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植物WRKY 转录因子及其在非生物胁迫中的研究进展

2020-12-21卢雯瑩秦素研戴晋刘美茹袁曼曼

河北农业科学 2020年6期
关键词:拟南芥结构域调控

卢雯瑩,秦素研,戴晋,刘美茹,袁曼曼

(漯河市农业科学院,河南 漯河 462300)

为应对生态环境不断恶化的严峻考验,植物在生长发育时逐渐形成了复杂的信号网络调控。研究表明,WRKY 家族转录因子能与靶基因启动子中的顺式作用元件W-box(TTGACC/T) 特异性结合,从而调控目的基因的表达,并广泛参与植物生长发育、非生物胁迫等应激响应。了解植物WRKY 转录因子及其参与非生物胁迫调控机制,对未来植物抗逆相关基因挖掘、抗逆遗传育种等具有实际意义。对WRKY 转录因子的结构、分类及其在部分非生物胁迫响应中的研究进展进行综述,旨为相关研究提供信息参考。

1 WRKY 转录因子的结构及分类

WRKY 蛋白属于WRKY 家族,是植物中较大的转录因子家族之一[1],最早从甜土豆中分离出来[2],随后又在拟南芥、水稻和大豆等多种植物中被发现和报道。WRKY 蛋白的名字来源于它们都含有1 个长度为60 个氨基酸左右的WRKY 结构域,其N 端含保守的WRKYGQK 序列[1],C 端含有1 个Cx4-5Cx22-23HxH(简称C2H2) 或者Cx7Cx23HxH(简称C2HC) 的锌指结构[3]。WRKYGQK 序列是WRKY 结构域的核心序列,其突变往往导致WRKY 蛋白结合DNA 的活性降低甚至丧失[4]。WRKY 结构域的首个溶液结构主要由4 条β 折叠构成,伴随有Cys/His 残基组成的锌指结构[5]。WRKYGQK 序列主要位于N 端的β 折叠上,使得该序列可以部分从蛋白表面伸出,进而有助于WRKY 蛋白与DNA 结合。Duan 等[6]报道的拟南芥WRKY1 蛋白晶体结构得到了相似的WRKY 结构域,只是其有1 个额外的β 折叠,使该结构域看起来更明显。此外,WRKY 的结构与NAC 和GCM 转录因子的DNA 结合域相似,表明WRKY 与NAC 和GCM 在进化上有很大的相关性[5,7]。WRKY 与GCM 锌指结构相似,但NAC缺乏WRKY 的核心序列WRKYGQK。这些相似结构是否具有其他作用,目前仍不清楚[5]。

WRKY 结构域和锌指结构是WRKY 蛋白的2 个重要组成部分,根据二者数量或类型的不同,可以将其分为3 个组(Group):GroupⅠ含有2 个WRKY 结构域,Group Ⅱ和Group Ⅲ仅含有1 个;GroupⅠ和GroupⅡ含有相同的C2H2锌指结构,而Group Ⅲ含有特殊的C2HC 锌指结构;根据氨基酸序列的不同,Group Ⅱ可以进一步分为Ⅱa、Ⅱb、Ⅱc、Ⅱd 和Ⅱe 5 个亚组[1]。系统发育树分析表明,高等植物的WRKY家族可以更精确地分为GroupsⅠ、Ⅱa+Ⅱb、Ⅱd+Ⅱe和GroupsⅢ[8,9]。

凝胶阻滞、酵母单杂交、共转染、转录激活等试验均证明WRKY 转录因子可以与下游基因启动子中的一些保守序列结合,这些序列被称为W-box,通常包含TTGACC/T 结构[1,10]。尽管几乎所有报道的WRKY蛋白都能结合到相同的核心序列(TGAC) 上,但WRKY 转录因子又是如何特异性地分辨各自靶基因的启动子呢?Ciolkowski 等[11]利用凝胶阻滞试验研究了拟南芥5 种WRKY 蛋白后发现,除W-box 的核心序列是WRKY 蛋白结合所必需的之外,W-box 的侧翼序列也能部分决定WRKY 的偏好性,如AtWRKY6、AtWRKY11 对5’端毗邻鸟嘌呤残基的W-box 具有 很高的亲和性,而AtWRKY26、AtWRKY38 和AtWRKY43 对5’端毗邻腺嘌呤、胞嘧啶或胸腺嘧啶残基的W-box 具有很高的亲和性。CTGACC 和TTGACA 不能被5 种WRKY 蛋白结合,表明类W-box序列并不具有W-box 序列的功能,W-box 元件应为TTGACC/T 结构[7]。生物信息学分析和功能研究均发现在胁迫诱导型启动子中含有多个W-box 元件[12],串联的W-box 能够增强WRKY 转录因子结合的效率,如多个W-box 对PcWRKY1 的转录效果具有协同性[13],大麦HvWRKY38 需要3 个毗邻的W-box 才能有效地结合[14]。但也有少数研究发现,WRKY 转录因子可以结合非W-box 元件来发挥功能。OsWRKY13 既可以结合Wbox 序列,又可以结合PRE4 元件(TGCGCTT)[15];HvWRKY46 能同时结合W-box 和SURE 元件(TAAA GATTACTAATAGGAA)[16];NtWRKY12 可以结合糖响应类似元件(TTTTCCAC),而不能结合W-box[17]。

2 WRKY 在非生物胁迫中的作用

早期的转录组分析揭示出WRKY 转录因子可能参与到非生物胁迫反应中,近年来,越来越多的研究证实了WRKY 在植物响应非生物胁迫中扮演着重要角色。响应热激的特异启动子HSP101 过表达水稻的WRKY11 基因研究发现,OsWRKY11 能够增强水稻的耐旱性,表现为减缓叶片萎蔫,提高绿色部位的存活率[18]。过表达OsWRKY45 和OsWRKY72 能够增强水稻对盐和干旱的耐受性[19,20]。PEG、NaCl 和ABA 处理能够增强OsWRKY08 的转录活性,从而通过正调控2种不依赖于ABA 的胁迫响应基因AtCOR47 和AtRD21 的表达来提高转基因拟南芥的渗透胁迫[20]。另外,过表达GmWRKY54 也能够增强植物对盐胁迫和干旱胁迫的耐性,而GmWRKY13 的过表达则会增加对盐胁迫和甘露醇胁迫的敏感性[21]。NaCl 和盐胁迫能够强烈地诱导TcWRKY53 的表达,且过表达TcWRKY53 会导致2 种ERF 家族基因NtERF5 和NtERFBP-1 的表达下调[22]。ABA、干旱和NaCl 处理能够增强拟南芥2 个紧密相关的WRKY 转录因子AtWRKY25 和AtWRKY33 的转录,且Atwrky33 的无效突变体和Atwrky25Atwrky33 双突变体都表现出对NaCl 敏感性增强,而过表达AtWRKY25 和AtWRKY33 其中1 个都可以增强拟南芥对NaCl 的耐受性[23]。

研究表明,WRKY 蛋白在ABA 信号途径中可能扮演激活子或者抑制子的角色,LtWRKY21 可以正调控ABA 相关基因的表达,瞬时表达试验分析表明,对于同一个ABA 诱导型启动子,OsWRKY24 和Os WRKY45 起抑制作用,而OsWRKY72 和OsWRKY77则起激活作用[24]。Atwrky2 的T-DNA 插入突变表明,AtWRKY2 负反馈调控ABA 介导的种子萌发[25]。AtWRKY57 和AtWRKY63 均参与拟南芥对干旱和ABA的响应,其中,AtWRKY57 直接调控ABA 合成基因的表达,而AtWRKY63 则直接调控ABA 下游基因ABF2 的表达[26,27]。Shang 等[28]发现3 类WRKY 蛋白(AtWRKY18、AtWRKY40、AtWRKY60) 在种子萌发的过程中负调控ABA 信号,进一步的遗传分析表明AtWRKY40 是3 类WRKY 转录因子中主要的负调控因子,能够通过结合启动子下游的W-Box 序列而直接抑制几种重要的ABA 响应基因AtABF4、AtABI4、AtABI5、AtDREB1A、AtMYB2 和AtRAB18 的表达;高浓度的ABA 能够从细胞核中招募AtWRKY40 到细胞质中,使AtWRKY40 与ABA 相互作用,从而促进ABA 响应基因的表达。单突变体、双突变体、三突变体以及过表达试验表明,AtWRKY18 和AtWRKY60 对于敏感型植株起正调控作用,从而抑制种子萌发和根系生长,同时它们也能够增强植株对盐胁迫和渗透胁迫的敏感性[29]。这些结果表明,WRKY 转录因子在ABA 信号途径中扮演重要的角色。

此外,越来越多的研究表明,WRKY 蛋白在植物营养胁迫中具有重要作用。AtWRKY6 同时参与拟南芥缺磷和缺硼的响应,AtWRKY6 能够抑制磷转运基因PHO1 的表达,在低磷情况下,AtWRKY6 蛋白的稳定性降低,导致其与PHO1 启动子的结合减弱,进而使PHO1 的表达下调[30]。Castrillo 等[31]进一步研究发现AtWRKY6 能够减少对砷的吸收,从而降低转座子的活性。此外,AtWRKY75 也参与缺磷的响应,并且能够调控拟南芥根系的发育[32]。

3 展望

WRKY 转录因子是植物特有的转录因子家族,自1994年发现第1 个WRKY 蛋白以来,借助遗传学和分子生物学的研究方法,WRKY 蛋白的研究取得了丰硕成果。迄今为止的报道表明,WRKY 不仅参与植物的生长发育,而且还能够参与多种非生物胁迫反应,如干旱、冷害、高温、高盐、营养匮乏等。绝大多数WRKY转录因子可以响应温度胁迫,以此避免温度变化带给植物的伤害;通过参与ABA 介导的信号通路提高植物对干旱胁迫的耐受性[33]。除此之外,它还积极响应盐胁迫和氧化胁迫等非生物胁迫[34]。WRKY 转录因子主要通过ABA、JA 和SA 等信号通过来调控植物的非生物胁迫反应,但其复杂的调控机制及相关信号通路之间的作用关系尚未完全清楚。通过对WRKY 家族的研究,采用转基因技术对作物进行改良,将有助于提高植物的抗逆性,帮助筛选抗逆性强的优良品种。

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