APP下载

基于深度学习的乳腺DCE-MRI图像推演模型的构建

2021-11-22王苹苹王丽芳党艳莉朱开国陈宝莹

肿瘤影像学 2021年5期
关键词:伪影造影剂乳腺

王苹苹,聂 品,王丽芳,党艳莉,朱开国,陈宝莹

1.西安国际医学中心医院临床实验中心,陕西 西安 710700;

2.西安国际医学中心医院影像诊疗中心,陕西 西安 710700

乳腺癌已经成为女性发病率最高的恶性肿瘤,并且发病率在世界范围内持续增长,严重威胁女性的健康[1-2]。磁共振成像(magnetic resonance imaging,MRI)筛查乳腺能发现更多的早期肿瘤[3-4],显著降低乳腺癌死亡率[5-7]。多个指南[8-9]均建议高危人群除须进行乳腺X线摄影筛查外,还应补充乳腺MRI筛查。但传统完整的乳腺MRI检查须进行平扫及多期动态对比增强MRI(dynamic contrast-enhanced MRI,DCEMRI),价格贵、耗时长、技术要求高,以及存在造影剂过敏风险及造影剂导致的不良反应等问题[10]。非增强简化乳腺MRI方案的提出有效缩短了扫描时间,降低了费用,且避免了造影剂的使用,但由于缺少增强序列图像,筛查的敏感性及准确性尚无法确定[11]。因此,亟须寻找一种新型技术方法,实现在无实际扫描的情况下,获取增强图像,来有效弥补非增强简化序列中信息的缺失。

近年来,生成对抗网络(generative adversarial networks,GAN)在医学图像中的应用,为提高医学图像质量及实现图像模态间的转换提供了新思路[12-14]。Huang等[15]利用上下文感知的GAN,实现了运用脑部MRI的T1加权成像(T1-weighted imaging,T1WI)图像推演生成T1WI增强、T2加权成像(T2-weighted imaging,T2WI)及T2液体抑制反转恢复(fluid-attenuated inversion recovery,FLAIR)序列图像,有效证明了GAN算法在医学图像合成中的潜在价值。此外,已有研究[16-17]证明GAN模型可以将低剂量计算机体层成像(computed tomography,CT)图像转换为正常剂量CT图像。虽然推演技术在医学影像领域已经取得了一定的成果,但准确度有待提高,同时生成的图像质量仍不能满足临床需求。另外,现有研究[15-17]多集中在脑部MRI、CT等方面,乳腺MRI图像模态间的转换研究未见报道。本研究旨在探究利用GAN实现乳腺MRI平扫图像合成DCE-MRI图像的可行性。在这里,我们拟利用深度学习Pix2Pix算法[18]构建乳腺DCE-MRI图像推演模型,使其能够利用T1WI序列图像合成DCE序列图像,以期补充非增强简化序列中信息的缺失。

1 资料和方法

1.1 研究对象

收集2020年1月—2021年8月在西安国际医学中心医院行乳腺MRI检查的54例女性患者的临床信息及乳腺MRI图像资料,随机分为训练集(38例)、测试集1(8例)及测试集2(8例)。纳入标准:① 具有完整的乳腺MRI序列;② MRI图像无严重运动伪影、磁敏感伪影或其他伪影;③ 未进行乳房切除手术、乳房整形手术及其他治疗。排除标准:① 乳腺MRI序列不完整;② MRI图像有严重运动伪影、磁敏感伪影或其他伪影导致无法分析;③ 行乳房切除手术或整形手术的患者;④ 乳腺癌新辅助治疗、放疗等治疗后的患者。本研究经西安国际医学中心医院伦理委员会批准,按照《赫尔辛基宣言》的原则进行。

1.2 仪器与图像采集

1.2.1 仪器

采用德国Siemens公司的Magenatom Prisma 3.0 T MRI仪行乳腺MRI检查,使用18通道专用乳腺相控阵线圈进行数据采集。

1.2.2 图像采集

患者采取俯卧位,足先进。平扫使用T1 快速小角度激发(fast low angle shot,FLASH)3D序列,T2最优可变翻转角改善对比完美采样(sampling perfection with application optimized contrast using different flip angle evolution,SPACE)精准频率反转恢复(spectral adiabatic inversion recovery,SPAIR)序列;弥散使用Zoomit弥散加权成像(diffusion weighted imaging,DWI)序列,b值选用0和1 000 s/mm2;增强采用容积内插屏气扫描(volumetric interpolated breath-hold examination,VIBE)序列,蒙片后扫描6期,单期时长111 s,造影剂使用钆贝葡胺注射液,注射剂量为0.2 mmol/kg并等量注射生理盐水,注射速率为2 mL/s。各序列扫描基本参数设置见表1。

表1 扫描序列基本参数设置表

1.3 深度学习模型

1.3.1 图像预处理

本研究采集的MRI原始图像均为DICOM格式;首先,将图像转换为PNG格式,且图像尺寸不变,即384 mm×384 mm;然后利用Min-Max方法对图像进行归一化处理,使得归一化后的图像像素调整到[-1,1]范围;最后,对图像进行旋转、裁剪和镜像操作,来扩展训练数据集。

1.3.2 推演模型构建

本研究采用Pix2Pix算法,使用训练集中的3 000对预处理后的DCE-MRI图像来训练乳腺DCE-MRI图像推演模型,学习T1WI序列图像与DCE序列第一期图像间的映射关系,从而使训练后的模型能够利用T1WI序列图像生成对应的DCE序列第一期图像。在模型训练过程中,我们使用Adam优化器优化目标损失函数,且每次训练都对目标函数进行更新,直到收敛。

1.3.3 模型性能评估

在测试集中利用乳腺DCE-MRI图像推演模型合成DCE第一期图像及序列,并分别通过峰值信噪比(peak signal to noise ratio,PSNR)、结构相似性(structural similarity,SSIM)、均方误差(mean square error,MSE)、平均绝对误差(mean absolute error,MAE)指标[19]对模型性能进行客观评估;另外,使用Pearson相关性分析来评估合成的DCE序列与原始的DCE序列间的相关性。

1.4 统计学处理

连续变量采用±s来表示;另外,采用Pearson相关性来分析合成的DCE序列与原始序列的相关性。

2 结 果

2.1 模型合成DCE图像的性能

首先,评估模型合成DCE图像的性能。在测试集1中随机选取了760张T1WI图像(来自8例患者),利用推演模型合成其对应的第一期DCE图像,合成图像的PSNR、SSIM评估结果见表2。结果显示,合成图像与原始图像具有较高的SSIM,且信息损失较低。

表2 模型合成DCE图像的性能评估结果

2.2 合成DCE序列的重建误差

评估模型合成第一期DCE序列的性能。图1展示了对测试集2中每个受试者合成的第一期DCE序列的重建误差分布情况,表3为合成的DCE序列的总体重建误差。可以看出,合成的DCE序列与其原始DCE序列相比具有较小的重建误差。

表3 合成的DCE序列的总体重建误差

图1 合成的第一期DCE序列重建误差分布图

2.3 相关性分析结果

评估合成的DCE序列与原始DCE序列间的相关性。如图2所示,箱形图展示了患者的合成序列与原始序列间相关性分布。结果显示,合成的第一期DCE序列与其原始DCE序列间均存在高度正相关,其中,合成的第一期DCE序列与原始DCE序列间相关性的平均值为r=0.872±0.038(95% CI:0.870~0.874,P=0.000)。

图2 合成的第一期DCE序列与真实DCE序列相关性分析结果

另外,如图3所示,图3A为合成的DCE第一期图像,图3B为原始的DCE第一期图像。合成的DCE图像在心脏及大血管中得到了显著的增强,且具有与原始DCE图像相似的背景实质增强及病灶增强。

图3 DCE第一期图像示例

3 讨 论

本研究利用Pix2Pix算法构建乳腺DCE-MRI图像推演模型,开发了利用T1WI序列推演合成DCE序列第一期图像的新技术。并且,我们发现通过该模型合成的DCE序列图像与原始的DCE序列图像具有很高的结构相似性、较低的信息丢失和重建误差。另外,合成的DCE序列与原始的DCE序列存在高相关性(r=0.872±0.038,95% CI:0.870~0.874,P=0.000)。由此可见,本研究构建的乳腺DCE-MRI图像推演模型可以生成逼真的DCE序列图像。

本研究构建的乳腺DCE-MRI图像推演模型为无须实际扫描即可获取DCE序列图像提供了一种新思路,通过该方式可以有效避免造影剂的使用,且补充非增强简化序列中缺失的信息,缩短检查时间,减少花费,对提高乳腺MRI的普适性具有重要意义。虽然不少研究者[20-21]已经利用深度学习方法实现了医学图像模态间的转换,但乳腺MRI图像存在像素分布不均匀等问题,且利用乳腺MRI平扫序列推演DCE序列的研究未见报道。本研究首次提出利用GAN算法,使用平扫图像推演生成DCE-MRI序列第一期图像,证明了其可行性,为拓宽深度学习在乳腺MRI模态间转换奠定了基础。

本研究的局限性在于仅在较小样本的数据集上构建了乳腺DCE-MRI图像推演模型;但值得肯定的是,该模型已经可以合成逼真的DCE序列图像。我们将在后续研究中扩大样本量来训练模型,以期提高性能。另外,本研究仅在回顾性数据集中验证了模型性能,在接下来的研究中,我们会进一步进行前瞻性研究来验证其性能。

总之,本研究利用Pix2Pix算法构建了乳腺DCE-MRI图像推演模型,该模型实现了利用T1WI图像合成DCE序列第一期图像的技术。合成的DCE序列图像与原始的DCE序列图像具有较高的SSIM、较低的信息损失及重建误差。该方法为有效避免造影剂的使用、补充非增强乳腺MRI简化序列中信息的缺失奠定了基础,同时能有效地缩短检查时间,减少花费,对提高乳腺MRI的普适性,尤其是促进乳腺MRI筛查的普及提供了很重要的思路。

猜你喜欢

伪影造影剂乳腺
Optima CT 660间歇性环形伪影故障分析
基于高频超声引导的乳腺包块导丝定位在乳腺病变中的诊断价值
乳腺结节状病变的MRI诊断
循证护理在增强CT检查中减少造影剂外漏发生的作用
乳腺超声检查诊断乳腺肿瘤的特异度及准确率分析
研究3.0T磁共振成像伪影的形成及预防
造影剂肾病的研究进展
研究3.0T磁共振成像伪影的形成及预防
张惠灏:乳腺肿瘤重在预防
“造影剂肾病”你了解吗