APP下载

大肠杆菌O157:H7 的免疫捕获PCR 快速检测

2013-10-30陈艳朱小清方水琴郭慧琴刘箐

食品与发酵工业 2013年7期
关键词:泳道出血性菌液

陈艳,朱小清,方水琴,郭慧琴,刘箐

1(上海理工大学医疗器械与食品学院,上海,200093)

2(上海慧耘生物科技有限公司,上海,200437)

由肠出血性大肠埃希菌O157:H7 引起的肠道感染性疾病已经成为全球关注的公共卫生问题。大肠杆菌O157:H7 感染能引起出血性结肠炎(HC),阑尾炎和结肠穿孔等严重胃肠道并发症[1],严重的可引起血栓性血小板紫癜(TTP)和溶血性尿路综合症(HUS)等全身性并发症,其中3% ~5%的HUS 病人死亡,约有12% 的HU S 病人有严重的后遗症[2]。而且人的感染剂量极低,摄入50 ~100 个活菌就可引起发病[3]。

目前肠出血性大肠埃希菌O157:H7 的常用检测方法包括传统平板分离培养和生理生化鉴别法、ELISA 法、PCR 法、荧光定量PCR 法等[4-6]。生化方法耗时耗力,而且容易漏检自然变异株。血清学方法抗体依赖国外进口检测成本太高,且O157:H7 抗血清与很多细菌有交叉凝集现象[4]。本实验将抗原抗体反应高特异性和PCR 反应高敏感性结合起来,首先免疫富集细菌,之后直接进行PCR 扩增,省略了核酸提取过程,所有反应在同一PCR 管里进行,操作简便,大大提高了检测灵敏度和准确性,同时降低了检测成本,是一种非常实用的肠出血性大肠杆菌O157:H7 快速检测技术。

1 材料与方法

1.1 实验材料

1.1.1 菌株

大肠杆菌O157:H7 ATCC 82346、金黄色葡萄球菌ATCC 27660、鼠氏伤寒沙门氏菌ATCC 22956、肠炎沙门氏菌ATCC 13076、单增李斯特菌ATCC 43251、小肠结肠炎耶尔森氏菌ATCC 23715、福氏志贺氏菌ATCC 12022、宋内氏志贺氏菌ATCC 25931、痢疾志贺氏菌ATCC 51329 、乙型溶血性链球菌ATCC 10373、阪崎肠杆菌ATCC 29004,副溶血性弧菌ATCC 17802 均为本公司保藏的标准菌株。

1.1.2 试剂

抗体:肠出血性大肠杆菌O157:H7 单克隆抗体(3 mg/mL)由本公司自主制备并纯化,单克隆抗体杂交瘤号是EC-Mab-D3;羊抗兔HRP-TgG,购买自上海励瑞生物科技有限公司;牛血清白蛋白,购买自亚科生物科技有限公司。

大肠杆菌O157:H7 的ELISA 试剂盒为本公司自主生产。

培养基:普通营养肉汤(NB)等培养基购买自国药集团。

分子生物学试剂:10 × PCR Buffer、dNTPs、TaqDNA 聚合酶等分子生物学试剂,购买自宝生物科技有限公司;rfbF 基因引物由生工合成。

无水Na2HPO4,无水KH2PO4,NaCl 等化学试剂,购买自上海凌峰化学试剂有限公司。

1.2 研究方法

1.2.1 细菌培养

肠出血性大肠杆菌O157:H7 标准菌株和对照菌株标准菌株分别在普通营养肉汤(副溶血性弧菌培养基需加入3%的NaCl,乙型溶血性链球菌培养基需加入7%的全血)中37 ℃摇床(150 r/min)培养18 ~24 h。通过平板计数法得到菌液的浓度(CFU/mL)。

1.2.2 免疫捕获方法的构建

1.2.2.1 抗体包被PCR 管制备IC-PCR 管

用包被液稀释出血性大肠杆菌O157:H7 单克隆抗体(3 mg/mL),使得单抗的浓度为10 μg/mL,将稀释好的单克隆抗体每管50 μL 加入PCR 管中,4℃过夜包被。免疫捕获出血性大肠杆菌O157:H7。

4℃过夜包被后取出并将PCR 管中的液体扣出,再加入PBST(0.1M,pH7.4)洗涤,洗涤时轻微震荡,重复洗涤2 ~3 次,洗涤完成后尽量叩干管内残存洗涤液。加入过夜培养的大肠杆菌O157:H7(普通营养肉汤为阴性对照),37℃孵育2h,取出,用PBST(0.1M,pH7.4)洗涤,重复洗涤2 ~3 次,洗涤完成后尽量叩干管内残存洗涤液。

1.2.2.2 PCR 扩增大肠杆菌O157:H7 的rfbF 基因[7]

在1.2.2.1 步骤得到的PCR 管中加入PCR 体系:10 ×PCR Buffer 5 μL;dNTP(2.5 mmol/L)2 μL;TaqDNA 聚合酶(5U/L)1 μL;正向引物(10 μmol/L)2 μL,引物5’-att gcg ctg aag cct ttg-3’;反向引物(10 μmol/L)2 μL,引物5’-cga gta cat tgg cat cgt g-3’;加入ddH2O 双蒸水补足至50 μL(反应体系为50 μL)。

PCR 的反应程序参数为:95℃预变性5 min,用于裂解菌体;35 个循环(95℃变性15 s;55℃退火30 s;72℃延伸1 min),72℃再延伸5 min,4℃保温;扩增产物用1.5%的琼脂糖凝胶电泳来检测目标条带并且紫外投射成像分析。

1.2.3 免疫捕获PCR 检测出血性大肠杆菌O157:H7 特异性

将目的菌株大肠杆菌O157:H7 和对照菌株金黄色葡萄球菌、鼠氏伤寒沙门氏菌、肠炎沙门氏菌、单增李斯特菌、小肠结肠炎耶尔森氏菌、福氏志贺氏菌、宋内氏志贺氏菌、痢疾志贺氏菌、乙型溶血性链球菌、阪崎肠杆菌培养过夜,然后在实验步骤1.2.2.1 所制备的IC-PCR 管中加入各种培养过夜菌株的菌液,进行免疫捕获和PCR 扩增检测,步骤如1.2.2.2 和1.2.2.3。

1.2.4 免疫捕获PCR、直接PCR、ELISA 检测出血性大肠杆菌O157:H7 灵敏度比较

1.2.4.1 免疫捕获PCR 检测出血性大肠杆菌O157:H7 灵敏度

将培养过夜大肠杆菌O157:H7 平板计数,用生理盐水将其稀释至1.04 ×108~1.04 ×10 CFU/mL,各取200 μL 菌液加入制备好的IC-PCR 管中,进行免疫捕获和PCR 扩增检测。同时设置阴性对照。

1.2.4.2 直接PCR 检测出血性大肠杆菌O157:H7灵敏度

肠出血性大肠杆菌O157:H7 标准菌株培养18 h后,稀释菌液,菌液浓度梯度为:1.04 ×108~1.04 ×10 CFU/mL。每个梯度各取5 μL 菌液进行直接PCR扩增,生理盐水设为阴性对照。

1.2.4.3 ELISA 检测出血性大肠杆菌O157:H7 灵敏度

将肠出血性大肠杆菌O157:H7 多克隆抗体包被到ELISA 板上,4℃过夜,次日洗掉残液,用PBST 洗3次拍干,用3%的的BSA 封闭(200 μL/孔),37℃封闭1 h,用PBST 洗3 次,拍干,各个孔中加入过夜培养的稀释梯度的大肠杆菌菌液(108~103CFU/mL,100 μL/孔),以肉汤作为阴性对照,37℃孵育1 h,用PBST 洗3 次,然后各孔加入100 μL 的酶标抗体,37℃温育1 h,加入TMB 显色液,,然后加入终止液,用酶标仪450 nm 测定各孔吸光值,计算P/N 值,如果P/N≥2.1,则为阳性。

1.2.5 免疫捕获PCR 检测出血性大肠杆菌O157:H7 食品模拟带菌

采用的食样为牛奶、酸奶、香肠、果汁、鸡蛋、蛋糕。按照国标GB/T4789.36 -2008《食品卫生微生物学检验 大肠埃希氏菌O157:H7/NM 检验》处理样品,然后用不同浓度的出血性大肠杆菌O157:H7 纯菌液人工污染样品,,菌液的浓度依次为:1.04 ×108~1.04 × 102CFU/mL,最后分别进行免疫捕获和PCR 扩增检测,步骤如1.2.2.2 和1.2.2.3,设置空白对照。

2 结果分析

2.1 免疫捕获PCR 方法特异性的验证

实验中采用了10 种非特异性菌株来验证此方法的特异性。从图1 中看出,泳道1 和2 出血性大肠杆菌O157:H7 扩增出499bp 左右的rfbF 基因片段,泳道9 宋内氏志贺氏菌出现了非特异性扩增条带,其他对照菌株均无目的片段出现,可见该IC-PCR 方法对大肠杆菌O157:H7 有较好的特异性。

2.2 免疫捕获PCR、ELISA、直接PCR 检测灵敏度比较

图1 IC-PCR 实验特异性验证Fig.1 Specific experiment of IC-PCR

表1 为ELISA 双抗夹心法检测大肠杆菌O157:H7 灵敏度结果,当菌浓度低于105CFU/mL 时,P/N<2.1,菌浓度达到105CFU/mL 时,P/N 值为2.67,大于2.1,所以ELISA 双抗夹心法检测大肠杆菌O157:H7 灵敏度达到105CFU/mL;图2 为直接PCR检测大肠杆菌O157:H7 的灵敏度检测的结果,图中泳道1 -4 号可见特异性目标条带出现,片段大小为499bp,并且可以看到亮度依次减弱。5 ~8 泳道和阴性对照未见特异性条带。实验结果显示,出血性大肠杆菌O157:H7 纯菌液直接PCR 检测的灵敏度为1.04 ×105CFU/mL,每反应体系细菌数为520CFU。图3 为免疫捕获PCR 方法检测大肠杆菌O157:H7的灵敏度,图中泳道1 ~7 号可见特异性目标条带出现,片段大小为499bp,并且可以看到亮度依次减弱。8 泳道和阴性对照未见特异性条带,由此推测ICPCR 检测大肠杆菌O157:H7 纯菌液检测限的灵敏度可达到1.04 ×102CFU/mL,每反应体系细菌数为20CFU。但在具体实验过程中,有时候检测限会达到1.04 ×104CFU/mL,实验结果显示免疫捕获PCR 方法检测大肠杆菌的灵敏度是ELISA 方法和直接PCR方法灵敏度的103倍。

多次重复实验显示IC-PCR 检测灵敏度为102~104CFU/mL,多次重复实验显示,菌落计数的误差、食品样品的影响、操作的误差等,是造成检测灵敏度波动的主要原因。

表1 ELISA 法检测大肠杆菌O157:H7 灵敏度结果Table 1 Results of detection of Escherichia coli O157:H7 by ELISA

图2 直接PCR 检测灵敏度验证Fig.2 Sensitivity of the detection method using direct PCR

2.3 食品样品模拟带菌检测

食品样品采用了牛奶,酸奶,蛋糕,鸡蛋,果汁,香肠。实验结果如图4 所示,图中A(1)、B(1)、C(1)、D(1)、E(1)、F(1)所示,可以看出直接PCR 检测大肠杆菌O157:H7 食品样本模拟带菌的灵敏度可达到1.04 ×105~1.04 ×106CFU/mL,每反应体系细菌数为5 ×102~5 ×103CFU。而图中A(2)、B(2)、C(2)、D(2)、E(2)、F(2)所示,可以看出免疫捕捉PCR 检测食品样本模拟带菌的灵敏度可达到1.04 ×103~1.04 ×104CFU/mL,每反应体系细菌数为2 ×102~2 ×103CFU。大肠杆菌O157:H7 食品样本模拟带菌免疫捕获PCR 比直接PCR 灵敏度至少提高了10 倍。

图3 免疫捕获PCR 检测灵敏度验证Fig.3 Sensitivity of the detection method using IC-PCR

图4 食品样品模拟带菌免疫捕获PCR 实验研究Fig.4 Results of bacteria detection in food samples

3 讨论

IC-PCR 技术集合了固相免疫反应和PCR 技术的优点,因而既提高了检测特异性,又具有极高的灵敏度[8]。相比于直接PCR,IC-PCR 的PCR 管上包被特异性抗体,样品中的出血性大肠杆菌O157:H7 被特异性抗体识别捕获富集,之后进行PCR 扩增,致病菌经过免疫学、分子生物学2 种检测技术的双重检测,确保了检测的准确性,避免PCR 检测中的假阳性。另外该技术具有较高灵敏度,此方法省略了DNA 的提取过程,不仅方便省时,而且降低了DNA提取过程中的细菌损失,PCR 管壁上的单克隆抗体捕捉并富集了样品中的出血性大肠杆菌O157:H7,间接提高了模板量,而在普通的PCR 实验中,没有免疫富集的步骤,加入纯菌液直接扩增的模板量有限,因此检测灵敏度会低于IC-PCR1-2 个数量级,因此IC-PCR 对于微量病原的检测,具有一定的优势。

本实验中由于计数等存在实验操作问题,有时灵敏度达到103CFU/mL。食样检测发现,不同的食品模拟带菌,检测灵敏度可达到(103~104)CFU/mL,是直接PCR 的100 倍左右,不同样品本身,对IC-PCR的灵敏度,具有一定的影响。另外实验采用10 种其他常见食源性致病菌作为对照菌株,检测结果都为阴性,只有大肠杆菌为阳性,证明了该检测方法具有较高特异性。

综上所述,IC-PCR 是一种廉价、高效、灵敏、快速的检测技术,全部试验可在3 h 内完成,致病菌经过免疫识别、PCR 双重检测,确保了检测结果的可靠性,适合食品安全监管部门、食品企业实施血性大肠杆菌O157:H7 的快速检测鉴定。

[1] 孙洋. 肠出血性大肠杆菌O157 快检方法的研究[D].吉林大学,2007.

[2] 朱文冠,薛素强,洪洁心,等. 多重PCR 方法检测大肠杆菌O157:H7 的初步研究[J]. 中国人兽共患病学报,2006,22 (5):428 -432.

[3] Altekruse S,Cohen M,Swerdlow D. Emerging foodborne diseases[J].Emerging Infectious Diseases,1997,3 (3):285.

[4] 郑桂丽,廖绍安,李钏华,等. 大肠杆菌O157 特异基因的PCR 检测方法[J]. 中国卫生检验杂志,2006,15(10):1 183 -1 185.

[5] 邬国军,陈淑珍. 免疫PCR 技术研究进展[J]. 国外医学:临床生物化学与检验学分册,2000,21 (5):260 -261.

[6] Sano T,Smith C L,Cantor C R. Immuno-PCR:very sensitive antigen detection by means of specific antibody-DNA conjugates[J].Science-NEW YORK Then Washington-DC,1992:120 -120.

[7] SNT 1869 -2007. 食品中多种致病菌快速检测方法:PCR 法[S].

[8] 黄杰,李金明. 免疫PCR 技术及其应用研究进展[J].国际检验医学杂志ISTIC,2006,27 (8).

猜你喜欢

泳道出血性菌液
多糖微生物菌液对油菜吸收养分和土壤氮磷淋失的影响
奔奔兔学游泳
Bonfire Night
鼠伤寒沙门氏菌回复突变试验中通过吸光度值测定菌液浓度的方法研究
家蚕色氨酸羟化酶 (TRH) 基因的克隆及表达特性分析
库尔勒市三例奶牛出血性乳房炎的诊治
游泳池里的航母
院前严重创伤出血性休克患者两种液体复苏分析
复合微生物菌液对黄瓜生长和抗病虫性效应研究
经血管介入治疗出血性疾病的临床研究