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奶牛白细胞介素2基因的克隆及序列分析

2012-09-26盖仁华李广兴

动物医学进展 2012年11期
关键词:抗原性进化树残基

盖仁华,平 丽,李广兴

(1.浙江大学药物安全评价研究中心,浙江杭州310058;2.东北农业大学动物医学学院,黑龙江哈尔滨150030)

白细胞介素2(interleukin 2,IL-2)是一种具有多种生物活性的细胞因子,研究表明[1],IL-2是 T细胞在体外长期生长所必需的因子,也是TC细胞成熟因子,它可促进已活化的T细胞增殖、分化、成熟成为效应的TD细胞和TC细胞,诱导T细胞表面IL-2R的表达增加;可使B细胞活化、增殖,产生抗体;还可活化单核/巨噬细胞,并能够增强其杀瘤活性。在体内,IL-2是参与免疫应答的重要细胞因子,还可参与抗肿瘤及移植排斥反应[2]。

IL-2具有重要的生物学特性,可用于免疫治疗,协同治疗恶性肿瘤[3]及感染性疾病等[4-5],目前IL-2在法国已。获准用于艾滋病的辅助性治疗[6]。本研究通过RT-PCR方法克隆了奶牛IL-2基因,并对其序列进行了分析,旨在为大量制备和生产高效价廉的奶牛IL-2,为在体外大量表达奶牛IL-2并获得重组蛋白积累资料。

1 材料与方法

1.1 材料

1.1.1 试验用动物 青年黑白花奶牛,来源于成高子奶牛养殖场。

1.1.2 菌种、质粒、工具酶和主要试剂 Trizol抽提试剂盒为Invitrogen公司产品,p MD18-T载体、DH5α、各种工具酶、反转录试剂盒及回收试剂盒为宝生物工程(大连)有限公司产品;淋巴细胞分离液为MP Biomedicals生物医学公司产品。

1.2 方法

1.2.1 引物的设计与合成 根据GenBank上发表的奶牛IL-2基因序列(序列号:NM_180997)使用Premier 6.0和 Oligo6.0设计一对特异性引物:P1:5′-CCCCGAATTCATGTCAGCAATGTACAAGATAC AACTCTTGTCTTGC-3′ ;P2:5′-GGGGCTCGAGT CAAGTCATTGTTGAGTAGATGC-3′。P1含Eco RⅠ酶切位点及起始密码子,从起始密码子起36个碱基均与GenBank上发表的奶牛IL-2基因序列同源。P2含XhoⅠ酶切点及终止密码子,引物序列与Gen-Bank上发表的奶牛IL-2基因序列的475位~498位互补,预期扩增目的片段大小为477 bp。引物由上海生工生物工程技术服务有限公司合成。

1.2.2 奶牛外周血淋巴细胞的分离与活化 根据于康震[7]的报导,用淋巴细胞分离液,从奶牛外周血中无菌分离淋巴细胞,用Hank′S液洗2遍。最后将淋巴细胞重悬于1640完全培养基中。计数并调整细胞浓度到107个/mL。Con A 浓度为7.5 μg/mL加入到24孔细胞培养板,置37℃、体积分数为5%的二氧化碳培养箱中培养24 h。

1.2.3 奶牛外周血淋巴细胞总RNA的提取 离心收集经Con A诱导培养的淋巴细胞,加Trizol并分装于1.5 mL的EP管中,按Trizol Reagent说明书提取奶牛外周血淋巴细胞总RNA。提取的奶牛外周血淋巴细胞总RNA于-80℃保存备用。

1.2.4 奶牛IL-2基因cDNA的合成 以提取的奶牛外周血淋巴细胞总RNA为模板,参照宝生物工程(大连)有限公司的反转录酶使用说明书合成cDNA。RT反应体系为10μL。在反应管中分别加入总RNA 模板1μL,10×RT缓冲1μL,MgCl22μL,特异下游引物0.5μL,d NTP混合物1μL,RNA酶抑制剂0.25μL,AMV反转录酶0.5μL,加灭菌超纯水至10μL,置42℃30 min,99℃5 min,4℃5 min,结束cDNA合成,进行PCR扩增。

1.2.5 奶牛IL-2基因的克隆及回收 PCR反应体系为50μL:在PCR反应管中加入cDNA模板10 μL,5×PCR缓冲液10μL,特异上、下游引物各0.5 μL,Ex Taq酶0.25μL,加灭菌超纯水至50μL,置PCR仪中进行PCR扩增。首先94℃预变性2 min,然后按以下条件进行反应:94℃30 s,56℃30 s,72℃30 s,35个循环,72℃延伸10 min。用TaKa-Ra Gel DNA Fragment Recovery Kit Ver.2.0回收PCR产物。取5μL回收产物用琼脂糖凝胶电泳分析。

1.2.6 重组质粒的构建及鉴定 将纯化后的目的片段与p MD18-T载体16℃连接30 min,将连接产物与50μL JM109感受态细胞混匀后冰浴30 min,42℃水浴90 s,冰浴2 min,再加入890μL的SOC培养基,37℃摇床振荡培养60 min,最后取适量的培养物均匀涂布于含有60μg/mL Amp的LB平板上,37℃倒置培养12 h。随机挑取LB平板上生长良好的10个白色菌落,分别接种到含60μg/mL Amp的LB液体培养基上,37℃摇床振荡培养过夜,菌落PCR进行鉴定。用碱裂解法小量制备重组质粒DNA,取少量重组质粒DNA进行PCR鉴定,并用Eco RⅠ和XhoⅠ进行双酶切鉴定。

1.2.7 重组奶牛IL-2的序列测定 鉴定阳性的重组菌液,在宝生物工程(大连)有限公司的协助下,利用ABI PRISMTM377型自动测序仪,进行序列测定。

2 结果

2.1 纯化回收PCR产物鉴定

取纯化回收产物5μL,在10 g/L琼脂糖凝胶上电泳,结果显示,在500 bp略下方有特异性的条带,与预期结果相符(图1)。

2.3 重组质粒的鉴定

将重组质粒进行菌落PCR、双酶切和PCR鉴定,得到的片段与预期的片段大小一致(图2和图3)。

2.4 序列测定

测序结果显示,该基因序列有477个碱基。将所测得的序列与GenBank序列库中的序列号为NM-180997的奶牛IL-2基因序列进行比较后,与其同源性为98.7%,确定扩增到的序列是的IL-2基因序列。扩增到的序列与参考序列比较发现,第206位的C突变为T和304位的T突变为C。其中304位突变为无意义突变,编码的氨基酸没有变化。第206位的突变导致氨基酸由丙氨酸突变为缬氨酸(图4)。

2.5 基因序列比较与进化树的绘制

用DNASTAR软件,将所得的序列与GenBank中一些动物的IL-2序列进行比较,发现该序列与奶牛IL-2同源性为98.7%,与水奶牛IL-2同源性为95.3%,与山羊的同源性为在97.4%~97%之间,将该序列与GenBank中7种动物IL-2基因序列比较,绘制基因序列进化树(图5)。

图4 序列测定结果Fig.4 Sequencing results

图5 IL-2基因序列进化树Fig.5 IL-2 gene sequence phylogenetic tree

2.6 氨基酸序列的进化树

运用DNA Star软件,将奶牛IL-2推导的氨基酸序列与其他动物IL-2氨基酸序列比较,根据不同动物IL-2氨基酸序列差异,绘制IL-2氨基酸序列进化树(图6)。由图可见,IL-2氨基酸进化树大致可分成两部分,哺乳动物的IL-2大都在第一组,第二组包括小鼠和鸡。由进化树可看出,奶牛IL-2与水牛IL-2、山羊IL-2亲源关系很近。

2.7 各种动物IL-2的抗原性比较分析

运用DNAStar软件,比较不同动物IL-2的抗原性(图7)。奶牛IL-2与水牛、山羊的抗原性相当接近,特别在N端的10位~60位以及75位~140位氨基酸残基处图谱基本一致。而鸡IL-2的抗原性与奶牛、水牛及山羊的相差较远,尤其在35位~75位及95位~120位氨基酸残基处,差异显著。由图谱可见,所有比较的动物中,前20位氨基酸的抗原性相似性均较高,几乎没有抗原性,并且这些氨基酸残基大部分是疏水性的氨基酸,研究表明,这部分氨基酸残基构成了IL-2的信号肽。

图6 IL-2氨基酸进化树Fig.6 IL-2 amino acid phylogenetic tree

图7 不同动物IL-2抗原性的比较Fig.7 IL-2 antigenicity of different animals

3 讨论

从奶牛外周血淋巴细胞中提取的总RNA的质量直接影响RT-PCR扩增奶牛IL-2基因的数量。国内尚未有市售的奶牛淋巴细胞分离液,试验采用人淋巴细胞分离液对奶牛外周血淋巴细胞进行分离。奶牛外周血离心后,雾状的淋巴细胞层与红细胞层界面不清,分离效果不好。因此,在吸出白细胞过程中易吸入较多量的红细胞。此时,用适量的淋巴细胞分离液再次分离淋巴细胞,效果较好。

通过对多种动物的IL-2氨基酸序列的比较,发现各种动物IL-2中均包含一些十分保守的氨基酸序列。去除信号肽后,从N端起的7个氨基酸存在于所有已知的IL-2序列中。该保守序列同样存在于奶牛IL-2中。对不同动物IL-2序列进行比较时发现,人IL-2序列中58、105及125位的3个保守的半胱氨酸,亦存在于其它动物中,包括我们扩增的奶牛IL-2。奶牛与山羊有5个氨基酸的差异;奶牛与水牛有5个氨基酸差异,在这差异的位点上,氨基酸的种类发生了变化,但酸碱性与疏水性变化不大。由此,我们推测这三种动物的IL-2氨基酸序列差异很小,且空间结构上也十分相似。

IL-2具有种属特异性。IL-2的空间构象决定它能否与IL-2受体(IL-2R)结合,进而决定其种属特异性。Fassina G等[8]于1995年首次证实了IL-2Rα的结合位点位于15~27位氨基酸残基上,同年,Moreau J W 等[9]证实了N-端是IL-2Rβ的结合位点。我们比较了15~27位残基之间的7种氨基酸序列发现,奶牛、水牛及山羊的这部分氨基酸组成完全一致;奶牛与人及猴有两个相同位置氨基酸差异,第18位残基,奶牛是丙氨酸,而人和猴的是苏氨酸,第20位残基,奶牛的是甘氨酸,而人和猴的是丝氨酸;奶牛与鼠比较,鼠除了18位是苏氨酸和20位是丝氨酸外,第15位是苏氨酸,而奶牛的是丙氨酸。其余的10个氨基酸残基在奶牛、水牛、山羊等哺乳动物中完全一致。该部分奶牛与鸡只有5个氨基酸残基相同。不同动物IL-2的氨基酸组成有差异,亲源性越远的动物,差异越大。IL-2只有与IL-2R结合才能发挥其生物学活性。而与IL-2R结合的IL-2氨基酸序列可以影响生物学活性的种属特异性[10]。此外,IL-2的空间构型对于种属特异性方面也起着重要的决定作用。不同种属动物间,IL-2氨基酸的组成及空间结构上的差异,直接影响它与不同种属动物IL-2R的结合能力,最终表现为对不同动物生物学活性上的差别。

[1]Semenzato G.Tumor necrosis factor:a cytokines with multiple biological activities[J].Br J Cancer,1990,61(3):354-361.

[2]Li G X,Lillehoj E P,Lillehoj H S.Interleukin-2 production in SC and TK chickens infected with Eimeria tenella[J].Avian Dis,2002,46(1):2-9.

[3]李祥瑞,闫慎飞.动物细胞因子的应用研究进展[J],畜牧与兽医,1999,31(5):36-37.

[4]Tang J T,Fang J Y,Gu W Q,et al.T cell immune response is correlated with fibrosis and inflammatory activity in hepatitis B cirrhotics[J].World J Gastroenterol,2006 ,12(19):3015-3019.

[5]Dubaniewicz A,Trzonkowski P,Dubaniewicz-Wybieralska M,et al.Mycobacterial heat shock protein-induced blood T lymphocytes subsets and cytokine pattern:Comparison of sar-coidosis with tuberculosis and healthy controls[J].Respirology,2007,12(3):346-354.

[6]Alice K P,Jorge A T.Therapeutic use of interleukin-2 in HIV-infected patients[J].Current Opinion Pharmacol,2002,2(4):433-439.

[7]于康震,卢景良,谷守林.牛外周血T,B和单核细胞的分离、鉴定及扫描电镜观察[J],中国兽医科技,1989,12(3):5-7.

[8]Fassina G,Cassani G,Gnocchi P,et al.Inhibition of interleukin-22/p55 receptor subunit interaction by complementary peptides[J].Arch Biochem Biophys,1995,318(1):37-45.

[9]Moreau J W,Bossus M,de Groote D,et al,Characterization of a monoclonal antibody directed against the NH2 terminal area of interleukin-2 and inhibiting specifically the binding of IL-2 to IL-2 receptor beta chain[J].Mol Immunol,1995,32(14):1047-1056.

[10]Smith K A.Interleukin-2[J].Curr Opin Immunol,1992,4(3):271-276.

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