基于网络药理学探讨菟丝子-枸杞子药对治疗男性不育症的作用机制
2021-05-15王继升代恒恒陈子龙冯隽龙李海松
赵 琦,王继升,代恒恒,陈子龙,冯隽龙,闫 菲,李海松
(北京中医药大学,北京100029)
男性不育症指的是夫妻之间有规律的性生活1 年以上,在未采取任何避孕措施之上,由男方原因使女方无法受孕的一种疾病。据统计,世界范围内不孕不育的发病率已超过15%,其中男性因素所占比例超过50%[1]。随着环境、食品、心理等因素及生活方式的变化,男性精子密度呈现以每年1.40%~2.15% 的比例快速下降[2]。目前,男性不育症的病因研究仍不清楚,现有的治疗措施包括如雌激素受体调节剂、精子营养剂、抗生素等对症治疗为主,临床疗 效 值 得 商 榷[3,4]。随 着 二 胎 政 策 的 放 开,男性不育症的治疗面临越来越巨大的挑战,因此寻找更好治疗手段也成为当前领域的热门话题。
男性不育症在中医中多归属为“不育”“少子”等范畴。中医认为男性不育症的核心病机为肾精亏虚,临床上常采用补肾填精之法[5]。菟丝子-枸杞子药对可见于多首补肾育精名方如五子衍宗丸、左归丸、右归丸、观音救苦丸、长春广嗣丹、延龄育子丸、经验广嗣丸等,是治疗男性不育症常用药对[6]。药对中菟丝子温补肝肾为阳,枸杞子滋补肝肾为阴,二者配伍阴阳同调,用药阴中求阳,阳中求阴,从而达到阴阳平衡,阴阳同补的用药范式,体现了治疗男性不育症“以肾虚为本,以补肾生精为则,以微调阴阳为法”的治疗理论[7]。网络药理学是近年来兴起的研究中药药理机制的新型学科,其通过对当前中药药理学、高通量生物信息学、高端数据分析软件系统整合,对中药作用机制可进行全面分析[8]。因此本文将采用网络药理学方法对菟丝子-枸杞子药对治疗男性不育症的主要成分、关键靶点和信号通路进行挖掘,并预测其潜在的作用机制。
1 材料与方法
1.1 菟丝子-枸杞子药对活性成分与潜在靶点筛选
本研究将在中药系统药理学分析平台(TCMSP)和中药分子机制的生物信息学分析工具(BATMAN)中检索菟丝子-枸杞子药对的全部化学成分。TCMSP 包含了499 味中药及其所对应的化合物成分(约29 000 种),并提供了每种化合物相对全面的药物活性数据,是最重要的中草药化合物成分数据库。BATMAN能够系统展示每种中药所含化学成分,能预测其中重要靶点,并进行生物信息学分析,能够帮助研究者全面的理解中药药理作用。并根据化合物口服生物利用度(OB)≥30% 和类药性(DL)≥0.18 作为活性化合物的筛选条件,将两个数据库的成分预测靶点合并,建立菟丝子-枸杞子化学成分-靶点数据集。
1.2 疾病靶点筛选
以“Male Infertility”为关键词,检索并筛选在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM,https://omim. org)疾 病 靶 标 和 GeneCards 数 据 库(https://genealacart.genecards.org/)中相关度≥5相关靶标,删除重复后得到男性不育症相关靶点信息。
1.3 药对-活性成分-作用靶点网络构建
通过构建中药-疾病靶标韦恩图,得到中药靶点和疾病靶标的共同靶点,最后得到药物成分靶点-男性不育症疾病靶点映射信息。利用Cytoscape3.6.1 软件构建“药对-活性成分-作用靶点”调控网络。其中“节点”信息包括中药,药物活性成分和作用靶点,节点与节点之间关系用“边”表示。
1.4 蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络的构建
将男性不育症与菟丝子-枸杞子药对的共同 靶 点 导 入STRING 数 据 库(https://string-db.org/,ver.11.0)中进行PPI 分析。筛选条件选择为“Homo sapiens”,并且选择最小互作分数值为0.700,最终构建PPI 网络图。将PPI 的结果导入Cytoscape 软件进行可视化展示。根据软件中Cytohubba 插件MCC 算法分析出核心程度最高的前八位蛋白,最终可预测出潜在核心靶标。
1.5 基因本体(GO)功能京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析
利 用 David 数 据 库(https://david. ncifcrf.gov/)对共同靶点蛋白进行GO 功能和KEGG通路富集分析。GO 功能分析主要用于描述基因靶点的功能,包括细胞功能、分子功能和生物功能。KEGG 富集分析可以得到药对和男性不育症共同靶点所富集的信号通路。GO 和KEGG 分析均以P<0.05 表示具有统计学意义。
1.6 成分-靶标-通路网络构建
筛选KEGG 排名前20 通路,并结合文件检索,得到可能与男性不育症治疗相关通路,并找到富集在通路上对应的靶标,并于菟丝子-枸杞子药对中活性成分对应,最终构建“成分-靶标-通路”多元网络关系图。
2 结果
2.1 菟丝子-枸杞子活性成分与潜在靶点筛选
在TCMSP 和BATMAN 中检索菟丝子-枸杞子的化合物成分,并根据OB≥30% 和DL≥0.18 对化合物进行筛选后,最终得到52 种潜在核心化合物,预测出化合物对应靶点242 个。
2.2 男性不育症靶标筛选
在OMIM、Gene Cards 数据库检索男性不育症相关靶点,并结合相关文献删除重复后共得到靶标7 661 个。通过构建韦恩图,从中获得菟丝子- 枸杞子药对和疾病共同靶点113 个。见图1。
2.3 药对-成分-靶点-疾病调控网络构建
将菟丝子-枸杞子药对活性成分与男性不育症共同靶点信息及映射关系导入到Cytoscape软件,建立“药对-成分-靶点-疾病”网络图,见图2。 通 过Cytoscape 的Network Analyzer 功 能可对构建的网络进行拓扑结构分析,用Degree表示节点重要性。在本网络中,Degree 前五位化合物为Quercetin(槲皮素),Kaempferol(山萘酚),Isorhamnetin(异 鼠 李 素),Glycitein(甘 氨酸),Stigmasterol(豆甾醇)。
2.4 PPI 网络的构建
图1 菟丝子-枸杞子药对-男性不育症靶标韦恩图Fig 1 Targets Venn diagram of Cuscuta-Medlar CM and male infertility
将113 个共同靶点导入STRING 中,选择高置信度0.700,下载PPItsv 文件导入到Cyto‐scape,得到PPI 网络图,图中共有114 节点和794 条边。根据Cytohubba 插件中MCC 算法,可得到了潜在候选前 8 位基因,包括 IL6、MAPK1、MMP9、TNF、EGF、ICAM1、PTGS2、AKT1。见图3、4。
2.5 GO 功能富集分析
图2 药对-成分-疾病-靶点调控网络Fig 2 The regulatory network of CM-ingredient disease-target
图3 菟丝子-枸杞子药对治疗男性不育症潜在靶标相互作用网络Fig 3 The interaction network of candidate targets of CM against male infertility
图4 菟丝子-枸杞子药对治疗男性不育症潜在靶标互作前8 位网络图Fig 4 The interaction network of Top8 CM candidate tar⁃gets against male infertility
为了更好地理解菟丝子-枸杞子药对治疗男性不育症潜在药理活性,DAVID 数据库可对共同靶点进行GO 和KEGG 富集分析。GO 分析结果提示菟丝子-枸杞子药对治疗男性不育症基因生物过程(BP)显著富集在氧化应激、细胞增殖、激素调节、凋亡等过程;细胞组分(CC)主要富集细胞外空间、细胞外区域、细胞器、细胞链接等部位;在分子功能(MF)主要富集在蛋白连接、分子功能调节、催化活性、抗氧化活性等。见图5~7。
图5 菟丝子-枸杞子药对治疗男性不育症的潜在靶标的BP 分析Fig 5 GO pathway enrichment analysis for biological processes of candidate targets from CM against male infertility
2.6 KEGG 功能富集
KEGG 富集分析得到信号通路113 条,结合文献检索并删除与“cancer”相关通路,根据P 值大小,选择显著性较高的前20 条通路进行气泡图绘制。与不育症相关的重要的信号通路包括:TNF 信号通路、细胞凋亡、PI3K-Akt 信号通路、FoxO 信号通路、甲状腺激素信号通路、Toll 样受体信号通路等。见图8。
图6 菟丝子-枸杞子药对治疗男性不育症的潜在靶标的CC 分析Fig 6 GO pathway enrichment analysis for cellular component of candidate targets from CM against male infertility
图7 菟丝子-枸杞子药对治疗男性不育症的潜在靶标的MF 分析Fig 7 GO pathway enrichment analysis for molecular function of candidate targets from CM against male infertility
2.7 成分-靶标-通路网络
根据KEGG 通路富集的结果,结合文献得到可能具有男性不育症治疗作用的通路,并将通路中富集的蛋白与枸杞子-菟丝子药对的活性成分与潜在靶点相映射,得到药对活性成分-靶表-通路网络图,并用cytoscape 软件可视化展示。如图9 所示,菟丝子-枸杞子药对治疗男性不育症涉及槲皮素、山奈酚、谷甾醇、β-谷固醇等24 种成分,其对应的靶标主要包括AKT1、MAPK1、IL6、TNF 等43 个,以上靶标可富集在TNF、PI3K-Akt、FoxO 等通路中。见图9。
图8 KEGG 通路富集前20 位气泡图Fig 8 Top 20 bubble map of KEGG pathway enrichment
图9 “成分-靶标-通路”网络关系图Fig 9 “Component-target-pathway”network
3 讨论
全世界大约有15%夫妻无法生育,其中男性因素约占不育病例一半以上。由于一线推荐药物不确定的疗效和副作用,临床仍需要更加有效的治疗选择。中医治疗男性不育症有一定优势,中药药对是中医临床遣药组方常用的配伍形式,是在中医理论指导下,长期临床实践经验中总结而成,体现了方剂隐含规律和辨证施治内涵。中医中菟丝子-枸杞子是治疗男性不育症的常用药对,中医处方中多作为核心药物出现。菟丝子味辛、甘,性平,有补益肝肾,固精缩尿功效;枸杞子甘、平,有滋补肝肾,益精明目之功。药理学研究表明,二者均有抗炎、抗凋亡和提高免疫力作用。然而,菟丝子-枸杞子药对治疗男性不育症的潜在机制仍不清楚,因此,本文设计了网络药理学方法进一步探索药对的药理机制。
通过药理活性筛选,得到菟丝子枸杞子药对有效成分52 个,包括槲皮素、山萘酚、甘氨酸、豆甾醇等。其中槲皮素是黄酮类化合物,具有很好的抗炎、抗氧化应激等保护作用[9]。研究表明,槲皮素能够显著改善白细胞精子症患者精子运动活力。经槲皮素治疗后,患者精子中精子中mtDNA 的含量显着下降,而精子中Cyt B 和NADH 5 的含量显着增加,从而改善精子过度活化运动和顶体反应的作用[10]。山奈酚能明显改善糖尿病大鼠精子的SOD,CAT,GPx 等氧化应激产物,降低精子的NF-κB 和TNF-α 等炎症因子水平,从而改善精子损伤[11]。豆甾醇、β-豆甾醇等属于植物甾醇类。植物甾醇是重要的营养剂能够促进动物发育,同时还具有降低胆固醇减少心血管病的风险[12]。研究表明,在食物中添加植物甾醇可显著增加精子数目和精子活力,同时降低精子中氧化应激反应[13]。因此可推测以上化合物是治疗男性不育症的核心化合物。
网络药理学结果显示菟丝子-枸杞子药对治疗男性不育症潜在靶点包括IL-6、MAPK1、MMP-9、TNF、EGF、ICAM-1 等。IL-6 是由巨噬细胞分泌的炎性细胞因子,参与体内的炎症反应,不育患者精液 中 炎 症 因 子 如IL-6 水 平 明 显 升 高[14]。TNF-α 是一种免疫调节剂,主要能够促进炎症反应,有报道白细胞精子症的不育患者精液中TNF-α 较正常患者升高,同时患者精子数目减少[15]。EGF 与雄性动物的生殖密切相关。适当剂量的EGF 能特异性地通过EGFR 介导促进精原干细胞的增殖,并且这种增 殖 效 应 呈 时 间 依 赖 性[16,17]。MAPK 是MAPK 信号通路重要组成部分,MAPK 与男性精子的增殖、炎症、分化、凋亡等过程密切相关[18]。细胞黏附分子-1(ICAM-1)是细胞黏附分子的免疫球蛋白超家族的成员,是血液-睾丸屏障的组成部分。研究表明,ICAM-1 在睾丸支持细胞和生殖细胞,尤其是精原细胞,正常睾丸的伸长和伸长精子中检测到ICAM-1 免疫反应,参与维持睾丸内环境稳态[19]。MMP-9 是基质金属蛋白酶(MMP)家族的重要组成成分,提高MMP-9 含量能够有效减轻精索静脉曲张诱导的生精障碍[20]。
KEGG 富集分析显示,菟丝子-枸杞子药对治疗男性不育症靶点通路主要集中在TNF 信号通路、PI3K-Akt 信号通路、FoxO 信号通路、细胞凋亡、Toll 样受体信号通路等。TNF 信号通路是炎症反应的核心信号通路,在男性生殖发育密切相关[21]。多种外界不良因素,如化学物质刺激,应激状态,辐射等均可见TNF 信号通路的参与,诱导精子损伤和数 目 下 降[22,23]。PI3K-Akt 信 号 通 路 是 人 体 重 要 信号通路,参与增殖、分化、凋亡和葡萄糖转运等多种细胞功能的调节[24]。研究表明,黄曲霉毒素可通过PI3K-AKT-mTOR 通路诱导精子细胞自噬,从而对男性生育功能造成损伤[25]。FoxO 信号通路是是FOX 蛋白转录因子的超家族,参与寿命、抗应激、凋亡、细胞增殖、分化和代谢等多种生命体过程,在男性生殖功能中也发挥了强大的调节作用[26]。FOXO能够调控精原干细胞(SSC),促进精子的生发,并且Foxo3 和Foxo4 的综合缺乏导致SSC 自我更新严重受损和完全分化障碍,这表明Foxo3 和Foxo4 尽管对雄性育种是必不可少的[27]。细胞凋亡通路是精子生成相关的重要通路,其中Caspase-3,Caspase-8,Bax,Bcl-2,都是凋亡通路的重要分子,多种信号通路分子如FoxO 通路,PI3K 通路均可影响凋亡通路相关蛋白,抑制精子细胞凋亡,促进生精过程[28]。Toll 样受体主要在体内发挥免疫识别和免疫调控作用,TLR 识别LPS、GpG-DNA、肽聚糖、脂蛋白等外源性物质并介导清除,是重要的免疫性信号通路。动物实验显示TLR 能够明显抑制LPS 造成大鼠精子细胞凋亡[29]。于此同时,VEGF signaling pathway和MAPK signaling pathway 均在精子生成,抑制精子损伤中发挥重要作用[30]。
综上所述,本研究借助网络药理学方法从多层面,多角度揭示了菟丝子枸杞子药对对于男性不育症的作用,深入揭示了药对参与调控男性不育症靶基因的性能。本研究的局限在于,通过网络药理学发现药理活性成分和靶点是理论预测的结果,应通过实验进行验证,后续研究将集中于使用动物实验和临床研究来验证该假设,以提高临床用药的合理性和科学性。