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东北地产药用植物数据库的建设与应用※

2014-02-06张建逵赵彦辉尹海波杨丹丹樊丽娜

中国中医药现代远程教育 2014年4期
关键词:药用植物东北地区数据库

张建逵 赵彦辉 尹海波 王 冰 杨丹丹 樊丽娜

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东北地产药用植物数据库的建设与应用※

张建逵 赵彦辉 尹海波 王 冰 杨丹丹 樊丽娜

(辽宁中医药大学药学院,大连116600)

为了满足现代教学、科研手段的需要,我们开展了东北地产药用植物数据库的建设工作。本文就数据库系统的开发、研究方法、特色与创新、应用效益等方面内容进行介绍,希望能对其他数据库建设提供有益的借鉴。

药用植物;东北地区;数据库;信息系统

东北地区药用植物资源丰富,是我国重要的药用植物资源分布区之一,出产人参、黄柏、细辛、五味子等多种道地药材。关于其药用植物记载的资料较多,但相关的数据库建设却未见报道,在互联网、信息技术高速发展的今天,传统的利用信息的方法已不能满足教学、科研和交流的需要,特别是现代教学、科研手段的需要。因此,建设一个将图像信息、文字信息等集于一体的药用植物数据库是解决以上问题的较好选择之一,这能更好地实现资源共享,助推教学、科研和资源的开发利用工作。近三年来,我们结合辽宁中医药大学现有药用植物信息,建成东北地区地产药用植物数据库,构建了相应的数据库功能,并在教学、科研工作中进行了应用实践。现介绍如下。

1 数据库平台

本数据库是以JavaEE版网站管理系统(JEECMS)为开发平台,结合hibernate3+struts2+spring2+ freemarker框架结构和WEB信息发布技术,采用MySQL作为数据库管理系统[1-2]。

2 研究方法与步骤

2.1资料收集、图像信息采集课题组成员采集到原植物标本数百份,收集到相关图像信息几千幅,均为现场实物拍摄所得。这些信息包括:不同生态环境、不同生长期下的同种植物的形态以及茎、叶、花、果实等器官的特写图像,这样才能从多个角度反映出该植物的全貌。

我们查阅了如《东北药用植物》、《长白山药用植物》、《辽宁中药志》、《辽宁植物志》、《东北植物检索表》、《黑龙江植物志》、《中国植物志》等书籍,对采集到的标本进行科、属、种的鉴定。最后从中整理出《中国药典》2010年版一部所收载的东北地区地产的植物药材(约100种),尤其是东北地区的道地药材。其次是省部级标准如《部颁药品标准》、《辽宁省中药材标准》、《吉林省药品标准》、《黑龙江省中药材标准》收载的药用植物(约90种),最后是民间习用的药用植物(约180种)。我们撰写出其描述信息,主要包括:植物种名、原植物形态描述、化学成分、功能主治、性味归经等内容。以上内容结合各类书籍、文献所报道的各药用植物近年来的研究进展,加以充实完善而成。

2.2前期处理这个阶段工作量较大而繁琐,内容包括:图像挑选、压缩,文字内容的取舍、内容格式的统一与匹配等,使之形成电子资源。

2.3数据库设计整个信息系统分为前台和后台两大模块,在功能上,后台管理员拥有数据录入、存储、修改、添加、查询、检索和系统维护模块等功能;为前台用户拥有信息浏览、查询、发表及查看评论等功能。

2.4系统树的建立系统树是整个数据库系统分类的依据和骨架,管理员在后台登录后,利用“添加栏目”的下拉框,选择“文章模型”来添加栏目名(显示名)、路径名,选择之后可选择要添加内容的树枝,同时添加文章内容。按照上述方法,分别添加“藻菌地衣类,苔藓类植物,蕨类植物,裸子植物,被子植物”子栏目。按照此分类,将各个植物都分类到各个栏目中。

2.5信息录入在对所有信息进行整理和编号后,将其录入数据库系统(见图1),最后对录入内容进行了交叉校对。

图1 东北地区地产药用植物数据库后台录入界面

2.6数据发布将所有库资源按照数据库软件要求,上传至数据库服务器进行数据发布,并检验是否符合设计要求,对其中不满意的地方进行微调。用户在前台可以进行数据查询(见图2)。

3 特色与创新

该数据库是国内首个东北地产药用植物数据库,具有极强的地域性;其内容较为丰富,包括了东北地区常用的中药材和民间药用植物;该数据库收载的图像信息非常丰富,不仅包括整体外观形态的展现,还有不同生态环境、不同生长期下的植物的形态及其器官的特写,能为药用植物的鉴别提供更大的帮助,这是国内一般数据库所不具备的[3]。本数据库还具有实用性强、适用性强、扩充性强的特点。

图2 东北地区地产药用植物数据库网站

4 应用效益

由于本数据库扩充性较强,因此建设—试运行—改进—更新工作同时进行,大大提高了使用效率和相关功能的完善。在教学方面,对于中药学专业,该数据库的使用在野外实习前起到了预习作用,在实习之后起到了复习的作用,改善了实习的学习效果;对于没有任何的野外实践教学的专业如制药工程、药物制剂、药学等专业,该数据库加强了学生对于植物的感性认识,提高了学生对知识的形象化认识,而不仅仅去死记硬背知识点,同样起到了改善学习效果的作用。本数据库收载的数据信息,突出了药用植物鉴别特征和科特征,有利于学生对药用植物学系统分类部分知识的学习和野外辨认药用植物能力的培养,经过药学院2009级~2011级三个年级本科生的应用实践,许多同学感觉到数据库改善了学习效果,提高了学习效率。

在科研方面,本数据库很好地配合了中药资源学、中药鉴定学相关课题的研究,极大地提高了中药资源学、中药鉴定学专业研究生和青年教师的药用植物辨别能力和经验,取得了较好的效果,截止目前总点击率已达到3000余次。随着即将到来的全国第四次中药资源普查工作(辽宁地区)的开展,该数据库将发挥更大的作用。

5 讨论

5.1数据库的更新与维护数据库更新与维护包括硬件、软件和数据三个方面。可在学校财力允许的情况下对数据库的软、硬件进行更新维护,以保证其运行的顺畅和功能的开发。数据的更新是数据库建设的核心,数据库建设不是一劳永逸的工作,应不断收集新的药用植物资源到数据库中,提高时效性。下一步的建设计划中就包括增加药材个子货及饮片等内容的更新。

5.2数据库功能的开发尽管目前数据库的功能已经可以基本满足大部分用户的需求,但相对于国内已经开发的较为成熟的数据库[4-5],其功能有待于进一步的完善。随着学校数字化校园建设工作的开展,我们也将在不久的将来推出该数据库的手机版,更方便地为用户提供服务。同时考虑扩大访问权限,实现更大范围的信息资源共享,不仅为从事中药学专业用户服务,也为全省需要这些资源的用户服务,为辽宁省的经济、文化建设做出贡献。

[1]林晓宇,赖贤伟,宁正元.JAVA程序设计[M].南京:东南大学出版社,2007,1-4.

[2]李冬.建设网站宝典[M].北京:人民邮电出版社,2000,159-160.

[3]王国良,谢秋兰.植物数据库构建研究进展综述[J].江苏林业科技,2007,34(6):37-40.

[4]黄克南,郭超峰,侯小涛,等.中泰药用植物专业数据库中图片的拍摄与制作[J].中国中医药现代远程教育,2012,10(16):109-110.

[5]谢波,周欣欣,许秀.单味中药数据库系统式教学应用探索[J].中国中医药现代远程教育,201311(8):73-74.

Construction and Application of Pharmaceutical Botany Database in Northeast of China

Zhang Jiankui Zhao YanhuiYin Haibo Wang Bing Fan Lina Yang Dandan
(Coliege of Pharmacy,Liaoning University of Traditional Chinese Medicine,Dalian,116600,China)

To meet the needs of modern teaching and researching,construction of pharmaceutical botany in Northeast of China database was carried out.In this paper,the exploitation of database,the research methods,characteristics and innovation,the application benefit are introduced in the hope that will provide useful references for other database construction.

Pharmaceutical Botany;Northeast of China;Database;information system

10.3969/j.issn.1672-2779.2014.04.081

:1672-2779(2014)-04-0125-02

苏 玲 本文校对:王 冰

2013-10-31)

辽宁中医药大学教育科学研究课题;辽宁省“大学生创新创业训练计划”项目[No:201310162045]

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