急性髓系白血病患者外周血外泌体中miR-4286 表达水平检测及其诊断价值
2023-05-06全海薇张亚丽艾一玖邹雨彤
全海薇, 张亚丽, 王 涵, 艾一玖, 邹雨彤, 夏 薇
(1.北华大学医学技术学院血液检验教研室,吉林 吉林 132013;2.北华大学附属医院血液科,吉林 吉林 132011)
急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)是一种造血系统恶性肿瘤,好发于成人,具有高复发率和高死亡率等特征[1]。外泌体是细胞膜衍生的囊泡,携带信使RNA(mRNA)、蛋白质和微小RNA(microRNAs,miRNAs)等大量信号分子,广泛分布于血清、尿液和唾液等体液中,参与细胞间相互作用,与肿瘤发生发展有密切关联[2-3]。研 究[4-5]表 明:白 血 病 细 胞 分 泌 的 外 泌 体可通过介导细胞间信号传递抑制造血、重塑骨髓造血微环境、诱导免疫耐受进而提高抗药性,与AML 的发生发展关系密切。miRNAs 是一类长度约为22 nt 的单链非编码RNA,多种外泌体miRNAs 已成为疾病的诊断指标。骨髓间充质干细胞 (bone marrow mesenchymal stem cells,BMSCs)和AML 细 胞 分 泌 的 外 泌 体miRNAs 在AML 细胞增殖、凋亡和分化的全过程均发挥重要作 用[6-8]。研 究[9]表 明:BMSCs 源 性 外 泌 体miR-425-5p 靶向Wilms 肿瘤蛋白1 相关蛋白(Wilms’tumor protein 1-associating protein,WTAP)抑制AML 细胞增殖、凋亡、侵袭和迁移。BMSCs 源性外泌体microRNA-7-5p 靶向氧化固醇结合样蛋白11 (oxysterol binding protein-like 11,OSBPL11)延 缓AML 病 程[10];人 间 充 质 干细胞源外泌体miR-23b-5p 靶向三结构域蛋白14(tripartite motif containing 14,TRIM14)抑 制AML 细 胞 的 生 长[11];AML 细 胞 源 性 外 泌 体miR-548ac 靶向TRIM28/STAT3 通路参与造血功能 调 节[12]。外 泌 体 内miRNAs 参 与AML 临 床 诊治:外周血外泌体中miR-532、miR-10b和miR-125b表达水平可作为AML 预后不良的诊断指标[13-15];小鼠外周血外泌体miR-150、miR-155 和miR-1246的联合检测可作为小鼠AML 的诊断指标[16]。二代测序技术的推广和应用为AML 诊疗拓宽思路。分析GEO 数据库基因表达芯片(GSE64029)[17]结果显示:与CD34+的骨髓基质细胞正常分泌的外泌体比较,原代AML 细胞分泌的外泌体中miR-4286表达水平明显升高。本研究结合生物信息学筛选差异表达基因,观察AML 患者和健康对照人群外周血外泌体miR-4286 表达水平,评估外泌体miR-4286 对AML 的诊断效能,为临床诊断AML 提供新思路。
1 资料与方法
1.1 一般资料收集2020 年2 月—2021 年9 月于北华大学附属医院就诊的45 例AML 初诊患者(AML 组)外周血标本,其 中 男 性23 例,女性22 例,平均年龄(43.4±14.04)岁。AML 患者诊断标准依据《世界卫生组织AML 诊断和分类标准2016》[18]。纳入标准:符合诊断标准的初诊AML 患者;无重要脏器功能损害。排除标准:伴非AML 恶性肿瘤。初诊AML 患者FAB 分型:急性髓细胞白血病微分化型(M0)4 例(8.889%),急 性 粒 细 胞 白 血 病 未 成 熟 型 (M1)4 例(8.889%),急性粒细胞白血病部分成熟型(M2)13 例(28.889%),急性早幼粒细胞白血病(M3)8 例(17.778%),急性粒单核细胞白血病(M4)6 例(13.333%),急性单核细胞白血病(M5)10 例(22.222%)。另随机收集35 名同期健康体检者外周血标本作为对照组,其中男性16 名,女性19 名,平均年龄(33.71±9.52)岁。受试者均已签署知情同意书,并同意参加本研究。本研究获北华大学附属医院医学伦理委员会批准[(2020)年第(04)号]。
1.2 主要试剂和仪器抗CD63 抗体、抗CD9 抗体和羊抗鼠单克隆二抗(英国Abcam 公司),Trizol 试剂、miRNA 反转录试剂盒和TB Green®Premix Ex Taq™ Ⅱ试剂盒(日本TaKaRa 公司),实 时 荧 光 定 量 PCR (real-time fluorescence quantitative PCR,RT-qPCR)引物[生工生物工程(上海)有限公司]。超速离心机(型号:Sorvall WX 100+,美国Thermo 公司),RT-qPCR仪(型号:5100,美国Thermo 公司),透射电子显微镜(transmission electron microscope,TEM)(型号:HT7700,日本Hitachi 公司),纳米粒度分析仪(型号:Nanotrac wave Ⅱ,美国Microtrac 公司),垂直板电泳系统(型号:PowerPac,美国Bio-Rad 公司)。
1.3 临床标本采集处理用含促凝剂的真空采血管采集受试者静脉血10 mL,4 ℃、3 000 r·min-1离心10 min,分离血清。4 ℃、12 000 g 离心10 min,上清分装至1.5 mL EP 管中,-80 ℃保存。
1.4 外泌体提取将-80 ℃储存的血清置于冰上融化,采用超速离心法[19]提取外泌体。过程如下:血清4 ℃、2 000 g 离心30 min;上清转移至新的离心管,4 ℃、12 000 g 离心45 min;上清转移至超离管,4 ℃、110 000 g 离心2 h。收集沉淀,1 mL无菌PBS 缓冲液重悬。使用0.22 μm 的无菌过滤膜过滤较大囊泡,滤液4 ℃、110 000 g 离心70 min。收集沉淀,200 μL 无菌PBS 缓冲液重悬,-80 ℃保存。
1.5 外泌体鉴定采用TEM 观察外泌体形态:外泌体样品滴加到铜网中心,3%磷钨酸负染色后烘干,于TEM 下观察外泌体颗粒形态并拍照。采用纳米颗粒示踪分析 (nanoparticle tracking analysis,NTA)法检测外泌体粒径:200 μL 外泌体稀释(1∶100)样本混匀后加入样本分析室,设置反应条件(90 s、3 次),分析外泌体粒径。Western blotting 法检测外泌体标志蛋白(CD63 和CD9 蛋白)表达情况:使用RIPA 裂解液提取外泌体内总蛋白,BCA 法检测蛋白浓度;通过十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis,SDSPAGE)分离蛋白,转印至PVDF 膜上。使用5%脱脂奶粉封闭液于室温摇床封闭2 h。加入一抗兔抗人CD9抗体(1∶1 000)和CD63抗体(1∶1 000),4 ℃冰箱孵育过夜。TBS-T 洗脱3 次后加入二抗稀释液于室温摇床1 h,再 用TBS-T 洗 脱3 次。按说明书配制发光底物,加入发光液,显影并拍照。
1.6 RT-qPCR 法检测外泌体中miR-4286 表达水平外泌体溶液冰上溶解,采用TRIzol 试剂法提取总RNA。使用逆转录试剂盒按说明书逆转录生成cDNA。按照RT-qPCR 试剂盒说明书配制反应体系。反应条件:95 ℃预变性30 s,95 ℃变性5 s,60 ℃退火及延伸1 min,40 个循环。miR-4286 正向引 物 序 列:5′-CGTACCCCACTCCTGGTACC-3′。通用引物和U6 引物均为试剂盒自带。以U6 为内 参 基 因,采 用2-ΔΔCt法 计 算miR-4286 表 达 水 平。以2-ΔΔCt值大于3.182 为表达阳性,每个样品设置3 个复孔。
1.7 统计学分析采用SPSS 22.0 统计软件和GraphPad Prism version 8.0 统计软件进行统计学分析。AML 组和对照组外周血外泌体中miR-4286 表达水平均呈非正态分布,以中位数(四分位间距)[M(Q)]表示,组间比较采用非参数曼-惠特尼U检验。绘制ROC 曲线计算外泌体miR-4286 诊断AML 的灵敏度和特异度及AUC,评价miR-4286对AML 的诊断效能。以P<0.05 为差异有统计学意义。
2 结 果
2.1 血清外泌体鉴定TEM 观察,分离的外周血外泌体是一种具有脂质双层膜的囊状颗粒,呈一侧凹陷半球形,具有典型的外泌体结构,直径为30~100 nm。见图1。NTA 法检测外泌体粒径,结果显示:粒径呈单峰正态分布曲线,主要分布在30~150 nm,颗粒分散均一。见图2。Western blotting法检测结果显示:AML 组和对照组受试者外周血中外泌体均表达CD63 和CD9 蛋白。见图3。上述结果表明本研究采用的外泌体分离方法可用于后续实验。
图1 TEM 观察AML 患者外周血中外泌体形态表现(Bar=100 nm)Fig.1 Morphology of exosomes in peripheral blood of AML patients observed by TEM(Bar=100 nm)
图2 NAT 法检测AML 患者外周血中外泌体粒径Fig.2 Particle sizes of exosomes in peripheral blood of AML patients detected by NAT method
图3 2 组受试者外周血外泌体中CD63 和CD9 蛋白表达电泳图Fig.3 Electrophoregram of expressions of CD63 and CD9 proteins in exosomes in peripheral blood of subjects in two groups
2.2 AML 患者外周血外泌体中miR-4286 表达水平RT-qPCR 法检测结果见图4A,AML 组患者外周血外泌体中miR-4286 表达水平[3.788(1.733,9.996)]高于对照组[0.994 (0.641,1.396)],差异有统计学意义(Z=-5.543,P<0.01)。GEO 数据库基因表达芯片(GSE64029)检测结果显示:AML 组(原代AML 细胞)分泌的外泌体中miR-4286 表达水平高于对照组CD34+的骨髓基质细胞(P<0.01)(图4B)。
图4 对照组和AML 组受试者外周血外泌体(A)和细胞(B)中miR-4286 表达情况Fig.4 Expressions of miR-4286 in cells(A) and exosomes in peripheral blood(B) of subjects in control group and AML group
2.3 外周血外泌体中miR-4286 表达水平诊断效能评估根据外周血外泌体miR-4286 表达水平生成ROC 曲线,评估外泌体miR-4286 对AML 患者的诊断价值,结果显示:外周血外泌体中miR-4286表达水平用于诊断AML 时,AUC 为0.862 9(95%CI:0.774 7,0.937 1,P<0.01);当诊断临界值为3.182 时,灵敏度为66.67%,特异度为97.14%,具有良好的诊断效能(图5)。
图5 外周血外泌体中miR-4286 表达水平诊断AML的ROC 曲线Fig.5 ROC curves of expression level of miR-4286 in exosomes in peripheral blood in diagnosis of AML
3 讨 论
AML 以克隆性造血干/祖细胞分化障碍、增殖失控和凋亡受抑为特征,具有高度异质性[20]。AML 的诊断已整合细胞形态学、细胞化学、免疫表型、细胞遗传学和分子生物学等多种学科[21]。已被证实有200 多种与AML 相关的分子和染色体异常,但仍有20%~25%的患者无法通过上述指标准确诊断[22],未来仍需要检测其他生物标志物。
外泌体是直径为30~100 nm、含双层膜结构的囊泡小体,可由多种细胞产生[23]。肿瘤细胞源性外泌体促进肿瘤生长,外泌体病理性改变可应用于肿瘤的诊治[24]。目前可借助外泌体分离技术测定外泌体中蛋白质、mRNA 和miRNAs 等内容物,分析肿瘤特异性和阶段特异性。有研究[25-26]证实:可利用外泌体中miRNAs 含量辅助诊断乳腺癌亚型。研 究[5,7,27-29]表 明:AML 分 泌 的 外 泌 体 在AML 发生发展中发挥重要作用,如参与基因调控网络、携带免疫抑制分子、重塑造血微环境和引发化疗耐药[白细胞介素8(interleukin-8,IL-8)和血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)/血 管 内 皮 生 长 因 子 受 体(vascular endothelial growth factor receptor,VEGFR)],为AML 诊治及预后监测提供新的研究方向。
miRNAs 作为转录后调节因子,与基因表达调控、细胞生物学过程和肿瘤发展有密切关联[5]。外泌体miRNAs 水平在患者外周血中保持稳定,可反映肿瘤细胞生物学特性,协助多种恶性肿瘤的早期诊断和预后评估,其中多种外泌体miRNAs 参与AML 的 发 生 发 展[5]。结 合 生 物 信 息 学 分 析 结 果[17]显示:CD34+的骨髓基质细胞和原代AML 细胞分泌的外泌体miR-4286 表达水平差异有统计学意义。已有研究[30-34]表明:miR-4286 可通过多种作用方式参与肿瘤发生发展,其可通过靶向INPP4A 调控Janus 激酶2(Janus kinase 2,JAK2)/信号转导和转录激活因子3 (signal transducer and activator of transcription,STAT3)通路、靶向第10 号染色体缺失的磷酸酯酶与张力蛋白同源物(phosphatase and tensin homologue deleted on chromosome 10,PTEN)调控 PI3K/Akt 通路,调节miR-4286/转化 生 长 因 子β1 (transforming growth factor-β1,TGF-β1)/Smad3 负 反 馈 轴 和miR-4286/BZRAP1轴,参与胰岛素样生长因子1(insulin-like growth factor-1,IGF-1)和 TGF-β 信号传递,进而参与调控肿瘤细胞的增殖分化。综上,外周血外泌体miR-4286 或可作为AML 的诊断标志物。
本研究通过超速离心法提取外周血外泌体,对外泌体miR-4286 进行RT-qPCR 法检测,结果显示:与健康人群比较,AML 组患者外周血外泌体中miR-4286 表达水平差异有统计学意义,AML 患者外周血外泌体miR-4286 表达水平明显升高。ROC 分析结果显示:外周血外泌体miR-4286 表达水平诊断AML 的AUC 为0.862 9,灵敏度和特异度较高。联合分析miRNA 靶基因预测软件miRWalk 和miRTarBase 显 示:miR-4286 靶 基 因FANCC、FANCA、TP53、ITGB3 与AML 的 发生发展有密切关联。通过对miR-4286 靶基因GO 和KEGG 富集分析发现:靶基因多集中范可尼贫血复合物、核质和染色质相关功能区域,参与DNA、肽链修复及酶结合,在范可尼贫血通路参与AML 病程。
本研究结果表明:外泌体miR-4286 表达水平可用于辅助AML 诊断,未来可进一步分析miR-4286 对白血病细胞功能的影响,探索miR-4286 基于纳米颗粒药物传递系统作为AML 治疗靶点的可能性。
综上所述,外周血外泌体miR-4286 在AML 患者中表达增强,可以作为AML 的诊断标志物。本研究存在一定局限性:①仅研究了外周血外泌体miR-4286 对AML 的诊断价值,但不排除与miR-125b、miR-150、miR-155 和miR-1246 等 联 合诊断会提高AML 的诊断效能;②本研究仅阐述部分miR-4286 的生信分析结果,预测其在AML 中的信号调控网络,具体机制还有待进一步研究。本研究未来仍需大规模、多中心的临床研究累积数据,推广应用于临床诊断,进一步探索外周血外泌体miR-4286 作为AML 诊断标志物的意义,实现准确快捷诊断AML。