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ACE基因单核苷酸多态性与冠心病易感性的关联性分析

2015-11-28贾一扬周丽婷李春艳王树越

吉林大学学报(医学版) 2015年4期
关键词:易感性频数等位基因

吴 娟,贾一扬,刘 特,周丽婷,孙 迪,徐 缙,李春艳,王树越,于 雷,叶 琳

(1.吉林大学公共卫生学院劳动卫生与环境卫生学教研室,吉林 长春 130021;2.吉林大学中日联谊医院急诊科,吉林 长春 130033;3.吉林大学第二医院放疗科,吉林 长春 130041)

冠心病 (coronary heart disease,CHD)是一种原因尚不明确的心血管疾病,其危险因素主要包括遗传因素、年龄、性别、血脂异常、高血压、糖尿病、肥胖与超重、不良生活饮食习惯和精神压力等。CHD的形成涉及到遗传因素、环境因素及其交互作用,动脉粥样硬化是其病变的主要病理生理学机制[1-2],在动脉粥样硬化的发生发展过程中肾素-血管 紧 张 素-醛 固 酮 系 统 (renin-angiotensinaldosterone system,RAAS)起着重要的作用[3]。RAAS是体内重要的内分泌系统,在血压及心血管稳态调节中占有重要的地位,其过度激活与CHD、充血性心力衰竭和高血压等疾病的发生、发展密切相关[4]。血管紧张素转换酶 (angiotensin converting enzyme,ACE)是RAAS系统中参与构成血管内皮细胞的一种金属肽酶,是ACE基因的表达产物[5-6]。目 前国内外 有关 ACE 基 因 与CHD相关性的研究多集中于ACE基因插入/缺失多态性 (I/D)[7-9],关于 ACE 基因单核苷酸多态性 (single nucleotide polymorphism,SNPs)与CHD关联性的研究少有报道。本研究拟通过病例对照研究,选取ACE基因rs4267385和rs4316位点,旨在探讨ACE基因与中国北方汉族人群CHD易感性的关系。

1 资料与方法

1.1 研究对象 选择2009—2013年在吉林大学第一医院确诊并住院治疗的CHD患者246例作为病例组,研究对象临床表现及心电图变化均符合WHO制定的CHD诊断标准。对照组为同期在吉林大学第一医院体检中心体检的健康个体251名。个体间均无血缘关系且2组人群均为中国北方汉族人。

1.2 主要试剂和仪器 DNA提取试剂盒、TaqDNA聚合酶引物、PCR引物、限制性内切酶、琼脂糖和DL 2000DNA Marker(Takara公司,日本),溴化乙锭 (大连宝生物工程有限公司)。离心机 (Eppendorf公司,德国),微量加样器(Gilson公司,美国),PCR扩增仪和紫外凝胶成像系统 (Bio-Rad公司,美国),电泳仪 (北京六一仪器厂),恒温培养箱 (上海贺德实验设备有限公司)。

1.3 基因组DNA的提取 在研究对象知情同意的情况下,抽取外周静脉血5mL,EDTA抗凝,-20℃冻存以备基因组DNA的提取。按照DNA提取试剂盒实验步骤从EDTA抗凝全血中提取DNA,采用紫外分光光度计检测DNA含量,A280/A260比值均在1.6~2.0。

1.4 SNPs的选择 在Hapmap数据库中查询中国北方汉族人群ACE基因的SNPs数据,运用Haploview 4.2软件对位点进行筛选,选取最小等位基因频率 (MAF)大于0.1、连锁不平衡系数 (r2)大于0.8、连锁不平衡程度随距离而改变的程度 (D′)为1的2个SNPs位点 (rs4267385和rs4316)作为研究位点,采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性 (PCR-RFLP)方法进行基因型检测。

1.5 基因型检测 引物设计:在NCBI的SNP库里查询ACE基因rs4267385和rs4316位点的模板序列,利用Primer 5.0软件设计引物。rs4267385,上游引物 5′-GGGAAGTGAGTCTGAGGG-3′,下游 引 物 5′-TGGAAGCCAGGTTATCTC-3′;rs4316,上 游 引 物 5′-CGGGCTCCGCTCTTATTG-3′, 下 游 引 物 5′-GGGCTCTGGGCTGATGTCT-3′。反应体系为20μL,含有2×Taq PCR MasterMix 10μL,上下游引物各2μL,二馏灭菌水 (ddH2O)4μL,模板DNA 2μL;反应条件:94℃ 预 变 性 5min;94℃、30s,58℃(rs4267385)/56℃ (rs4316)、30s,72℃、1min,34个循环;72℃延伸10min;4℃保存。酶切体系及反应条件:酶切体系为20μL,包含PCR扩增产物10μL,限制性内切酶 (rs4267385用PmlⅠ,rs4316用 Xsp Ⅰ)0.8μL,ddH2O 7.2μL,10×Buffer/10×Buffer TangoTM2μL。酶切体系在37℃恒温箱中酶切4~16h后,用2.5%琼脂糖凝胶电泳30min,凝胶成像分析系统观察酶切图谱,判断位点的基因型。

1.6 统计学分析 采用SPSS 17.0统计软件进行统计学分析,采用拟合优度χ2检验分析病例组和对照组基因型频数分布是否符合Hardy-Weinberg平衡定律,采用χ2检验分析SNPs基因型、等位基因频数分布与CHD的关联性。

2 结 果

2.1 研究对象的基本情况 病例组共246例,其中男性130例,女性116例,平均年龄 (64.74±11.35)岁。对照组共251例,其中男性124例,女性127例,平均年龄 (62.39±12.16)岁。病例组与对照组研究对象年龄和性别比较差异均无统计学意义 (t年龄=1.614,P=0.205;χ2性别=0.150,P=0.904),说明病例组与对照组人群年龄和性别均匹配,具有可比性。

2.2 rs4267385和rs4316位点酶切电泳结果rs4267385位点带有C基因型被酶切成336和52bp 2个片段;带有T基因型不能被酶切,电泳时只有388bp片段;CT杂合子同时具有3个片段。rs4316位点带有T基因型被酶切成140和116bp 2个片段;而带有C基因型不能被酶切,电泳时只有256bp片段;CT杂合子同时具有3个片段。见图1。

2.3 Hardy-Weinberg平衡定律检测 采用拟合优度χ2检验对病例组和对照组rs4267385、rs4316位点的基因型频数分布进行Hardy-Weinberg平衡检验,结果显示:病例组和对照组研究对象2个位点基因型分布均符合 Hardy-Weinberg平衡定律(P>0.05)。见表1。

2.4 病例组和对照组人群ACE基因rs4267385和rs4316位点的基因型和等位基因频数分布比较病例组和对照组rs4267385位点CC、CT和TT基因型频数分布比较差异均有统计学意义 (P<0.05),OR (CC/CT)=0.660 (95%CI:0.398~1.118), OR (TT/CT) = 1.402 (95%CI:0.954~2.052),OR (CC+ TT/CT) =1.139(95%CI:0.798~1.626);C、T等位基因频数分布比较差异有统计学意义 (P<0.05),OR (C/T)=0.640 (95%CI:0.495~0.827)。见表2。

图1 rs4267385(A)和rs4316(B)位点酶切电泳图Fig.1 Electrophoregram of digestion of rs4267385(A)and rs4316(B)sites

病例组和对照组rs4316位点CC、CT和TT基因型频数分布比较差异均无统计学意义 (P>0.05), OR (CC/CT) = 0.926 (95%CI:0.581~1.475),OR (TT/CT)=1.100(95%CI:0.717~1.686),OR (CC+TT/CT)=1.019(95%CI:0.715~1.454);C、T等位基因频数分布比较差异无统计学意义(P>0.05),OR (C/T)=0.928 (95%CI:0.723~1.191)。见表3。

表1 2个SNPs位点Hardy-Weinberg平衡的拟合优度χ2检验结果Tab.1 Results ofχ2 test of Hardy-Weinberg equilibrium of two SNPs sites

3 讨 论

人体ACE基因位于染色体17q23,ACE对于心血管系统具有重要作用,主要使血管紧张素Ⅰ(AngiotensinⅠ,AngⅠ)转化为血管紧张素Ⅱ(AngiotensinⅡ,AngⅡ),灭活缓激肽和调节血管张力。AngⅡ有缩血管的作用,且能诱导血管平滑肌细胞增生和肥厚,加强血小板衍生生长因子的表达及抑制纤溶活性,使低密度脂蛋白 (LDL)在血管壁内滞留、氧化并被巨噬细胞吞噬,促进血栓形成;而缓激肽能刺激内皮细胞释放舒张因子,抑制平滑肌细胞的增殖[10]。当ACE基因上某个碱基发生改变,可引起血管紧张素表达量或活性的改变,与冠心病和心肌梗死的发生发展密切相关。Sesal等[11]和 Dzielinska等[12]研 究 发 现:ACE 基因是欧洲人群中CHD的易感基因。YýLmaz等[13]对ACE基因I/D多态性与儿童CHD发病相关性进行研究发现:病例组人群D等位基因频数高于对照组。姜昕等[14]对中国居民ACE基因I/D多态性与CHD易感性关系进行了荟萃分析,结果发现:病例组人群DD基因型和D等位基因频数分布均高于对照组,DD基因型个体CHD发病风险高于ID型和II型,表明D等位基因与CHD发病风险密切相关。

表2 病例组和对照组人群rs4267385位点基因型和等位基因频数分布Tab.2 Distribution of genotypic and allelic frequencies at rs4267385site in case and control groups [n (η/%)]

表3 病例组和对照组人群rs4316位点基因型和等位基因频数分布Tab.3 Distribution of genotypic frequencies and allelic frequencies at rs4316site in case and control groups[n(η/%)]

CHD是一种受多个遗传因素和环境因素共同作用的复杂疾病。Sun等[15]研究发现:ACE基因rs4332位点多态性与老年人冠心病发病有关。Ellis等[16]对ACE基因多态性与CHD易感性的研究发现:ACE基因rs4267385多态性与CHD发病有关。本研究采用病例-对照研究探讨ACE基因上2个SNPs与中国北方汉族人群CHD易感性的关系,结果显示:病例组和对照组人群rs4267385位点基因型和等位基因频数分布比较差异有统计学意义,OR (CC/CT)=0.660、OR (TT/CT)=1.402、OR (C/T)=0.640,表明rs4267385位点多态性与中国北方汉族人群CHD易感性有关联,TT基因型个体CHD发病风险高于CC基因型和CT基因型个体,与Ellis等[16]研究结果一致。rs4267385位点多态性改变可能会导致ACE表达的差异,影响AngⅠ转化为AngⅡ的过程,从而导致心血管疾病易感性的差异。本研究发现:rs4316位点多态性与中国北方汉族人群CHD易感性无关联,可能是由于rs4316位点多态性与CHD易感性无关或本研究样本量较少,检验效能低的原故。在今后的研究中需进一步扩大样本量,同时检测与CHD发生可能相关的其他基因,进行基因与基因、基因与环境之间交互作用的分析。

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