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亚稳外延等位基因与结直肠癌变机制相关性研究进展

2014-03-06刘家麒游柳平综述黄跃南审校

疑难病杂志 2014年5期
关键词:表观等位基因甲基化

刘家麒,游柳平综述 黄跃南审校

综 述

亚稳外延等位基因与结直肠癌变机制相关性研究进展

刘家麒,游柳平综述 黄跃南审校

亚稳外延等位基因;结直肠癌;无创检查;DNA甲基化;表观遗传标志

亚稳外延等位基因(MEs)是哺乳动物表观等位基因组位点,可以被一种可变、可逆的方式修饰,使遗传上相同细胞出现不同的表型分布[1,2]。多项研究结果显示,在胃癌、乳腺癌、大肠癌、肾母细胞瘤中一些MEs基因发生DNA甲基化,且与肿瘤的发生、发展密切相关[3~13]。结直肠癌(colorectal carcinoma,CRC)是最常见的恶性肿瘤,近年发病率和病死率明显上升。大量证据表明,无创检查可以明显提高CRC的早期诊断率,已得到公众的认可。迄今为止,DNA甲基化检测是一种无创检查CRC的理想方案。本文就MEs相关CRC癌变机制的最新进展综述如下。

1 结直肠癌的早期检测与预后

结直肠癌包括结肠癌和直肠癌,是世界范围内癌症相关疾病发病和死亡的一个主要原因。CRC在男性是第3位最常见的恶性肿瘤,在女性恶性肿瘤居第2位,2008年有超过120万个新发病例,估计有608 700人死亡[14]。近几十年来,随着社会经济的发展和生活水平的提高,在包括中国、日本、韩国和新加坡在内的一些亚洲国家和地区,CRC的发病率增加了2~4倍,患病率也呈现持续上升的趋势,这与饮食习惯趋向于高蛋白质、高脂肪、低纤维素变化有很大关系。被诊断为CRC的患者往往存在远处转移(IV期)且无法治愈,大约40%的CRC患者死于肿瘤的转移。显然,局部癌症(I/II期)及早发现更有利于根治性治疗,提供更好的预后。

现有的CRC筛查技术包括大便隐血试验、双对比钡灌肠、内窥镜检查、直肠指诊以及血清癌胚抗原(CEA)的检验。现有的筛选方式使病死率仅有下降,但没有达到很高的公众参与。例如结肠镜检查是侵入性的策略,而大便隐血测试的用途有限,因为需要进行反复测量并受到膳食成分的干扰;在早期阶段CEA缺乏足够的灵敏度,容易受到憩室炎、胃炎、糖尿病等良性疾病的影响。在过去的10年,肿瘤来源的异常DNA可以在癌症患者的血浆或血清中检测发现,DNA甲基化(DNA methylation)用于早期癌症的检测是一个很有前途的工具。几项研究证明来源于癌症患者血液中实体肿瘤的自由DNA的存在[3~13],提高了在被检者体内检测出癌症特异性分子的可能性。生物标志物的使用,特别是表观遗传生物标志物血清、尿液、粪便,有望缩小侵袭而可靠的测试和非侵入性但不可靠研究之间的差距。无创检查诊断CRC和癌前病变的DNA甲基化的生物标志物已被广泛研究,无创更利于患者接受,同时提高CRC筛查率。

2 MEs的生物学功能

表观等位基因(epiallele)是一种广义生物等位基因,是在同一基因座位中,DNA发生不同程度的甲基化所形成的等位基因。由于环境对表观遗传标记的影响,有3个基因组目标可能对基因表达有易感性:一些管家基因的启动子区域、与MEs邻近的转座子元件和印记基因的调控元件。表观遗传学改变,包括DNA甲基化和组蛋白修饰,可以独立地影响基因表达的遗传密码。表观基因在妊娠期、新生儿发育期、青春期和老年期都容易发生异常,但在胚胎发育过程中最容易受到环境因素的影响。因为在早期发育过程中DNA合成的速率很高,而且人体正常组织发育所需的复杂DNA甲基化的图案和染色质结构也是这个时期建立的。MEs是Rakyan在2002年发现的哺乳动物基因组位点,这个位点可以被一种可变、可逆的方式修饰,使遗传上相同细胞出现不同的表型分布[1,2]。等位基因的表达常常与转座子的表观状态有关,大多数的转座子元件是沉默的,但是转座子元件子集的表观遗传状态是亚稳的,并且以一个随机地方式从低甲基化到高甲基化变化。在实验室对鼠的研究发现产前环境可以影响产后表型,这为早期环境影响哺乳动物的表观基因组的修饰并且关联到不同疾病表型提供了根据[15,16]。环境表观基因组学中MEs是已知的对环境敏感的表观遗传标记,这种可变的表观遗传状态影响邻居基因的表达。近年来研究发现DNA甲基化是发生癌变早期阶段频繁出现的表观遗传学变化,可以作为癌症存在的一个指标[7,17]。此外,启动子区域内异常的DNA甲基化基因可能会导致染色质基因的转录下调[18]。抑癌基因的启动子CpG岛甲基化是一种常见的人类癌症的标志[19,20],有助于癌症的发生和发展。一般来说,肿瘤抑制基因的表达减少是由于等位基因的丧失或启动子区域的超甲基化。一项前瞻性研究发现,一些DNA甲基化的基因的变化已被联系到各种形式的人类疾病,如哮喘和急性髓系白血病、胃癌、乳腺癌、大肠癌、肾母细胞瘤等,这提示MEs在肿瘤潜在的致病作用,并强调MEs可能是这些恶性肿瘤的发展起源。其中与CRC关系最密切的基因有EBF3、KCNK15、TCERG1L、FBN2、NDRG4等[16,21,22]。

2.1 EBF3 早期B细胞因子(early B-cell factor,EBF)为核转录因子,又称COE或O/E,家族成员由EBF1、EBF2、EBF3、EBF4组成,均通过其非典型的锌指结构(H-X3-C-X2-C-X5-C)与含有5c-CCCNNGGG-3c的DNA序列结合,在神经系统发育、B细胞成熟、骨质代谢平衡、脂肪细胞分化成熟及肿瘤发生中发挥重要作用。EBF3在1997年由Wang等[23]利用序列同源性筛选的方法在鼠胚胎cDNA文库中发现,人EBF3由551个氨基酸残基组成,相对分子质量约为60 kD,mRNA全长为4361bp,基因定位于染色体10q26.3。EBF3 mRNA广泛表达于心脏、胎盘、肝脏、骨骼肌等组织,在细胞生长、增殖、细胞凋亡中具有关键作用。EBF3作为一种抑癌基因,在不同的肿瘤细胞具有广泛的抑制肿瘤功能[24]。在脑肿瘤、乳腺癌、胃癌、结直肠癌、胰腺癌、肝癌和骨肿瘤、头颈部鳞状细胞癌等多种肿瘤组织中,EBF3呈甲基化或者缺失[25~28]。EBF3在正常的细胞系表达,但在脑肿瘤细胞系中沉默,其表达可能被5-氮杂-2'-脱氧胞苷(5-aza-2′-deoxycytidine)和曲古抑菌素A(trichostatin A)重新激活[28]。研究结果表明,EBF3的表观遗传沉默是人类癌症的一个普遍现象,EBF3甲基化可以做为肿瘤的表观遗传标志物,并且可以用抗癌药物治疗后逆转,可能为肿瘤治疗提供一个新思路。

2.2 KCNK15 KCNK通道是一类新型的钾离子通道,与电压依赖性钾通道和内向整流钾通道均有所不同,它具有4个跨膜片断(tansmembrane segment,TM)和2个膜孔区(pore domain,P)。KCNK通道最初被称为K2P通道(two-pore-domain potassium channels),后被统一命名为KCNK通道。该家族共有17个亚族,系统命名依次为KCNK1~KCNK17。这种通道最初发现于酵母细胞中,广泛分布于兴奋和非兴奋组织中,在心肌细胞上主要为TWIK、TASK和TREK。KCNK15(又称为KT3.3、TASK5、TASK-5、K2p15.1),位于染色体20q13.12区域,KCNK15岛连接EST和外显子BF195580,主要表达在肾上腺和胰腺,可能对这些器官中激素的分泌扮演重要的角色,在心脏、骨骼肌、睾丸、甲状腺、唾液腺也少量表达。近30年研究发现,在肿瘤细胞中K+通道调控细胞增殖、抗细胞凋亡、肿瘤血管形成,侵袭和转移扩散[29]。在肿瘤微环境中K+通道也可以调节免疫、炎性反应,促进肿瘤的发生和发展。用亚硫酸氢钠焦磷酸测序检测血液样本双向启动子甲基化水平,在10个细胞系发现KCNK15甲基化,包括结肠癌、白血病、膀胱癌,在结肠癌细胞系中呈高度甲基化[30]。而通过DNA甲基转移酶抑制剂(DAC)治疗后,双向启动子的甲基化有不同程度降低,表明启动子甲基化可以被药物逆转。大约25%的癌症高甲基化启动子相关的CpG岛是双向的,暗示KCNK15的双向启动子甲基化导致抑癌基因沉默,在肿瘤发生发展中可能是一个重要途径。

2.3 TCERG1L 转录延伸器1系(transcription elongation regulator 1-like,TCERG1L)的基因位于10号染色体上。TCERG1L可能与TCERG1(转录延伸器1)有相似的生物学作用,TCERG1位于人类染色体5q32,TCERG1也被称为TAF2S;TATA盒结合蛋白相关因子2S,CA150,转录因子CA150),最初被确定为通过相对应答HeLa细胞核片段来调节人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)转录延长[31]。TCERG1由多个蛋白质结构域组成,最显著的是在N-末端有3个WW结构域,在C-末端有6个重复的FF结构域。TCIRG1与血浆脂联素关系密切[32],血浆脂联素是肥胖病、炎性反应、胰岛素抵抗(IR)和糖尿病的关键调节剂。在基因芯片技术研究中显示频发的肿瘤特异性甲基化,TCERG1L最近已被确定为在结肠癌中的一个低频的突变基因[33,34]。Kim等[35]研究发现TCERG1L可以增加炎性肠病(IBD)包括溃疡性结肠炎(UC)和克罗恩病(CD)患者发展为CRC的风险。Yi等[36]通过突变基因的DNA甲基化分析证实TCERG1L在CRC甲基化频率>90%。在大肠癌中TCERG1L甲基化和表达下调是肿瘤特异性的方式,可能是CRC前病变和癌变的无创性检测的一个重要的生物标志物[37]。

2.4 原纤维蛋白-2(FBN2) 原纤蛋白(fibrillin,FBN)是具有高度同源性的氨基酸序列保守的多结构域架构,主要结构部件糖蛋白是细胞外与钙离子结合的平均直径为10 nm微纤维,FBN有2个成员FBN1和FBN2。FBN2是一种细胞外基质蛋白,由47个类EGF结构域组成,其中43个有一致的钙结合序列,被含有固定模块的8个半胱氨酸阻断,固定模板是在隐藏的TGF-β1结合蛋白中发现的,模板由一个独特的C端、N末端和一个富含甘氨酸的小结构域组成。它与弹性纤维在若干组织相关联,被认为是作为一种αvβ3整合素配体,后者是一个已知的成形素。FBN2首先被发现表达在间质组织及上皮间质界面。FBN2优先定位于弹性组织,如弹性软骨和主动脉内膜层。研究表明FBN2在肺发育起着关键的作用,在肺癌发展中扮演着重要角色[38]。使用高通量的基因芯片分析的方法确定在胰腺癌细胞株FBN2启动子甲基化[39]。FBN2被证实原发性乳腺癌组织[40]、食管鳞状细胞癌[41]、肾癌组织中FBN2启动子区域频繁甲基化,FBN2沉默可促进肿瘤发生[42]。Beggs等[43]用基因集富集分析(GSEA)比较癌与正常组织发现369组基因的高甲基化基因,FBN2甲基化的程度最高。Yagi等[44]证实FBN2 DNA在正常组织中度甲基化,FBN2在结肠癌组织中沉默,与KRAS基因突变(+)与较差的预后相关。Yi等[36]在结肠癌细胞系通过甲基化特异性PCR(MSP)检测启动子区域FBN2完全甲基化,并观察到88%的管状腺瘤和91%的绒毛状腺瘤组织中FBN2甲基化,FBN2基因可能是CRC早期检测的生物标志物。

2.5 NDRG4 Myc基因是一种原癌基因,通过对其靶基因的转录调控,参与许多生物学功能,如细胞增殖、凋亡、分化、发病机制等[45]。其下游调控基因家族(N-Myc Downstream-Regulated Gene,NDRG),由NDRG1、NDRG2、NDRG3和NDRG4组成,NDRG在最近几年被确定为一类新的Myc抑制基因。NDRG家族成员已被证明是肿瘤发生的关键,并可以用作许多疾病和癌症的生物标志物[46]。NDRG1基因在大肠癌中高表达可以抑制肿瘤转移[47]。NDRG2已被认为是一个候选抑癌基因[48]。NDRG4基因位于染色体16q21-q22.3,长度26个碱基,并包含17个外显子,其中包括3个互补的DNA(cDNA)的异构体:NDRG4-B、NDRG4-B var和NDRG4-H。NDRG4主要表达在出生后早期的大脑、脊髓中的神经元和心脏,参与细胞分化和神经突形成过程。NDRG3和NDRG4被认为是抑癌基因,在生物过程和发病机制有重要作用[22]。NDRG4在细胞分化和轴突形成中扮演重要角色,是细胞周期进程、胶质母细胞瘤细胞系和癌症干细胞浓缩细胞生存所必需的,是脑肿瘤独立预后因素[49,50],NDRG4参与调节细胞增殖、入侵和迁移[51]。在粪便中提取的NDRG4 DNA标志物的检测结果表明,粪便DNA检测在结直肠肿瘤、炎性肠病及胰腺癌非侵入性检测的可行性[4,52~55],而且粪便DNA测试比血浆DNA检测更准确[11]。Melotte等[56]通过对粪便脱落的DNA检测,证实NDRG4是无创检测粪便样本中大肠癌的潜在生物标志物。

3 MEs与肿瘤的关系及研究进展

CRC的发生由遗传和环境等诸多因素相互作用所致,是一个涉及多基因、多阶段的复杂过程,主要发生途径为:(1)染色体不稳定(chromosome instability,CIN )途径;(2)微卫星不稳定(microsatellite instability,MSI)途径;(3)CpG岛甲基化表型(CPG island methylator phenotype,CIMP)途径;(4)锯齿状途径。各条途径存在特异性基因和表观遗传性改变,部分CRC的发生发展涉及2条及其以上途径[57]。“MEs”一词是描述在哺乳动物中等位基因的差异表达与表观遗传差异相关,而不是与遗传异质性相关。Agouti viable yellow(AVY)小鼠是这种等位基因中一个显著的例子,在人类中已经观察到了相似的表现位点[1]。在AVY小鼠中,母体微量营养素可以在群体水平上改变DNA甲基化分布和相应的毛皮表型,暗示着MEs存在于相同的人类疾病的环境起源。进一步研究证明营养可以改变个体内在变异,但是个体内在的系统DNA甲基化在原肠胚形成之前出现,在其他的哺乳MEs中也出现相似的行为。最近在冈比亚儿童中PBL DNA的检测支持了人类MEs的存在[15]。在这个地理区域,在遗传平衡群体中一个连续的有前景的研究揭示,在婴儿的DNA 甲基化中一些基因组位点被修饰,作为母性微量营养素补充的一个结果[58]。相关MEs定义基因表达筛查了35个基因:包括2个或更多的CpG位点,长度10 kb的基因组。这些基因的DNA甲基化的变化已经与各种形式的人类疾病有关,如哮喘、急性髓系白血病(ALOX12)、胃癌(EBF3)、乳腺癌(NAV1)、大肠癌(KCNK15,TCERG1L)、肾母细胞瘤(PCDHAs)、帕金森病(CYP2E1)[59]、躁郁症(HCG9)[60]、胶质母细胞瘤(MGMT)[61],提示MEs在肿瘤的潜在致病作用,并强调成为这些恶性肿瘤可能的发展起源。有研究证实DNA甲基化为DNA化学修饰的一种形式,能在不改变DNA序列的前提下,改变遗传表现[58,59]。DNA甲基化可能使基因沉默化,进而使其失去功能。DNA甲基化在胚胎发育期间是必需的,在体细胞DNA甲基化的方式通常是高保真的传给子细胞。异常的DNA甲基化模式与大量人类恶性肿瘤有关,抑癌基因的启动子CpG岛甲基化已作为一种常见的人类癌症的标志[20,44]。SRBC基因DNA甲基化已作为CRC对奥沙利铂耐药的一个敏感性标志[62]。随着液相色谱—质谱联用仪(liquid chromatograph mass spectrometer,LC-MS)的广泛应用,在不久的未来,DNA甲基化检测可能在大规模人群实现。

4 结 论

综上所述,肿瘤形成过程中涉及多种基因,单独一种基因的多态不足以致癌,多种基因功能的积累才能引起调控细胞生长和增殖能力的改变,使个体对肿瘤的易感性产生差异。目前,虽然已有部分针对MEs及其相关基因的多态位点和恶性肿瘤关系的研究,但停留于实验室研究阶段,缺乏人群研究的佐证,研究样本量不大。本研究只能提供流行病学线索并不能揭示其作用方式。可能的机制是由于MEs的变异导致转录活性的变化,从而对蛋白的表达水平产生影响。因此,MEs通路之间存在复杂的相互作用,需要更深入地研究分析其生物学功能,与肿瘤易感性的关系需要进一步验证。

1 Rakyan VK, Blewitt ME, Druker R, et al.Metastable epialleles in mammals[J]. Trends in Genetics,2002,18(7):348-351.

2 Dolinoy DC, Das R, Weidman JR, et al.Metastable epialleles, imprinting, and the fetal origins of adult diseases[J]. Pediatric Research,2007,61:30R-37R.

3 Carmona FJ, Azuara D, Berenguer-Llergo A, et al.DNA methylation biomarkers for noninvasive diagnosis of colorectal cancer[J]. Cancer Prevention Research,2013,6(7):656-665.

4 Lidgard GP, Domanico MJ, Bruinsma JJ, et al.Clinical performance of an automated stool DNA assay for detection of colorectal neoplasia[J]. Clinical Gastroenterology and Hepatology,2013,11(10):1313-1318.

5 Tetzner R, Model F, Weiss G, et al.Circulating methylated SEPT9 DNA in plasma is a biomarker for colorectal cancer[J].Clinical Chemi-stry,2009,55(7):1337-1346.

6 Lofton-Day C, Model F, DeVos T, et al.DNA methylation biomarkers for blood-based colorectal cancer screening[J].Clinical Chemistry,2008,54(2):414-423.

7 Wallner M, Herbst A, Behrens A, et al.Methylation of serum DNA is an independent prognostic marker in colorectal cancer[J].Clinical Cancer Research,2006,12(24):7347-7352.

8 Herbst A, Wallner M, Rahmig K, et al.Methylation of helicase-like transcription factor in serum of patients with colorectal cancer is an independent predictor of disease recurrence[J]. European Journal of Gastroenterology & Hepatology,2009,21(5):565-569.

9 Tang D, Liu J, Wang DR,et al.Diagnostic and prognostic value of the methylation status of secreted frizzled-related protein 2 in colorectal cancer[J]. Clinical & Investigative Medicine,2011,34(1):E88-E95.

10 Herbst A, Rahmig K, Stieber P, et al.Methylation of NEUROG1 in serum is a sensitive marker for the detection of early colorectal cancer[J].Am J Gastroenterol,2011,106(6):1110-1118.

11 Ahlquist DA, Taylor WR, Mahoney DW, et al.The stool DNA test is more accurate than the plasma septin 9 test in detecting colorectal neoplasia[J]. Clinical Gastroenterology and Hepatology,2012,10(3):272-277.

12 Tänzer M, Balluff B, Distler J, et al.Performance of epigenetic markers SEPT9 and ALX4 in plasma for detection of colorectal precancerous lesions[J]. PloS One,2010,5(2):e9061.

13 Li M, Chen WD,Papadopoulos N, et al.Sensitive digital quantification of DNA methylation in clinical samples[J]. Nature Biotechnology,2009,27(9):858-863.

14 Jemal A, Bray F, Center MM, et al.Global cancer statistics[J]. CA:A Cancer Journal for Clinicians,2011,61(2):69-90.

15 Waterland RA, Kellermayer R, Laritsky E, et al.Season of conception in rural gambia affects DNA methylation at putative human metastable epialleles[J]. PLoS Genetics,2010,6(12):e1001252.

16 Harris RA, Nagy-Szakal D, Kellermayer R.Human metastable epiallele candidates link to common disorders[J]. Epigenetics,2013,8(2):157-163.

17 Das PM, Singal R.DNA methylation and cancer[J]. Journal of Clinical Oncology,2004,22(22):4632-4642.

18 Lo PK, Lee JS, Liang X, et al.Epigenetic inactivation of the potential tumor suppressor gene FOXF1 in breast cancer[J]. Cancer Research. 2010,70(14):6047-6058.

19 Herman JG, Baylin SB.Gene silencing in cancer in association with promoter hypermethylation[J]. New England Journal of Medicine,2003,349(21):2042-2054.

20 van Vlodrop IJ, Niessen HE, Derks S, et al.Analysis of promoter CpG island hypermethylation in cancer: location, location, location[J]. Clinical Cancer Research,2011,17(13):4225-4231.

21 Hong L, Ahuja N.DNA methylation biomarkers of stool and blood for early detection of colon cancer[J]. Genetic Testing and Molecular Biomarkers,2013,17(5):401-406.

22 Yang X, An L, Li X.NDRG3 and NDRG4,two novel tumor-related genes[J]. Biomedicine & Pharmacotherapy. 2013,67(7):557-684.

23 Wang SS, Tsai RY, Reed RR.The characterization of the Olf-1/EBF-like HLH transcription factor family: implications in olfactory gene regulation and neuronal development[J]. The Journal of Neuroscience. 1997,17(11):4149-4158.

24 Liao D.Emerging roles of the EBF family of transcription factors in tumor suppression[J]. Molecular Cancer Research,2009,7(12):1893-1901.

25 Kim J, Min SY, Lee HE, et al.Aberrant DNA methylation and tumor suppressive activity of the EBF3 gene in gastric carcinoma[J]. International Journal of Cancer,2012,130(4):817-826.

26 Hong SM, Omura N, Vincent A, et al.Genome-wide CpG island profiling of intraductal papillary mucinous neoplasms of the pancreas[J]. Clinical Cancer Research,2012,18(3):700-712.

27 Bennett KL, Lee W, Lamarre E, et al.HPV status‐independent association of alcohol and tobacco exposure or prior radiation therapy with promoter methylation of FUSSEL18, EBF3, IRX1, and SEPT9, but not SLC5A8, in head and neck squamous cell carcinomas[J].Genes, Chromosomes and Cancer,2010,49(4):319-326.

28 Zhao LY, Niu Y, Santiago A, et al.An EBF3-mediated transcriptional program that induces cell cycle arrest and apoptosis[J]. Cancer Research,2006,66(19):9445-9452.

29 Damico M, Gasparoli L, Arcangeli A.Potassium channels: novel emerging biomarkers and targets for therapy in cancer[J]. Recent Patents on Anti-Cancer Drug Discovery,2013,8(1):53-65.

30 Shu J, Jelinek J, Chang H, et al.Silencing of bidirectional promoters by DNA methylation in tumorigenesis[J]. Cancer Research,2006,66(10):5077-5084.

32 Chen G, Bentley A, Adeyemo A, et al.Genome-wide association study identifies novel loci association with fasting insulin and insulin resistance in African Americans[J]. Human Molecular Genetics,2012,21(20):4530-4536.

33 Daley GQ, Lensch MW, Jaenisch R, et al.Broader implications of defining standards for the pluripotency of iPSCs[J]. Cell Stem Cell,2009,4(3):200-201.

34 Martin ES, Tonon G, Sinha R, et al.Common and distinct genomic events in sporadic colorectal cancer and diverse cancer types[J]. Cancer Research,2007,67(22):10736-10743.

35 Kim TO, Park J, Kang MJ, et al.DNA hypermethylation of a selective gene panel as a risk marker for colon cancer in patients with ulcerative colitis[J]. International Journal of Molecular Medicine,2013,31(5):1255.

36 Yi JM, Dhir M, Van Neste L, et al.Genomic and epigenomic integration identifies a prognostic signature in colon cancer[J]. Clinical Cancer Research,2011,17(6):1535-1545.

37 Yi JM, Dhir M, Guzzetta AA, et al.DNA methylation biomarker candidates for early detection of colon cancer[J]. Tumor Biology,2012,33(2):363-372.

38 Yang Q, Ota K, Tian Y, et al.Cloning of rat fibrillin-2 cDNA and its role in branching morphogenesis of embryonic lung[J]. Developmental Biology,1999,212(1):229-242.

39 Hagihara A, Miyamoto K, Furuta J, et al.Identification of 27 5′ CpG islands aberrantly methylated and 13 genes silenced in human pancreatic cancers[J].Oncogene,2004,23(53):8705-8710.

40 Kikuyama M, Takeshima H, Kinoshita T, et al.Development of a novel approach, the epigenome-based outlier approach, to identify tumor-suppressor genes silenced by aberrant DNA methylation[J]. Cancer Letters,2012,322(2):204-212.

41 Tsunoda S, Smith E, De Young NJ, et al.Methylation of CLDN6, FBN2, RBP1, RBP4, TFPI2, and TMEFF2 in esophageal squamous cell carcinoma[J]. Oncology Reports,2009,21(4):1067-1073.

42 Morris MR, Ricketts C, Gentle D, et al.Genome-wide methylation analysis identifies epigenetically inactivated candidate tumour suppressor genes in renal cell carcinoma[J]. Oncogene,2010,30(12):1390-1401.

43 Beggs AD, Jones A, El-Bahwary M, et al.Whole-genome methylation analysis of benign and malignant colorectal tumours[J]. The Journal of Pathology,2013,229(5):697-704.

44 Yagi K, Akagi K, Hayashi H, et al.Three DNA methylation epigenotypes in human colorectal cancer[J]. Clinical Cancer Research,2010,16(1):21-33.

45 Zhou RH, Kokame K, Tsukamoto Y, et al.Characterization of the human NDRG gene family:a newly identified member,NDRG4, is specifi-cally expressed in brain and heart[J]. Genomics,2001,73(1):86-97.

46 Qu X, Zhai Y, Wei H, et al.Characterization and expression of three novel differentiation-related genes belong to the human NDRG gene family[J]. Molecular and Cellular Biochemistry,2002,229(1-2):35-44.

47 Mao Z, Sun J, Feng B, et al.The metastasis suppressor, N-myc downregulated gene 1 (NDRG1), is a prognostic biomarker for human colorectal cancer[J]. PloS One,2013,8(7):e68206.

48 Ohki T, Hongo S, Nakada N, et al.Inhibition of neurite outgrowth by reduced level of NDRG4 protein in antisense transfected PC12 cells[J]. Developmental Brain Research,2002,135(1):55-63.

49 Li S, Yang B, Li G, et al.Downregulation of N-Myc downstream-regulated gene 4 influences patient survival in gliomas[J]. Brain Tumor Pathology,2013,30(1):8-14.

50 Ding W, Zhang J, Yoon JG, et al.NDRG4 is downregulated in glioblastoma and inhibits cell proliferation[J]. Omics:A Journal of Integrative Biology,2012,16(5):263-267.

51 Kotipatruni RP, Ferraro DJ, Ren X, et al.NDRG4, the N-Myc downstream regulated gene, is important for cell survival, tumor invasion and angiogenesis in meningiomas[J]. Integrative Biology,2012,4(10):1185-1197.

52 Kisiel J, Yab T, Nazer Hussain F, et al.Stool DNA testing for the detection of colorectal neoplasia in patients with inflammatory bowel disease[J]. Alimentary Pharmacology & Therapeutics,2013,37(5):546-554.

53 Kisiel JB, Yab TC, Taylor WR, et al.Stool DNA testing for the detection of pancreatic cancer[J]. Cancer,2012,118(10):2623-2631.

54 Ahlquist DA, Zou H, Domanico M, et al.Next-generation stool DNA test accurately detects colorectal cancer and large adenomas[J]. Gastroenterology,2012,142(2):248-256.

55 Zou H, Allawi H, Cao X, et al.Quantification of methylated markers with a multiplex methylation-specific technology[J]. Clinical Chemistry,2012,58(2):375-383.

56 Melotte V, Lentjes MH, van den Bosch SM, et al.N-Myc downstream-regulated gene 4 (NDRG4): a candidate tumor suppressor gene and potential biomarker for colorectal cancer[J]. Journal of the National Cancer Institute,2009,101(13):916-927.

57 陈慧.结直肠癌发生机制研究进展[J]. 胃肠病学,2013,18(3):188.

58 Khulan B, Cooper WN, Skinner BM, et al.Periconceptional maternal micronutrient supplementation is associated with widespread gender related changes in the epigenome: a study of a unique resource in the Gambia[J]. Human Molecular Genetics,2012,21(9):2086-2101.

59 Kaut O, Schmitt I, Wüllner U.Genome-scale methylation analysis of Parkinson's disease patients' brains reveals DNA hypomethylation and increased mRNA expression of cytochrome P450 2E1[J].Neurogenetics,2012,13(1):87-91.

60 Kaminsky Z, Tochigi M, Jia P, et al.A multi-tissue analysis identifies HLA complex group 9 gene methylation differences in bipolar disorder[J]. Molecular Psychiatry,2011,17(7):728-740.

61 Skiriute D, Vaitkiene P, Saferis V, et al.MGMT, GATA6, CD81, DR4, and CASP8 gene promoter methylation in glioblastoma[J]. BMC Cancer,2012,12(1):218.

62 Moutinho C, Martinez-Cardús A, Santos C, et al.Epigenetic inactivation of the BRCA1 interactor SRBC and resistance to oxaliplatin in colorectal cancer[J].J Nati Cancer Inst,2014,106(1):djt322.

150086 哈尔滨医科大学附属第二医院普外十科

黄跃南,E-mail:dr-huangyuenan@163.com

10.3969 / j.issn.1671-6450.2014.05.036

2013-11-23)

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