单纯疱疹病毒性角膜炎的病原学检测技术进展
2010-02-10颖综述吴欣怡审校
张 颖综述,吴欣怡审校
(山东大学齐鲁医院眼科,山东济南250012)
单纯疱疹病毒性角膜炎(herpes simplex keratitis,HSK)主要由 I型单纯疱疹病毒(herpes simplex virus,HSV-1)引起,发病率及致盲率均占角膜病的首位。目前HSK的诊断主要依据病史、典型症状和角膜病变形态,但该病临床表现复杂多样,常不典型,与腺病毒、棘阿米巴原虫等引起的角膜炎不易鉴别[1-2],造成误诊或漏诊,报道误诊率高达79.3%[3]。因此,HSK病原学诊断成为临床确诊的重要依据。病毒培养是HSV-1感染诊断的金标准,但费时费力、技术要求高,难以推广。本文对目前各种检测HSV-1的病原学诊断技术的最新进展综述如下。
1 环媒恒温扩增法(Loop-Mediated Isothermal Amplification,LAMP)
是一种新式的恒温核酸扩增方法,由Notomi T[4]于2000年研发。原理为设计4种引物,特异性识别靶基因上6个不同的序列区域,利用链置换DNA聚合酶(Bst DNA polymerase)扩增靶基因(恒温条件下一小时内可扩增靶基因的109倍),凝胶电泳检测扩增产物。
1.1 LAMP技术的改进和完善 2001年,Mori Y[5]建立了浊度法-LAMP,改进了检测扩增产物的方法。该法利用扩增副产物-焦磷酸镁白色沉淀的浊度判断靶基因扩增与否,缩短了检测时间,保证扩增与检测同步进行,实现了实时检测监控。2004年,Mori Y[6]依据浊度法-LAMP设计了相应的检测仪器,可在恒温下实时检测多个样品的浊度变化,实现了对多个LAMP扩增产物的定量分析。2002年Nagamine K[7]发现,在LAMP反应体系中加入一种环状引物(loop primer)可加速反应,使实验总时间缩短至30 min内。2007年,Kaneko H[8]评价了LAMP对临床样品中杂质的耐受性,认为可直接检测样品,无需先提取样品中DNA。
1.2 LAMP的优点 ①条件简易,对空间及环境要求较小,无需大型精密仪器和特殊试剂,可适用于各级医院及小型诊所。②过程简单:该法不必进行模板热变性、多个热温循环、繁琐易污染的电泳、紫外观察等PCR反应过程。③反应迅速:四个区域同时环状扩增,形成茎-环结构,可在30 min内扩增至靶基因的109倍。④操作简便:虽然原理较复杂,但仅需将检测样品和试剂一起放入恒温环境中30-60 min,即可肉眼判断扩增与否,无需专业人员。⑤特异性高:4个引物特异性识别靶基因上6个不同的区域,且六个区域的顺序也有规定,因而特异性高。⑥灵敏度高:模板1-10拷贝即可实现扩增。
1.3 LAMP对HSV-1的检测效果 Sugiyama H[9]利用 LAMP和“金标准”病毒培养法检测38例疑似HSV-1感染的生殖器皮损样品。结果显示:与病毒培养相比,LAMP扩增30分钟、60分钟的灵敏度分别为90%(9/10)、100%(10/10),阳性预测值分别为100%(9/9)、100%(10/10)。提示:①LAMP灵敏度较高,可有效的筛检病人;②阳性预测值高,LAMP结果阳性时患病的可能性较高。该研究样本含量较小,不能显示不同扩增时间下LAMP灵敏度之间的统计学差异,尚需进一步研究确证。
Yoshihiko Enomoto[10]将23例皮肤、口腔粘膜疱疹和生殖器疱疹样品配对设计为是否提取DNA两组,评价LAMP对两组样品中HSV-1的检测效果。与检测速度较快的PCR相比,浊度法LAMP检测效果与PCR相同,样品是否提取DNA对其检测效果无明显影响。Kaneko H[11]利用60例疑似眼部及生殖器疱疹样品,评价LAMP、PCR检测直接样品的效果。结果表明,与“金标准”病毒培养相比,LAMP、PCR检测直接样品的灵敏度分别为 88%(15/17)、6%(1/17),前者明显高于后者(P<0.001)。以上研究显示,PCR受临床样品中抑制物(文献报道眼表麻醉剂、荧光素[12])的影响较大;LAMP受临床样品中抑制物的影响较小,可直接检测样品,无需提取DNA,快速且灵敏。浊度法LAMP进一步省略凝胶电泳检测过程,速度更快,达到了快速诊断的目的。
2 PCR技术的改进
2.1 过程的简化 常规PCR需首先提取样品DNA为扩增提供模板,通常认为该步必不可缺,约花费整个PCR检测时间接免疫荧光法(Indirect Immunofluorescence Assay,IIF)因参加反应的因素较多,受干扰的可能性大等缺点,限制了其在临床检验诊断中的应用。单克隆抗体(Monoclonal antibody,m-Ab)技术的发展,产生了敏感性高、特异性强的抗体,减少了与其它物质的交叉反应,使试验结果可信度增大,更易于菌种的型及亚型、病毒变异株等的鉴别。随着该技术的商业化,出现了许多单抗试剂盒,进一步加快了检测速度。单克间的一半。Pandori MW[13]用PCR直接检测57个HSV样品,发现无需提取样品DNA,经济省时一半,敏感性下降2-5倍,但相对病毒分离法仍为一种较实用的方法。需强调的是,应用PCR直接检测样品,要求最大化减少样品中的潜在抑制物。Pandori MW[13]发现用擦拭法收集样品经稀释后置于95℃下10分钟,通过稀释组织碎片即可减少潜在抑制物,该条件能充分暴露核酸,提高检测灵敏度。该研究提示,简化后的常规PCR技术节省时间,污染小,值得在临床中推广。
2.2 实时荧光探针定量PCR 实时荧光探针定量PCR,即在PCR反应体系中加入特异性荧光探针(如TaqMan)和引物。该探针能与靶序列特异性结合,探针两端各标记一个荧光报告基团(如FAM)和一个荧光淬灭基团(如TAMRA)。探针完整时,TAMR A淬灭FAM的荧光,致无荧光信号发出;PCR扩增时,具有外切酶活性的TaqMan酶将探针上的FAM切下,FAM与TAMR A分离,产生的荧光信号可被监测。随扩增循环的重复,酶切下的FAM数量增加,实现了荧光信号积累与PCR产物形成的同步进行。Kowalski RP[14]利用该法检测122个角膜或结膜样品中的HSV-1,与病毒培养相比,灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值分别为98%(63/64)、100%(58/58)、100%(58/58)、91%(58/64),显示了实时荧光探针PCR技术在减少误诊和漏诊方面有优势。与常规PCR相比,该法优点在于,特异度提高,假阳性率降低,更加快速准确,符合临床需要,可成为检测HSV-1的常规手段。
2.3 多重PCR(multiplex PCR) 是在常规PCR技术基础上改进和发展起来的一种新型扩增技术,即在同一PCR反应体系内加入两对或多对特异性引物,一次扩增多个DNA片段,从而实现多种病原体DNA的同时快速鉴定。多重PCR同单引物PCR相比,优点在于多对引物同时扩增,扩增结果的阳性及阴性条带可互为对照,进一步排除了PCR假阳性、假阴性问题,且比多次单引物PCR扩增所用试剂少、时间短、通过一次扩增反应可得到多方面的信息[15]。疱疹类病毒引起的眼部疾病常具有相似的临床表现,特别是发生混合感染,或同时出现多个疑似眼部疱疹病毒感染的患者时,可用该法进行快速诊断,具有临床实际意义。Zhang Y[16]分别利用多重PCR和单引物PCR检测33例疑似眼部疱疹病毒感染的患者,两种方法检出率相同(57.6%,19/33),因前者可检测出同一样品中的多种病毒,优于后者。 Anne J.Jääskeläinen[17]将多重PCR与生物芯片技术相结合,用于同时检测脑脊液中的八种疱疹病毒,并设计出新的HSV-PCR引物对和寡核苷酸探针,完善了两种技术的结合,提高了检测的敏感性和可靠性。
3 单克隆抗体引导的间接免疫荧光法
隆抗体引导的IIF法,克服了IIF的许多不足,目前得到了广泛的应用。刘军连[18]采用HSV型共同性单克隆抗体为夹心的IIF方法,检测120例生殖器疱疹样品中的HSV,并与病毒培养法进行比较,结果显示:IIF法的灵敏度为96.5%(82/85),特异性为40.0%(14/35)。IIF法较病毒培养法更适用于病程较长的病例,阳性检出率为83.3%(75/90),高于病毒培养法的阳性检出率64.4%(58/90,P<0.01)。作者推断可能原因为:病程较长时,有活力的病毒明显减少甚至消失,但HSV抗原仍存在且能被IIF法检出,所以IIF法优于病毒培养法。Pereira SR[19]分别应用FITC-mAb法、病毒培养法检测感染鼠(BALB/c小鼠)角膜中的HSV抗原,两种方法24小时灵敏度分别为100%(20/20)、45%(9/20)。FITC-mAb法灵敏度明显高于病毒培养法(P<0.001)。Pereira SR认为单克隆抗体引导的IIF法联合角膜印迹取材法,可直接应用于患者,作为病毒培养确诊前的筛检实验。单克隆抗体引导的IIF法具有较高的诊断价值,但特异性较低,今后仍需更多临床实验综合评价该法,确定该法应用于诊断HSK的临床实用价值。
4 IELIS法
新的HSV-1抗体的出现促使了IELIS技术检测HSV-1的新进展。Idandi K[20]合成了包括全长gG蛋白的pTrc His2A-gG1质粒,并利用该质粒获得了新的HSV-1抗体,联合IELIS法研制出新的型特异性HSV-1诊断试剂盒,灵敏度为100%,特异度为89.5%。
5 小结
早期诊断治疗HSK可降低复发率,诊断延误有可能造成不可逆转的视力损害,因而临床医生应选择快速灵敏的检测方法。目前研究表明,LAMP法、实时荧光探针PCR法能够较快速有效的筛检病人且可信性相对较高,值得普及推广;单克隆抗体引导的IIF法灵敏度较高,但特异性较低,可用作疑似病人进行病毒培养确诊前的筛检实验。目前存在的问题是,尚缺少对各种方法的灵敏度、特异度、阳性和阴性预测值等综合性评价,以便为眼科临床工作者在HSK的诊断和治疗中提供决策证据。
[1]Marangon FB,Miller D,Alfonso E.Laboratory results in ocular viral diseases:implications in clinical-laboratory correlation[J].Arq Bras Oftalmol,2007,70(2):189.
[2]Thebpatiphat N,Hammersmith KM,Rocha FN ,et al.Acanthamoeba keratitis:a parasite on the rise[J].Cornea ,2007 ,26(6):701.
[3]朱志忠,王印其,张月琴,等.单纯疱疹性角膜基质炎诊疗中的失误和对策[J].美中国际眼科杂志,2002,2(3):30.
[4]Notomi T ,Okayama H ,Masubuchi H ,et al.Loop-mediated isothermal amplification of DNA[J].Nucleic Acids Res,2000,28(12):63.
[5]Mori Y,Nagamine K,Tomita N,et al.Detection of loop-mediated isother
mal amplification reaction by turbidity derived from magnesium pyrophosphate formation[J].Biochem Biophys Res Commun,2001,289(1):150.
[6]Mori Y,Kitao M ,Tomita N ,et al.Real-time turbidimetry of LAMP reaction for quantifying template DNA[J].J Biochem Biophys Methods,2004,59(2):145.
[7]Nagamine K,Hase T,Notomi T.Accelerated reaction by loop-mediated isothermal amplification using loop primers[J].Mol Cell Probes,2002,16(3):223.
[8]Kaneko H,Kawana T,Fukushima E,et al.Tolerance of loop-mediated isothermal amplification to a culture medium and biological substances[J].J Biochem Biophys Methods,2007,70(3):499.
[9]Sugiyama H,Yoshikawa T ,Thira M,et al.Comparison of loop-mediated isothermal amplification,real-time PCR,and virus isolation for the detection of herpes simplex virus in genital lesions[J].J Med Virol,2005,75(4):583.
[10]Enomoto Y,Yoshikawa T,Ihira M,et al.Rapid diagnosis of herpes simplex virus infection by a loop-mediated isothermal amplification method[J].J Clin Microbiol,2005 ,43(2):951.
[11]Kaneko H ,Iida T ,Aoki K ,et al.Sensitive and rapid detection of herpes simplex virus and varicella-zoster virus DNA by loop-mediated isothermal amplification[J].J Clin Microbiol,2005 ,43(7):3290.
[12]Goldschmidt P ,Rostane H ,Saint-Jean C,et al.Effects of topical anaesthetics and fluorescein on the real-time PCR used for the diagnosis of Herpesviruses and Acanthamoeba keratitis[J].Br J Ophthalmol,2006,90(11):1354.
[13]Pandori MW ,Lei J,Wong EH ,et al.Real-Time PCR for detection of herpes simplex virus without nucleic acid extraction[J].BMC Infect Dis,2006,6:104.
[14]Kowalski RP,Thompson PP,Kinchington PR,et al.Evaluation of the SmartCycler II system for real-time detection of viruses and Chlamydia from ocular specimens[J].Arch Ophthalmol,2006 ,124(8):1135.
[15]刘爱英,尹跃平,孙建方,等.多重PCR检测性传播生殖器溃疡性疾病病原体方法的研究[J].中国皮肤性病学杂志,2005,19(9):530.
[16]Zhang Y,Kimura T,Fujiki K ,et al.Multiplex polymerase chain reaction for detection of herpes simplex virus type 1,type 2,cytomegalovirus,and varicella-zoster virus in ocular viral infections[J].Jpn J Ophthalmol,2003,47(3):260.
[17]J ääskeläinen AJ,PiiparinenH ,Lappalainen M,et al.Improved multiplex-PCR and microarray forherpesvirus detection from CSF[J].J ClinVirol,2008,42(2):172.
[18]刘军连,徐志凯,喻启桂,等.单克隆抗体间接免疫荧光试验检测生殖器单纯疱疹病毒感染[J].第四军医大学学报,2004,25(8):728.
[19]Pereira SR,C âmara FP,Guimar ães MA ,et al.An immunofluorescence test for diagnosis of ophthalmic herpes in a mouse corneal model[J].Rev Inst Med Trop Sao Paulo,2007,49(2):87.
[20]Zandi K,Roostaee MH,Sadeghizadeh M ,et al.Production of recombinant gG-1 protein of herpes simplex virus type 1 in a prokaryotic system in order to develop a type-specific enzyme-linked immunosorbent assay kit[J].FEMS Immunol Med Microbiol,2007 ,50(3):319.