synthesis.Am J Nurs. 2014,114(7):49-54
[4]Munn Z, Lockwood C, Moola S. The development and use of evidence summaries for point of care information systems: astreamlined rapid review approach. Worldviews Evid Based Nurs,2015,12(3):131-138
[5]Munn Z. Software to support the systematic review process: the Joanna Briggs Institute System for the Unified Management, Assessment and Review of Information (JBI-SUMARI). JBI Database System Rev Implement Rep,2016,14(10):1
(本文编辑:张崇凡,孙晋枫)
1 复旦大学护理学院,复旦大学JBI循证护理合作中心 上海,200032;2 复旦大学附属儿科医院 上海,201102
胡雁,E-mail: huyan@fudan.edu.cn
10.3969/j.issn.1673-5501.2017.02.014
2017-04-18
2017-04-20)