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PowerPlex21系统在亲子鉴定中的应用评估

2014-04-19邱平明陆慧洁黄恩平余嘉欣

中国司法鉴定 2014年2期
关键词:基因座亲子鉴定法医学

陈 玲,邱平明,陆慧洁,黄恩平,余嘉欣

(南方医科大学 法医学系;南方医科大学司法鉴定中心,广东 广州 510515)

PowerPlex21是美国Promega公司2012年推出的常染色体检测试剂盒。该试剂盒除包括CODIS推荐的13个核心基因座外,还增加了D1S1656、D6S1043、Penta E、D2S1338、Penta D、D12S391 和 D19S433 这7个基因座。本研究对该系统在1704例亲子鉴定中的应用及相关问题进行了分析,以评估该系统在中国人群亲子鉴定中的效力。

1 材料和方法

1.1 样本

南方医科大学司法鉴定中心亲子鉴定检案1704例(其中1937个无关个体),检材类型包括人体血样、唾液斑、带毛囊毛发、羊水等。

1.2 仪器和试剂

9700扩增仪(美国AB公司);3130xL遗传分析仪(美国AB公司);PowerPlex21试剂盒(美国Promega公司)。

1.3 方法

1.3.1 DNA提取、PCR扩增、STR分型检测

采用chelex100法提取DNA,扩增体系和热循环反应按PowerPlex21试剂盒说明书进行,扩增产物在3130xL遗传分析仪电泳,Genemapper ID v3.2软件分析结果。

1.3.2 统计分析

应用PowerStats V12.xls软件,计算STR基因座的杂合度(H)、个体识别力(DP)、非父排除率(PE)、多态信息含量(PIC)等法医学应用参数。累积非父排除率(CPE)和累积个体识别力(CDP)参照文献[1]进行计算。

2 结果

2.1 PowerPlex21系统的法医学应用参数

用PowerPlex21系统对1937个无关个体进行DNA分型,对分型结果进行法医学应用参数统计,结果见表1。除TH01和TPOX基因座外,其余基因座均H>0.7;除 TPOX 基因座外,其余基因座均 DP>0.8;除D3S1358、CSF1PO、TH01和TPOX基因座外,其余基因座均 PE>0.5、PIC>0.7。

表1 中国汉族人群20个STR基因座的法医学常用参数

2.2 PowerPlex21在亲子鉴定中的应用

用PowerPlex21系统检测1704例亲子鉴定案件,认定亲子关系的三联体案件为82例、二联体案件为1357例,排除亲子关系265例,其中Penta E基因座的排除概率最高,为71.54%;TPOX的排除概率最低,为 20.97%(见表 2)。

表2 PowerPlex21系统20个基因座作为排除基因座的概率

2.3 PowerPlex21系统20个STR基因座的突变情况

在认定的1439例亲子鉴定中,其中44例表现为1个基因座违反遗传规律。发现的突变基因座共15个,按突变率从高到低排列如下:D12S391、Penta E、D18S51、vWA、FGA、D5S818、D13S317、CSF1PO、D8S1179、D19S433、D3S1358、D1S1656、D2S1338、TH01和 D21S11,见表 3。

2.4 PowerPlex21系统的等位基因丢失

用PowerPlex21系统检测的1704例亲子鉴定案件中,2例亲子鉴定经PowerPlex21系统检测,父和子在D5S818基因座均表现为纯合子、且峰高约为附近纯合子基因座峰高的一半,经Sinofiler检测证实PowerPlex21系统在D5S818基因座出现等位基因丢失,见图1。

图1 PowerPlex21和Sinofiler系统检测两例案件在D5S818基因座的分型图谱

3 讨论

Shriver等[2]认为当 DP>0.80、PE>0.50 时,该基因座属于高度多态性。Gill等[3]认为,DP≥0.9、H≥0.7 的基因座具有高鉴别力。与目前常用的试剂盒相比,PowerPlex21试剂盒增加了D1S1656基因座,该基因座的H、DP、PE、PIC值均显示满足高度多态性基因座的标准,可见D1S1656基因座在亲子鉴定和个体识别方面有较大的应用价值。

对于认定亲子关系的案件,PowerPlex21检测三联体的CPI值均大于10000,检测二联体CPI小于10000的案例百分比低于其他检测系统。这表明PowerPlex21可更好地满足亲子鉴定的要求。对于排除亲子关系的案件,PowerPlex21系统在Penta E基因座的排除概率最高,在TPOX基因座的排除概率最低,这与统计得到的PE值一致。PowerPlex21系统认定的1439例亲子鉴定中,有15个STR基因座检出突变,突变率较高的基因座是 D12S391、Penta E、D18S51、vWA、FGA。

PowerPlex21检测时出现了2例亲子鉴定在D5S818基因座发生等位基因丢失的现象。这两例案件在分析DNA图谱时,根据该基因座的峰高特征(峰高约为附近杂合子基因座峰高的一半),且仅该基因座违反遗传规律,初步预测可能是等位基因丢失,因此加做其他公司的扩增试剂盒(Sinofiler系统)检测,确认用PowerPlex21检测时在D5S818基因座出现等位基因丢失。这2宗案例易误认为是发生一步突变,因此对于亲代和子代为纯合子的基因座判断突变时要特别慎重。

[1] 侯一平.法医物证学[M].北京:人民卫生出版社,2009:21-23.

[2] Shriver MD,Jin L,Boerwinkle E,A novel measure of genetic distance for highly polymorphic tandem repeat loci.Mol Biol Evol[J].1995, 12(5):914-920.

[3] Gill P.A new method of STR interpretation using in feren tial logic developm ent of a crim in al in telligence database.In t J Leg Med, 1996, 109(1):14-22.

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