利用cBioPortal分析P53在肌层浸润型膀胱癌中的表达、突变及临床意义
2020-12-21梁维朝高伟伟
梁维朝,高伟伟*
(桂平市人民医院肿瘤科,广西 贵港 537200)
膀胱癌的发病率越来越高,是男性第四种常见的癌种,严重危害人类的健康[1]。膀胱癌发生机制与基因突变及新生血管形成密切相关。p53突变在尿路上皮肿瘤最常见的遗传事件。p53是一种充分表征的肿瘤抑制基因, p53突变与肿瘤进展和预后有关[2]。本研究应用TCGA数据库提供的数据分析p53在肌层浸润型膀胱癌中的表达、突变及临床意义。
1 资料与方法
1.1 数据材料收集
从http://www.cBioPortal.org/中下载413例 TCGA 数据库提供的肌层浸润型膀胱癌临床资料数据及p53 RNASeq V2的数据,进行分析。
1.2 数据集筛选与临床参数资料相关研究
将标本样品的ID号将病人信息整合成EXCEL表格,删除缺失或部分资料缺失的数据,按照p53表达值从高到底排列,取中位数为截点,分低表达组206例,高表达组201例,分析p53的表达与临床之间的相关性。
1.3 统计学处理方法
使用SPSS 22.0处理数据。计数资料以率(%)表示,比较采用x2检验,以P<0.05表示有统计学意义。采用Spearman相关分析p53基因表达与相关因素之间关系等。将有统计学意义的指标纳入cox模型行多因素分析。
2 结 果
2.1 突变情况
413例肌层浸润型膀胱癌患者,P53突变比率50%(207/413);在207例p53基因突变病例中,错义突变占77.8%(161/207),截短突变32.9%(68/207),错义突变+截短突变22例,框移突变1例。
2.2 p53的表达与临床病理资料及突变的相关性
p53的表达与 AJCC P TNM分期、肿瘤远处转移、淋巴结转移,临床分期在Spearman相关分析中呈负相关(P<0.05),而与肿瘤淋巴管浸润和病理分级呈正相关(P<0.05),p53的表达与突变无相关性。t检验得出,P53按膀胱癌肿瘤病理分型低级别(2510.44±960.50)和高级别(1669.41±968.28)的表达有差异(P<0.05),其余AJCC p TNM分期、临床分期、突变的p53的表达没有差异(P>0.05)。
2.3 p53表达与肌层浸润型膀胱癌患者预后分析
Kaplan-Meier检验法分析p53表达与肌层浸润型膀胱癌患者总生存期、无病生存期无显著统计学意义(P>0.05),P53的表达可能与肌层浸润型膀胱癌的预后无关.与cBioPortal分析结果一致。
2.4 p53与肌层浸润型膀胱癌预后的 COX 多因素分析
将单因素分析中对预后有影响的指标纳入多因素COX分析,结果提示肿瘤淋巴结转移及浸润,肿瘤远处转移是影响肌层浸润型膀胱癌预后的独立不良因素(P<0.05),而P53在肌层浸润型膀胱癌的表达以及发生突变,并不是影响肌层浸润型膀胱癌预后的独立因素。
3 讨 论
大多数膀胱癌来自尿路上皮细胞,大约75%的患者是非肌层浸润型膀胱癌,而肌层肌层浸润型膀胱癌约占比25%。尽管医疗技术不断发展,但肌层浸润型膀胱癌患者的治疗和预后基本没有改变。P53可分为野生型和突变型。对于突变型P53,突变方式较多等。而野生型P53为正常基因,其编码的p53蛋白半衰期短,免疫组化难以检测;突变型编码的p53蛋白空间构象发生改变,半衰期延长,免疫组化可测出较高的P53蛋白表达量,故如果免疫组会测到较高的p53表达量则可以判断为突变型P53基因。p53可作为细胞内的一个强大的转录因子,当DNA发生损伤时,p53可被不同的信号通路激活并保持稳定, 增强其下游多种基因的转录而引起细胞周期阻滞、凋亡或衰老, 以保持细胞基因组的完整性,清除损伤细胞,这些生物学作用取决于不同的应激信号和细胞类型。
本次研究的样本中,约半数发生了p53基因突变,发生了错义突变、截短突变,少部分样本错义突变和截短突变同时存在,发生突变率高。行p53突变与肌层浸润型膀胱癌患者的预后分析,p53的表达与AJCC pTNM分期、肿瘤远处转移、淋巴结转移,临床分期呈负相关(P<0.05),而与肿瘤淋巴管浸润和病理分级中呈正相关(P<0.05),与突变无相关性(P>0.05)。生存分析提示,有无突变对肌层浸润型膀胱癌患者无病生存期及总生存期无影响(P>0.05)。认为p53的突变对膀胱癌复发的预测无多大的作用。但也有学者认为P53的突变可作为评估膀胱癌预后的指标[3-4],这与本次研究结果不一致。笔者分析本次研究的样本,全部有肌层浸润,分期靠后患者病例数较多,可能是样本差异导致结果的不一致。而其中的机制,值得深入研究。p53是一个经典的抑癌基因,在多种癌症中与患者预后相关。在肌层浸润型膀胱癌的研究中,其相关性却存在争议。本次研究肌层浸润型膀胱癌P53突变患者与未突变患者行生存分析显示,两者的总生存期、无病生存期尚不能认为有差异(P>0.05)。目前为止,还没有充分证据认为p53突变可以作为判断肌层浸润型膀胱癌预后的独立因素。
综上所述, P53在肌层浸润型膀胱癌中发生突变率高,在突变组中和未突变组中生存期和无病生存期未能发现有明确差异,尚不能认为p53突变可影响肌层浸润型膀胱癌的预后。