利用正交设计优选NR2A的Western Blot成像条件
2014-11-27高岚岳
高岚岳,苑 洁,姜 泓
(中国医科大学 公共卫生学院,辽宁 沈阳 110001)
Western Blot中文称为蛋白质印迹法,是蛋白质分析的最流行的技术之一,现己广泛应用于基因在蛋白水平的表达研究、抗体活性检测和疾病早期诊断等方面.Western Blot测定结果采用目的蛋白的灰度值计算法,在自动曝光成像过程中,常由于背景干扰大的原因,而出现测量结果不准确及测定结果重现性差等问题.为保证良好的成像质量及准确度、重现性好的条带灰度值,有必要对成像条件进行优化,以确保Western Blot结果的准确性.
NR2A是兴奋性氨基酸谷氨酸的特异性受体(NMDA受体)的调节亚单位之一,具有调制突触传递、触发突触可塑性以及参与学习与记忆等重要的生理功能[1-2].在前期研究中,作者通过调整蛋白上样量、电泳和转膜条件、封闭时间、一抗和二抗稀释倍数用以增强杂交信号、降低背景.但采用自动曝光的凝胶成像系统,NR2A成像结果仍然不理想,所以本研究采用手动曝光的凝胶成像系统,以双指标(条带灰度值和背景灰度值)进行综合评价优化NR2A的成像条件,以期得到理想的成像结果.
本研究以NR2A为切入点,研究其最佳成像条件,采用正交实验法,对影响条带灰度值和背景灰度值的因素如光圈(A)、焦距(B)、曝光时间(C)等进行考查;探讨NR2A的Western Blot最佳手动成像条件,以期为采用该技术的应用提供依据.
1 实验部分
1.1 试剂与仪器
BCA试剂盒(全士金公司)、山羊抗NR2A抗体(SANTA公司)、山羊抗β-actin抗体(SANTA公司)、ECL显影试剂盒(全士金公司).
超声波细胞粉碎机(宁波科生仪器厂)、3K18型超速低温离心机(美国Sigma公司)、水平及垂直摇床(海门市麒麟医用仪器厂)、蛋白质电泳装置(TANON公司)、蛋白质电转印装置(TANON公司)、Gel Logic 2200型成像系统(KODAK公司)、Gel-Pro analyzer4图像分析软件.
1.2 组织蛋白的提取及浓度测定
取50mg大鼠脑海马置于2mL EP管中,用干净的剪刀将组织块剪碎,加入450μL细胞裂解液进行裂解,然后置于冰上;用超声波细胞粉碎机超声60s后再置于冰上,重复3次使细胞破碎;4℃下12 000r/min离心15min×2次,取上清液,分装于新离心管中;采用BCA试剂盒法测定上清液中蛋白浓度,并调整蛋白浓度至3g/L.
1.3 蛋白的分离与含量测定
采用Western Blot法进行蛋白含量分析.每孔道加15uL蛋白样品,依次经聚丙烯酰胺凝胶电泳,转膜(采用PVDF膜),TBS-T洗膜,脱脂奶粉封闭,TBS-T洗膜,4℃下一抗(NR2A1∶1 000,β-actin 1∶3 000)孵育过夜,TBS-T洗膜,二抗(兔抗山羊1∶3 000)孵育2h,TBS-T洗膜,ECL法显色.用成像系统采集图像,重复3次,利用图像分析软件测量蛋白条带和背景的灰度值.
1.4 正交实验优选成像条件与实验安排
以条带和背景的灰度值为考查指标,以光圈(A)、焦距(B)、曝光时间(C)作为3个因素,因素水平见表1.采用L9(34)正交设计表安排实验.
表1 成像的因素水平Table 1 The factor level of imaging
1.5 数据处理
采用SPSS 16.0软件对所测数据进行统计分析,数据用均数±标准差(¯x±s)表示,采用正交设计方差分析进行比较,各因素内各水平进行多重比较,检验水准P<0.05.
2 结果与讨论
2.1 成像条件的选择
如前所述,Western Blot是分子生物学、生物化学和免疫遗传学中常用的一种实验方法,用于研究目的蛋白的表达特性分析、组织定位、表达量分析及与其他蛋白的相互作用.Western Blot具有电泳技术分辨力强、免疫反应特异性强和免疫标记技术灵敏度高的特点,是一种便捷、可靠的实验方法.Western Blot实验结果要求所得图片清晰,即杂交信号强、背景低,测定的目的蛋白灰度值准确、重现性好.在实验过程中,除通过调整封闭时间、膜的处理、一抗和二抗稀释倍数降低非特异性结合背景外,还需要通过调整成像效果排除背景色干扰,这是Western Blot实验的最后、最关键的一步.
光圈、焦距和曝光时间是影响成像效果的三个主要因素.光圈和曝光时间调节明暗,焦距调节清晰度.光圈是用来控制光线透过镜头,进入机身内感光面光量的装置.光圈大小用F值表示,F值愈小,通光孔径越大,在同一单位时间内的进光量便越多,例如光圈从F8调整到F5.6,进光量便多一倍.此外,上一级的进光量是下一级的一倍,所以光圈F值越小,图像越亮,反之越暗.本实验光圈的F值范围是1.2~16mm.前期实验证明光圈为2~4mm时,灰度值无显著差异(P>0.05),所以本实验对光圈范围(4mm≤F≤8mm)进行研究.曝光时间是为了将光投射到照相感光材料的感光面上,快门所要打开的时间,主要指CCD成像平面的感光时间.曝光时间越长,进光量便越多,拍摄的图像越亮,反之图像越暗.前期实验证明曝光时间为60~120s时,灰度值无显著差异(P>0.05).考虑到工作效率问题,选定曝光时间在60s内进行研究.焦距指平行光入射时透镜光心到光聚集之焦点的距离,亦是从照相机镜片中心到CCD成像平面的距离.本实验焦距的范围是2.5~30mm.除以上三个因素外,视场(ZOOM=30%)、像素合并(binning=4*)均为固定值.
NR2A是NMDA受体的亚单位之一,在脑内分布广泛,以海马、皮层和小脑最丰富,具有调制突触传递、触发突触可塑性以及参与学习与记忆等重要的生理功能[3-4].已有研究发现,在突触后致密体(PSD)中,NMDA受体中NR2A蛋白质C末端由于受到钙/钙调素依赖的蛋白激酶Ⅱ(CaMKⅡ)同突触后致密体95(PSD-95)之间竞争性地结合从而影响海马的突触可塑性[5].决定受体的电生理学和药理学特性[6-7].实验过程中,我们采用凝胶成像系统自动曝光,未得到理想的NR2A成像结果,所以本研究采用具有均衡分散、综合可比及可伸缩、效应明确等特性的正交实验设计法,以便最快的找到最优的水平组合[8-9].
2.2 正交实验结果
目前关于Western Blot成像条件的优化研究未见报道,本实验以NR2A为切入点,以条带灰度值和背景灰度值为考查指标进行研究.按实验部分1.2、1.3进行操作,测量条带和背景的灰度值,并进行方差分析,结果见表2和表3.
表2 成像的因素水平L9(34)正交实验表Table 2 L9(34)orthogonal design table for the factor level of imaging
表3 方差分析结果Table 3 Results of variance analysis
从表2和表3的结果分析上可以看出,三个因素的影响大小依次为A>C>B,且A1>A2>A3,B2>B3>B1,C3>C2>C1,A因素和C因素的影响具有显著性.综合分析各个因素对条带和背景灰度值的影响,确定最佳成像条件:光圈为4mm、焦距为30mm、曝光时间为60s.
2.3 验证实验
为了验证所选条件的合理性,进行了三次验证实验,从表4结果可知,所选成像条件较稳定,故确定最佳成像条件:光圈为4mm、焦距为30mm、曝光时间为60s.采集图像如图1所示.
表4 三次验证实验结果Table 4 Results of three verification tests
图1 三次验证实验图像Fig.1 Images of three verification tests
3 结论
采用正交设计的方法得到NR2A的Western Blot最佳成像条件:光圈为4mm、焦距为30mm、曝光时间为60s.
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