MYB转录因子在水稻抗逆基因工程中的研究进展
2021-06-30董勤勇张圆圆魏景芳朱昀
董勤勇 张圆圆 魏景芳 朱昀
摘要: 干旱、寒冷、高盐以及病虫害胁迫是造成水稻减产的重要因素。近年来,植物特异性转录因子在水稻抗旱、抗寒、抗盐以及抗病虫害胁迫机制上扮演着重要角色。MYB转录因子是植物最大的转录因子家族之一,其结构高度保守,常见1R-MYB/MYB-related、R2R3-MYB、3R-MYB以及4R-MYB 4种结构类型。MYB转录因子主要参与植物生长发育、生物以及非生物胁迫的应答过程。本文就MYB转录因子的结构特征、分类以及在水稻(Oryza sativa)生物及非生物胁迫中的应答进行综述,为MYB转录因子的研究及植物抗逆新品种培育提供参考。
关键词: MYB转录因子;生物胁迫;非生物胁迫
中图分类号: S511.035.3 文献标识码: A 文章编号: 1000-4440(2021)02-0525-06
Abstract: Stresses from drought, cold, high salinity, diseases and pests are important factors leading to the reduction of rice yield. In recent years, plant-specific transcription factors played important roles in the mechanisms of drought resistance, cold resistance, salt resistance, diseases resistance and pests resistance of rice. MYB transcription factors family was one of the largest transcription factors families in plants. It was highly conserved in domains, and four kinds of common structure types were 1R-MYB/MYB-related,R2R3-MYB,3R-MYB and 4R-MYB. MYB transcription factors mainly involved in the growth and development of plants, response processes under biological and abiotic stresses. This paper summarized the structural characteristics and classification of MYB transcription factors as well as their responses to biological and abiotic stresses in Oryza sativa to provide reference for the research on MYB transcription factors and the cultivation of new plant varieties against stresses.
Key words: MYB transcription factor;biotic stress;abiotic stress
植物在田間会遭受干旱、寒冷、高盐等非生物胁迫以及包括害虫和病原体在内的生物胁迫。植物自身具备应对复杂胁迫反应的机制与策略,转录因子(Transcription factors)是逆境响应的主要调控因子,其编码基因是作物改良的最佳候选基因[1]。转录因子是一类调节基因表达水平的重要调控蛋白,通过与靶标基因启动子区的顺式作用元件结合,激活或抑制靶标基因的转录表达[1]。据报道在已发现的80个转录因子家族中,只有MYB、NAC、bZIP、锌指蛋白等少量转录因子在逆境胁迫响应中起到重要作用。其中MYB转录因子是最大的植物转录因子家族之一,它在植物生长发育、激素信号转导以及植物对生物及非生物应答中起到十分重要的作用[2-5]。目前从水稻中已鉴定出185个MYB转录因子[6],研究发现这些转录因子的功能不仅体现在调节植物生长发育上,在植物应对复杂的生物和非生物胁迫反应方面上也具有显著的作用。这些MYB转录因子基因提高了水稻的综合抗逆能力,是实现水稻抗逆遗传改良的重要资源。
1 MYB转录因子的结构与分类
MYB转录因子结构上具有1~4个重复单元构成的MYB结构域,每个重复单元由50~53个氨基酸构成[7]。MYB重复序列内部有3个α-螺旋,近C端的2个螺旋以转角的方式相连形成螺旋-转角-螺旋(Helix-turn-helix, HTH)的三维结构。MYB重复单位上每隔18~19个氨基酸有1个保守色氨酸残基,共3个[8],这3个残基形成疏水核心,对维持MYB空间结构及MYB蛋白和靶DNA之间互作具有重要意义[9]。在一定条件下色氨酸残基会被疏水氨基酸取代,如在植物中,R3的第一个色氨酸可被苯丙氨酸或异亮氨酸取代[10]。
根据MYB结构域的数量,MYB家族可分为1R-MYB/MYB-related、R2R3-MYB、3R-MYB和4R-MYB 4个亚类,不同的亚类行使不同的功能[3]。1R-MYB/MYB-related是一种端粒结合蛋白质,它可以维持端粒结构的稳定,对染色体进行保护,影响分裂分化等过程,还在调控基因转录上有着一定的影响[11]。目前对R2R3-MYB亚类的研究最广泛,其C段具有转录激活功能。R2R3-MYB在控制植物初级和次生代谢、细胞周期和鉴定、发育以及对非生物和生物胁迫的响应中发挥核心作用[12]。双子叶植物和单子叶植物的基因组中有超过100个R2R3-MYB成员。3R-MYB的功能主要是参与细胞分裂分化的调控过程和植物的耐受性,但是该群体较小,只有5个成员[13]。4R-MYB是最小的亚类,其成员包含4个R1/R2重复序列。目前4R-MYB基因只有在拟南芥(Arabidopsis thaliana)、杨树(Populus L.)和葡萄(Vitis vinifera L.)中发现[14]。目前关于4R-MYB的研究很少,且其功能并未涉及到植物抗逆方面。
2 水稻MYB转录因子的抗非生物胁迫功能
水稻中存在响应逆境胁迫的4条途径,分别為渗透调节、脱水保护机制、抗氧化防御系统和植物激素调节。在胁迫环境下水稻细胞可迅速积累无毒害的渗透调节物质,这些渗透调节物质包括可溶性糖(Soluble carbohydrate)、甜菜碱(Alkilamid propil)、脯氨酸(Proline)等,它们通过提高细胞液浓度使得水稻仍然可以在低渗环境下吸收外部水分从而保证体内正常生理生化活动。水稻的脱水保护机制可通过产生水通道蛋白(Paquaporin)和胚胎发育晚期丰富蛋白(Late embryogenesis abundant protein)等脱水保护蛋白来减轻水稻细胞处于严重胁迫时受到的毒害作用[8]。水稻抗氧化防御系统包括活性氧清除系统和抗氧化物质2部分。活性氧清除系统主要由过氧化氢酶(Catalase)、过氧化物酶(Peroxidase)、超氧化物歧化酶(Super oxide dismutase)以及谷胱甘肽转移酶(Glutathione transferase)构成,该系统的动态平衡是清除水稻在胁迫环境下产生活性氧(Reactive oxygen species)的关键。其次,在抗氧化系统中,维生素类(Vitamin)、抗坏血酸(Ascorbic acid)和还原型谷胱甘肽(Reduced glutathione)等抗氧化物质在调节氧化应激功能上具有重要意义。水稻体内的植物激素功能体现在逆境伤害的修复过程和对逆境的防御过程。近年来对脱落酸(Abscisic acid)和乙烯(Ethene)的研究较为深入。在这4条途径中均存在编码MYB转录因子的基因,编码出的转录因子可识别水稻抗逆境相关基因的启动子序列中MYB结合位点(序列为TAACTG)并产生特异结合,从而调控下游相关逆境基因的应答[15]。MYB转录因子处于一个多方位多层次的抗逆胁迫调控网络中,它在这个调控网络中起到承上启下的作用,在调控下游抗胁迫相关基因表达的同时也受到上游基因的表达调控。抗逆胁迫的调控网络中相关基因是相互联系、相互制约而非独立的。
2.1 MYB转录因子在水稻盐胁迫调控中的作用
盐胁迫会限制和破坏水稻的形态及生理生化过程,是限制作物生长的非生物因素之一[16]。高盐胁迫会导致水稻水分亏缺、离子毒性和营养失衡。水稻耐盐胁迫相关基因的表达谱分析结果表明水稻耐盐性受多基因控制,是一个数量性状[17]。
尽管不同的MYB蛋白氨基酸序列相似,但MYB转录因子对水稻盐胁迫的调控机制不尽相同[18]。一些MYB蛋白通过依赖脱落酸(Abscisic acid,ABA)的方式实现抗盐功能。Yang等[19]发现在盐胁迫下,OsMYB2高表达品系的种子萌发对ABA的敏感性高于野生型和RNAi品系,这表明ABA参与了水稻OsMYB2对盐胁迫的响应机制。在盐胁迫中OsMYB2的表达有所上调,证实OsMYB2转录因子响应盐胁迫。同时发现在盐胁迫下OsMYB2的过表达导致植株的代谢发生变化,这些代谢变化包括起渗透剂作用的可溶性糖与游离脯氨酸含量的上调以及引起脂质过氧化的过氧化氢(H2O2)和脂质过氧化标志物丙二醛(MDA)含量的减少。针对盐胁迫,OsMYB2除了通过提高植株渗透调节能力这一策略,还可以通过高表达应激相关基因来提高抗逆胁迫能力,如响应胁迫相关基因OsLEA3、OsRab16A以及OsDREB2A。Schmidt 等[20]发现水稻中编码MYB家族转录因子的一个基因OsMPS可受盐胁迫和ABA的诱导,其表达也受到生长素、赤霉素的抑制。OsMPS在植物激素与盐胁迫等环境影响的综合作用中起到调节植物适应性生长的效果。Zhu等[21]发现在盐胁迫下,OsMYB91超表达植株中脯氨酸含量明显增加,且参与脯氨酸合成,转运蛋白相关基因OsP5CS1及03g44230表达量上升。除此之外清除活性氧的能力也有所加强。利用不同浓度的ABA对野生型的种子和转基因材料分别处理,发现在一定范围里,随着ABA浓度的提高,转基因材料的发芽率与野生型的发芽率的差值增大。为了进一步确认ABA和OsMYB91超表达间的联系,通过液相色谱对内源ABA含量进行检测,发现OsMYB91超表达材料有较高水平的内源ABA,RNAi和野生型的内源ABA含量差别不大,表明植株OsMYB91通过影响内源ABA的水平,间接参与ABA介导的逆境应答通路[22]。Piao等[23]利用瞬时表达OsMYB102-MYC的水稻原生质体,再利用基因芯片检测OsMYB102是否与编码ABA分解代谢酶的OsCYP707A6的启动子区发生特异结合,发现水稻OsMYB102可以直接激活OsCYP707A6的转录,OsMYB102在盐胁迫中起到重要作用,但具体作用不详。
还有一些MYB蛋白可以不依赖ABA路径行使功能。CBF/DREB1是不依赖ABA信号转导途径调控过程的关键转录因子。盐胁迫下,过量表达水稻OsMYB3R-2的拟南芥对ABA的敏感性降低,且伴随着DREB2A、COR15a和RCI2A等逆境反应基因的上调[24]。其中,DREB2A属于DRE/CRT类胁迫反应基因;拟南芥中的COR15是一种抗冻基因;RCI2A蛋白不是CBF/DREB1调节子的成员,也不参与CBF/DREB1非依赖性通路调节应激信号,但是Hasegawa等[25]和Thomashow[26]研究发现亲水的RCI2A蛋白在提高转基因植物的抗逆性上或许有重要作用。由此可见,OsMYB3R-2在激活逆境响应基因表达的功能上具有多种手段和策略,在多种胁迫响应中起到了“主开关”的作用[27]。
2.2 MYB转录因子在水稻冷胁迫调控中的作用
低温胁迫导致水稻黄化、矮化、枯萎、分蘖减慢和产量低下,是制约水稻产量的主要因素之一[28-29]。冷驯化可以提高水稻在高寒环境下抵抗能力,降低冷胁迫对水稻的不利影响。冷胁迫响应的转录因子与含有相对应顺式作用元件的启动子的下游基因共同组成了转录因子调控网络。且这一调控网络可对水稻耐寒能力的强弱进行调节,对水稻低温驯化有着重要影响[24]。
目前,在水稻冷信号通路上CBF/DREB途径是一条短暂而迅速的短期冷胁迫调控通路,且该信号通路不依赖ABA信号转導途径。研究发现CBFs可与启动子区上的CRT/DRE顺式作用元件特异性结合,使COR、LTI及RD等一系列低温应答基因的表达被激活[24]。Su等[30]研究发现OsMYBS3在植株不同部位对ABA的响应有区别,外源ABA抑制叶片中该基因的表达,而在根中的表达对ABA没有响应。过表达MYBS3的转基因水稻在4 ℃条件下可存活至少7 d。MYBS3正调控抗寒途径是一种依赖CBF的途径,其介导的冷信号通路对冷胁迫反应缓慢而持久,这是与常见的DREB1/CBF冷信号通路最明显的不同之处。其次,通过对转OsMYBS3基因水稻进行转录图谱分析发现OsMYBS3介导的冷信号通路从转录水平上抑制了DREB1/CBF的冷信号通路。表明控制水稻冷胁迫应答的通路可能存在互补关系,这些通路协调调控着水稻短期冷胁迫和长期冷胁迫。
Vannini等[31]发现4 ℃环境会诱导29 ℃环境下生长3 d的水稻胚芽鞘中低水平Osmyb4的表达。水稻Osmyb4基因的功能在拟南芥中也有体现,过表达Osmyb4基因的拟南芥同样具有较好的抗冻性和耐寒性。ABA可以诱导冷调节基因的表达,但冷诱导基因的表达并非一定受到ABA等激素的诱导。研究发现,OsMYB4只可以被冷胁迫诱导表达,而不受干旱胁迫及ABA的诱导。通过瞬时表达检测发现PAL2、SCD9、SAD和COR15a冷诱导启动子可被OsMYB4反式激活,表明OsMYB4表达使参与不同冷诱导途径的基因表达受到不同影响,可能在控制耐冷网络中起到主开关的重要作用。
Dai等[32]发现拟南芥中超量表达水稻3R型MYB转录因子OsMYB3R-2能提高对低温的耐受性,且可不依赖ABA行使其功能。Ma等[27]进一步研究发现OsMYB3R-2可与细胞周期蛋白基因OsCycB的启动子区有丝分裂顺式元件(T/C)C(T/C)AACGG(T/C)(T/C)A特异结合。其次,OsCPT1上游序列存在DRE/CRT顺式元件CCGACCT。OsMYB3R-2核心区位于N端的350和450之间,冷胁迫下具有转录激活活性的OsMYB3R-2可通过上调OsCPT1转录水平,进而参与DREB1/CBF胁迫途径来抵抗冷胁迫。Lv等[33]研究发现水稻OsMYB30参与了新的耐冷性负调控机制。在JA信号传递上发挥作用的OsJAZ9可被冷胁迫处理强烈诱导,并作为阻遏蛋白结合水稻OsMYB30后通过对BMY2、BMY6和BMY10基因进行负调控。这一调控机制将对作为亲和溶质的淀粉和麦芽糖的含量进行微调以实现植株耐冷。
2.3 MYB转录因子在水稻干旱胁迫调控中的作用
干旱是影响水稻生长发育以及产量的重要因素之一。在干旱胁迫下,水稻通过对生理生化反应进行调节抵抗胁迫环境。主要表现为增强呼吸作用、关闭气孔和抑制细胞生长[34]。
水稻针对胁迫环境会从细胞和分子层面对逆境胁迫响应信号网络和转录因子进行调节,如积累渗透调节小分子物质和产生抗逆境相关的蛋白质。经证明,在水稻中转录因子是水稻干旱胁迫信号传导的主要参与者。大部分MYB转录因子参与干旱信号转导途径需借助ABA信号途径,也有部分MYB转录因子可以不依赖ABA信号途径对抗旱能力进行调控。因此,根据是否依赖于ABA信号转导途径,干旱信号转导途径可以大致分为2大类:ABA依赖型和ABA非依赖型[32]。Yang等[19]研究发现OsMYB2高表达植株可通过OsDREB2A依赖的信号通路调节水稻对非生物胁迫耐受性密切相关的下游基因的表达,且对盐、冷等大部分胁迫有显著耐受性。Xiong等[35]发现水稻OsMYB48-1基因通过调节ABA合成基因(OsNCED4、OsNCED5)的表达以及对下游水稻抗逆相关基因(早期信号基因OsPP2C68、OsRK1和晚反应基因OsRAB21、OsLEA3、OsRAB16C、OsRAB16D)进行调控,并通过提高转基因植株体内LEA蛋白和脯氨酸的水平来抵抗干旱胁迫。Yin等[36]发现水稻OsMYBR1参与介导植物对ABA和干旱的反应。Tiwari等 [37]进一步研究发现过表达OsMYBR1的转基因植株可通过改变分子信号、细胞内部稳态和根系形态,控制生长素和水杨酸信号与其他基因(OsP5CS1、OsProt、OsLEA3和OsRab16)在多重胁迫下的串扰。Piao等[38]研究发现水稻OsMYB102基因可以通过下调ABA的生物合成和对下游信号响应来抵制水稻干旱胁迫,将水稻OsMYB102基因转入拟南芥植株后发现在高旱、高盐的非生物胁迫下拟南芥表现较高的干旱、高盐抗性。Guo等[39]发现水稻M1D1过表达植株可被渗透胁迫、盐度和低温诱导调控抗干旱相关基因和花药发育基因的表达,但是其过表达植株对外源ABA没有响应。Tang等[40]发现水稻OsMYB6基因是耐旱作物品种分子育种的候选基因,具有逆境响应转录因子的功能,对干旱和盐胁迫具有正向调节作用。由此可见,ABA信号途径并不是MYB转录因子参与干旱信号转导的唯一途径。
3 MYB转录因子在水稻抗生物胁迫中的作用
病原菌和害虫作为植物生长过程中遭受到的主要生物胁迫,造成全国水稻产量每年减少4.00×106~5.00×106 t[41]。基因表达调控网络除了通过转录因子与下游基因启动子区结合实现对靶基因的表达调控, 还可以通过形成同源、异源二聚体和其他蛋白质的激活来参与茉莉酸(JA)、水杨酸(SA)和ABA等信号传导途径[42]。但参与水稻生物胁迫响应的MYB转录因子数量较少。
茉莉酸是一种防卫相关激素,对植株抵御咬食性昆虫和死体营养型病原菌非常关键,且可诱导某些水稻MYB基因的表达来参与抗逆胁迫。文献报道水稻OsJAMyb的表达受到茉莉酸的诱导[41]。Campos-Soriano等[43]给水稻幼苗接种稻瘟菌Hoku1,发现过表达OsJAMyb的水稻幼苗病斑数量较少,并具有较强抗稻瘟病能力。水杨酸是另一种重要的防卫激素,在植株抵抗活体、半活体营养型病原微生物中起到关键的作用。Tiwari等[37]破译了OsMYBR1转录因子在非生物以及生物胁迫中的激素串扰机制,发现OsMYBR1可通过改变细胞内部稳态和根系形态,控制生长素和水杨酸信号途径以及逆境胁迫响应基因(致病相关蛋白基因、过氧化物酶基因、谷胱甘肽S-转移酶基因等)表达来进行调控。
4 展望
水稻产量对国家粮食安全意义重大,提高水稻抗逆能力是实现稳产和丰产的途径之一[44-46]。发掘优异基因材料并用分子手段来改善水稻抗逆能力将是一条重要途径。MYB转录因子在水稻抗逆中发挥着重要作用。有些MYB基因可在多种胁迫下被诱导表达,并参与不同的信号调控。但抗逆性大多由多基因控制,且许多胁迫因子对植物的伤害结果具一致性,因此仅靠单个MYB基因难以提高植物抗非生物胁迫能力[5]。这就要求发现并鉴定与MYB相联系的有关胁迫响应的其他基因。
理想抗性材料需具有较好的抗逆能力,保证产量又不影响生长发育。目前已发现的水稻MYB基因大多作用于营养生长期,较少作用于对产量影响较大的生殖生长期。因此通过对水稻生殖生长期和营养生长期同时进行抗逆研究来了解MYB转录因子抗逆能力显得尤为重要[47]。水稻MYB基因功能的鉴定大多是在人工气候室或温室营养生长期进行。相对于田间环境而言,温室环境降低了日益恶化的气候对水稻生长发育的综合影响,并且不能准确地反映转录因子基因在生殖生长期和营养生长期的抗逆能力。这也是目前我们发现的生殖生長期MYB转录因子较少的原因之一。所以通过田间试验鉴定出在生殖生长期和营养生长期都有显著抗逆作用的MYB转录因子将是一个需要解决的问题。
大部分水稻MYB基因过量表达使用的组成型启动子对水稻营养生长有一定副作用,换用组织特异型启动子会有较小的不利影响并对抗逆性和产量有更好的改善效果[48]。
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(责任编辑:张震林)