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长链非编码RNA ELFN1-AS1在结直肠癌患者血清中的表达及临床意义*

2022-02-11董利阳徐小卫郑婷婷刘佳梦毛朝明

国际检验医学杂志 2022年2期
关键词:生存率试剂盒引物

董利阳,徐小卫,郑婷婷,刘佳梦,毛朝明

江苏大学附属医院核医学科,江苏镇江 212002

2018年全球肿瘤流行病学调查显示,结直肠癌的发病率在全球恶性肿瘤中排第3位,在肿瘤病死率中排第2位[1]。研究表明,结直肠癌患者的生存率与疾病分期明显相关,Ⅰ~Ⅱ期患者的整体生存率约为90%,Ⅲ期约为71%,Ⅳ期约为14%[2]。显然,早期发现对提高结直肠癌患者的整体生存率具有重要的临床意义。长链非编码RNA(lncRNA)是一种长度大于200 nt且蛋白质编码能力有限的RNA。研究发现,lncRNA在多种类型的肿瘤组织中表达异常,且影响肿瘤的发生、癌变和转移[3]。lncRNA亦在血液样品中稳定表达,显示出作为新型肿瘤标志物的潜能,而将循环lncRNA作为癌症诊断的标志物已在肺癌、肝癌、乳腺癌中被报道[4]。lncRNA ELFN1-AS1是一种新近发现的lncRNA,位于ELFN1基因的反义位置[5]。GEPIA数据库分析发现,结直肠癌患者结肠病灶中lncRNA ELFN1-AS1高表达,并与患者总生存率降低密切相关[6]。笔者先前对22例结直肠癌患者结肠和其邻近组织中lncRNA ELFN1-AS1测定时发现,lncRNA ELFN1-AS1水平在结直肠癌组织中明显升高。体外细胞实验发现,ELNF1-AS1的敲除明显抑制了结直肠癌细胞株的生长和迁移,提示lncRNA ELFN1-AS1失调在结直肠癌发展中发挥关键作用[7]。本研究旨在探究lncRNA ELFN1-AS1在结直肠癌患者血清中的表达及临床意义,以期为结直肠癌的早期诊断提供新策略。现报道如下。

1 资料与方法

1.1一般资料 选取2019年9月至2021年2月于本院胃肠外科和肿瘤科诊治的结直肠癌患者50例作为结直肠癌组。纳入标准:(1)病理学检查明确诊断;(2)为初次诊治,无放疗、化疗及靶向抗癌治疗史。排除标准:(1)合并其他肿瘤;(2)既往有结直肠肿瘤史,并接受抗肿瘤治疗;(3)患有精神疾病或存在严重的心、肝、肺等其他重要脏器疾病。收集同期本院体检健康者40例作为对照组。结直肠癌组男30例,女20例;年龄<60岁患者17例,≥60岁33例。对照组男25例,女15例;年龄<60岁13例,≥60岁27例。结直肠癌组和对照组性别、年龄比较差异均无统计学意义(P>0.05)。本研究通过本院医学伦理委员会批准,研究对象均知情同意。

1.2仪器与试剂 MolPure®Blood RNA提取试剂盒(上海YEASEN公司),lncRNA ELFN1-AS1及18S real-time PCR引物(广州复能基因公司),All-in-one First-Strand cDNA Synthesis反转录试剂盒及All-in-oneTMqPCR Mix实时荧光定量试剂盒(广州复能基因公司),NnoDrop ONE微量紫外分光光度计(美国Thermo公司),普通PCR仪(美国Bio-Rad公司),QuantStudio 5实时荧光定量PCR仪(美国Thermo公司)。

1.3方法

1.3.1标本采集 采集所有研究对象的空腹静脉血5 mL(结直肠癌患者于手术前采集,体检健康者于体检时采集),置于含促凝胶的真空采血管中,2 000 r/min离心10 min,吸取上层血清置于无RNAse的1.5 mL EP管中并于-80 ℃冰箱保存备用。同时获取结直肠癌患者临床资料用于分析。

1.3.2血清总RNA的提取 按照MolPure®Blood RNA试剂盒说明书提取血清总RNA,简化步骤如下:血清样品用裂解液LB充分裂解后加入氯仿,混匀后12 000 r/min离心,取上层水相并加入无水乙醇(混合液),将混合液置于RNA吸附柱并离心,经过去蛋白液及漂洗液洗涤后收集RNA。应用NnoDrop ONE测定RNA浓度及纯度。

1.3.3反转录 按照反转录试剂盒说明书将获取的合格RNA反转录为cDNA,反应条件为37 ℃ 60 min, 85 ℃ 5 min,用DEPC水2倍稀释cDNA后置于-20 ℃冰箱保存。

1.3.4实时荧光定量PCR 荧光定量PCR总反应体系为20 μL,包括2 μmol/L上、下游引物各2 μL,2×All-in-One qPCR Mix 10 μL,cDNA 2 μL,ddH2O 4 μL。循环参数:95 ℃预变性10 min,95 ℃变性10 s,60 ℃退火 20 s,72 ℃延伸 15 s(采集荧光信号),共40个循环。lncRNA ELFN1-AS1:正向引物5′- CCT GAT GTT CTG CTT GGT TAT-3′,反向引物5′-ACA CAG CTC CTG CTC TTG-3′;18S(内参基因):正向引物5′-ACA GGA TTG ACA GAT TGA-3′,反向引物5′-TAT CGG AAT TAA CCA GAC A-3′。使用QuantStudio Design Software v1.4.3进行熔解曲线分析,评测PCR产物的特异度。采用2-ΔΔCt法计算lncRNA ELFN1-AS1的相对表达水平,公式为ΔΔCt=结直肠癌(Ct目的-Ct内参)-健康对照(Ct目的-Ct内参)。

1.4统计学处理 采用SPSS22.0软件进行统计分析。数据为非正态分布,以M(P25,P75)表示,组间比较采用Mann-WhitneyU检验。采用受试者工作特征(ROC)曲线评价lncRNA ELFN1-AS1对结直肠癌的诊断价值。以P<0.05为差异有统计学意义。

2 结 果

2.1结直肠癌组与对照组血清lncRNA ELFN1-AS1检测结果 结直肠癌组血清lncRNA ELFN1-AS1的相对表达水平[2.291(1.23,4.55)]明显高于对照组[0.46(0.13,1.27)](Z=-5.209,P<0.001),见图1。

图1 血清lncRNA ELFN1-AS1在对照组与结直肠癌组中的相对表达水平

2.2血清lncRNA ELFN1-AS1相对表达水平与结直肠癌患者临床病理参数关系 将血清lncRNA ELFN1-AS1相对表达水平与结直肠癌患者性别、年龄、肿瘤部位、肿瘤最大径、淋巴结转移、远处转移状态、TNM分期进行分析,结果发现血清lncRNA ELFN1-AS1相对表达水平在不同淋巴结转移、远处转移状态及TNM分期患者之间差异有统计学意义(P<0.05),而在不同性别、年龄、肿瘤部位、肿瘤最大径患者之间差异均无统计学意义(P>0.05),见表1。

表1 血清lncRNA ELFN1-AS1相对表达水平与结直肠癌患者临床病理参数的关系[M(P25,P75)]

2.3血清lncRNA ELFN1-AS1检测对结直肠癌的诊断价值 绘制ROC曲线评估lncRNA ELFN1-AS1对结直肠癌的诊断效能,结果表明lncRNA ELFN1-AS1的ROC曲线下面积(AUC)为0.821(95%CI:0.734~0.908),当最佳截断值为1.465时,其诊断结直肠癌的灵敏度为74.0%,特异度为82.5%,见图2。

图2 血清lncRNA ELFN1-AS1诊断结直肠癌的

3 讨 论

近年来,lncRNA被报道参与了结直肠癌的发生过程[8]。研究表明,lncRNA ELFN1-AS1不仅参与结直肠癌的发生,且在细胞迁移及肿瘤侵袭中发挥重要作用。LEI等[9]发现,lncRNA ELFN1-AS1在结直肠癌肿瘤组织中的表达水平明显高于邻近癌旁正常组织,lncRNA ELFN1-AS1表达水平较高的患者生存率明显降低。DU等[10]发现,lncRNA ELFN1-AS1可以海绵样吸附miR-191-5p,从而释放特殊AT丰富序列结合蛋白1(SATB1)的促癌作用促进结直肠癌的生长及转移。笔者前期发现,lncRNA ELFN1-AS1通过激活Erk及EMT信号通路,促使结直肠癌细胞的增殖和迁移[7]。本研究结果提示,结直肠癌组血清中可稳定表达lncRNA ELFN1-AS1,且其相对表达水平明显高于对照组,血清中lncRNA ELFN1-AS1相对表达水平在不同性别、年龄、肿瘤部位、肿瘤最大径患者之间差异无统计学意义(P>0.05),但在不同临床TNM分期、不同淋巴结转移和远处转移状态患者之间差异有统计学意义(P<0.05),提示lncRNA ELFN1-AS1可能成为诊断结直肠癌的生物学标志。

癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析发现,结直肠组织(结直肠癌227例,正常对照26例)中lncRNA ELFN1-AS1的表达具有诊断结直肠癌的潜在价值,其诊断结直肠癌的灵敏度为87.6%,特异度为100.0%[11]。本研究结果显示,血清lncRNA ELFN1-AS1诊断结直肠癌的AUC为0.821,当最佳截断值取1.465时,灵敏度和特异度分别是74.0%、82.5%,进一步表明lncRNA ELFN1-AS1对诊断结直肠癌的重要价值。鉴于血清学的取材方便、无创性的特点,血清lncRNA ELFN1-AS1在结直肠癌筛查中可能更具明显优势。

lncRNA ELFN1-AS1表达水平在结直肠癌患者血清中明显升高,其表达水平与肿瘤转移和TNM分期有关,有望成为结直肠癌诊断的重要指标之一。但由于本研究样本量较小,仍需要进行大规模多中心临床研究来验证其有效性。

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