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印度尼西亚源食蟹猴干扰素-γ基因的克隆和序列分析

2010-09-17孙兆增李爱学孔德强赵彦斌时彦胜

中国比较医学杂志 2010年10期
关键词:食蟹恒河干扰素

孙兆增,李爱学,孔德强,赵 爽,赵彦斌,刘 冰,时彦胜,曾 林

(军事医学科学院实验动物中心,北京 100071)

印度尼西亚源食蟹猴干扰素-γ基因的克隆和序列分析

孙兆增,李爱学,孔德强,赵 爽,赵彦斌,刘 冰,时彦胜,曾 林

(军事医学科学院实验动物中心,北京 100071)

目的 获得印度尼西亚食蟹猴的干扰素-γ基因,为常用实验猕猴干扰素-γ的基因工程生产奠定基础。方法 根据GenBank上公布的恒河猴干扰素-γ基因序列设计特异性引物,从印度尼西亚食蟹猴的外周血液中分离单核淋巴细胞,利用Trizol试剂,提取淋巴细胞的总RNA,通过RT-PCR的方法获得干扰素-γ基因片段,并对该片段进行克隆、鉴定和序列分析。结果 扩增到一498 bp的目的片段,经序列测定证实为印度尼西亚食蟹猴的干扰素-γ基因,与恒河猴、人及狒狒的干扰素-γ基因相比,同源性分别为100%、96%、99%。结论 常用的两种实验猕猴食蟹猴与恒河猴的干扰素-γ基因完全相同。

印度尼西亚源食蟹猴;干扰素-γ;克隆;序列分析

干扰素-γ(interferon-γ,IFN-γ)是由活化的 T淋巴细胞和NK细胞在诱生剂的作用下产生的一种细胞因子,由于其具有抗病毒、抗肿瘤和免疫调节等独特作用,在动物传染性疾病的预防和治疗中具有广阔的应用前景[1,2]。自 Isaacs 和 Lindenmann[3]于1957年首次发现干扰素的存在以来,各种动物和类型的干扰素相继被发现并克隆[4-9]。与其它干扰素类似,IFN-γ生物学作用有较严格的种属特异性,如人和小鼠的IFN-γ在DNA水平上有65%左右同源性,在氨基酸水平的同源性只有40%左右[10,11]。

目前在非人灵长类动物疾病防控过程中主要应用人源干扰素。恒河猴的IFN-γ由166个氨基酸组成,与人的同源性为96%。对于食蟹猴的干扰素-γ基因,国内外的研究报道较少,本研究拟获得印度尼西亚食蟹猴的干扰素-γ基因片段,并与其它种属的干扰素-γ基因序列进行比较,为常用实验猕猴干扰素-γ的基因工程生产奠定基础。

1 材料和方法

1.1 实验动物

4只印度尼西亚源食蟹猴,由军事医学科学院实验动物中心提供[SCSK-(军)2002-001]。

1.2 主要试剂

人淋巴细胞分离液购自天津TBD公司;Trizol购自Invitrogen公司;反转录酶M-MLV和DEPC为Promega公司产品;凝胶回收试剂盒和质粒提取试剂盒购自杭州 BioFlux公司;LA-Taq、dNTP、Oligo(dT)、pMD18-T克隆载体、EcoRⅠ及HindⅢ内切酶均为大连宝生物公司产品;E.coli DH5α感受态为北京博迈德公司产品。

1.3 引物合成

根据GenBank上公布的恒河猴的干扰素-γ序列设计引物,其上游序列引物为:5′-atgaaatacacaagttatat-3′,下游引物序列为:5′-ttattgggatgctcttcgac-3′,由上海生物工程技术有限公司合成。

1.4 外周血单核细胞的分离和总RNA的提取

无菌采取食蟹猴的外周血各4mL,肝素抗凝。取2mL抗凝血与2mL的Hank’s液充分混合,缓慢加入到2mL淋巴细胞分离液之上,1500 g离心10 min;去掉上层的水相,将包含淋巴细胞的中间层全部转移到1.5mL的离心管中,2000 r/min离心10 min,收集淋巴细胞。用 DEPC水洗涤后,转入到DEPC处理过的离心管中,加入1mL的Trizol,按照Trizol试剂说明书,提取总RNA。

1.5 食蟹猴IFN-γ基因的RT-PCR扩增

以提取的总RNA为模版,以olig(dT)为反转录引物,进行反转录反应。反应条件为:42℃,1 h;95℃,5 min;4℃,5 min。以2 μL 的反转录产物为模版,利用LATaq酶扩增食蟹猴干扰素-γ基因。反应条件为:预变性95℃,4 min;30 个循环,95℃,30 s,54℃,40 s,72℃,1 min;最后 72℃延伸 7 min。利用1%的琼脂糖凝胶电泳检测结果,并用凝胶回收试剂盒回收基因片段。

1.6 食蟹猴IFN-γ基因的克隆、鉴定及序列分析

PCR产物回收、纯化后,与pMD18-T载体连接。连接产物转化至DH5α感受态细胞,进行蓝白斑筛选。挑取单个白色转化菌落,接种于含氨苄青霉素的LB液体培养基中,利用质粒提取试剂盒提取质粒,通过PCR和酶切结合的方法筛选阳性重组子,阳性重组子由北京鼎国生物工程公司测序。利用DNAMAN软件编辑测序序列,并与GenBank上公布的恒河猴、人及狒狒的IFN-γ序列进行同源性分析。

2 结果

2.1 外周血单核细胞总RNA的提取结果

利用Trizol试剂从食蟹猴外周血淋巴细胞中提取到总RNA,rRNA的三条带比较明显,没有明显的降解(图1)。

图1 外周血单核细胞总RNA的提取结果Fig.1 The results of total RNA extraction of peripheral blood mononuclear cells

2.2 食蟹猴IFN-γ基因的RT-PCR扩增

以食蟹猴外周血单核细胞中提取的总RNA为模版,进行反转录反应。利用反转录产物为模版,从两只食蟹猴的反转录产物中扩增到IFN-γ的基因片段,经1%琼脂糖凝胶电泳检测,得到长度约为500 bp的特异性DNA片段(图2),与预期片段的大小一致。

图2 食蟹猴IFN-γ基因RT-PCR扩增结果Fig.2 RT-PCR results of IFN-γ gene of Cynomolgus monkeys

2.3 重组质粒的酶切和PCR鉴定

用EcoRⅠ、HindⅢ进行重组克隆质粒的双酶切分析,并以重组克隆质粒为模板进行PCR鉴定,琼脂糖凝胶电泳结果显示,获得了两个阳性重组质粒(图3)。

图3 IFN-γ阳性质粒的鉴定结果Fig.3 Identification of the IFN-γ positive plasmids

2.4 IFN-γ基因的测序和序列比较

两个阳性质粒序列测定的结果表明,食蟹猴IFN-γ全长为 498 bp,编码 166个氨基酸,与GenBank上公布的恒河猴IFN-γ的同源性为100%(序列比对图略),不存在种间差异。与人的IFN-γ相比,同源性为96%;与狒狒的同源性为99%,仅有5个碱基不同。

3 讨论

目前国内共有食蟹猴饲养场39家,其存栏量超过20万只。食蟹猴的疾病防控在其规模化生产中具有重要作用。目前在非人灵长类兽医临床中多应用抗生素等常规药物,基因工程药物应用基础薄弱。基因工程干扰素与血源性干扰素相比,具有无污染、安全性高、纯度高、比活性高、成本低、疗效确切等优点,是应用最成功的基因工程药物。但目前国内外对食蟹猴干扰素的研究报道较少,本研究通过PT-PCR方法对食蟹猴IFN-γ的序列进行了克隆,并进行了序列分析,为下一步食蟹猴IFN-γ的基因工程生产奠定基础。

序列分析结果表明食蟹猴IFN-γ基因序列与恒河猴IFN-γ基因序列完全相同,与人的同源性为96%,与狒狒的同源性为99%,仅有5个碱基不同。国内外用于实验的非人灵长类动物主要包括恒河猴和食蟹猴,本研究表明食蟹猴与恒河猴的IFN-γ基因不存在种间差异,利用本研究获得的IFN-γ序列进行基因工程生产,可广泛应用到非人灵长类的兽医临床中。

[1]Farrar MA,Schreiber RD.The molecular cell biology of interferon-gamma and its receptor[J].Annu Rev Immunol,1993,11:571-611.

[2]潘晓梅,窦永喜,才学鹏.猪干扰素-γ的研究进展[J].生物技术通报,2008,6:36-39.

[3]Isaacs A,Lindenmann J.Virus interference I the interferon[J].Proc R Soc Lond B Biol Sci,1957,147:258-267.

[4]娄忠子,兰喜,李建强,等.猪γ2干扰素的克隆表达及单抗的潜在应用[J].生物技术通报,2010,1:173-179.

[5]李林,余为一,张敬梅,等.猪γ干扰素基因的克隆表达及其抗原性的初步研究[J].安徽农业大学学报,2010,37:32-35.

[6]孟庆玲,乔军,才学鹏,等.兔IFNγ基因的克隆、遗传进化分析及其表达[J].甘肃农业大学学报,2008,43:7-11.

[7]白宇,童铁钢,刘光亮.马γ-干扰素成熟蛋白基因在大肠埃希氏菌中表达及其多克隆抗体制备[J].中国预防兽医学报,2007,29:878-882.

[8]丁忠庆,刘胜旺,孔宪刚.鸡γ-干扰素基因在大肠杆菌中的高效表达及多克隆抗体的制备[J].中国兽医学报,2004,24:255-257.

[9]史喜菊,汪明,夏春.牛干扰素研究进展[J].中国兽医杂志,2005,41:14-16.

[10]朱颖慧,朱兰才,刘然义,等.干扰素-γ治疗肿瘤的研究进展[J].肿瘤学杂志,2008,14:4-9.

[11]刘林林,郭彩霞,孙宝胜,等.小鼠分泌型γ干扰素原核表达载体 pFLAG-IFN-γ的构建[J].中国实验诊断学,2009,13:863-865.

Cloning and Sequence Analysis of Interferon-γ of Indonesian Cynomolgus Monkeys

SUN Zhao-zeng,LI Ai-xue,KONG De-qiang,ZHAO Shuang,ZHAO Yan-bin,LIU Bing,SHI Yan-sheng,ZENG Lin
(Laboratory Animal Center of the Academy of Military Medical Science,Beijing 100071,China)

Objective To obtain the IFN-γgene of Indonesian Cynomolgus monkeys and provide a theoretical and material basis for the production of the recombinant IFN-γ.Method Based on the published nucleotide sequence of IFN-γ gene of rhesus monkey in GenBank,a pair of RT-PCR primers were designed and synthesized.Total RNA,isolated from the peripheral blood mononuclear cells by Trizol,was used as template to amplify the IFN-γgene by RT-PCR.The gene was identified by endonuclease,PCR and DNA sequencing.Result A 498 bp DNA fragments were amplified.DNA sequencing confirmed that the fragment was IFN-γof Cynomolgus monkeys.Compared with rhesus monkeys,humans and baboons,the homology of nucleotide sequence of IFN-γgene were 100%,96%and 99%respectively.Conclusion The IFN-γ gene of cynomolgus monkey was identical to that of rhesus monkey.

Indonesian Cynomolgus monkeys;IFN-γ;Cloning;Sequence analysis

R349.64

A

1671-7856(2010)10-0003-03

10.3969/j.issn.1671.7856.2010.10.002

2010-06-12

国家自然基金(30970416),国家科技部基础平台项目(2005DKA21500)。

孙兆增(1977-)男,博士,研究方向:实验动物学。

曾林(1965-)男,研究员,研究方向:实验动物科学与管理。

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