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基于文献计量学的10年视网膜色素变性研究特征分析

2022-12-01黄子杨梁丽娜李亚敏李晓宇许凯

中国中医眼科杂志 2022年4期
关键词:变性发文视网膜

黄子杨,梁丽娜,李亚敏,李晓宇,许凯

视网膜色素变性(retinitis pigmentosa,RP)是一类遗传性视网膜变性疾病,其特征是以进行性视杆细胞凋亡为主,继而视锥细胞受累,从而导致视力逐渐丧失[1]。感光细胞的丧失伴随着视网膜色素上皮细胞变性[2]。患者初发症状多为暗适应障碍或夜盲,逐渐出现视野缩窄。当视野缺损进展至黄斑区,中心视力也随之丧失[3-4]。RP 是最常见的遗传性致盲眼病,世界范围内患病率为1/7,000~1/3,000,在我国约为1/3,784[5]。近年来针对RP 的发病机制及防治国内外学者开展了大量研究并取得一定进展。

截至目前,仅有刘菊等[6]基于文献计量学方法分析了1994—2003 年RP 的研究进展,尚无使用CiteSpace 对RP 进行可视化的文献计量学分析的研究。RP 研究成果不断涌现,有必要对最新的研究进行分析。因此,本文基于文献计量学方法,运用CiteSpace 软件对国内外RP 研究的文献进行定量和可视化分析,该软件是一款用于统计和分析科学文献数据信息的可视化软件,融入了人工智能大数据技术,能快速定量地梳理相关文献,对学科知识进行网络分析[7-8],利用该工具可对比国内外研究现状、热点以及价值,以期为将来RP 研究提供思路。

1 资料与方法

1.1 资料来源

本研究的数据来源于Web of Science(WOS)数据库核心集和中国知网(CNKI)数据库。检索时间为2011 年1 月1 日—2021 年2 月28 日。

1.2 检索策略

基于WOS 数据库核心合集的检索主题词为:“retinitis pigmentosa”or“pigmentary degeneration of the retina”;基于CNKI 数据库的检索主题词为:“视网膜色素变性”“色素性视网膜炎”。

1.3 纳入标准

(1)研究类型:已公开发表的临床研究、证候研究、动物实验、细胞实验等文献;(2)研究对象:文献所研究的对象均为RP。

1.4 排除标准

(1)重复发表的文献;(2)新闻专访、资讯、会议通知等无全文文献、作者和年份信息不全等。

1.5 检索结果

将CNKI 数据库检索的英文文献与WOS 合并分析,筛选删除与主题无关和重复后,共有文献5,488 篇,其中WOS 和CNKI 数据库分别获取有效文献5,010 篇和478 篇。

1.6 统计学方法

应用CiteSpace 5.7.R2 软件对文献发表时间、国家、研究机构、研究作者、被引文献、关键词等进行定量和可视化分析,并结合Microsoft Excel记录相关文献数据信息。采用CiteSpace 和Microsoft Excel 结合绘制文献发表数量分布、国家、机构、作者合作网络以及关键词共现性、突现词可视化图谱。

2 结果

2.1 发文量分析

自2011 年2021 年,RP 相关研究发文量呈现波动变化状态,但总体呈现增长趋势,中文和英文文献发表情况增长趋势大致相似。值得关注的是,2021 年仅统计2 个月发文情况(图1)。

图1 CNKI与WOS近10年RP发文量分析

2.2 作者国家分布

网络中节点大小表示该国家发文量的多少,连线表示国家之间合作关系,连线的粗细表示合作紧密程度。统计结果显示,近10 年发表的RP 相关英文文献分别来自多个国家,WOS 数据库显示,不同国家合作网络及发表英文文献量排名前3 位的国家为美国(2,055 篇)、中国(649 篇)、英国(577 篇),三者是发表RP 研究英文文献的核心贡献国家,其相互合作也较为紧密(图2A)。

图2 WOS中RP研究国家及机构合作网络。2A 国家合作;2B 机构合作

2.3 研究机构分布

CNKI 中分析国内机构合作图谱较为分散,均以各大学及附属医院为研究个体独立进行研究,几乎无机构间相互合作,其中湖南、北京、上海为RP 主要研究机构所在地(表1)。

WOS 中RP 研究机构间合作相比于国内较为紧密(图2B),发文量排名前10 位的机构均是国外高校及眼科研究院所,暂无国内研究机构跻身前列(表1)。

教学实践证明:教师根据教学内容精心创设问题情境,让学生在问题情境中,在教师的指导、帮助下,通过自主或同伴间的协作式学习,最终实现对知识的建构。这样的教学模式对于学生来说,不仅增强了学生学习的兴趣,调动了学生学习的积极性,而且在潜移默化中培养了学生分析问题、解决问题的能力,以及同学间相互协作的精神,从而提高了课堂教学的有效性。

表1 RP研究发文量前10位机构

2.4 研究作者分布

统计分析显示,CNKI 数据库作者合作相当分散,以同一机构内部作者合作研究为主,与机构合作网络一致,较为突出的核心科研团队由湖南中医药大学彭清华、彭俊、北京同仁医院李根林领导,发文量稳居中文文献榜首(表2)。

表2 RP研究发文量前10位作者

WOS 数据库显示,作者合作网络较国内集中,其 中以STEPHEN H TSANG、FRANS P M CREMERS、ANDREW R WEBSTER、JOSEALAIN SAHEL 4 位研究者领导了RP 研究的核心合作网络(图3)。

图3 WOS中RP研究作者合作网络

2.5 文献共被引分析

对WOS 数据库中共被引文献进行聚类分析,得出时间线图(图4)。由图可知近几年关于#5 氧化应激、#7 干细胞治疗、#9 基因治疗的这些聚类的文献被引用的频次越来越高。对于聚类最丰富的“#0 全基因组外显子测序、#1 视网膜假体”类别,被引频次最高的前12 篇文献中有4 篇文献属于该聚类,可能是近10 年RP 相关研究的热点研究领域(表3)。

表3 RP参考文献中被引频次最高的12篇文献

图4 WOS中RP研究文献共被引时间线图

2.6 关键词分析

近10 年WOS 和CNKI 数据库中RP 研究关键词分析可见,中英文关键词共现分布情况总体相似(表4)。CNKI 关键词共现情况,可知国内RP 研究主流方向是围绕疾病的治疗以及发病机制展开,图中线条颜色越深表示研究年代越久远,黄色区域可看出近期国内更多研究倾向于中医药治疗RP,如“针刺”“枸杞子”“丹参”等关键词出现频次增多(图5)。WOS 中关键词随时间推移分布情况可知,英文文献更多关注其发病机制,尤其与遗传相关方面,使得基因治疗也一直成为研究热点。从其聚类分析看,治疗上关注视神经保护更多,其次是人工视网膜移植,再者是基因治疗(图6)。

图5 CNKI中RP研究关键词共现网络。CNKI 中国知网数据库;RP 视网膜色素变性

图6 WOS中RP研究关键词共现时间线图。WOS 科学网数据库;RP 视网膜色素变性

表4 RP研究前16位共现关键词

2.7 突现词分析

2011 年至今,中英文发表文献中突现的关键词普遍生命周期不长,从2018 年开始,中文文献突现词几乎都与中医药治疗RP 相关,如“针刺”“丹参”“枸杞子”等,并且其生命周期维持较久。英文文献中从2017 年开始持续关注RP 发病机制,如与炎症和遗传相关等(图7)。

图7 近10年CNKI和WOS数据库中RP研究突现关键词。7A CNKI数据库;7B WOS数据库

3 讨论

从发表文献一般特征看,中英文文献增长趋势大致相同,近10 年内年度发文量波动性缓慢上升,与1994—2003 年RP 研究文献计量学分析的结果比较,其增长也并未呈现指数型上升,表明RP 相关研究一直处于平稳增长的状态,也反映出该领域并无突破性的研究进展。

从发文地区和研究机构以及作者合作网络分析,美国、中国、英国是发表RP 文献的核心国家,其中以美国贡献最为突出,从英文文献发表量最高的作者STEPHEN H TSANG 研究的方向看,他所在的团队2011 年关注以病毒为载体的基因疗法的基础实验研究[9];再转化成临床上利用眼底自发荧光[10]、多模式成像技术[11]诊断及监测RP 进展;发现高通量测序(High-throughput sequencing,HTS) 技术比阵列引物延伸技术(arrayed primer extension,APEX)能识别更多RP患者的变异基因[12],使得临床上RP 相关致病基因被大量挖掘;随后研究基因和干细胞治疗以及新的医学电疗法出现[13];近2 年开始探讨代谢组学对视网膜变性原因的解释,并讨论了如何利用代谢组学来预防视网膜变性发展到晚期[14],研究发现通过口服补充三羧酸循环代谢产物可以延长视网膜功能,并对感光细胞和内部视网膜结构提供保护作用[15]。通过对高产作者的研究方向分析,可以反映整个研究领域的发展方向和研究热点。

从文献共被引以及关键词共现方面分析,国内外RP 研究重心领域仍在治疗和机制方面,并且研究方向总体一致。从WOS 数据库中共被引文献聚类分析看出,对RP 相关致病基因的探索从未停止,无论研究其在遗传学上的机制,还是探索治疗方法方面,一直都是中文、英文文献最主要的分享成果。聚类最丰富的全基因组外显子测序这一类别中,包含被引文献频次排第2 的1 篇综述,该文总结了用于RP 基因以及突变的检测方法[16]。被引频次最高的前12 篇文献中,Russell、Bainbridge 等完成了以腺相关病毒为载体的基因疗法治疗与RP 类似的遗传性视网膜疾病的Ⅲ期临床试验,并证明了其疗效和安全性[17-18]。这些高引用文献为RP 后期研究奠定了基础,也提供了循证参考依据。除基因研究外,还有近几年引用量增多的RP 相关机制研究如氧化应激通路的激活,RP 疗法方面研究如干细胞治疗等。关键词共现和突现分析共同反映出近期国内研究的大热点,即中医药治疗RP 或将成为该领域一重大突破性进展,随着国内外研究者对中医药越来越多的关注,“针刺”“丹参”“枸杞子”等词频频作为关键词出现,提示中医药防治RP的作用及机制在不断深入。

在WOS 和CNKI 2 个数据库中获取近10 年的RP 有效文献共5,488 篇,其年度发文量增长趋势缓慢,说明RP 作为疑难眼病,其发病机制和治疗研究瓶颈仍难以突破,造成10 年间无发文量突增的情况。国内与国外研究关键词大体相同,研究热点在治疗上略有差别,在主要研究节点上国内滞后于国外。RP的治疗一直是该领域研究的热点和难点,中医在RP 的治疗方面积累了丰富的经验,随着中医药学研究的进一步拓展及深入,中医药或将成为RP防治的突破点,为全世界RP 患者带来新希望。本文基于文献计量学方法,首次运用CiteSpace 软件对最具代表性的中英文数据库中RP 相关文献进行可视化分析,展示了近10 年研究重点和发展方向,为将来视网膜色素变性的深入研究和选题方向提供参考。

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