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中华蜜蜂磁响应基因MagR、Cry2的克隆和时空表达

2022-06-06李英娇陈艺杰李江红

关键词:亲缘工蜂日龄

李英娇, 周 贺, 陈艺杰, 李江红

(1.福建农林大学动物科学学院(蜂学学院),福建 福州 350002;2.农业农村部(福建)蜜蜂生物学观测站,福建 福州 350011)

蜜蜂是自然生态链中不可或缺的重要一环.在蜜蜂的生活环境中,它们不得不面对许多包括磁场、杀虫剂、疾病、天敌、气候变化等诸多胁迫因子影响.研究表明[1-7],磁场影响着蜜蜂的行为、生理和生长发育等方面.蜜蜂体内有磁感应受体,但其作用机制还不明确.生物对磁场感知的关键在于“磁受体”的确定,目前主要有两种假说得到了广泛认可,即基于磁铁矿颗粒(Fe3O4)的磁受体假说和依赖于隐花色素的化学自由基对假说.前者认为,生物可借助体内的磁铁矿颗粒(Fe3O4)感受磁场[8].目前得到公认的、最有可能存在该类磁受体部位有鸟的上喙和内耳、鱼的鼻组织以及昆虫的腹部.其中蜜蜂前腹的背侧区被认为是磁受体可能存在的解剖位点之一[9].而后者则认为生物体内的隐花色素(cryptochrome, Cry)是理想的磁受体,Cry在蓝光/近紫外光等光刺激下容易发生电子转移,产生自由基对(2个不成对电子),这个自由基对的自旋状态能够受磁场影响,在单重态和三重态之间快速转换,从而引发下游的神经信号传导,使生物在第一时间感受到变化的磁场信息,指导动物精确定位、定向[10-11].

实际上,基于磁铁矿颗粒和隐花色素的两种磁感应机制之间并不冲突,少数生物的磁感应仅涉及其中一种,而大多数则是两者兼具,互为补充;两种磁受体同时感应磁场,同时将来自太阳、星空和地标等视觉信息进行整合,使生物辨别方向的准确率显著提高.此外,另一种潜在的磁受体,即MagR(Magnetoreceptor),原名IscA,属于铁硫簇结合蛋白(简称铁硫蛋白)[12],该蛋白由Jacobson et al[13]首次在棕色固氮菌中发现,命名为ORF6.随着测序技术的进步,经过PCR测序等手段进行验证后,将ORF6改名为IscA[14].之后,Long et al[15]研究表明,将IscA1导入到HEK-293细胞及秀丽隐杆线虫中,发现外加磁场会改变细胞的动作电位和线虫的运动,并将IscA命名为MAR.也有研究人员在果蝇全基因组中筛选到全新的磁受体蛋白,并最终将其命名为MagR[16].MagR蛋白是线粒体内一类重要的功能蛋白,不仅自身能够感应磁场,也能与Cry相互作用形成光磁耦合的磁场感应复合物.在大肠杆菌、帝王蝶、鸽子和人等多种生物中均已证实MagR能与Cry在体外形成稳定的蛋白复合物[16].目前MagR基因在果蝇、粘虫、褐飞虱等昆虫上均有报道,而在蜜蜂领域的研究较少.隐花色素Cry对蓝光、近紫外光较敏感,在长期进化过程中,Cry产生了两大基因家族,即Cry1和Cry2,果蝇体内只有Cry1,而蜜蜂体内只有Cry2[17].目前在果蝇、褐飞虱等昆虫上有较多关于Cry的报道[16,18-22],而在蜜蜂领域的研究较少.赵方媛等[23]成功克隆了西方蜜蜂MagR基因序列,但MagR基因是否通过编码的蛋白作为磁受体在蜜蜂的定位导航中发挥作用,目前尚不清楚.另外,MagR和Cry2蛋白能够形成复合体,其蛋白结构具有特殊的结构域使两者有机地结合在一起[16].因此,本试验通过对中蜂磁响应基因AcMagR和AcCry2进行克隆和测序,分析相关基因序列信息,对编码蛋白的结构特征进行预测,利用qPCR技术对这两个基因在工蜂不同日龄、不同组织中的表达特征进行分析,以期为磁响应基因MagR和Cry2的功能及磁感应机理研究提供依据.

1 材料与方法

1.1 材料

1.1.1 试验材料 中华蜜蜂样本来自农业农村部(福建)蜜蜂生物学观测站内自养蜂群.基因克隆样本:在蜂箱内随机抓取10只工蜂,液氮速冻后置于-80 ℃储存备用.荧光定量PCR的样本:选取6群群势强壮、无自然分蜂倾向的中华蜜蜂健康蜂群,分别从蜂巢中抽出1~2张新蜂即将大量出房的封盖子脾置于人工培养箱中恒温恒湿培养(相对温度34.5 ℃,相对湿度60% RH,避光培养),待其羽化出房后用油漆笔在背部进行标记,再放回原来的蜂群,分别在成蜂1、5、10、15、20、25、30日龄时进行采样.每个日龄均采90只,随机分为3组,每组30只,并用镊子取下各日龄工蜂的头、胸、腹(去除消化系统),迅速投入液氮速冻后置于-80 ℃储存备用.

1.1.2 试剂 Trizol RNA分离试剂,Ambion公司;氯仿,北京化工厂;酚,Coolaber公司;反转录试剂盒,PCR试剂盒,Takara公司;荧光定量PCR试剂盒Hieff®qPCR SYBR Green Master Mix (Low Rox Plus),上海翊圣公司;胶回收试剂盒,AXYGEN公司;Primer Mix,天根生物科技有限公司.

1.1.3 仪器 高压灭菌锅(SS-325,日本TOMY公司)、Venticell 55升标准型干燥箱(MC000712,德国MMM公司)、低温离心机(5424-R,德国Eppendoff公司)、移液枪(德国Eppendoff公司)、大型低温离心机(Centrifuge 5145D,德国Eppendoff公司)、电热恒温水浴锅(上海精宏实验设备有限公司)、超纯水器(E1IX10,美国Millipore公司)、PCR 扩增仪(PTC-200,Takara公司)、凝胶成像系统(Gel Doc2000,美国Bio-Rad公司)、超低温冰箱(FORMA,美国Thermo Electron公司)、电泳仪(北京六一仪器厂)、荧光定量PCR仪(QuantStudio 6 Flex,美国ABI公司).

1.2 方法

1.2.1 提取总RNA与合成cDNA 用研磨器对不同日龄、不同组织的工蜂样品充分研磨,参照 RNA提取试剂盒说明书步骤提取总RNA.1%琼脂糖凝胶电泳检测提取总RNA质量,紫外分光光度计测量总RNA浓度,参照反转录试剂盒说明书步骤,以1 μg总RNA量反转录合成第1条cDNA 链,存于-20 ℃备用.

1.2.2 引物设计与目的基因克隆 以前期实验室转录组结果为基础,引物使用Primer Premier 6.0进行设计,引物合成委托福州尚亚生物技术有限公司完成(表1).按照陈艺杰等[24]的反应体系和程序进行PCR扩增,MagR和Cry2退火温度分别设定58、55 ℃.电泳检测并于紫外灯下切取目的条带回收纯化,用pGM-T载体连接过夜,转至DH5α感受态细胞,平板培养过夜.最后,挑取单克隆菌落PCR鉴定为阳性后扩大培养,菌液送福州博尚生物技术有限公司测序.

表1 试验所用引物Table 1 Primers used in the experiment

1.2.3 基因的序列分析 采用NCBI BlastP同源性分析;利用ORF Finder软件获得该序列的编码区域;SMART分析功能结构域;使用MEGA 6.0软件邻位相连法(Neighbor-joining)进行1 000次重复计算后构建系统进化树,MagR、Cry蛋白序列来源见表2.

表2 中蜂与其他昆虫MagR、Cry蛋白序列来源Table 2 Sequence information of MagR and Cry proteins used in phylogenetic analysis

1.2.4 荧光定量PCR反应 以β-actin作为参照基因,荧光定量PCR反应体系(10 μL):SYBR Green Master Mix 5 μL,上、下游引物各0.25 μL,cDNA模板0.5 μL,DEPC水4 μL.反应条件:UDG激活50 ℃ 2 min,预变性95 ℃ 3 min;PCR扩增(40个循坏)95 ℃ 30 s,55 ℃ 25 s,72 ℃ 45 s;溶解曲线95 ℃ 15 s,60 ℃ 1 min,95 ℃ 15 s.定量分析设置3个生物学重复和3个技术重复.

1.2.5 数据处理与分析 根据荧光定量PCR得到的标准曲线及荧光曲线的Ct值,采用2-ΔΔCt法进行数据分析,分别采用SPSS 21.0软件中的单因素方差分析(ANOVA)和t-检验进行显著性差异分析.所得结果均以平均数±标准误(Mean±SE)表示,并利用GraphPad Prism 8.0软件进行图形分析.P<0.05 作为具有显著性差异的标准.

2 结果与分析

2.1 目的基因克隆

利用设计的引物,以中华蜜蜂cDNA为模板进行PCR 扩增,将产物进行电泳检测,得到与预期长度一致的目的片段,AcMagR和AcCry2分别约为500、1 700 bp(图1).

图1 AcMagR和Accry2基因PCR产物电泳图Fig.1 Electrophoresis of PCR products of AcMagR and Accry2 genes

2.2 序列分析

利用NCBI BlastP分析测序所得的序列同源性,将目的基因分别命名为AcMagR和AcCry2,并提交至GenBank数据库,获得的登录号分别为:MZ054257、MZ054258.利用ORF Finder对所获得的序列分析表明,2个目的基因的完整开放阅读框(ORF)分别为393、1 713 bp,分别编码130、570个氨基酸.氨基酸序列中分别含有4和13个保守的半胱氨酸位点,AcMagR蛋白具有Fe-S_biosyn功能结构域,位于第24~126位氨基酸之间.AcCry2蛋白具有2个功能结构域(DNA_photolyase和FAD_binding_7),分别位于第23~189、303~503位氨基酸之间.

2.3 系统进化树分析

将克隆所得核酸序列在NCBI核酸数据库中进行Blastp分析,找到与目的基因(AcMagR和AcCry2)有同源性的昆虫氨基酸序列,用MEGA6.0软件构建系统进化树(图2).结果表明,中华蜜蜂MagR基因与西方蜜蜂亲缘关系最近,与大蜜蜂、小蜜蜂、黑大蜜蜂、欧洲熊蜂等亲缘关系较近,与北方皱切叶蚁、红收获蚁亲缘关系较远,与西花蓟马、黑腹果蝇、铜绿蝇、丝光绿蝇亲缘关系最远;而中华蜜蜂Cry2基因与西方蜜蜂的亲缘关系最近,与大蜜蜂、小蜜蜂、欧洲熊蜂等亲缘关系较近,与佛罗里达弓背蚁、北方皱切叶蚁、红收获蚁等亲缘关系较远.

A:MagR;B:Cry2.图2 基于MagR和Cry2蛋白序列构建的系统进化树Fig.2 Phylogenetic tree constructed by MagR and Cry2 proteins

2.4 AcMagR和AcCry2基因表达分析

实时荧光定量PCR结果表明,在同日龄工蜂中,胸部AcMagR基因的表达量显著高于头部和腹部,头部和腹部之间差异不显著,AcMagR基因在20日龄后的工蜂体内表达量显著高于前期日龄工蜂,胸部AcCry2的表达量也显著高于头部和腹部,头部和腹部两者比较差异不显著,但AcCry2基因在所有日龄工蜂体内表达量均较高(图3).

A:AcMagR;B:AcCry2.柱上不同的小写字母代表同一日龄不同组织的表达量差异显著.图3 中蜂不同日龄工蜂头部、胸部和腹部中AcMagR、AcCry2的相对表达量Fig.3 Relative expression level of AcMagR and AcCry2 in head, thorax and abdomen of A.cerana workers bee at different ages

3 结论

本试验获得中蜂AcMagR、AcCry2基因序列,分别含有长为393、1 713 bp的完整开放阅读框(ORF),编码130、570个氨基酸.系统进化树分析表明,中华蜜蜂的MagR基因与西方蜜蜂亲缘关系最近,与大蜜蜂、小蜜蜂、黑大蜜蜂等亲缘关系较近,而与果蝇、绿蝇等其他昆虫的亲缘关系较远,这与这些昆虫之间的亲缘关系基本一致.MagR蛋白具有多个铁硫簇结合位点,而铁硫簇是形成磁感应复合体magnetoreceptor的关键物质,说明MagR可能与磁感应有关[25].已有研究证明[26],在果蝇中MagR蛋白聚合形成棍状的形似指南针的结构,能够感受外界磁场的变化;AcCry2蛋白具有DNA光解酶结构域(DNA_photolyase)和黄素腺嘌呤二核苷酸(FAD_binding_7)结合区域,这两个结构域均属于Cry蛋白的发色团,在光信号接收和传导方面是重要功能元件,说明Cry2需要结合在DNA上发挥作用,光诱导的Cry蛋白的FAD-色氨酸自由基对具有磁敏感特征,可以感应地磁场.这说明AcMagR、AcCry2基因可能在蜜蜂的磁场感受中发挥重要作用.

AcMagR基因在胸部的表达量显著高于头部和腹部,与赵方媛等[23]在西方蜜蜂试验中所得结果一致.胸部是蜜蜂的运动中心,在蜜蜂飞行过程中起着至关重要的作用.在正常蜂群中,出房1周后的成年工蜂,主要从事巢内相关哺育任务(哺育蜂),1~2周后,它们则从事巢内清理、保卫或储蜜酿蜜等工作,出房3周以后开始外出从事采粉采蜜等工作(采集蜂)[27].研究表明[4,28-30],在外磁场干扰下,采集蜂容易受到影响,如舞蹈行为、定向能力易受干扰,返巢数减少,学习能力、记忆力下降,导致飞行和觅食行为均受影响,进而降低授粉能力.因此,AcMagR基因在20日龄后采集蜂胸部高表达,可能与蜜蜂外出采集、返巢过程中的定位有关系;AcCry2基因在不同日龄工蜂的胸部表达量高于头部和腹部,高表达部位上与黏虫、鸽子等一致[16,31].AcMagR和AcCry2共同高表达于采集蜂的胸部,这为蜜蜂形成类似于果蝇体内的棒状磁感应复合体提供了基础,暗示它们在工蜂定位、归巢中发挥重要作用[16].由于MagR和Cry2基因及其蛋白在蜜蜂领域的研究较少,从基因层面对蜜蜂定向机制的研究存在一定的局限性,不能完全确定MagR和Cry2基因在蜜蜂体内的具体功能,未来还需要研究蜜蜂行为学、神经生物学、蛋白组学等,以解开蜜蜂的磁感应之谜.

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