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17号染色体单亲二体研究进展*

2022-02-28许晨霞彭建明

中国医学工程 2022年1期
关键词:表型单亲染色体

许晨霞,彭建明

(中山市博爱医院 产前诊断中心,广东 中山 528400)

1 概述

染色体单亲二体(uniparental disomy,UPD)从形成机制上可分为单亲同二体(uniparental isodisomy,iUPD,来自同一亲体的同一染色体)、单亲异二体(uniparental heterodisomy,hUPD,分别来自同一亲体的两条同源染色体)和混合型单亲二体(mixUPD,同一条染色体上同时存在单亲同二体和异二体)三种。UPD 主要致病机制是基因印记及隐性遗传致病基因纯合表达。孕妇高龄是UPD 的易感因素。UPD 使染色体或染色体某些片段位点上的隐性遗传致病基因纯合表达,从而导致疾病的发生。

目前通过无创产前筛查(non-invasive prenatal testing,NIPT)和有创产前诊断发现的完全型17 三体和嵌合型17 三体的病例十分少见[1-2],17 号染色体UPD 更是罕见[3]。传统概念认为,除了存在印记基因和纯合性隐性突变外,UPD 对临床表型没有很大的影响。Geneimprint 网站数据库显示,17 号染色体存在TP53(17p13.1)印记基因,同时存在其杂合性丢失(loss of heterozygosity,LOH)的记录,但尚无明确的疾病相关报道。

关于17 号染色体UPD 的发生概率,2010 年RODRÍGUEZ-SANTIAGO 等[4]研究发现其在正常人群中的发生概率:34% 的血细胞中含有17p13.2-17pter 节段性UPD;39% 的血细胞中含17p11.2-17pter 节段性UPD;28% 的血细胞中有17q21.2-17qter;21% 的血细胞中含有17q22-17qter。SASAKI 等[5]从173 个家系(trios)中鉴定出一例父源iUPD(17)(17p13.3-17p13.1),节段性UPD 发生率为0.57803%(1/173)。该区段包括233 个RefSeq 基因,但都没有印记效应[5]。根据所研究的常染色体的数据,节段性UPD 发生率是每3 806 对染色体中有1 对,其概率为0.026 27[5]。

2019 年LABRIJN-MARKS 等[6]发现,17 号染色体完全UPD 和三例片段性单亲同二体iUPD(17q)导致的庞贝氏症(Pompe disease)病例。庞贝患儿B 在染色体17q25.2q25.3 的位置上GAA 基因的第13 外显子表现为新发的纯合无义突变c.1853G>A。双亲检测结果母亲为突变基因杂合携带者,父亲未发现该突变。患儿C 存在GAA 基因第5 外显子序列改变,其先证者为致病性错义突变c.925G>A,p.(Gly309Arg)的纯合子;患儿D 表现为新发错义突变c.871C>T,p.(Leu291Phe)纯合子,其临床相关性尚不清楚。所有病例均表现为患儿母亲携带变异、父亲没有检查到突变。患儿E 临床表现为心肌肥厚,但不存在肌无力,实验室检查酸α-葡糖苷酶在白细胞中活性减低,而在体外培养的成纤维细胞中检测不到。对患儿E 的白细胞和成纤维细胞DNA 进行GAA 基因分型,在两个DNA 样本中均观察到一个正常的(母源性)和一个突变的(父源性)等位基因,其先证者为致病性错义突变体c.925G>A,p.(Gly309Arg)。UPD(17)病例占纯合子糖原贮积病Ⅱ型(Pompe 病)的11%。全球新生儿罹患机率约在1∶40 000 或0.0025% 左右,不同的地区有所差异,例如在非洲裔的美国人中,发生率略高约为1∶14 000;而在中国的发生率则约为五万分之一[6]。

DNA 准确诊断依赖于家系的检测。轻度或异常的常染色体隐性遗传病表型应注意嵌合节段性iUPD 的可能性。

2 临床特征

GENUARDI 等[3]在羊水培养中发现的1 例17号染色体母源性UPD(mat UPD17)病例,2 岁随访未见生长与心理异常,通过淋巴细胞微卫星技术及11 个markers 家系确认了17 号染色体来源于其母亲。胎儿17 号染色体着丝粒区域纯合、远端杂合证明减数分裂二期不分离。三体自救形成UPD 及部分母源性17 号同源UPD。考虑17 号染色体着丝粒区域可能不包含与生长发育相关的重要印记基因。

LEBRE 等[7]报道一名mat UPD17 的两岁半女童,其临床表型为肾病型胱氨酸病。该女童17 号染色体存在57 kb 纯合性缺失,缺失片段包括了CTNS 基因,这种病例常见于欧洲人群。先证者的母亲为杂合性缺失,而父亲没有携带这种缺失。用横跨整条17 号染色体多态性标记进行了单倍型分析,结果显示17 号染色体长臂和短臂近端一半的区域存在两个母源性等位基因,但没有父源性等位基因,在17 短臂末端只有一个母源性等位基因。这些结果提示女童17 长臂和短臂近端存在母源性单亲异二体,17 短臂远端存在母源性单亲同二体。该研究首次在胱氨酸病中发现了17 短臂母源性单亲同二体。

NATSUGA 等[8]发现1 例父源性iUPD17(pat iUPD17),该患儿由于17q25.1 区域的基因ITGB4突变出现罕见的隐性遗传病交界性大疱性表皮松懈症(epidermolysis bullosa,EB)。

SASAKI 等[5]从173 个家系中(trios)鉴定出一例父源性节段性iUPD17(17p13.3-17p13.1)。该名男性表型正常,据此推测pat iUPD17(17p13.3-17p13.1)是被人体耐受的。

LIEHR 等[9]报道1 例完全性和1 例节段性母源性UPD(17),未发现被iUPD 激活的基因。

LABRIJN-MARKS 等[6]发现1 例17 号染色体完全UPD 和3 例片段性单亲同二体导致的庞贝氏症。该文中患儿B、C、D 均是mat UPD,患儿B父母系堂兄妹近亲结婚,3 岁时体外培养成纤维细胞缺乏酸性α-糖苷酶;患儿C 出生后6 周5 天因呼吸困难住院,随后在体外培养的成纤维细胞缺乏酸性α-葡糖苷酶而诊断为庞贝疾病,该患儿因心肌病和肝脾肿大,入院后第11 天开始肌酶替代治疗,但因病情恶化于3 周后死亡;患儿D 是一名斯堪的纳维亚混合血统儿童,16 个月时因肥厚型心肌病和广义肌无力、酸性α-葡糖苷酶不足被诊断患有庞贝病,从17 个月大时开始接受肌酶治疗;患儿E 是pat UPD,其母亲自然受孕后顺产,产前超声怀疑有持续性的左上腔静脉,患儿在2岁5 个月时心脏超声检查发现左心室肥厚,后来发展为双心室心肌肥厚。该患儿运动发育和力量正常,不存在肌无力和其他临床症状,该案例特殊。患儿具体临床特征以及预后见表1。

表1 17 号染色体单亲二倍体临床表现及预后

3 治疗与预后

目前对于UPD 尚无特效治疗方法,应加强对患儿的护理,对症支持治疗,做好产前诊断显得尤为重要。

Mat iUPD(17)导致的17p13.2 肾病型胱氨酸病,应主要防治胱氨酸结石的形成及其并发症。pat iUPD(17)患儿其17q25.1 的基因ITGB4 发生突变,导致的各型遗传型交界性EB,目前均无特效治疗方法,其中全身性和产生合并症的患儿预后较差,局限性、病情轻的患儿预后尚好。庞贝氏症婴儿型一般预后不良,无法如期达到发育的标准,晚发型预后较好庞贝氏症则使用Myozyme(美国Genzyme 公司)药物治疗,但由于只是替代治疗,目前并不能从根本上治愈该疾病,而且由于其价格昂贵,普通家庭的经济情况基本难以支持该药物的使用。

4 实验室检查

常规染色体核型分析可以检测染色体数量和大片段结构畸变,但不能识别单亲二倍体。短串联重复序列(short tandem repeat,STR)分布于整个人类基因组,平均每15 kb 就存在一个STR 基因座,其分布广泛、信息量大、易于检测,是继限制性片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)之后的第二代遗传记,可用于UPD 的来源分析。单核苷酸多态性-微阵列技术(single nucleotide polymorphism array,SNP-array)是最近几年新兴的一种检测方法,由于其省去了复杂繁琐的培养环节、分辨率高(核型分析的近千倍),可以发现拷贝数的改变和杂合性丢失,结合父母双亲的SNP-array 技术能够检测UPD,因此日益受到临床的重视和欢迎。不过受限于其技术原理,无法发现探针未覆盖区域的染色体畸变,故而限制了发现新染色体疾病的可能。目前常用的诊断技术还包括特异性甲基化检测、全外显子测序和全基因组测序。当能够根据临床表型预测到具体的UPD 时,可以用STR 或者特异性甲基化检测;当难以预测或欲查找隐性基因具体突变位点时,可用测序的方法。无论哪种检测方法,最好能够同时检测父母双方的基因组,以便核对验证及指导后续生育。

5 再发风险评估及遗传咨询意见

有研究表明UPD 的发生率大约为1/3 500 到1/5 000,最近NAKKA 等[10]对440 多万份样本研究后发现,UPD 在活产儿中的发生率可达1/2 000。完全性17 号染色体的UPD 非常罕见,极少的病例是节段性UPD(17)。完全性UPD 的发生机理包括3 种:①三体自救;②配体互补;③有丝分裂复制。理论上由三体自救发生单亲二倍体的概率是1/3。片段性UPD 既可以发生在生殖细胞减数分裂过程,也可发生在体细胞有丝分裂过程。与完全性UPD 一样,当染色体片段或位点具有基因组印迹效应,片段性UPD 就会导致疾病发生。运用上述分子技术以确定UPD 的染色体来源,对于评估疾病的再发风险的评估有一定帮助。但是总的来说,由于UPD 在家族内重复出现的风险非常低,作为上述情况引起的隐性疾病,其复发风险与双亲携带者遗传的25% 相比微不足道。17 号染色体UPD 的临床表型可以从完全没有症状到有致死性的临床表型,这样也就大大增加了遗传咨询的难度,只能根据已有的病例来给出合适的建议。

17 号染色体单亲二倍体是微结构异常病,诊疗过程通常包括以下环节:①如果有先证者,详细询问先证者的症状学特征及遗传家族史。②是否为近亲结婚,如近亲结婚则17 号染色体单亲二倍体发生率提高。③发生在17q25.2-q25.3、17p13.2、17q25.1 区域的单亲二倍体则可能出现表1中的临床表现,建议密切超声监测,并告知其父母。④如发现胎儿为17 号染色体单亲二倍体,知情同意后其父母做进一步分子遗传学检测,以确定胎儿17 号染色体单亲二倍体的来源。⑤对遗传诊断明确发生在上述区域的17 号染色体的单亲二倍体,有再生育要求的家系进行产前诊断,根据结果进行遗传咨询。⑥根据患儿病情制定治疗方案。

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