呼和浩特地区蒙古族人群19个STR基因座遗传多态性

朱永强+莫日根+王月星+张文广

本文应用Goldeneye DNA身份鉴定系统20A扩增试剂盒对呼和浩特地区346名蒙古族无关健康个体的血样进行19个STR基因座的复合扩增、联合检测，并利用AB3130XL遗传分析仪对扩增产物进行检测，用GeneMapper ID 3.2软件进行电泳后的基因分型，分型数据经过统计分析，最终获得呼和浩特地区蒙古族群体19个STR基因座的遗传多态信息，完善了本地人群数据库，为本地区蒙古族群体法医学个体识别、亲权鉴定中运用相关参数提供了依据和可靠的基础数据。

一、材料与方法

（一）样本来源

本实验所使用的样本是根据知情同意的原则，采集生活居住在呼和浩特地区的蒙古族无关健康个体血样346份，其中男性286份，女性60份。以上样本均系本实验室DNA数据库和日常受理案件积累。

（二）DNA提取及分型检验

本实验采用Chelex-100法[1]提取个体血样的DNA，并使用Goldeneye TM身份检定系统20A扩增试剂盒对提取的DNA模板进行19个STR 基因座复合扩增。按照商品试剂盒提供的试验配比，配制10 μl 的PCR反应体系。用3130XL型遗传分析仪进行毛细管电泳，电泳结束后使用Genemapper ID V3.2软件，进行基因分型。

（三）统计学处理

采用法医学统计软件Modified-PowerState V12分析软件[2]对实验获得的数据结果进行分析，统计出各基因座的等位基因频率、杂合度（H）、个人识别能力（DP）、多态信息含量（PIC）、非父排除率（PE）和匹配概率（Pm）等群体遗传学参数。

根据以上获得的数据，运用相应公式[3，4]计算出19个STR基因座的累积个体识别率（TDP），累积非父排除率（CEP），并用χ 2检验各STR基因座是否符合Hardy—Weinberg平衡。

二、结果与讨论

呼和浩特地区蒙古族群体346名无关个体在19个STR基因座共检出217个等位基因和763种基因型。经χ 2检验，19个STR基因座分布均符合Hardy—Weinberg平衡定律（P>0.05）；各等位基因及其分布频率见表1，相关遗传学参数见表2。

本文发现本次呼和浩特地区蒙古族346名无关个体的调查检测中，19个基因座共检出217个等位基因和763种基因型。其中19个STR基因座中，检出等位基因最多的基因座为PentaE，共计20个，其次为D21S11和D18S51，均为17个，等位基因最少的为TPOX、D16S539、TH01和D13S317，均为7个；D3S1358为8个， CSF1PO、D8S1179、D7S820、D5S818和vWA均有9个等位基因； Penta D有11个；D19S433有12个；D2S1338有13个；D12S391有14个；D6S1043和FGA均为16个等位基因。

这19个STR基因座中检测中，测得频率最高的等位基因为TPOX的等位基因8 （ 0.5448 ），其它依次为TH01的等位基因9（0.4913）；CSF1PO的12 （0.3887）； D3S1358的15 （0.3627）； D7S820的11（ 0.3454）； D16S539的9（0.3338 ）；D5S818的11 （0.3295）。19个STR基因座单基因频率最小为0.0014，最大为0.5448。

19个STR基因座个体识别力DP值最大为PentaE （0.9860），最小为TPOX（0.7881） ；杂合度H值最大为Penta E （0.9220），最小为TPOX（ 0.5838）； 认为DP>0.9， H>0.7的基因座为具有高鉴别力的基因座[5]，根据表2可见，本次调查的19个STR基因座除了CSF1PO，D3S1358，TPOX和TH01四个基因座的DP值在0.7881至0.8801之间，H值在0.5838至0.7514之间，其多态性偏低，鉴别力较弱，信息量较少外，其余15个STR基因座都为高杂合度、高多态性、高信息量、高鉴别力的基因座。

本次呼和浩特地区蒙古族346名无关个体的调查检测中，19个STR基因座多态性信息含量PIC值最大为PentaE（0.9151），最小为TPOX（0.5494）； 19个STR基因座非父排除率PE值最高为基因座PentaE（0.8405），最小为TPOX（0.2719）；匹配概率Pm最高的为TPOX（0.2119），最小的为PentaE（0.0140）。

本次呼和浩特地区蒙古族346名无关个体的调查检测中，19个STR基因座累积匹配率为1.594×10-23； 19个STR基因座的累积個体识别率TDP大于99.99999999999999999999%，19个STR基因座累积非父排除率CPE达0.999999990743111，在呼和浩特地区蒙古族人群中，该19个STR基因座构成的检测系统可以满足该群体个体识别和亲权鉴定的需要，在该群体中具有高度多态性。

经χ 2检验，本次研究中所使用的19个STR基因座，其19个基因座的P值均大于0.05，均符合Hardy—Weiberg平衡。

观察19个STR基因座，在D12S391、D21S11、D6S1043、D18S51、D7S820和D2S1338共6个基因座上共检出9个微变异等位基因。这些特殊位点等位基因按Jhon M. Butler法[6，7]确定、命名， 由表1可知，这些微变异等位基因的频率均小于0.0100。

刘淑萍等[46]对中国蒙古族群体（内蒙古土默特左旗）6个STR基因座（vWA、FGA、Penta E、D6S1043、D2S1772、D7S3048）的遗传多态性进行调查的结果显示，其DP值在0.9160～0.9826，H值在0.7945～0.9234之间，PIC值在0.7617～0.9161之间。本文与之比较，19个基因座中与之相同的基因座的DP值、H值、PIC值略有差异，但本文除与之相同的四个基因座（vWA、FGA、Penta E、D6S1043）外，另外增加了15个基因座检出了更多的等位基因，更多的基因型，获得了更多的群体遗传学基础信息。endprint

参考文献：

[1] walsh P S， Metzger D A， Higuchi R. Chelex-100 as a medium for simple extraction of DNA for PCR-based typing from forensic material[J]. Biotechniques， 1991，10（4）：506-513.

[2]赵方，伍新尧，蔡贵庆等. Modified-Powerstates软件在法医生物统计中应用[J]. 中国法医学杂志，2003，（05）：297-298+312.

[3] Fisher RA. Standard Calculation for evaluating a blood group system[J]. Heredity， 1951，5：95-97.

[4]Odelberg SJ ， White R. Repetitive DNA：Molecular Structure， Polymorphism， and forensic application[A]. In： DNA and other polymorphisms in forensic science[M].lst ed. Chicago： Year book medical publishers Inc， 1990，26-28.

[5] Gill P. A new method of STR interpretation using inferential logie development of a criminal intelligence database[J].Int J LegMed， 1996， 109：14.

[6]Gill P. A new method of STR interpretation using inferential logie development of a criminal intelligence database[J].Int J LegMed， 1996， 109：14.

[7] John M. Butler（侯一平，劉雅诚，译）.法医DNA分型STR遗传标记的生物学、方法学及遗传学[M].北京：科学出版社，2007：99-100， 107-109，353.

[46]刘淑萍，毕力夫，苏秀兰. 中国蒙古族群体六个短串联重复序列位点的遗传多态性[J]. 中华医学遗传学杂志，2005，（02）：222-223.

【作者简介】朱永强，男，汉族，法医师，学士学位，主要从事法医DNA检验工作。endprint