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美国《Emerging Infectious Diseases》2022年第1期有关人兽共患病论文摘译

2022-04-01李晓庆

中国人兽共患病学报 2022年3期
关键词:猪链球菌血清型基因组

P1 印度浦那冠状病毒病患者中暴发毛霉菌病//Samir Joshi,Rahul Telang,Muralidhar Tambe,等

本文回顾了冠状病毒病(COVID-19)大流行时期毛霉菌病的流行病学和临床病程。在印度浦那第2波COVID-19流行期间,对178例COVID-19治疗后经临床、内窥镜诊断或组织病理学确诊的鼻-眶-脑毛霉菌病患者,进行回顾性图表分析。从诊断为COVID-19到出现毛霉菌病症状的中位时间为28 d。73%的患者为中度或重度COVID-19,74.2%的患者既往或新近诊断患有糖尿病;52.8%的患者接受了类固醇治疗;75%的患者鼻上方或鼻内可见焦痂,但多数患者入院时的临床体征和实验室指标并无特殊;大约90%的病例有骨穿透,30%的病例有翼腭窝软组织肿胀,7%的病例有海绵状窦血栓形成,60%的病例有多灶核霉病;在178例研究病例中,151人(85%)接受了外科清创术,26人(15%)死亡,死亡病例中16人(62%)患有多灶毛霉病。病例数情况详见图1。

A为2016年1月1日至 2021年6月14日;B为2020年9月1日至2021年6月14日。图1 印度浦那Sassoon综合医院在COVID-19大流行之前和期间评估和治疗的鼻-眶-脑毛霉菌病病例数

P35 美国多州暴发与大规模公众集会相关的新型冠状病毒感染,包括疫苗突破性感染//Radhika Gharpure,Samira Sami,Johanna Vostok,等

2021年7月,在美国马萨诸塞州普罗文斯敦举行大规模公众集会后,发生了新型冠状病毒(SARS-CoV-2)B.1.617.2型变异株感染,包括疫苗突破性感染,促使开展一项多州调查。公共卫生部门通过新冠监测数据、病例调查和接触者追踪来确定原发和续发病例。原发病例被定义为在7月3日至17日在普罗温斯敦旅行或居住后的14 d内检出SARS-CoV-2。续发病例被定义为7月3日至8月10日期间,在与原发病例密切接触后的14 d内检出SARS-CoV-2,但无普罗温斯敦旅居史。本文确定了1 098例原发病例和30例续发病例,其中26例原发病例发生在完全和未完全接种疫苗的人群中。大规模集会可对SARS-CoV-2传播产生广泛影响,尤其是在高流行期,完全接种疫苗的人也应采取戴口罩等防护措施,以预防SARS-CoV-2感染与传播。

P51 2018-2019年美国到墨西哥的医疗旅游与广泛耐药的耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌//Ian Kracalik,D.Cal Ham,Gillian McAllister,等

耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌(CRPA)可产生维罗纳整合子编码的金属-β-内酰胺酶(VIM),是一种高抗菌耐药病原体,在美国并不常见。本文调查了在墨西哥蒂华纳接受减肥手术的美国医疗游客中VIMCRPA的来源。病例为2018年1月至2019年12月期间,分离出VIM-CRPA或CRPA且在标本采集前45 d内赴墨西哥接受了选择性侵入性医疗手术的对象。对分离株进行全基因组测序。在18个州发现了38名病例患者;31例由外科医生进行手术,且大多数(27/31)来自A机构。美国患者和医疗服务提供者应认识到,存在医疗旅游后被美国不常见的高耐药性病原体定植和感染的风险。

P62 香港COVID-19的非药物干预对儿童其他呼吸道病毒感染住院治疗的影响//Ian Kracalik,D.Cal Ham,Gillian McAllister,等

为确定COVID-19的非药物干预(NPIs)对儿童感染新冠病毒以外的呼吸道病毒的住院治疗的影响,本文分析了2017-2021年的医院数据。与2017-2019年相比,2020年实施了NPIs,同年与呼吸道病毒相关的年龄别住院率大幅下降。此外,在实施NPIs期间,各年龄段儿童感染甲型和乙型流感病毒、呼吸道合胞病毒、腺病毒、副流感病毒、人类偏肺病毒和鼻病毒/肠病毒的住院率也有所下降。年龄和季节调整后的回归模型表明,其他原因所致急性发热性疾病/呼吸道症状的住院率降低了76%,而感染上述病毒的住院率降低了85%~99%。香港施行NPIs与儿童呼吸道病毒住院率降低相关,而施行NPIs 和学校复课与感染鼻病毒/肠道病毒的住院率小幅增加相关。

P85 新冠病毒再次感染和复发的系统基因组学和临床分析//Cristina Rodríguez-Grande,Luis Alcalá,Agustín Estévez,等

由于缺乏包含基因组学支持的人群水平研究,很难评估新冠病毒再次感染的负担。在病毒基因分析和宿主基因分析的支持下,在西班牙马德里对新冠病毒再次感染进行了系统研究,以消除实验室错误,并区分涉及同一毒株的再次感染和复发。在2020年3月至2021年3月确诊的41 195例病例中,93例(0.23%)有2次逆转录PCR检测阳性(间隔55~346 d)。在剔除标本未保存、序列质量不佳或属于不同病例的情况后,得到22例有效数据。4例(0.01%)为同一毒株的复发;患者年龄为39~93岁,其中3例免疫抑制。18例为再次感染(0.04%);患者年龄为19~84岁,多数无相关临床病史。第1次发作病情加重的有8例。

P111 肺炎支原体全球基因组多样性与重组//Yu-Chia Hsieh,Shiao-Wen Li,Yi-Yin Chen,等

肺炎支原体对环境或生态压力的适应引起的基因组变化,知之甚少。本研究收集了2017-2020年台湾地区确诊肺炎儿童的肺炎支原体,使用全基因组测序将这些分离株与全球范围内当前和历史临床菌株库进行比较,描述种群结构特征。对284株菌株进行系统进化树分析,结果显示,所有测序菌株由5个进化枝组成:T1-1(序列型1)、T1-2(序列型以ST3为主)、T1-3(序列型ST17)、T2-1(序列型以ST2为主)、T2-2(序列型以ST14为主)。本研究鉴定出一个可能包含6个基因的重组区(MPN366-371)。每个进化枝都检测到涉及23S rRNA突变的大环内酯类耐药性。大环内酯抗性的克隆扩增主要发生在1亚型株中,其中进化枝T1-2表现出最高的重组率和基因组多样性。重组区域的功能表征阐明了这些重组事件在肺炎支原体进化中的生物学作用。

P139 2017-2019年意大利病猪猪链球菌新序列类型及耐药菌株研究//Lucilla Cucco,Marta Paniccià,Francesca Romana Massacci,等

猪链球菌是一种与猪和人类严重疾病相关的病原体。人类感染源于猪,为人兽共患病。为评估循环毒株,本研究对2017-2019年意大利病猪身上分离到的78株猪链球菌的血清型、序列类型和抗菌药物敏感性进行分析。近60%的感染是由血清型1/2和血清型9引起的。血清型2和血清型1/2的分离株除1株外均聚集在一个聚类中,而血清型9株则沿系统进化树分布。除序列类型(ST)1外,血清型2还包括ST17,该序列类型曾在1998年和2005年在中国引起严重的人感染。大部分的血清型9分离株,归类为ST123,对青霉素耐药。这种克隆株的出现影响了猪链球菌感染治疗的成功率。从猪身上分离猪链球菌株并加以鉴定,将有助于早期发现新出现的克隆株。

P166 与死亡相关的肺炎链球菌血清型,南非,2012-2018年//Annelies Müller,Jackie Kleynhans,Linda de Gouveia,等

肺炎链球菌荚膜多糖与疾病严重程度有关。本文采用向后剔除多变量logistic回归,评估了2012-2018年(疫苗时代)南非侵袭性肺炎球菌病(IPD)和脑膜炎血清型与病死率(CFR)的关系。IPD最常见的血清型为8型和19A型。在<15岁的患者中,控制混杂因素后,与8型相比,与IPD中CFR升高相关的血清型为11A、13、19F、15A和6A。这些血清型均与脑膜炎患者病死率增加无关。在>15岁的IPD患者中,15B/C型与CFR增高相关。在所有年龄的脑膜炎患者中,血清1型与CFR病死率增加相关。应监测PCV13血清型1、3、6A、19A和19F,且应考虑将血清型8、12F、15A和15B/C纳入疫苗,以减少肺炎链球菌导致的死亡。

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