15 份魔芋资源的生物学特性和ISSR 分析
2021-05-17张晓玲郑立飞杨柱琼余学堂曾黎琼
董 坤,陈 玲,卢 俊,张晓玲,郑立飞,4,杨柱琼,余学堂,曾黎琼
(1.云南省农业科学院富源魔芋研究所,云南 富源 655500;2.云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所,云南省农业生物技术重点实验室,农业部西南作物基因资源与种质创制重点实验室,云南 昆明 650223; 3.威信县农业技术推广中心,云南 昭通 657900;4.云南农业大学园林园艺学院,云南 昆明 650201)
魔芋是天南星科多年生草本植物,其球茎中含有大量葡甘露聚糖,该物质具有高吸水性和高膨胀性,在医药、食品、化工等领域都有广泛的应用。中国是魔芋的原产地之一,栽培和利用魔芋历史悠久。云南省特有的地形和气候条件,是发展魔芋产业的适宜 区域[1-2]。尤其是近年来,随着国家乡村振兴战略的实施,魔芋产业成为山区扶贫的重要项目之一,农民种植魔芋的积极性日益高涨。目前,关于魔芋的研究多集中在栽培技术[3-5]、病虫害防治[6-7]等方面。也有学者就魔芋的形态学开展了一系列研究[8-10],制定了相关的国家标准[11],为魔芋种质资源的鉴定奠定了良好的基础。在分子标记方面,RAPD、AFLP、ISSR等技术都被应用于魔芋种质资源研究[12-16],为魔芋属植物分类以及种质资源的遗传多样性分析提供了依据。笔者利用ISSR 分子标记技术,对富源县金地魔芋种业有限公司收集和自育的15 份魔芋资源的亲缘关系进行分析,旨在为不同魔芋资源的鉴定及其开发利用提供依据。
1 材料与方法
1.1 试验材料
15 份魔芋资源编号为1~15 号,其中,1、5~7、11 号来源于云南富源,2 号来源于云南普洱,3 号来源于云南楚雄,4 号来源于云南文山,8 号(远杂1 号)来源于湖北恩施,9、12 号来源于云南临沧,10、13、14、15 号分别来源于云南会泽、贵州威宁、云南昭通、云南泸西。收集后于2019 年种植在富源县金地魔芋种业有限公司魔芋种植基地。
1.2 调查方法
参考NT-T2500—2013 植物新品种特异性、一致性和稳定性测试指南 魔芋观测记录魔芋植株叶柄、叶片、球茎、花、果的形态特征。播种时测定种芋重量,膨大期测量其株高、叶柄周长、叶柄长度、开展度,倒苗后挖出球茎测定其重量。
1.3 ISSR 分析
采用Magen(美基)生物公司DNA 提取试剂盒提取供试材料单株叶片基因组DNA。DNA 纯化后用0.8%琼脂糖凝胶检测,以确定其质量。利用紫外分光光度计将DNA 浓度调整为10 ng/μL,存于-20℃冰箱备用。
PCR 反应体系总体积为15 μL:天根2×Taq PCR MasterMPCR 7.5 μL,引物(10 μmol/L)1 μL(所用引物由上海生工合成,详见表1),模板DNA(10 ng/μL)2 μL,ddH2O 4.5 μL,最后加1 滴石蜡油防止蒸发。反应条件为:94℃预变性5 min;94℃变性30 s,50~55℃复性30 s(温度因引物不同而异,具体温度如表1 所示),72℃延伸1 min,共35 个循环;72℃延伸10 min。PCR 扩增产物在3%琼脂糖凝胶上以5 V/cm 恒压电泳,选用DL 1 000 marker (宝生物工程大连有限公司)作为对比,通过凝胶成像系统拍照记录。
1.4 数据处理方法
采用Excel 和SPSS19.0 统计软件进行试验数据的分析比较;运用Popgeng-32 软件计算各材料间的遗传相似系数和遗传距离,并进行聚类分析。
2 结果与分析
2.1 魔芋资源的生物学特性
表1 ISSR 引物名称,序列及其退火温度
15 份魔芋资源的形态特征详见图1 和表2。1、3、15、5、13、9 号样品具有花魔芋形态特征,它们的主要区别在于叶柄主色、叶柄斑纹颜色和形状的不同。1、3、15、5、13、9 号样品球茎肉色都为白色,其中15号样品白色球茎肉色中有红丝,与其他样品明显不同。1、3、15、13、9 号魔芋的肉穗状花序长度高于佛焰苞位置;5 号魔芋的肉穗状花序长度约等于佛焰苞位置。6、7、14、8 号样品具有白魔芋形态特征,植株较矮小,主要区别是叶柄主色、叶柄斑纹形状和颜色不同。6 号魔芋叶柄绿色,细小点状灰白色斑纹;7号魔芋叶柄绿色,块状斑纹;14 号魔芋叶柄绿色,点状斑纹;8 号魔芋叶柄浅粉红色,块状墨绿色斑纹。2号魔芋植株相对较大,球茎肉色为黄色,附属器浅紫色且有皱褶,果序为蓝色,鉴定为勐海魔芋。4 号魔芋植株分叉处有株芽,植株较大,球茎肉色为粉红色,佛焰苞内侧红色,外侧粉红色,果序为橙红色,是一种珠芽魔芋。10 号魔芋和11 号魔芋鉴定为滇魔芋,主要区别是叶柄和叶柄斑颜色不同,11 号魔芋的叶柄主色更深,斑点更多,果序为蓝色。12 号魔芋植株较大,丛生性强,球茎上芽点较多,根系发达,球茎肉色为橙色,鉴定为甜魔芋,开花后干枯死亡,未见结子。
图1 15 份魔芋相关器官的形态特征
表2 样品来源及形态比较
2.2 魔芋植株的长势
如表3 所示,2、4 号魔芋的平均株高、叶柄长、开展度、叶柄周长数值较大,6、7、8、14 号魔芋的平均株高、叶柄长、开展度、叶柄周长数值较小;生长系数最大的是5 号魔芋,为5.78。
2.3 ISSR 分析
提取15 份魔芋叶片基因组DNA 进行了ISSR分析。从41 条引物中筛选出31 条引物可扩增出清晰稳定、重复性好、多态性高的条带,图2 为引物UBC822 的电泳图谱。结果显示,以15 份魔芋叶片基因组DNA 作为模板,31 条引物共扩增出490 条DNA带,其中多态性条带共489 条,占99.80%。
利用Popgen 32 软件计算不同魔芋材料间的遗传相似系数和遗传距离,结果见表4。可见,15 份魔芋材料之间的遗传相似系数在0.555 1~0.942 9,遗传距离在0.058 8~0.588 6,其中1 号花魔芋与3 号花魔芋之间的遗传相似系数最大,为0.942 9,遗传距离最小,为0.058 8;3 号花魔芋与11 号滇魔芋芋之间的遗传相似系数最小,为0.555 1,遗传距离最大,为0.588 6。聚类分析结果见图3,15 份魔芋材料在遗传相似系数为0.69 的位置处分成6 大类:第一类包括1、3、15、5、13、9 号样品,具有花魔芋形态特征;第二类包括6、7、14、8 号样品,具有白魔芋形态特征;第三类包括2 号样品(勐海魔芋);第四类包括4 号样品(珠芽魔芋);第五类包括10、11 号样品,具有滇魔芋的形态特征;第六类包括12 号样品,具有甜魔芋的形态特征。可见,15 份魔芋的遗传聚类与形态外观调查分析结果基本一致。
表3 15 份魔芋材料的生长情况
图2 ISSR 分析电泳图(引物UBC822)
表4 15 份魔芋材料的的遗传相似系数(—以上)和遗传距离(—以下)
3 小结与讨论
在同样的种植条件下观察不同魔芋种质资源的农艺性状,可以看出曲靖市富源县竹园镇的气候环境不是白魔芋、勐海魔芋、珠芽魔芋、滇磨芋和甜魔芋的最佳生长条件,导致这些魔芋植株长势稍差。从生长系数看,5 号魔芋更适合在当地种植。
图3 15 份魔芋材料的聚类结果
对15 份魔芋材料的叶、球茎、花、果等进行了观察记载和农艺性状分析调查,并利用ISSR 分子标记技术分析了它们的遗传多样性,聚类分析结果显示,花魔芋、白魔芋、勐海魔芋、珠芽魔芋、滇魔芋、甜魔芋各自聚为一类,远杂1 号在遗传上更接近于白魔芋,为今后魔芋种质资源鉴定和保护利用提供了依据。
ISSR 分子标记技术能够揭示植物的遗传多态性,有效反映出品种间的亲缘关系。任盘宇等[14]对云南南部5 种魔芋属植物居群遗传结构的分析中,通过PCR 扩增9 个ISSR 引物共获得95 条条带,其中多态性条带占总条带数的100%。在该研究中,15 份魔芋材料通过31 个引物进行PCR 扩增共获得490 条条带,其中多态性条带489 条,占总条带数的99.80%。遗传相似系数是比较不同品种或群体间遗传多样性的重要指标。任盘宇等[14]利用ISSR 技术对云南南部5 种魔芋属植物居群遗传结构分析的样品间遗传相似系数为0.857 1~0.473 7,宣慢[16]利用ISSR 技术对49 份魔芋属资源的多样性分析,其遗传相似系数为1.00~0.68,该研究中15 份魔芋样品间的遗传相似系数为0.555 1~ 0.942 9,居于前二者的研究结果之间。聚类分析结果显示,花魔芋和白魔芋的杂交品种远杂1 号的亲缘关系更靠近白魔芋。滕彩珠等[17]进行的云南魔芋种质资源亲缘关系ISSR 分析发现甜魔芋与花魔芋聚到一起,与该研究结果中甜魔芋(12 号样品)与滇魔芋(10、11 号样品)聚到一起,有所不同,可能是因为该研究所选择的ISSR 引物较少未能全面地反映二者在DNA水平上的差异所致。