宿州市新冠肺炎疫情不同防控阶段核酸检测结果分析
2021-09-07胡雪影张玲李垚陈樱玮赵娟娟
胡雪影,张玲,李垚,陈樱玮,赵娟娟
宿州市疾病预防控制中心,安徽 宿州 234000
新型冠状病毒肺炎(以下简称新冠肺炎)是由新型冠状病毒感染引起的急性呼吸道传染病,临床主要表现为发热、干咳、乏力等症状,后期可加速进展为急性呼吸窘迫综合征、脓毒症休克、出凝血功能障碍等多器官衰竭[1]。新型冠状病毒属于β冠状病毒,主要经呼吸道飞沫传播和接触传播,在一定条件下也存在经气溶胶传播的可能,另外也有报道认为该病毒存在粪-口传播的可能[2-3]。目前,实时荧光RT-PCR检测病毒核酸仍是临床确诊的金标准[4]。2020年1月24日,宿州市报告了该市首例新冠肺炎病例,为了解新冠肺炎不同防控阶段核酸检测结果的差异,本文对宿州市新冠肺炎流行情况及其核酸检测情况进行分析,报道如下。
1 材料与方法
1.1样本来源 2020年1月22日—2月29日,采集有湖北省旅居史人员、宿州市新冠肺炎各定点医疗机构发热门诊留观患者以及新冠肺炎确诊病例和疑似病例密切接触者的咽拭子和痰液。各类样本由县(区)疾病预防控制中心按照实验室生物安全相关要求运送至宿州市疾病预防控制中心实验室进行检测。
1.2资料来源 病例个案信息来自中国疾病预防控制信息系统,新冠病毒核酸检测数据来自宿州市疾病预防控制中心实验室。
1.3防控阶段 根据病例的流行病学特征以及采取的防控措施,宿州市新冠肺炎疫情大致分为四个阶段:第一阶段是2020年1月22日—28日,以输入性病例及其家庭内密切接触者感染为主,该阶段检测对象主要是有症状的湖北省旅居史人群及密切接触者;第二阶段是2020年1月29日—2月7日,辖区出现病例所在家庭内、外的密切接触者聚集性感染,该阶段检测对象主要包括有湖北省旅居史人员、密切接触者和部分发热门诊留观人员等重点人群;第三阶段是2020年2月8日—16日,病例主要是有湖北省旅居史人员及其密切接触者,此阶段主要采取扩大人群检测策略;第四阶段是2020年2月17日—29日,除1例湖北省武汉市输入性病例外,无新增本地确诊病例,此阶段继续采取扩大人群筛查策略。
1.4检测方法 采用实时荧光RT-PCR技术检测样本中的新冠病毒核酸。按照新型冠状病毒感染的肺炎实验室检测技术指南(第二版)[5]推荐,选用针对新型冠状病毒的开放读码框、核壳蛋白基因区域的引物和探针。严格按照核酸检测试剂盒的说明书进行操作和结果判读。
1.5主要试剂与仪器 采用上海伯杰BG-Flex-48核酸提取仪和台湾圆点全自动核酸提取仪进行核酸提取。采用ABI公司7500 PCR仪及赛默飞Q7 PCR仪进行产物扩增分析。新冠病毒核酸检测试剂盒购自上海捷诺及伯杰生物医疗科技有限公司,所有检测试剂均在有效期内使用。
1.6统计分析 使用Excel 2010录入数据并进行统计分析,描述不同防控阶段、不同检测人群、不同类型样本的实验室检测结果。
2 结 果
2.1一般情况 2020年1月22日—2月29日,共检测704人,检出新冠病毒核酸阳性者46例,阳性检出率为6.53%(46/704);累计采集1 182份样本,新冠病毒核酸检测阳性样本59份,样本阳性检出率4.99%(59/1 182),其中咽拭子样本检测阳性率为4.46%(45/1 010),痰液样本检测阳性率为8.14%(14/172)。46例新冠病毒核酸阳性者(以下统称为感染者)中,确诊病例41例,无症状感染者5例;湖北输入性感染者27例,本地感染者19例;男性25例,女性21例,男女性别比为1.19∶1;平均年龄(37.52±15.22)岁,其中最大67岁,最小9岁。
2.2新冠病毒核酸检测阳性病例数时间分布 宿州市从2020年1月24日首次检出新冠病毒核酸阳性样本开始,1月26日、1月31日及2月10日出现病例高峰,之后除了2月24日一例输入性病例检测阳性之外,未再检出阳性样本。见图1。
2.3不同防控阶段新冠病毒核酸检测情况 宿州市自开展新冠病毒核酸检测以来,新冠病毒核酸检测阳性率最高的阶段是在第一阶段(14.81%,12/81),其次是第二阶段(6.17%,24/389)和第三阶段(5.71%,22/385),最低的是第四阶段(0.31%,1/327)。见表1。
表1 宿州市不同防控阶段新冠病毒核酸检测情况
2.4不同重点人群新冠病毒核酸检测情况 有湖北省旅居史人员共检测306份样本,核酸检测阳性率为10.13%;密切接触者共检测727份样本,核酸检测阳性率为3.85%;本地发热门诊留观患者的149份样本中均未检出新冠病毒核酸阳性。见表2。
表2 宿州市不同防控阶段重点人群新冠病毒核酸检测情况
2.5感染者检出次数及样本类型 46例感染者中,82.61%(38/46)的感染者在首次采样检测中检出新冠病毒核酸阳性,10.87%(5/46)的感染者在第二次采样检测中检出阳性,有6.52%(3/46)的感染者经过3~4次采样检出阳性;37例感染者咽拭子样本核酸检测阳性,9例感染者痰液样本核酸检测阳性。
3 讨 论
从宿州市疫情不同防控阶段检测结果来看,新冠病毒核酸检测阳性率最高的是第一阶段,样本阳性检出率达14.81%,该阶段有症状的有湖北省旅居史人员和密切接触者样本阳性检出率分别达到16.32%和16.00%,原因一方面是春节前湖北返宿、来宿人员增加并陆续发病,另一方面是密切接触者居家隔离、自我管控不到位,导致部分密切接触者在居家隔离的过程中出现再传播,因此该阶段感染的密切接触者主要是家庭内成员。其次是第二阶段,核酸阳性率达6.17%,检测对象主要包括有湖北省旅居史人员、密切接触者和部分发热门诊留观人员等重点人群,样本阳性检出率较第一阶段有所下降。该阶段对重点人群落实集中隔离措施,尽管出现了本地家庭内、外传播的病例,但最大程度降低了再传播的风险。疫情防控第三阶段核酸阳性率达5.71%,此阶段主要采取扩大检测范围的策略,把所有可能有感染风险的人群均纳入检测范围,切实做到“早发现、早报告、早隔离、早诊断、早治疗”;尤其把“湖北武汉等疫情较重地区来宿正在居家观察但未满8天的人员”和“2月3日以来发热就诊病人凡有湖北武汉等重点地区旅居史的人员”纳入扩大检测范围后,有湖北省旅居史人群的样本阳性检出率(14.52%)较第二阶段(7.74%)有所上升,有助于及时发现风险,避免疫情扩散。疫情第四阶段基于前期对各类重点人群的扩大检测、限制人员流动、关停部分公共场所、加强个人防护等措施的落实,除2月24日有1例武汉返宿的输入性病例外,未再检出阳性,提示宿州市在疫情不同发展阶段,及时调整核酸检测策略并制定针对性防控措施是科学有效的。
从不同人群样本的新冠病毒核酸检测情况来看,有湖北省旅居史人员样本阳性检出率最高,其次是密切接触者,而本地发热门诊留观患者的样本中未检出新冠病毒核酸,提示宿州市新冠患者主要以有湖北尤其武汉旅居史的人员及其密切接触者为主。另外,有6.52%(3/46)的感染者经过3~4次采样才检出阳性,这些感染者临床症状不典型,但均有确切的湖北武汉旅居史等流行病学史,针对这类人群,宿州市在国家方案要求至少间隔24 h再次进行1次检测的基础上,增加采样检测次数,提高检出率。国内也曾报道经7次核酸检测才检出阳性的病例[6],原因可能主要与感染者机体内的病毒载量相关,潜伏期病毒载量低,检测假阴性高,多数病例需要多次检测才能检出阳性[7-8];也可能与标本采集、核酸提取过程、试剂盒保存和运输等环节有关[9],实验室诊断只能作为新冠病毒检测的重要手段之一,不能孤立地据此进行感染的排查[10]。因此,对于有流行病学史的人员,即便临床症状不典型,也不能放松警惕,可增加采样次数或增加检测样本类型。
宿州市在新冠肺炎疫情不同防控阶段采取了不同的核酸检测策略,新冠病毒核酸阳性检出率也明显不同。在疫情发展的初始阶段检测的主要是有症状的重点人群,随着对新冠病毒和新冠肺炎疾病认识的不断深入,扩大检测范围覆盖到各类有感染风险的人群。虽然新冠病毒核酸阳性检出率呈逐步下降趋势,但宿州市把有潜在传播风险的人群均纳入管控范围中,实施集中隔离医学观察,最大限度降低疾病传播的风险,有效控制了疫情。