禽流感病毒M 1蛋白表(拟)位定位及免疫检测分析
2012-08-30宋建领张富强李华春杨仕标王金萍
宋建领,张富强,李华春*,杨仕标,王金萍
(1.云南省热带亚热带动物病毒病重点实验室,云南昆明 650224;2.成都军区疾病预防控制中心,云南昆明 650032)
禽流感(Avian influenza,AI)是由A型禽流感病毒(AIV)引起的一种禽类的感染性疾病综合征。近年来,H5N1和H9N2亚型AIV的暴发,特别是H5N1亚型AIV突破种间屏障感染人的病例[1],赋予AI全新的公共卫生意义。AIV属于正粘病毒科流感病毒属A型流感病毒成员。AIV基因组由8个节段的单股负链RNA组成,编码10种病毒功能蛋白。病毒第7节段RNA转录过程中,经剪接、编辑合成两条不同的mRNA,翻译合成M 1和M 2基质蛋白。M 1是病毒的主要结构蛋白由252个氨基酸残基组成,分子量约26 ku,占病毒蛋白总量的30%~40%。该蛋白具有型特异性,其抗原性差异是流感病毒分型的依据之一。M 1在病毒复制中还具有重要的调节功能[2],如控制病毒的转录和被感染细胞的胞核胞浆之间的物质运输[3]。研究表明8位~89位、80位~109位、129位~164位氨基酸区域至少各存在一个B细胞表位,89位~141位氨基酸区域内至少存在2个B细胞表位,存在2个RNA结合位点[4],羧基端238QAYQKRMGVQMQRFK252肽构成 CD4+T细胞表位[5],58位~66位(58GILGFVFTL66)氨基酸构成 CD+8细胞毒性 T细胞表位[6],63位~70位(63FVFTLTVPS70)氨基酸构成CD+4 T细胞表位[7]。
本实验室前期进行了AIV M1、N1和N2基因克隆、表达,获得具有良好抗原性的表达产物[8-10];并应用噬菌体展示随机12肽库,确定了AIV M1蛋白222位~230位氨基酸(222HPNSSARLR230)构成一个型特异性表位[11]。在此基础上,本研究采用针对AIV的M 1蛋白型特异性单克隆抗体(MAb),淘选M 13噬菌体展示的7肽随机肽库,获得与MAb特异性结合的噬菌体拟位,比对分析噬菌体拟位的共有序列,在病毒M 1蛋白中鉴定相同(似)区域,结合不同噬菌体拟位与MAb的免疫反应性分析结果,进一步进行M 1蛋白表(拟)位分析。
1 材料和方法
1.1 MAb、噬菌体展示随机肽库及主要试剂 AIV M1 MAb、阴性抗体、M 1重组蛋白由有本实验室制备[11]。新城疫病毒(NDV)、H5N1、H9N2 AIV抗原购自哈尔滨兽医研究所。包被重组蛋白G的磁性珠、噬菌体展示的7肽随机肽库(Ph.D.-7TMPhage Display Peptide Library)购自美国 Beverly New England生物实验室;辣根过氧化物酶标记的鼠抗M 13抗体(HRP-IgG)购自Amersham-Pharmacia公司;PCR产物纯化试剂盒购自上海华舜生物工程有限公司;OPD底物购自Sigma公司。
1.2 肽库库容量滴定及评价 用TBS将待滴定肽库作10-1~10-12稀释,取100μL稀释液与100μL处于对数生长期的ER2738E.coli悬液混合,室温孵育20 min,加至3 ML 42℃的Agarose Top(顶层琼脂糖营养液),立即涂布LB/Agar/Tet/X-gal/IPTG平板,37℃过夜培养,滴定噬菌体蚀斑形成单位(PFU),计算噬菌体浓度。随机挑选20个蓝色的蚀斑对其携带的插入序列进行测序,评价7肽插入序列的随机性和肽库的库容量。
1.3 生物淘选 参照试剂盒说明及参考文献[9]的方法,将5μLM 1MAb、30μL噬菌体肽库(约含9×1010PFU)及165μL含有2%脱脂奶粉的TBS(pH7.5)混合,室温震荡孵育30min,与蛋白G包被磁性珠混合,室温震荡孵育20m in,缓冲液洗涤,用100μL 0.2 mol/L HCl(pH2.2)溶液(含 1 mg/mL BSA)洗脱结合于磁性珠上的噬菌体,并迅速中和至中性。对每一轮淘选获得的洗脱液,除少量稀释后按1.2方法涂布平板,其余用ER2738增殖,纯化,进行下一轮淘选。第二轮和第三轮分别使用2μL和1μL M1 MAb,以增强淘选的特异性。经3轮“淘选-扩增-淘选”,可以富集与抗体特异性结合的噬菌体。
1.4 ELISA 在第3轮淘选后涂布的平板上分别随机挑选48个蓝色噬菌体蚀斑,增殖培养后,以MAb及阴性对照鼠源抗体为包被抗体或捕捉抗体,以鼠抗M 13 HRP-IgG为检测抗体,OPD为底物,进行ELISA检测。当样品针对M 1 MAb的OD490nm值与针对阴性抗体的OD490nm值存在2倍或2倍以上差异时,判为阳性。
1.5 外源插入多肽序列分析 根据野生型噬菌体p III基因(ZY40350)中对所有fd-tet衍生载体均保守的区域,设计引物FUSE-U:5'-GCAAGCTGATAAA CCGATAC-3', FUSE-D: 5'-CCATGTACCGTAACA CTGAG-3',经PCR扩增包含外源插入多肽序列(7肽编码序列)的基因片段(约330 bp),产物纯化后,由上海生工生物工程技术服务有限公司进行测序。采用DNAMAN Version 5.2.2软件进行序列比对,分析7肽序列中的共有序列。
1.6 竞争性ELISA 以MAb为包被抗体,天然病毒抗原为竞争剂或阻断剂,抗M 13 HRP-IgG抗体为检测抗体,OPD为底物,对噬菌体拟位进行竞争性ELISA分析。检测OD490nm值。按以下公式计算:抑制率(%)=(OD490nm缓冲液对照-OD490nm试验)/OD490nm缓冲液对照×100%。设置阳性、阴性及空白对照。
2 结果
2.1 噬菌体展示随机肽库的库容量评价 肽库噬菌体浓度为8×1011pfu/mL。随机挑选20个克隆的序列比对分析结果显示,20个噬菌体克隆中有两个无插入序列,其余18个克隆展示的7肽序列各不相同,并且无相同(相似或共有)序列。
2.2 M1 MAb淘选获得噬菌体克隆的ELISA分析
M 1 MAb第3轮淘选获得的噬菌体洗脱液,经稀释涂布培养后,随机挑选96个蚀斑增殖培养,经ELISA检测与MAb发生特异性结合的噬菌体克隆,结果78个噬菌体克隆为阳性(图1)。
图1 单克隆抗体淘选后噬菌体克隆ELISA分析Fig.1 ELISA analysis of phage clones after panning by MAb
2.3 阳性噬菌体克隆外源插入序列的PCR扩增挑选20个阳性噬菌体克隆,经PCR扩增包含外源插入序列(7肽编码序列)的基因片段,分别获得大小约330 bp的扩增产物(图2)。
图2 阳性噬菌体克隆插入序列PCR扩增Fig.2 PCR amplification of insert sequence from positive phage clones
2.4 阳性噬菌体克隆展示的7肽序列比对分析PCR产物纯化后测序,根据获得的核苷酸序列推导7肽氨基酸序列,20个阳性克隆展示的7肽氨基酸序列比对结果表明,10个克隆含有MDRxL序列(10/20),其中有5个克隆序列完全相同,均为KVMDRWL;有6个克隆序列含有HPR序列(6/20);2个克隆含有PR序列。1个克隆含有MRxL序列,1个克隆无共有序列序列(表1)。在M 1蛋白氨基酸序列中查找,显示M 1蛋白93位~95位氨基酸序列为MDR,99位氨基酸序列为L,222位~223位氨基酸序列为HP,230位氨基酸序列为R,分别与获得MAb识别的共有序列MDRxL或HPR相似。
表1 淘选后噬菌体展示的7肽序列比对分析Table 1 Alignment of peptide sequences displayed by phage after panning
2.5 竞争性ELISA检测 以M 1 MAb为包被抗体,AIV H5N1、H9N2及NDV抗原为竞争剂或阻断剂,HRP标记的抗M 13抗体为检测抗体,OPD为底物,对噬菌体拟位(KVMDRWL或LTHPRFH)进行竞争性ELISA分析,同时设缓冲液空白对照。结果表明,在缓冲液空白对照成立的前提下,噬菌体拟位(KVMDRWL或 LTHPRFH)与 M1 MAb间的结合,能够被H5N1、H9N2病毒抗原特异性抑制或阻断(H5N1病毒抗原阻断效率高于H9N2病毒抗原的阻断效率),抑制率随病毒抗原浓度降低而降低,而不能被NDV抗原抑制或阻断(图3和图4)。
图3 噬菌体拟位(KVMDRWL)竞争性ELISA分析Fig.3 Analysis of phagemimotope(KVMDRWL)by competitive ELSIA
图4 噬菌体拟位(LTHPRFH)竞争性ELISA分析Fig.4 Analysis of phagem imotope(LTHPRFH)by competitive ELSIA
3 讨论
基于病毒与MAb免疫反应性差异,筛选或构建病毒MAb逃逸株,分析其基因序列差异,以此间接推测抗原表位分布区域及构成表位的关键性氨基酸残基,对高变异性病毒(如AI),难以获得表位精确定位结果[9]。采用分子生物学软件预测病毒蛋白可能的表位区域,需要进一步研究确证。采用噬菌体肽库进行病毒表位分析,可以获得表位及其关键性氨基酸准确定位结果[12-13]。
采用针对M 1蛋白的流感病毒型特异性MAb淘选获得共有序列MDRxL,与M 1蛋白93位~99位(93MDRAVKL99)氨基酸序列结构基本一致。经ELISA、竞争性ELISA分析,携带MDRxL基序的噬菌体能够与MAb发生特异性结合,并且其结合能够被天然病毒抗原特异性抑制或阻断,表明MDRxL序列及其侧翼序列真实模拟病毒蛋白上与MAb结合的抗原决定簇或表位的结构和功能,研究提示M 1蛋白93位~99位(93MDRAVKL99)氨基酸区域构成AIV型特异性表位,93位、94位、95位和99位是构成表位的关键性氨基酸位点。
淘选获得第二个共有序列HPR,与本实验室先前应用噬菌体展示随机12肽库将AIVM 1蛋白型特异表位定位于222位~230位氨基酸(222HPNSSARLR230)的结果一致。一般认为一个MAb针对一个病原表位,本研究使用的AIV型特异性MAb能够与模拟M 1蛋白93位~99位和222位~230位区域的7肽特异结合,可能表明本研究使用的MAb需要进一步克隆纯化。下一步将应用基因分段、截短或连续缺失表达技术和合成多肽进行表位精细定位,研究表位抗原性差异的分子基础。
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